奥村英夫 (Hideo Okumura) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人高輝度光科学研究センター構造生物学推進室研究員

学位: 博士（理学）(名古屋大学)

researchmap会員ID: B000308147

外部リンク: http://stbio.spring8.or.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2011年4月 - 現在

公益財団法人高輝度光科学研究センター, タンパク質結晶解析推進室, 研究員
2010年4月 - 2011年4月

独立行政法人理化学研究所, 基幹研究所長田抗生物質研究室, 基幹研究所研究員
2007年4月 - 2010年3月

独立行政法人理化学研究所, 中央研究所長田抗生物質研究室, 基礎科学特別研究員
2005年7月 - 2007年3月

独立行政法人理化学研究所, 中央研究所長田抗生物質研究室, 協力研究員
2003年4月 - 2005年6月

名古屋大学大学院, 理学研究科, 産学官連携研究員

学歴

1998年4月 - 2003年3月

名古屋大学大学院, 理学研究科, 物質理学専攻
1994年4月 - 1998年3月

名古屋大学, 理学部, 物理学科

論文

In situ crystal data-collection and ligand-screening system at SPring-8.

Hideo Okumura, Naoki Sakai, Hironori Murakami, Nobuhiro Mizuno, Yuki Nakamura, Go Ueno, Takuya Masunaga, Takashi Kawamura, Seiki Baba, Kazuya Hasegawa …

Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 78(Pt 6) 241-251 2022年6月1日査読有り
Structures of oxygen dissociation intermediates of 400 kDa V2 hemoglobin provide coarse snapshots of the protein allostery

Nobutaka Numoto, Seiko Onoda, Yoshiaki Kawano, Hideo Okumura, Seiki Baba, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki, Nobutoshi Ito

Biophysics and Physicobiology 19 n/a-n/a 2022年査読有り
Coarse snapshots of oxygen-dissociation intermediates of a giant hemoglobin elucidated by determining the oxygen saturation in individual subunits in the crystalline state.

Nobutaka Numoto, Yoshiaki Kawano, Hideo Okumura, Seiki Baba, Yoshihiro Fukumori, Kunio Miki, Nobutoshi Ito

IUCrJ 8(Pt 6) 954-962 2021年11月1日査読有り
X-ray dose-dependent structural changes of the [2Fe-2S] ferredoxin from Chlamydomonas reinhardtii.

Yusuke Ohnishi, Norifumi Muraki, Daiki Kiyota, Hideo Okumura, Seiki Baba, Yoshiaki Kawano, Takashi Kumasaka, Hideaki Tanaka, Genji Kurisu

Journal of biochemistry 167(6) 549-555 2020年6月1日査読有り
Upgrade of bending magnet MX beamline BL38B1 at SPring-8

Seiki Baba, Nobuhiro Mizuno, Hideo Okumura, Nipawan Nuemket, Kazuya Hasegawa, Yuki Nakamura, Hironori Murakami, Go Ueno, Tomoki Fukui, Takaki Irie …

13TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON SYNCHROTRON RADIATION INSTRUMENTATION (SRI2018) 2054 2019年
Present status of SPring-8 macromolecular crystallography beamlines

Hideo Okumura, Kazuya Hasegawa, Seiki Baba, Nobuhiro Mizuno, Hironori Murakami, Takashi Kumasaka, Kunio Hirata, Go Ueno, Masaki Yamamoto

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 74 E174-E174 2018年8月
Dimeric structure of the uracil: proton symporter UraA provides mechanistic insights into the SLC4/23/26 transporters

Xinzhe Yu, Guanghui Yang, Chuangye Yan, Javier L. Baylon, Jing Jiang, He Fan, Guifeng Lu, Kazuya Hasegawa, Hideo Okumura, Tingliang Wang …

CELL RESEARCH 27(8) 1020-1033 2017年8月査読有り
Development of data collections of SPring-8 MX beamlines

Nobuhiro Mizuno, Kazuya Hasegawa, Seiki Baba, Hideo Okumura, Nipawan Nuemket, Hironori Murakami, Yuki Nakamura, Masaki Yamamoto, Takashi Kumasaka

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 73 C642-C642 2017年
SPring-8 BL41XU, a high-flux macromolecular crystallography beamline

Kazuya Hasegawa, Nobutaka Shimizu, Hideo Okumura, Nobuhiro Mizuno, Seiki Baba, Kunio Hirata, Tomoyuki Takeuchi, Hiroshi Yamazaki, Yasunori Senba, Haruhiko Ohashi …

JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION 20(Pt 6) 910-913 2013年11月査読有り
A Point Mutation in ftmD Blocks the Fumitremorgin Biosynthetic Pathway in Aspergillus fumigatus Strain Af293

Naoki Kato, Hirokazu Suzuki, Hideo Okumura, Shunji Takahashi, Hiroyuki Osada

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 77(5) 1061-1067 2013年5月査読有り
A small-molecule inhibitor shows that pirin regulates migration of melanoma cells

