奥村英夫 (Hideo Okumura) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人高輝度光科学研究センター回折・散乱推進室研究員

学位: 博士（理学）(名古屋大学)

researchmap会員ID: B000308147

外部リンク: http://stbio.spring8.or.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2025年4月 - 現在

高輝度光科学研究センター, 回折・散乱推進室, 研究員
2022年4月 - 2025年3月

高輝度光科学研究センター, 放射光利用研究基盤センター, 構造生物学推進室, 研究員
2014年4月 - 2022年3月

高輝度光科学研究センター, タンパク質結晶解析推進室, 研究員
2011年4月 - 2014年3月

高輝度光科学研究センター, 利用研究促進部門, 構造生物グループ, 研究員
2010年4月 - 2011年4月

理化学研究所, 基幹研究所長田抗生物質研究室, 基幹研究所研究員
2007年4月 - 2010年3月

理化学研究所, 中央研究所長田抗生物質研究室, 基礎科学特別研究員
2005年7月 - 2007年3月

理化学研究所, 中央研究所長田抗生物質研究室, 協力研究員
2003年4月 - 2005年6月

名古屋大学大学院, 理学研究科, 産学官連携研究員

学歴

1998年4月 - 2003年3月

名古屋大学大学院, 理学研究科, 物質理学専攻
1994年4月 - 1998年3月

名古屋大学, 理学部, 物理学科

論文

Structural and Functional Analyses of Inhibition of Human Dihydroorotate Dehydrogenase by Antiviral Furocoumavirin

Miku Nakahara, Shogo Watanabe, Michio Sato, Hideo Okumura, Makoto Kawatani, Hiroyuki Osada, Kodai Hara, Hiroshi Hashimoto, Kenji Watanabe

Biochemistry 63(10) 1241-1245 2024年5月9日査読有り
The structure of the rat vitamin B12 transporter TC and its complex with glutathionylcobalamin.

Marcel Bokhove, Takashi Kawamura, Hideo Okumura, Sawako Goto, Yoshiaki Kawano, Stefan Werner, Franziska Jarczowski, Victor Klimyuk, Akihiko Saito, Takashi Kumasaka

The Journal of biological chemistry 300(5) 107289-107289 2024年5月査読有り
Single crystal spectroscopy and multiple structures from one crystal (MSOX) define catalysis in copper nitrite reductases.

Samuel L Rose, Seiki Baba, Hideo Okumura, Svetlana V Antonyuk, Daisuke Sasaki, Tobias M Hedison, Muralidharan Shanmugam, Derren J Heyes, Nigel S Scrutton, Takashi Kumasaka …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(30) e2205664119 2022年7月26日査読有り
In situ crystal data-collection and ligand-screening system at SPring-8.

Hideo Okumura, Naoki Sakai, Hironori Murakami, Nobuhiro Mizuno, Yuki Nakamura, Go Ueno, Takuya Masunaga, Takashi Kawamura, Seiki Baba, Kazuya Hasegawa …

Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 78(Pt 6) 241-251 2022年6月1日査読有り
Structures of oxygen dissociation intermediates of 400 kDa V2 hemoglobin provide coarse snapshots of the protein allostery

Nobutaka Numoto, Seiko Onoda, Yoshiaki Kawano, Hideo Okumura, Seiki Baba, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki, Nobutoshi Ito

Biophysics and Physicobiology 19 n/a-n/a 2022年査読有り
Coarse snapshots of oxygen-dissociation intermediates of a giant hemoglobin elucidated by determining the oxygen saturation in individual subunits in the crystalline state.

Nobutaka Numoto, Yoshiaki Kawano, Hideo Okumura, Seiki Baba, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki, Nobutoshi Ito

IUCrJ 8(Pt 6) 954-962 2021年11月1日査読有り
X-ray dose-dependent structural changes of the [2Fe-2S] ferredoxin from Chlamydomonas reinhardtii.

Yusuke Ohnishi, Norifumi Muraki, Daiki Kiyota, Hideo Okumura, Seiki Baba, Yoshiaki Kawano, Takashi Kumasaka, Hideaki Tanaka, Genji Kurisu

Journal of biochemistry 167(6) 549-555 2020年6月1日査読有り
Upgrade of bending magnet MX beamline BL38B1 at SPring-8

Seiki Baba, Nobuhiro Mizuno, Hideo Okumura, Nipawan Nuemket, Kazuya Hasegawa, Yuki Nakamura, Hironori Murakami, Go Ueno, Tomoki Fukui, Takaki Irie …

13TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON SYNCHROTRON RADIATION INSTRUMENTATION (SRI2018) 2054 2019年査読有り
Dimeric structure of the uracil: proton symporter UraA provides mechanistic insights into the SLC4/23/26 transporters

Xinzhe Yu, Guanghui Yang, Chuangye Yan, Javier L. Baylon, Jing Jiang, He Fan, Guifeng Lu, Kazuya Hasegawa, Hideo Okumura, Tingliang Wang …

CELL RESEARCH 27(8) 1020-1033 2017年8月査読有り
SPring-8 BL41XU, a high-flux macromolecular crystallography beamline

