志田洋介 (Yosuke Shida) - マイポータル

基本情報

所属: 長岡技術科学大学技学研究院准教授

J-GLOBAL ID: 201801001022515920
researchmap会員ID: 7000022315

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研究分野

ものづくり技術（機械・電気電子・化学工学） / バイオ機能応用、バイオプロセス工学 /

論文

Identification and characterization of the suppressed lipid accumulation-related gene, SLA1, in the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi

Rikako Sato, Harutake Yamazaki, Kazuki Mori, Sachiyo Aburatani, Koji Ishiya, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Kosuke Tashiro, Satoru Kuhara, Hiroaki Takaku

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2024年7月31日
Classification of Oleaginous Yeast Images Based on Mixture of Experts with Micro-Spatial Attention

Soma Nagatsu, Ryosuke Harakawa, Akihiro Nakamura, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Masahiro Iwahashi

GCCE 2024 - 2024 IEEE 13th Global Conference on Consumer Electronics 172-173 2024年
Micro-Spatial Attention with Sparse Constraint for Self-Supervised Learning for Oleaginous Yeast Image Representation

Kazuma Ohtomo, Yukina Kitahara, Ryosuke Harakawa, Akihiro Nakamura, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Masahiro Iwahashi

2023 IEEE International Conference on Visual Communications and Image Processing (VCIP) 2023年12月4日
Ultrahigh-throughput screening of Trichoderma reesei strains capable of carbon catabolite repression release and cellulase hyperproduction using a microfluidic droplet platform

Xuan Chinh Luu, Yosuke Shida, Yoshiyuki Suzuki, Daiki Kuwahara, Takeshi Fujimoto, Yuka Takahashi, Naomi Sato, Akihiro Nakamura, Wataru Ogasawara

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2023年8月8日
A microfluidic device for simultaneous detection of enzyme secretion and elongation of a single hypha

Ayaka Itani, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara

Frontiers in Microbiology 14 2023年3月3日
The monitoring of oil production process by deep learning based on morphology in oleaginous yeasts

Yukina Kitahara, Ayaka Itani, Kazuma Ohtomo, Yosuke Oda, Yuka Takahashi, Makoto Okamura, Mizue Mizoshiri, Yosuke Shida, Toru Nakamura, Ryosuke Harakawa …

Applied Microbiology and Biotechnology 107(2-3) 915-929 2023年2月
LsSpt23p is a regulator of triacylglycerol synthesis in the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi

Hiroaki Takaku, Haruka Kazama, Rikako Sato, Kazuki Mori, Satoshi Ara, Koji Ishiya, Tomohiko Matsuzawa, Katsuro Yaoi, Hideo Araki, Yosuke Shida …

Applied Microbiology and Biotechnology 107(4) 1269-1284 2023年1月17日査読有り
A novel high-throughput approach for transforming filamentous fungi employing a droplet-based microfluidic platform

Xuan Chinh Luu, Yosuke Shida, Yoshiyuki Suzuki, Naomi Sato, Akihiro Nakamura, Wataru Ogasawara

New Biotechnology 72 149-158 2022年12月査読有り
Using gel microdroplets to develop a simple high-throughput screening platform for oleaginous microorganisms

Yuma Tanaka, Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Kodai Maruta, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara

Journal of Biotechnology 358 46-54 2022年11月
A real-time monitoring system for automatic morphology analysis of yeast cultivation in a jar fermenter

Yukina Kitahara, Ayaka Itani, Yosuke Oda, Makoto Okamura, Mizue Mizoshiri, Yosuke Shida, Toru Nakamura, Ken Kasahara, Wataru Ogasawara

Applied Microbiology and Biotechnology 106(12) 4683-4693 2022年6月
Effect of Proteins and Polysaccharides on the Adsorption of Cellulose Fibers in <i>Geotrichum</i> sp. M111-M3

Isana Makabe, Natsumi Sasamoto, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Masayuki Takeguchi

KAGAKU KOGAKU RONBUNSHU 48(3) 104-108 2022年5月20日
7-Aminocoumarin-4-acetic Acid as a Fluorescent Probe for Detecting Bacterial Dipeptidyl Peptidase Activities in Water-in-Oil Droplets and in Bulk

Akihiro Nakamura, Nobuyuki Honma, Yuma Tanaka, Yoshiyuki Suzuki, Yosuke Shida, Yuko Tsuda, Koushi Hidaka, Wataru Ogasawara

Analytical Chemistry 94(5) 2416-2424 2022年2月8日査読有り
Disruption of alpha-tubulin releases carbon catabolite repression and enhances enzyme production in Trichoderma reesei even in the presence of glucose

Nozomu Shibata, Hiroshi Kakeshita, Kazuaki Igarashi, Yasushi Takimura, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Tohru Koda, Tomohisa Hasunuma, Akihiko Kondo

Biotechnology for Biofuels 14(1) 39-39 2021年12月
Analysis of the light regulatory mechanism in carotenoid production in Rhodosporidium toruloides NBRC 10032.

