田中良樹 (Yoshiki Tanaka) - マイポータル

基本情報

所属: アグロデザイン・スタジオ研究開発部

学位: 博士（理学）(東京大学)

J-GLOBAL ID: 201801002186816081
researchmap会員ID: B000302639

外部リンク: http://bsw3.naist.jp/tsukazaki/member_tanaka.html

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

論文

Structural basis of a <scp>GatC</scp> ortholog transporter in the bacterial phosphotransferase system

Yutaro S. Takahashi, Hidetaka Kohga, Min Fey Chek, Kotomi Yamamoto, Jun F. Takahashi, Hideki Shigematsu, Yoshiki Tanaka, Muneyoshi Ichikawa, Ryoji Miyazaki, Toshio Hakoshima …

FEBS Letters 2025年8月5日
YeeD is an essential partner for YeeE-mediated thiosulfate uptake in bacteria and regulates thiosulfate ion decomposition

Mai Ikei, Ryoji Miyazaki, Keigo Monden, Yusuke Naito, Azusa Takeuchi, Yutaro S. Takahashi, Yoshiki Tanaka, Keina Murata, Takaharu Mori, Muneyoshi Ichikawa …

PLOS Biology 22(40) e3002601 2024年4月24日査読有り
Structure and function of a YeeE-YeeD complex for sophisticated thiosulfate uptake

Mai Ikei, Ryoji Miyazaki, Keigo Monden, Yusuke Naito, Azusa Takeuchi, Yutaro S. Takahashi, Yoshiki Tanaka, Takaharu Mori, Muneyoshi Ichikawa, Tomoya Tsukazaki

2023年7月29日
Crystal structure of the lipid flippase MurJ in a "squeezed" form distinct from its inward- and outward-facing forms.

Hidetaka Kohga, Takaharu Mori, Yoshiki Tanaka, Kunihito Yoshikaie, Katsuhide Taniguchi, Kei Fujimoto, Lisa Fritz, Tanja Schneider, Tomoya Tsukazaki

Structure (London, England : 1993) 2022年5月23日
Crystal structures of a nicotine MATE transporter provide insight into its mechanism of substrate transport.

Yoshiki Tanaka, Shigehiro Iwaki, Akira Sasaki, Tomoya Tsukazaki

FEBS letters 595(14) 1902-1913 2021年7月
Reversible autoinhibitory regulation ofEscherichia colimetallopeptidase BepA for selective β-barrel protein degradation

Yasushi Daimon, Shin-ichiro Narita, Ryoji Miyazaki, Yohei Hizukuri, Hiroyuki Mori, Yoshiki Tanaka, Tomoya Tsukazaki, Yoshinori Akiyama

Proceedings of the National Academy of Sciences 117(45) 27989-27996 2020年11月10日
Crystal structure of a YeeE/YedE family protein engaged in thiosulfate uptake

Yoshiki Tanaka, Kunihito Yoshikaie, Azusa Takeuchi, Muneyoshi Ichikawa, Tomoyuki Mori, Sayaka Uchino, Yasunori Sugano, Toshio Hakoshima, Hiroshi Takagi, Gen Nonaka …

Science Advances 6(35) eaba7637-eaba7637 2020年8月
Author Correction: Structural basis for the drug extrusion mechanism by a MATE multidrug transporter.

Yoshiki Tanaka, Christopher J Hipolito, Andrés D Maturana, Koichi Ito, Teruo Kuroda, Takashi Higuchi, Takayuki Katoh, Hideaki E Kato, Motoyuki Hattori, Kaoru Kumazaki …

Nature 578(7794) E19 2020年2月査読有り
A snapshot of membrane protein insertion.

Tanaka Y, Tsukazaki T

EMBO reports e49034 2019年9月査読有り
Structural Basis of Sarco/Endoplasmic Reticulum Ca2+-ATPase 2b Regulation via Transmembrane Helix Interplay

Michio Inoue, Nanami Sakuta, Satoshi Watanabe, Yuxia Zhang, Kunihito Yoshikaie, Yoshiki Tanaka, Ryo Ushioda, Yukinari Kato, Junichi Takagi, Tomoya Tsukazaki …

Cell Reports 27(4) 1221-1230.e3 2019年4月
Structural Basis for the Function of the β-Barrel Assembly-Enhancing Protease BepA.

Shahrizal M, Daimon Y, Tanaka Y, Hayashi Y, Nakayama S, Iwaki S, Narita SI, Kamikubo H, Akiyama Y, Tsukazaki T

Journal of molecular biology 2018年12月査読有り
Structural Basis of H⁺-Dependent Conformational Change in a Bacterial MATE Transporter.

