藤本 明洋

J-GLOBALへ         更新日: 19/07/31 09:17
 
アバター
研究者氏名
藤本 明洋
 
フジモト アキヒロ
ハンドル
Akihiro Fujimoto
eメール
fujimotoddm.med.kyoto-u.ac.jp
URL
http://kaken.nii.ac.jp/d/r/30525853.ja.html
所属
京都大学
学位
博士(保健学)(東京大学)
その他の所属
理化学研究所

プロフィール

2003年 九州大学・理学部・生物学科卒業(指導教官 舘田英典教授)
2005年 九州大学大学院・理学府・生物科学専攻 修士課程修了(指導教官 舘田英典教授)
2008年 東京大学大学院・医学系研究科・国際保健学専攻 博士課程修了(指導教官 徳永勝士教授)
2008年〜2010年 理化学研究所・次世代計算科学研究開発プログラム・データ解析融合研究チーム
2010年〜2013年 理化学研究所・ゲノム医科学研究センター・情報解析研究チーム
2013年〜2014年 理化学研究所・統合生命医科学研究センター・医科学数理研究グループ
2014年8月〜2016年3月 理化学研究所・統合生命医科学研究センター・ゲノムシーケンス解析研究チーム
2016年4月〜2019年6月 京都大学・医学研究科・創薬医学講座
2019年7月~ 東京大学大学院・医学系研究科・国際保健学専攻・人類遺伝学分野

研究分野

 
 

経歴

 
 
   
 
京都大学 
 
 
   