Isao Miyazaki, Siro Simizu, Hideo Okumura, Satoshi Takagi, Hiroyuki Osada

NATURE CHEMICAL BIOLOGY 6(9) 667-673 2010年9月査読有り
P-76 麹菌Aspergillus oryzaeにおけるcyclopiazonic acid生合成と安全性(ポスター発表の部)

加藤直樹, 徳岡昌文, 篠原靖智, 川谷誠, 浦本昌和, 小山泰二, 長田裕之

天然有機化合物討論会講演要旨集 (51) 695-700 2009年9月1日
Structure-Affinity Relationship Study of Bleomycins and Shble Protein by Use of a Chemical Array

Isao Miyazaki, Hideo Okumura, Siro Simizu, Yoshikazu Takahashi, Naoki Kanoh, Yasuhiko Muraoka, Yoshiaki Nonomura, Hiroyuki Osada

CHEMBIOCHEM 10(5) 845-852 2009年3月査読有り
The identification of an osteoclastogenesis inhibitor through the inhibition of glyoxalase I

Makoto Kawatani, Hideo Okumura, Kaori Honda, Naoki Kanoh, Makoto Muroi, Naoshi Dohmae, Masamichi Takami, Mitsuhiro Kitagawa, Yushi Futamura, Masaya Imoto …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 105(33) 11691-11696 2008年8月査読有り
Crystal structures of archaerhodopsin-1 and-2: Common structural motif in archaeal light-driven proton pumps

N Enamil, K Yoshimura, M Murakami, H Okumura, K Hara, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 358(3) 675-685 2006年5月査読有り
Crystal structures of acid blue and alkaline purple forms of bacteriorhodopsin

H Okumura, M Murakami, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 351(3) 481-495 2005年8月査読有り
Crystal structure of the M intermediate of bacteriorhodopsin: Allosteric structural changes mediated by sliding movement of a transmembrane helix

K Takeda, Y Matsui, N Kamiya, S Adachi, H Okumura, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 341(4) 1023-1037 2004年8月査読有り
Crystal structure of the L intermediate of bacteriorhodopsin: Evidence for vertical translocation of a water molecule during the proton pumping cycle

T Kouyama, T Nishikawa, T Tokuhisa, H Okumura

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 335(2) 531-546 2004年1月査読有り
Specific damage induced by X-ray radiation and structural changes in the primary photoreaction of bacteriorhodopsin

Y Matsui, K Sakai, M Murakami, Y Shiro, S Adachi, H Okumura, T Kouyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 324(3) 469-481 2002年11月査読有り

MISC

破骨細胞の分化を阻害する小分子化合物—Identification of a small molecule that inhibits osteoclastogenesis

川谷誠, 奥村英夫, 長田裕之

バイオサイエンスとインダストリー / バイオサイエンスとインダストリー編集委員会編 67(1) 24-28 2009年1月
【シグナル伝達研究2005-'06 生命現象や疾患を支配する分子メカニズムと新しい研究法現在と未来】シグナル伝達研究における新たなアプローチバイオプローブの探索と細胞内標的分子の同定

臼井健郎, 叶直樹, 清水史郎, 長田裕之

実験医学 23(11) 1803-1809 2005年6月
骨粗鬆症モデル動物を用いたリベロマイシンAの骨吸収抑制効果

川谷誠, 新木敏正, 叶直樹, 長田裕之, 禹済泰

ビタミン 79(2) 121-122 2005年2月
骨粗鬆症モデル動物を用いたリベロマイシンAの骨吸収抑制効果

川谷誠, 新木敏正, 叶直樹, 禹済泰, 長田裕之

日本骨代謝学会学術集会プログラム抄録集 22回 213-213 2004年8月
49(P-13) 官能基非依存型低分子アレイの作成と評価(ポスター発表の部)

叶直樹, 熊代沙織, 清水史郎, 長田裕之, 近藤恭光, 畠山哲, 田代英夫

天然有機化合物討論会講演要旨集 45 287-292 2003年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ポリケチド合成酵素機能改変と難化学合成反応解明による新規天然化合物創出基盤の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

高橋俊二, 奥村英夫
De novoピリミジン生合成経路を標的とした新規抗癌剤の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2013年4月 - 2016年3月

川谷誠, 奥村英夫, 清水猛, 平沼佐代子, ヴィエジバコンスタンティ
次世代天然化合物導出を指向した新規生合成ロジックの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2012年4月 - 2016年3月

高橋俊二, 奥村英夫
有機合成では困難なサクシニル転移を行う酵素の反応機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2011年 - 2012年

奥村英夫
生理活性物質と標的蛋白質の微視的相互作用解明のための化学構造生物学

日本学術振興会科学研究費助成事業学術創成研究費学術創成研究費 2005年 - 2009年

長田裕之, 齊藤安貴子, 清水猛, 城宜嗣, 掛谷秀昭, 臼井健郎, 林雄二郎, 小嶋聡一, 吉田稔, 高橋俊二, 奥村英夫, 吉田稔
イオン輸送蛋白質の4次元構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2005年 - 2006年

神山勉, 井原邦夫, 村上緑, 倭剛久, 奥村英夫

奥村英夫

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