Khanh Dung Pham, Yuuki Hakozaki, Takeru Takamizawa, Atsushi Yamazaki, Harutake Yamazaki, Kazuki Mori, Sachiyo Aburatani, Kosuke Tashiro, Satoru Kuhara, Hiroaki Takaku …

Bioscience, biotechnology, and biochemistry 85(8) 1899-1909 2021年7月23日
Isolation and characterization of Lipomyces starkeyi mutants with greatly increased lipid productivity following UV irradiation.

Hiroaki Takaku, Sayaka Ebina, Kotoha Kasuga, Rikako Sato, Satoshi Ara, Haruka Kazama, Tomohiko Matsuzawa, Katsuro Yaoi, Hideo Araki, Yosuke Shida …

Journal of bioscience and bioengineering 131(6) 613-621 2021年6月
Structural basis for an exceptionally strong preference for asparagine residue at the S2 subsite of Stenotrophomonas maltophilia dipeptidyl peptidase 7.

Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Yasumitsu Sakamoto, Saori Roppongi, Chisato Kushibiki, Natsuri Yonezawa, Masato Takahashi, Yosuke Shida, Hiroaki Gouda, Takamasa Nonaka …

Scientific reports 11(1) 7929-7929 2021年4月12日
Functional analysis of a novel lytic polysaccharide monooxygenase from Streptomyces griseus on cellulose and chitin

Kazuki Sato, Daisuke Chiba, Sayaka Yoshida, Mayu Takahashi, Kazuhide Totani, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Yuko S. Nakagawa

International Journal of Biological Macromolecules 164 2085-2091 2020年12月1日
Functional analysis of a novel lytic polysaccharide monooxygenase from Streptomyces griseus on cellulose and chitin

Kazuki Sato, Daisuke Chiba, Sayaka Yoshida, Mayu Takahashi, Kazuhide Totani, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Yuko S. Nakagawa

INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES 164 2085-2091 2020年12月
Functional analysis of a novel lytic polysaccharide monooxygenase from Streptomyces griseus on cellulose and chitin.

Kazuki Sato, Daisuke Chiba, Sayaka Yoshida, Mayu Takahashi, Kazuhide Totani, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Yuko S Nakagawa

International journal of biological macromolecules 164 2085-2091 2020年12月1日
Involvement of Xyr1 and Are1 for Trichodermapepsin Gene Expression in Response to Cellulose and Galactose in Trichoderma reesei.

Nayani Dhanushka Daranagama, Yoshiyuki Suzuki, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara

Current microbiology 77(8) 1506-1517 2020年8月

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MISC

油脂酵母Lipomyces starkeyi油脂生産関連因子Snf1pの同定と油脂合成経路へ及ぼす効果

佐藤里佳子, 渡部凌, 藤井佑弥, 志田洋介, 小笠原渉, 石谷孔司, 油谷幸代, 荒学志, 山崎晴丈, 高久洋暁

日本生物工学会大会講演要旨集 75th 2023年
油脂酵母Lipomyces starkeyi変異株のゲノム比較解析による新規油脂生産関連遺伝子の同定

佐藤里佳子, 森一樹, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 田代康介, 石谷孔司 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2022 2022年
油脂酵母ATP-クエン酸リアーゼの生育と油脂生産への影響

佐藤里佳子, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 石谷孔司, 油谷幸代, 高久洋暁

日本生物工学会大会講演要旨集 73rd 2021年
NEDOスマートセルプロジェクト複数遺伝子同時発現制御技術の開発糸状菌を用いた有用タンパク質同時生産制御技術の開発

小笠原渉, 志田洋介, 油谷幸代

バイオサイエンスとインダストリー 78(5) 2020年
糸状菌Trichoderma reeseiのβ-グルコシダーゼ1高発現によるセルラーゼの改良

阿部倫代, 塩屋幸樹, 中澤光, 河合哲志, 井田紀子, 志田洋介, 小林良則, 岡田宏文, 谷修治, 炭谷順一 …

日本農芸化学会関東支部講演要旨集 2012(Oct) 2012年

書籍等出版物

微生物によるキノコ廃菌床からの化学工業原料生産システム開発の現状と将来

高久洋暁, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉

環境技術学会 2016年5月査読有り

講演・口頭発表等

ゲルマイクロドロップレットを用いた油糧微生物の超高効率な変異育種法の開発

中村彰宏, 田中裕真, 鈴木義之, 丸田航大, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月27日
油脂生産酵母 Lipomyces starkeyi における生育・油脂生産に関与する因子の解析