 
京都大学 医学研究科 特定准教授
 

受賞

 
2017年7月
大正富山Award
 
2017年4月
平成29年度文部科学大臣表彰 若手科学者賞
 
2016年
第8回理化学研究所・研究奨励賞
 
2016年
第35回日本癌学会奨励賞
 
2016年
2016年度日本人類遺伝学会奨励賞
 

論文

 
Identification of intermediate-sized deletions and inference of their impact on gene expression in a human population
Wong JH, Shigemizu D, Yoshii Y, Akiyama S, Tanaka A, Nakagawa H, Narumiya S, Fujimoto A*
Genome Medicine   in press    2019年   [査読有り]
Clinical utility of androgen receptor gene aberrations in circulating cell-free DNA as a biomarker for treatment of castration-resistant prostate cancer.
Sumiyoshi T, Mizuno K, Yamasaki T, Miyazaki Y, Makino Y, Okasho K, Li X, Utsunomiya N, Goto T, Kobayashi T, Terada N, Inoue T, Kamba T, Fujimoto A, Ogawa O, Akamatsu S
Sci Rep   9 4030   2019年   [査読有り]
肝癌の全ゲノムシークエンス解析
藤本 明洋
医学のあゆみ      2018年8月   [招待有り]
Whole Genome Sequencing of a Vietnamese Family from a Dioxin Contamination Hotspot Reveals Novel Variants in the Son with Undiagnosed Intellectual Disability.
Nguyen DT, Nguyen HH, Nguyen TD, Nguyen TTH, Nakano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Nguyen VB, Nguyen DB, Le BQ, Wong JH, Tsunoda T, Nakagawa H, Fujimoto A*, Nong VH
Int J Environ Res Public Health   15    2018年   [査読有り]
IMSindel: An accurate intermediate-size indel detection tool incorporating de novo assembly and gapped global-local alignment with split read analysis.
Shigemizu D, Miya F, Akiyama S, Okuda S, Boroevich KA, Fujimoto A, Nakagawa H, Ozaki K, Niida S, Kanemura Y, Okamoto N, Saitoh S, Kato M, Yamasaki M, Matsunaga T, Mutai H, Kosaki K, Tsunoda T
Sci Rep   8 10367   2018年   [査読有り]
進化遺伝学とがんゲノム解析
藤本 明洋
実験医学      2018年   [招待有り]
ゲノムシークエンスデータの情報解析
藤本 明洋
生物物理   58 001   2018年   [査読有り][招待有り]
Wardell CP, Fujita M, Yamada T, Simbolo M, Fassan M, Karlic R, Polak P, Kim J, Hatanaka Y, Maejima K, Lawlor RT, Nakanishi Y, Mitsuhashi T, Fujimoto A, Furuta M, Ruzzenente A, Conci S, Oosawa A, Sasaki-Oku A, Nakano K, Tanaka H, Yamamoto Y, Michiaki K, Kawakami Y, Aikata H, Ueno M, Hayami S, Gotoh K, Ariizumi SI, Yamamoto M, Yamaue H, Chayama K, Miyano S, Getz G, Scarpa A, Hirano S, Nakamura T, Nakagawa H.
J Hepatol   68 959   2018年   [査読有り]
Loss-of-function mutations in Zn-finger DNA-binding domain of HNF4A cause aberrant transcriptional regulation in liver cancer.
Taniguchi H, Fujimoto A, Kono H, Furuta M, Fujita M, Nakagawa H.
Oncotarget   25 26144   2018年   [査読有り]
Whole genome sequencing and mutation rate analysis of trios with paternal dioxin exposure.
Ton ND, Nakagawa H, Ha NH, Duong NT, Nhung VP, Hien LTT, Hue HTT, Hoang NH, Wong JH, Nakano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Tsunoda T, Fujimoto A*, Van Hai N*.
Hum Mutat.   39 1384   2018年   [査読有り]
Furuta M, Ueno M, Fujimoto A, Hayami S, Yasukawa S, Kojima F, Arihiro K, Kawakami Y, Wardell CP, Shiraishi Y, Tanaka H, Nakano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Tokunaga N, Boroevich KA, Abe T, Aikata H, Ohdan H, Goto K, Kubo M, Tsunoda T, Miyano S, Chayama K, Yamaue H, Nakagawa H.
J Hepatic.   66 363   2017年   [査読有り]
Genomic landscape of colitis-associated cancer indicates the impact of chronic inflammation and its stratification by mutations in RNF43 and Wnt signaling.
Fujita M, Matsubara N, Matsuda I, Maejima K, Oosawa A, Yamano T, Fujimoto A, Furuta M, Nagano K, Oku-Sasaki A, Tanaka H, Shiraishi Y, Mateos RN, Sakai K, Miyano S, Tomita N, Hirota S, Ikeuchi H, and Nakagawa N.
Oncotarget   12 969   2017年   [査読有り]
Fujimoto A, Furuta M (equal contribution), Totoki Y (equal contribution), Tsunoda T (equal contribution), Kato M (equal contribution), Shiraishi Y, Tanaka H, Taniguchi H, Kawakami Y, Ueno M, Gotoh K, Ariizumi S, Wardell CP, Hayami S, Nakamura T, Aikata, Arihiro K, Boroevich KA, Abe T, Nagano K, Maejima K, Sasaki-Oku A, Oshawa A, Shibuya T, Nakamura H, Hama N, Hosoda F, Arai Y, Shashi S, Urushidate T, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Ojima H, Hiraoka N, Okusakan T, Kubo M, Marubashi S, Yamada T, Hirano S, Yamamoto M, Ohdan H, Shimada K, Ishikawa O, Yamane H, Chayama K, Miyano S, Aburatani H, Shibata T, and Nakagawa H. (2016)
Nat Genet      2016年   [査読有り]
Fujimoto A*, Okada Y, Boroevich KA, Tsunoda T and Taniguchi H, and Nakagawa H.
Sci Rep   6 26483   2016年   [査読有り]
Alexandrov LB, Ju YS, Haase K, Van Loo P, Martincorena I, Nik-Zainal S, Totoki Y, Fujimoto A, Nakagawa H, Shibata T, Campbell PJ, Vineis P, Phillips DH, Stratton MR.
Science   354 618   2016年   [査読有り]