Kusakizako T, Claxton DP, Tanaka Y, Maturana AD, Kuroda T, Ishitani R, Mchaourab HS, Nureki O

Structure (London, England : 1993) 27(2) 293-301 2018年10月査読有り
2.8-Å crystal structure of Escherichia coli YidC revealing all core regions, including flexible C2 loop.

Tanaka Y, Izumioka A, Abdul Hamid A, Fujii A, Haruyama T, Furukawa A, Tsukazaki T

Biochemical and biophysical research communications 505(1) 141-145 2018年10月査読有り
Single-Unit Imaging of Membrane Protein-Embedded Nanodiscs from Two Oriented Sides by High-Speed Atomic Force Microscopy.

Haruyama T, Sugano Y, Kodera N, Uchihashi T, Ando T, Tanaka Y, Konno H, Tsukazaki T

Structure (London, England : 1993) 2018年10月査読有り
Remote Coupled Drastic β-Barrel to β-Sheet Transition of the Protein Translocation Motor.

Furukawa A, Nakayama S, Yoshikaie K, Tanaka Y, Tsukazaki T

Structure (London, England : 1993) 26(3) 485-489.e2 2018年3月6日査読有り
Crystallographic Analysis of MATE-Type Multidrug Exporter with Its Inhibitors.

Tsukasa Kusakizako, Yoshiki Tanaka, Christopher J Hipolito, Hiroaki Suga, Osamu Nureki

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 1700 37-57 2018年査読有り
The TPR domain of BepA is required for productive interaction with substrate proteins and the β-barrel assembly machinery complex.

Daimon Y, Iwama-Masui C, Tanaka Y, Shiota T, Suzuki T, Miyazaki R, Sakurada H, Lithgow T, Dohmae N, Mori H …

Molecular microbiology 106(5) 760-776 2017年12月査読有り
Crystal Structure of a Plant Multidrug and Toxic Compound Extrusion Family Protein

Yoshiki Tanaka, Shigehiro Iwaki, Tomoya Tsukazaki

STRUCTURE 25(9) 1455-+ 2017年9月査読有り
Structural insights into ligand recognition by the lysophosphatidic acid receptor LPA(6)

Reiya Taniguchi, Asuka Inoue, Misa Sayama, Akiharu Uwamizu, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Masahito Yoshida, Yoshiki Tanaka, Hideaki E. Kato, Yoshiko Nakada-Nakura …

NATURE 548(7667) 356-+ 2017年8月査読有り
SecY-SecA fusion protein retains the ability to mediate protein transport

Yasunori Sugano, Arata Furukawa, Osamu Nureki, Yoshiki Tanaka, Tomoya Tsukazaki

PLOS ONE 12(8) e0183434 2017年8月査読有り

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MISC

多剤排出輸送体MATEの構造および機能解析

田中良樹, 草木迫司

ファルマシア(Web) 56(6) 2020年
細菌由来の新奇チオ硫酸イオン輸送体YeeEの構造機能解析

竹内梓, 田中良樹, 吉海江国仁, 市川宗厳, 森智行, 内野清香, 菅野泰功, 箱嶋敏雄, 高木博史, 野中源 …

トランスポーター研究会年会抄録集 15th 2020年
大腸菌表層ストレス応答:インプットとアウトプットに働くプロテアーゼの機能

秋山芳展, 秋山光市郎, 岩間(舛井)千草, 大門康志, 檜作洋平, 水野慎也, 宮崎亮次, 森博幸, 禾晃和, 塩田拓也 …

Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications (33) 2019年
新奇硫黄系トランスポーターの構造と機能

竹内梓, 田中良樹, 吉海江国仁, 内野清香, 高木博史, 塚崎智也

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
結晶構造解析から明らかとなってきたタンパク質膜透過モーターSecDFの劇的な構造変化

古川新, 中山慎太郎, 吉海江国仁, 田中良樹, 塚崎智也

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 18th 124 2018年5月23日
プロトン駆動型タンパク質膜透過モーターの可溶性ドメインにおける大きな構造変化

田中良樹, 吉海江国仁, 塚崎智也

トランスポーター研究会年会抄録集 13th 2018年
MATEトランスポーターの結晶構造解析

岩木薫大, 田中良樹, 塚崎智也

日本植物生理学会年会(Web) 59th ROMBUNNO.P.161 2018年
植物MATEトランスポーターの結晶構造解析

岩木薫大, 田中良樹, 塚崎智也

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.1P‐0057 (WEB ONLY) 2018年
大腸菌YidCの2.8Å分解能の結晶構造は,すべての細胞質ループを明らかとした

泉岡祥也, 田中良樹, 塚崎智也

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.1P‐0054 (WEB ONLY) 2018年
イオン駆動型の蛋白質膜透過モーター膜蛋白質の構造解析

