志田洋介 (Yosuke Shida) - マイポータル

基本情報

所属: 長岡技術科学大学技学研究院准教授

J-GLOBAL ID: 201801001022515920
researchmap会員ID: 7000022315

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研究キーワード

研究分野

ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学 /

論文

A CRISPR/Cas9-based genome-editing platform enabling efficient and precise gene replacement in Lipomyces starkeyi

Rikako Sato, Kaito Maruyama, Satoshi Ara, Masayuki Shibata, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Harutake Yamazaki, Hiroaki Takaku

FEMS Yeast Research 26 2026年1月5日
Extracting regions of lipid droplets from confocal microscopy images utilizing optical properties of oleaginous yeast.

Ryosuke Harakawa, Yuki Imai, Yuka Takahashi, Seiya Ueda, Hiromi Shoji, Ayaka Itani, Akihiro Nakamura, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Masahiro Iwahashi

Applied microbiology and biotechnology 109(1) 195-195 2025年9月2日
Ultrahigh-throughput screening of environmental bacteria for proteolytic activity using droplet-based microfluidics

Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Nobuyuki Homma, Yosuke Shida, Rikako Sato, Hiroaki Takaku, Wataru Ogasawara

Applied and Environmental Microbiology 2025年6月13日
Identification and characterization of the suppressed lipid accumulation-related gene, SLA1, in the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi

Rikako Sato, Harutake Yamazaki, Kazuki Mori, Sachiyo Aburatani, Koji Ishiya, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Kosuke Tashiro, Satoru Kuhara, Hiroaki Takaku

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2024年7月31日
Classification of Oleaginous Yeast Images Based on Mixture of Experts with Micro-Spatial Attention

Soma Nagatsu, Ryosuke Harakawa, Akihiro Nakamura, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Masahiro Iwahashi

GCCE 2024 - 2024 IEEE 13th Global Conference on Consumer Electronics 172-173 2024年
Micro-Spatial Attention with Sparse Constraint for Self-Supervised Learning for Oleaginous Yeast Image Representation

Kazuma Ohtomo, Yukina Kitahara, Ryosuke Harakawa, Akihiro Nakamura, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Masahiro Iwahashi

2023 IEEE International Conference on Visual Communications and Image Processing (VCIP) 2023年12月4日
A water-mediated hydrogen-bond network facilitates an exceptionally strong preference for asparagine in the S2 subsite of dipeptidyl peptidase 7 from Stenotrophomonas maltophilia

Yasumitsu Sakamoto, Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Saori Roppongi, Chisato Kushibiki, Natsuri Yonezawa, Masato Takahashi, Yosuke Shida, Hiroaki Gouda, Takamasa Nonaka …

Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances 79(a2) C672-C672 2023年8月22日
Ultrahigh-throughput screening of Trichoderma reesei strains capable of carbon catabolite repression release and cellulase hyperproduction using a microfluidic droplet platform

Xuan Chinh Luu, Yosuke Shida, Yoshiyuki Suzuki, Daiki Kuwahara, Takeshi Fujimoto, Yuka Takahashi, Naomi Sato, Akihiro Nakamura, Wataru Ogasawara

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2023年8月8日
A microfluidic device for simultaneous detection of enzyme secretion and elongation of a single hypha

Ayaka Itani, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara

Frontiers in Microbiology 14 2023年3月3日
The monitoring of oil production process by deep learning based on morphology in oleaginous yeasts

Yukina Kitahara, Ayaka Itani, Kazuma Ohtomo, Yosuke Oda, Yuka Takahashi, Makoto Okamura, Mizue Mizoshiri, Yosuke Shida, Toru Nakamura, Ryosuke Harakawa …

Applied Microbiology and Biotechnology 107(2-3) 915-929 2023年2月
LsSpt23p is a regulator of triacylglycerol synthesis in the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi

Hiroaki Takaku, Haruka Kazama, Rikako Sato, Kazuki Mori, Satoshi Ara, Koji Ishiya, Tomohiko Matsuzawa, Katsuro Yaoi, Hideo Araki, Yosuke Shida …

Applied Microbiology and Biotechnology 107(4) 1269-1284 2023年1月17日査読有り
Computational approaches for smart cell creation in the bioeconomy era

Sachiyo Aburatani, Koji Ishiya, Tomokazu Shirai, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Hiroaki Takaku, Tomohiro Tamura

Genomics and the Global Bioeconomy 59-82 2023年
A novel high-throughput approach for transforming filamentous fungi employing a droplet-based microfluidic platform

Xuan Chinh Luu, Yosuke Shida, Yoshiyuki Suzuki, Naomi Sato, Akihiro Nakamura, Wataru Ogasawara

New Biotechnology 72 149-158 2022年12月査読有り
Using gel microdroplets to develop a simple high-throughput screening platform for oleaginous microorganisms

Yuma Tanaka, Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Kodai Maruta, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara

Journal of Biotechnology 358 46-54 2022年11月
A real-time monitoring system for automatic morphology analysis of yeast cultivation in a jar fermenter