Kazuya Hasegawa, Nobutaka Shimizu, Hideo Okumura, Nobuhiro Mizuno, Seiki Baba, Kunio Hirata, Tomoyuki Takeuchi, Hiroshi Yamazaki, Yasunori Senba, Haruhiko Ohashi …

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 20(Pt 6) 910-913 2013年11月査読有り
A Point Mutation in ftmD Blocks the Fumitremorgin Biosynthetic Pathway in Aspergillus fumigatus Strain Af293

Naoki Kato, Hirokazu Suzuki, Hideo Okumura, Shunji Takahashi, Hiroyuki Osada

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 77(5) 1061-1067 2013年5月査読有り
A small-molecule inhibitor shows that pirin regulates migration of melanoma cells

Isao Miyazaki, Siro Simizu, Hideo Okumura, Satoshi Takagi, Hiroyuki Osada

NATURE CHEMICAL BIOLOGY 6(9) 667-673 2010年9月査読有り
Structure-Affinity Relationship Study of Bleomycins and Shble Protein by Use of a Chemical Array

Isao Miyazaki, Hideo Okumura, Siro Simizu, Yoshikazu Takahashi, Naoki Kanoh, Yasuhiko Muraoka, Yoshiaki Nonomura, Hiroyuki Osada

CHEMBIOCHEM 10(5) 845-852 2009年3月査読有り
The identification of an osteoclastogenesis inhibitor through the inhibition of glyoxalase I

Makoto Kawatani, Hideo Okumura, Kaori Honda, Naoki Kanoh, Makoto Muroi, Naoshi Dohmae, Masamichi Takami, Mitsuhiro Kitagawa, Yushi Futamura, Masaya Imoto …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 105(33) 11691-11696 2008年8月査読有り
Crystal structures of archaerhodopsin-1 and-2: Common structural motif in archaeal light-driven proton pumps

N Enamil, K Yoshimura, M Murakami, H Okumura, K Hara, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 358(3) 675-685 2006年5月査読有り
Crystal structures of acid blue and alkaline purple forms of bacteriorhodopsin

H Okumura, M Murakami, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 351(3) 481-495 2005年8月査読有り
Crystal structure of the M intermediate of bacteriorhodopsin: Allosteric structural changes mediated by sliding movement of a transmembrane helix

K Takeda, Y Matsui, N Kamiya, S Adachi, H Okumura, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 341(4) 1023-1037 2004年8月査読有り
Crystal structure of the L intermediate of bacteriorhodopsin: Evidence for vertical translocation of a water molecule during the proton pumping cycle

T Kouyama, T Nishikawa, T Tokuhisa, H Okumura

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 335(2) 531-546 2004年1月査読有り
Specific damage induced by X-ray radiation and structural changes in the primary photoreaction of bacteriorhodopsin

Y Matsui, K Sakai, M Murakami, Y Shiro, S Adachi, H Okumura, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 324(3) 469-481 2002年11月査読有り

MISC

走化性制御系で酸素センサーとして機能するHemATの結晶構造解析

東田怜, 村木則文, 馬場清喜, 奥村英夫, 河野能顕, 青野重利

日本結晶学会年会講演要旨集 2023 2023年
Reveromycin A生合成酵素RevK-RevL複合体モデル構造に基づくRevL変異酵素の解析と相互作用領域の決定

岡村英治, 佐藤(汐崎)裕美, 奥村英夫, 熊坂崇, 長田裕之, 高橋俊二

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2023 2023年
リベロマイシンA生合成に関わる複合酵素の鍵相互作用残基の同定

岡村英治, 佐藤(汐崎)裕美, 奥村英夫, 熊坂崇, 長田裕之, 高橋俊二

日本放線菌学会大会講演要旨集 36th 2022年
超高分解能X線結晶解析により解明された[2Fe-2S]型フェレドキシンの酸化還元に伴う構造変化

OHNISHI Yusuke, TANAKA Hideaki, OKUMURA Hideo, BABA Kiyoki, KAWANO Yoshiaki, KUMASAKA Takashi, TESHIMA Kezo, IKEGAMI Takahisa, IKEGAMI Takahisa, AGO Hideo …

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 100th 2020年
理研構造ゲノムビームラインI&IIの現状

上野剛, 仲村勇樹, 奥村英夫, 伊藤翔, 水野伸宏, 水野伸宏, 引間孝明, 平田邦生, 河野能顕, 村上博則 …

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム(Web) 33rd 2020年
[2Fe2S]クラスターの酸化還元に起因する藍藻由来フェレドキシンの構造変化

OHNISHI Yusuke, TANAKA Hideaki, OKUMURA Hideo, BABA Kiyoki, KAWANO Yoshiaki, KUMASAKA Takashi, TESHIMA Kezo, IKEGAMI Takahisa, KURISU Genji

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 99th 2019年
藍藻由来フェレドキシンの[2Fe-2S]クラスター還元に起因する構造変化の段階的可視化