古川新, 吉海江国仁, 森貴治, 森博幸, 森本雄祐, 菅野泰功, 岩木薫大, 南野徹, 杉田有治, 田中良樹 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 115 2017年5月22日
大腸菌のペリプラズムプロテアーゼBepAは,TPR domainを介したタンパク質間相互作用により外膜機能を維持する

大門康志, 舛井千草, 宮崎亮次, 櫻田洋人, 田中良樹, 鈴木健裕, 堂前直, 森博幸, 塚崎智也, 成田新一郎 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2017 ROMBUNNO.3C20p12 (WEB ONLY) 2017年3月5日
構造解析から明らかにされる細菌タンパク質機能膜輸送装置の構造と機能(Function of bacterial proteins revealed by the structural analysis Structure and function of the proton-driven protein translocation motor)

田中良樹, 古川新, 森貴治, 森博幸, 森本雄祐, 菅野泰功, 岩木薫大, 南野徹, 杉田有治, 塚崎智也

日本細菌学雑誌 72(1) 39-39 2017年2月
プロトン駆動型タンパク質膜透過モーターの驚くべき構造変化

中山慎太郎, 古川新, 吉海江国仁, 田中良樹, 塚崎智也

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.2P‐0087 (WEB ONLY) 2017年
共生細菌由来MATE様多剤排出トランスポーターの結晶化

谷口勝英, 藤本圭, 田中良樹, 塚崎智也

日本細菌学雑誌(Web) 72(1) 94(J‐STAGE) 2017年
分子シミュレーションによるプロトン駆動モーターSecDFのプロトン透過経路の探索

森貴治, 田中良樹, 吉海江国仁, 塚崎智也, 杉田有治

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 42nd 122‐123 2016年12月16日
次世代研究者による動的構造生命タンパク質膜透過を駆動するモータータンパク質のスナップショット(Dynamic structural biology by next-generation researchers Snapshots of a protein translocation motor)

Furukawa Arata, Yoshikaie Kunihito, Mori Takaharu, Mori Hiroyuki, Morimoto Yusuke, Sugano Yasunori, Iwaki Shigehiro, Minamino Tooru, Sugita Yuji, Tanaka Yoshiki …

生物物理 56(Suppl.1-2) S170-S170 2016年10月
新生鎖を膜透過させるSec蛋白質のX線結晶構造解析

田中良樹, 菅野泰功, 武本瑞貴, 森貴治, 古川新, 吉海江国仁, 草木迫司, 熊崎薫, 鹿島絢子, 石谷隆一郎 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 37 2016年5月19日
Secトランスロコンの1ユニット再構成系の構築と動的探査

菅野泰功, 春山隆充, 田中良樹, 紺野宏記, 塚崎智也

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 45 2016年5月19日
Secタンパク質膜透過装置の活写にむけて

塚崎智也, 春山隆充, 菅野泰功, 田中良樹, 紺野宏記

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 14th 5 2014年5月26日
膜タンパク質YidCによるタンパク質膜組み込み機構の構造基盤

熊崎薫, 千葉志信, 武本瑞貴, 古川新, 菅野泰功, 森貴治, 田中良樹, 杉田有治, 伊藤維昭, 石谷隆一郎 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 14th 85 2014年5月26日

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共同研究・競争的資金等の研究課題

植物の環境ストレス耐性に関わる金属イオントランスポーターの構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2021年3月

田中良樹
新生膜タンパク質の膜組込み過程の構造生物科学研究

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

田中良樹
タンパク質分泌システムの活写

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

塚崎智也, 田中良樹
１分子解析によるプロトン駆動型輸送モーターの動態探査

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

塚崎智也, 田中良樹, 古川新, 菅野泰功
新生膜タンパク質の膜組込み過程の構造生物科学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年4月 - 2017年3月

田中良樹
すべての生物に共通する膜タンパク質形成過程の構造生命科学

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

塚崎智也, 田中良樹
金属耐性に関わる輸送体膜タンパク質の構造基盤の解明

日本学術振興会基盤研究(C)(一般) 2015年4月 - 2017年3月

田中良樹
ヒト由来膜輸送体の結晶構造解析への挑戦

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

島村達郎, 野村紀通, 田中良樹, 小笠原諭, 荒川孝俊

産業財産権

特許第6229966号 MATE活性阻害ペプチド

菅裕明, 濡木理, クリストファー, ジェイヒポリト, 田中良樹
特開2014-027904 MATE活性阻害ペプチド

菅裕明, 濡木理, クリストファー, ジェイ, ヒポライト, 田中良樹

田中良樹

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論文

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共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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