Yukina Kitahara, Ayaka Itani, Yosuke Oda, Makoto Okamura, Mizue Mizoshiri, Yosuke Shida, Toru Nakamura, Ken Kasahara, Wataru Ogasawara

Applied Microbiology and Biotechnology 106(12) 4683-4693 2022年6月
Effect of Proteins and Polysaccharides on the Adsorption of Cellulose Fibers in <i>Geotrichum</i> sp. M111-M3

Isana Makabe, Natsumi Sasamoto, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Masayuki Takeguchi

KAGAKU KOGAKU RONBUNSHU 48(3) 104-108 2022年5月20日
7-Aminocoumarin-4-acetic Acid as a Fluorescent Probe for Detecting Bacterial Dipeptidyl Peptidase Activities in Water-in-Oil Droplets and in Bulk

Akihiro Nakamura, Nobuyuki Honma, Yuma Tanaka, Yoshiyuki Suzuki, Yosuke Shida, Yuko Tsuda, Koushi Hidaka, Wataru Ogasawara

Analytical Chemistry 94(5) 2416-2424 2022年2月8日査読有り
Disruption of alpha-tubulin releases carbon catabolite repression and enhances enzyme production in Trichoderma reesei even in the presence of glucose

Nozomu Shibata, Hiroshi Kakeshita, Kazuaki Igarashi, Yasushi Takimura, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Tohru Koda, Tomohisa Hasunuma, Akihiko Kondo

Biotechnology for Biofuels 14(1) 39-39 2021年12月
Analysis of the light regulatory mechanism in carotenoid production in Rhodosporidium toruloides NBRC 10032.

Khanh Dung Pham, Yuuki Hakozaki, Takeru Takamizawa, Atsushi Yamazaki, Harutake Yamazaki, Kazuki Mori, Sachiyo Aburatani, Kosuke Tashiro, Satoru Kuhara, Hiroaki Takaku …

Bioscience, biotechnology, and biochemistry 85(8) 1899-1909 2021年7月23日
Isolation and characterization of Lipomyces starkeyi mutants with greatly increased lipid productivity following UV irradiation.

Hiroaki Takaku, Sayaka Ebina, Kotoha Kasuga, Rikako Sato, Satoshi Ara, Haruka Kazama, Tomohiko Matsuzawa, Katsuro Yaoi, Hideo Araki, Yosuke Shida …

Journal of bioscience and bioengineering 131(6) 613-621 2021年6月

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MISC

ドロップレットスクリーニングを用いたタンパク質分解活性に基づく環境微生物の探索

中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 佐藤里佳子, 高久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2025 2025年
ドロップレットスクリーニング法を用いた新規油脂生産微生物の取得に向けた基盤技術の開発

橘駿介, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2025 2025年
Pseudoxanthomonas mexicana WO24株のオリゴペプチド取り込み機構の解明に向けた変異株取得方法の確立

片岡敬太, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2025 2025年
培養時に変化する油脂生産酵母Lipomyces starkeyiの脂肪球形態と可視化法

高橋優花, 志田洋介, 中村彰宏, 佐藤里佳子, 高久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2025 2025年
変異育種によるRhodosporidium toruloidesの油脂高生産株の取得

福光春那, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 佐藤里佳子, 高久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2025 2025年
糸状菌Trichoderma reeseiにおけるトランセプターCRT1の変異がセルラーゼ誘導に与える影響

五十嵐薫, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2025 2025年
Aspergillus oryzaeによる固体基質を用いたドロップレットスクリーニング系の開発

岸田悠佑, 中村彰宏, 志田洋介, 小笠原渉

日本生物工学会大会講演要旨集 77th 2025年
環境試料中からのリパーゼ/エステラーゼ活性を指標としたドロップレットスクリーニング

海野蒼生, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本生物工学会大会講演要旨集 77th 2025年
デンプン資化性油脂酵母における米からの油脂の発酵生産

海津有哉, 佐藤里佳子, 中村彰宏, 志田洋介, 小笠原渉, 山崎晴丈, 高久洋暁

日本生物工学会大会講演要旨集 77th 2025年
Trichoderma reeseiにおけるBGLIIの生理学的役割

中村彩奈, 高橋真智子, 松沢智彦, 志田洋介, 矢追克郎, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2016 2016年
3P-176 セルロース系食品廃棄物を用いた糸状菌Trichoderma reeseiの酵素生産(バイオマス,資源,エネルギー工学,一般講演)—3P-176 Utilization of cellulosic waste for enzyme production of filamentous fungus Trichoderma reesei.