大西裕介, 田中秀明, 奥村英夫, 馬場清喜, 河野能顕, 熊坂崇, 栗栖源嗣

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム(Web) 32nd 2019年
理研構造ゲノムビームラインI&IIの現状

上野剛, 仲村勇樹, 奥村英夫, 伊藤翔, 水野伸宏, 水野伸宏, 引間孝明, 平田邦生, 河野能顕, 村上博則 …

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム(Web) 32nd 2019年
高分解能の結晶構造解析により解明された還元に起因する藍藻由来フェレドキシンの構造変化

大西裕介, 田中秀明, 奥村英夫, 馬場清喜, 河野能顕, 熊坂崇, 栗栖源嗣

日本結晶学会年会講演要旨集 2018 70 2018年11月1日
Present status of SPring-8 macromolecular crystallography beamlines

Hideo Okumura, Kazuya Hasegawa, Seiki Baba, Nobuhiro Mizuno, Hironori Murakami, Takashi Kumasaka, Kunio Hirata, Go Ueno, Masaki Yamamoto

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 74 E174-E174 2018年8月
酸化型フェレドキシンの精密な結晶構造解析に向けた,X線損傷の分光学的評価

大西裕介, 田中秀明, 奥村英夫, 馬場清喜, 河野能顕, 熊坂崇, 栗栖源嗣

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 98th ROMBUNNO.2PB‐108 2018年3月6日
理研構造ゲノムビームラインI&IIの現状

上野剛, 仲村勇樹, 奥村英夫, 伊藤翔, 水野伸宏, 水野伸宏, 引間孝明, 平田邦生, 山下恵太郎, 河野能顕 …

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム(Web) 31st 2018年
酸化型フェレドキシン結晶のX線回折実験における還元損傷の確認と評価

大西裕介, 田中秀明, 奥村英夫, 馬場清喜, 河野能顕, 熊坂崇, 栗栖源嗣

日本結晶学会年会講演要旨集 2017 78 2017年11月23日
SPring‐8 BL38B1の高性能化と利用技術開発

馬場清喜, 奥村英夫, 仲村勇樹, 水野伸宏, 長谷川和也, 河野能顕, 上野剛, 梶原堅太郎, 木村滋, 鈴木凌 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2017 93 2017年11月23日
Development of data collections of SPring-8 MX beamlines

Nobuhiro Mizuno, Kazuya Hasegawa, Seiki Baba, Hideo Okumura, Nipawan Nuemket, Hironori Murakami, Yuki Nakamura, Masaki Yamamoto, Takashi Kumasaka

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 73 C642-C642 2017年
SPring-8MXBLオンライン顕微分光装置の開発

河野能顕, 奥村英夫, 上野剛, 熊坂崇, 山本雅貴

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム(Web) 30th 2017年
理研構造ゲノムビームラインI&IIの現状

上野剛, 仲村勇樹, 奥村英夫, 河野能顕, 水野伸宏, 水野伸宏, 村上博則, 馬場清喜, 馬場清喜, 引間孝明 …

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム(Web) 30th 2017年
SPring‐8 MXBLオンライン顕微分光測定装置の開発

奥村英夫, 河野能顕, 熊坂崇, 山本雅貴

日本結晶学会年会講演要旨集 2016 113 2016年11月17日
SPring‐8MXBLオンライン顕微分光測定装置の開発

奥村英夫, 河野能顕, 熊坂崇, 山本雅貴

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 91 2016年5月19日
理研構造ゲノムビームラインI&IIの現状

上野剛, 仲村勇樹, 村上博則, 水野伸宏, 水野伸宏, 馬場清喜, 馬場清喜, 奥村英夫, 長谷川和也, 長谷川和也 …

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム予稿集 29th 134 2016年1月9日

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書籍等出版物

破骨細胞の分化を阻害する小分子化合物—Identification of a small molecule that inhibits osteoclastogenesis

川谷誠, 奥村英夫, 長田裕之

バイオインダストリー協会 2009年1月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ポリケチド合成酵素機能改変と難化学合成反応解明による新規天然化合物創出基盤の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

高橋俊二, 奥村英夫
De novoピリミジン生合成経路を標的とした新規抗癌剤の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

川谷誠, 奥村英夫, 清水猛, 平沼佐代子, ヴィエジバコンスタンティ
次世代天然化合物導出を指向した新規生合成ロジックの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2012年4月 - 2016年3月

高橋俊二, 奥村英夫
有機合成では困難なサクシニル転移を行う酵素の反応機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2011年 - 2012年

奥村英夫
生理活性物質と標的蛋白質の微視的相互作用解明のための化学構造生物学

日本学術振興会科学研究費助成事業学術創成研究費学術創成研究費 2005年 - 2009年

長田裕之, 齊藤安貴子, 清水猛, 城宜嗣, 掛谷秀昭, 臼井健郎, 林雄二郎, 小嶋聡一, 吉田稔, 高橋俊二, 奥村英夫, 吉田稔
イオン輸送蛋白質の4次元構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2005年 - 2006年

神山勉, 井原邦夫, 村上緑, 倭剛久, 奥村英夫

奥村英夫

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