司東来珠, 丸田航大, 田中裕真, 中村彰宏, 鈴木義之, 森一樹, 佐藤里佳子, 田代康介, 志田洋介, 高久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月27日
ドロップレットスクリーニングにおける蛍光物質拡散の抑制

村山祐樹, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
酸性ゲルマイクロドロップレットを活用した環境中からのハイスループットな油脂酵母スクリーニング法の開発

橘駿介, 若月良子, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉, 赤澤真一

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
油脂生産酵母Lipomyces starkeyiにおける脂肪球動態解析に向けた蛍光染色検討

高橋優花, 志田洋介, 中村彰宏, 佐藤里佳子, 仁子陽輔, 高久暁洋, 小笠原渉

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月25日
多剤耐性菌Stenotrophomonas maltophilia DPP7に対する抗菌薬開発に向けた阻害剤開発の構造基盤

阪本泰光, 中村彰宏, 鈴木義之, 六本木沙織, 櫛引千里, 米澤夏里, 高橋聖人, 志田洋介, 合田浩明, 野中孝昌, 田中信忠, 小笠原渉

日本薬学会年会要旨集(Web) 2022年
病原性細菌由来ジペプチジルペプチダーゼのS2サブサイト特異性の構造的基盤

中村彰宏, 阪本泰光, 鈴木義之, 六本木沙織, 志田洋介, 田中信忠, 小笠原渉

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 2022年
病原性細菌由来Dipeptidyl peptidaseの基質P2残基の嗜好性と認識機構の分子基盤

中村彰宏, 阪本泰光, 鈴木義之, 六本木沙織, 志田洋介, 田中信忠, 田中信忠, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2021年
エマルション培養法を用いたペプチダーゼ生産微生物のスクリーニング

橋口太一, 本間宣行, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
抗菌薬開発に資するPorphyromonas gingivalis由来Dipeptidyl peptidase11の構造解析と阻害化合物探索

中村彰宏, 阪本泰光, 鈴木義之, 鈴木義之, 渡邉友里江, 關谷瑞樹, 六本木沙織, 櫛引千里, 飯塚一平, 谷修, 阪下日登志, 伊中浩治, 田仲広明, 山田貢, 大田和敬, 本間宣行, 志田洋介, 中西真弓, 野中孝昌, 合田浩明, 田中信忠, 田中信忠, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
マーカーリサイクル法を用いたRhodosporidium toruloides二倍体株におけるKU70破壊株の作出

筥崎悠貴, 高見沢健留, 志田洋介, 森一樹, 田代康介, 油谷幸代, 山崎晴丈, 高久洋暁, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
比較ゲノム解析による油脂酵母Lipomyces starkeyiの新規油脂蓄積制御因子の同定とその機能解析

風間春香, 森一樹, 油谷幸代, 油谷幸代, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 田代康介, 高久洋暁

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
フラックスバランス解析を活用した油脂酵母の油脂生産性の改良

寺澤大輝, 白井智量, 松田史夫, 油谷幸代, 油谷幸代, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 高久洋暁

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
比較ゲノム解析による油脂酵母Lipomyces starkeyiの油脂低蓄積原因遺伝子の同定

佐藤里佳子, 山田日向子, 森一樹, 油谷幸代, 油谷幸代, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 田代康介, 高久洋暁

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
油脂酵母Lipomyces starkeyiのトリアシルグリセロール分解酵素の機能解析

山本大雅, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 高久洋暁

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
情報科学を活用した油脂酵母Lipomyces starkeyiの新規油脂生産制御因子の獲得

庭山ひかる, 油谷幸代, 油谷幸代, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 荒木秀雄, 高久洋暁

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020年
Water-in-Oil DropLet(WODL)を用いたペプチダーゼ高生産微生物のスクリーニングと菌叢解析

本間宣行, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 小笠原渉

日本微生物生態学会大会(Web) 2019年
Water-in-Oil Droplet(WODL)の捕捉と観察に向けたマイクロ流路チップの開発

田中裕真, 南木創, 本間宣行, 中村彰宏, 鈴木義之, 志田洋介, 溝尻瑞枝, 野田尚宏, 栗田僚二, 小笠原渉

化学とマイクロ・ナノシステム学会研究会講演要旨集 2019年
糸状菌Trichoderma reeseiにおける分泌プロテアーゼの発現制御機構の解析

鈴木義之, DARANAGAMA Nayani, 志田洋介, 森一樹, 油谷幸代, 小笠原渉

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019年
油脂酵母Lipomyces starkeyi油脂低蓄積変異株の原因遺伝子の同定と解析

酒井里佳子, 阿部紗也, 荒学志, 山崎晴丈, 志田洋介, 小笠原渉, 矢追克郎, 森一樹, 油谷幸代, 荒木秀雄, 田代康介, 高久洋暁

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019年

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