小笠原,渉, 志田,洋介

日本生物工学会大会講演要旨集 66 238 2014年8月5日

書籍等出版物

NEDOスマートセルプロジェクト複数遺伝子同時発現制御技術の開発糸状菌を用いた有用タンパク質同時生産制御技術の開発

小笠原渉, 志田洋介, 油谷幸代

2020年
微生物によるキノコ廃菌床からの化学工業原料生産システム開発の現状と将来

高久洋暁, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉

環境技術学会 2016年5月査読有り

講演・口頭発表等

Pseudoxanthomonas mexicana WO24株のオリゴペプチド取り込み機構の解明に向けた変異株取得方法の確立

片岡敬太, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会2025年度大会 2025年3月7日
ドロップレットスクリーニング法を用いた新規油脂生産微生物の取得に向けた基盤技術の開発

橘駿介, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会2025年度大会 2025年3月7日
ドロップレットスクリーニングを用いたタンパク質分解活性に基づく環境微生物の探索

中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 佐藤里佳子, 髙久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会2025年度大会 2025年3月7日
培養時に変化する油脂生産酵母Lipomyces starkeyiの脂肪球形態と可視化法

高橋優花, 志田洋介, 中村彰宏, 佐藤里佳子, 高久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会2025年度大会 2025年3月6日
糸状菌Trichoderma reeseiにおけるトランセプターCRT1の変異がセルラーゼ誘導に与える影響

五十嵐薫, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会2025年度大会 2025年3月6日
変異育種によるRhodosporidium toruloidesの油脂高生産株の取得

福光春那、中村彰宏、鈴木義之、志田洋介、佐藤里佳子、高久洋暁、小笠原渉

日本農芸化学会2025年度大会 2025年3月5日
Trichoderma reesei strain breeding by Micro-droplet screening

Yosuke Shida, Nguyen Huyen Anh, Wataru Ogasawara

17th European Conference on Fungal Genetics 2025年3月4日
繊維凝集性糸状菌 Geotrichum sp. M111 のセルロース凝集メカニズムの解析

宮城彰冶、志田洋介、小笠原渉

第23回⽷状菌分⼦⽣物学コンファレンス 2024年11月3日
Trichoderma reesei におけるトランセプターCRT1 によるセルラーゼ誘導機構の解析

五十嵐薫, 北原雪菜, 志田洋介, 小笠原渉

第23回⽷状菌分⼦⽣物学コンファレンス 2024年11月3日
ゲルマイクロドロップレットを用いた油糧微生物の超高効率な変異育種法の開発

中村彰宏, 田中裕真, 鈴木義之, 丸田航大, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月27日
油脂生産酵母 Lipomyces starkeyi における生育・油脂生産に関与する因子の解析

司東来珠, 丸田航大, 田中裕真, 中村彰宏, 鈴木義之, 森一樹, 佐藤里佳子, 田代康介, 志田洋介, 高久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月27日
ドロップレットスクリーニングにおける蛍光物質拡散の抑制

村山祐樹, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
酸性ゲルマイクロドロップレットを活用した環境中からのハイスループットな油脂酵母スクリーニング法の開発

橘駿介, 若月良子, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉, 赤澤真一

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
油脂生産酵母Lipomyces starkeyiにおける脂肪球動態解析に向けた蛍光染色検討

高橋優花, 志田洋介, 中村彰宏, 佐藤里佳子, 仁子陽輔, 高久暁洋, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
デンプン資化性油脂酵母Lipomyces starkeyiにおける研米粉からの油脂の発酵生産

海津有哉, 佐藤里佳子, 中村彰宏, 志田洋介, 小笠原渉, 山崎晴丈, 高久洋暁

日本生物工学会大会講演要旨集 2024年
Trichoderma reeseiにおける窒素制御とセルラーゼ生産の関係

藤本健志, 平沢大樹, 志田洋介, 小笠原渉

糸状菌分子生物学コンファレンス(Web) 2023年
油脂酵母の多焦点画像に生じる明度変化を活用した領域抽出に関する検討

植田聖也, 高橋優花, 原川良介, 中村彰宏, 志田洋介, 小笠原渉, 岩橋政宏

映像情報メディア学会技術報告(Web) 2023年
油脂酵母Lipomyces starkeyi油脂生産関連因子Snf1pの同定と油脂合成経路へ及ぼす効果

佐藤里佳子, 渡部凌, 藤井佑弥, 志田洋介, 小笠原渉, 石谷孔司, 油谷幸代, 荒学志, 山崎晴丈, 高久洋暁

日本生物工学会大会講演要旨集 2023年
油脂酵母Lipomyces starkeyi変異株のゲノム比較解析による新規油脂生産関連遺伝子の同定

佐藤里佳子, 森一樹, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 田代康介, 石谷孔司, 油谷幸代, 高久洋暁

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2022年
多剤耐性菌Stenotrophomonas maltophilia DPP7に対する抗菌薬開発に向けた阻害剤開発の構造基盤

阪本泰光, 中村彰宏, 鈴木義之, 六本木沙織, 櫛引千里, 米澤夏里, 高橋聖人, 志田洋介, 合田浩明, 野中孝昌, 田中信忠, 小笠原渉

日本薬学会年会要旨集(Web) 2022年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

資源危機を防ぐ微生物培養モニタリングシステムのための新奇バイオデータ解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2025年6月 - 2029年3月

岩橋政宏, 原川良介, 中村彰宏, 志田洋介
糸状菌を用いた食品廃棄物のトータル利用プロセス開発

科学技術振興機構産学が連携した研究開発成果の展開/研究成果展開事業/研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP)/探索タイプ 2013年 - 2013年

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