プレシシャルル (Charles Plessy) - マイポータル

基本情報

所属: Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University Genomics and Regulatory Systems Unit Staff scientist

研究者番号: 60391984
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-7410-6295
J-GLOBAL ID: 202001006653771872
researchmap会員ID: R000007198

論文

Extreme genome scrambling in marine planktonic Oikopleura dioica cryptic species.

Charles Plessy, Michael J Mansfield, Aleksandra Bliznina, Aki Masunaga, Charlotte West, Yongkai Tan, Andrew W Liu, Jan Grašič, María Sara Del Río Pisula, Gaspar Sánchez-Serna …

Genome research 34(3) 426-440 2024年4月25日
Deep sequencing of short capped RNAs reveals novel families of noncoding RNAs.

Michiel de Hoon, Alessandro Bonetti, Charles Plessy, Yoshinari Ando, Chung-Chau Hon, Yuri Ishizu, Masayoshi Itoh, Sachi Kato, Dongyan Lin, Sho Maekawa …

Genome research 32(9) 1727-35 2022年8月12日
Speed variations of bacterial replisomes.

Deepak Bhat, Samuel Hauf, Charles Plessy, Yohei Yokobayashi, Simone Pigolotti

eLife 11 2022年7月25日
Automated phenol-chloroform extraction of high molecular weight genomic DNA for use in long-read single-molecule sequencing

Andrew W. Liu, Alejandro Villar-Briones, Nicholas M. Luscombe, Charles Plessy

F1000Research 11 240-240 2022年2月28日
Author Correction: RADICL-seq identifies general and cell type–specific principles of genome-wide RNA-chromatin interactions (Nature Communications, (2020), 11, 1, (1018), 10.1038/s41467-020-14337-6)

Alessandro Bonetti, Federico Agostini, Ana Maria Suzuki, Kosuke Hashimoto, Giovanni Pascarella, Juliette Gimenez, Leonie Roos, Alex J. Nash, Marco Ghilotti, Christopher J. F. Cameron …

Nature Communications 12(1) 2021年12月1日
H3S28P Antibody Staining of Okinawan Oikopleura dioica Suggests the Presence of Three Chromosomes [version 2; peer review: 2 approved]

Andrew W. Liu, Yongkai Tan, Aki Masunaga, Aleksandra Bliznina, Charlotte West, Charles Plessy, Nicholas M. Luscombe

2021年3月1日
Use of Cap Analysis Gene Expression to detect human papillomavirus promoter activity patterns at different disease stages.

Ayumi Taguchi, Kazunori Nagasaka, Charles Plessy, Hiroe Nakamura, Yoshiko Kawata, Sachi Kato, Kosuke Hashimoto, Takeshi Nagamatsu, Katsutoshi Oda, Iwao Kukimoto …

Scientific reports 10(1) 17991-17991 2020年10月22日査読有り
Analysis of hiPSCs differentiation toward hepatocyte-like cells upon extended exposition to oncostatin

Mathieu Danoy, Yannick Tauran, Stéphane Poulain, Hiroshi Arakawa, Daiki Mori, Karin Araya, Sachi Kato, Taketomo Kido, Hiroyuki Kusuhara, Yukio Kato …

Differentiation 114 36-48 2020年7月
Machine-driven parameter screen of biochemical reactions

Stéphane Poulain, Ophélie Arnaud, Sachi Kato, Iris Chen, Hiro Ishida, Piero Carninci, Charles Plessy

Nucleic Acids Research 2020年4月17日
Widespread use of the “ascidian” mitochondrial genetic code in tunicates

Julien Pichon, Nicholas M. Luscombe, Charles Plessy

F1000Research 2020年4月14日
RADICL-seq identifies general and cell type-specific principles of genome-wide RNA-chromatin interactions.

Alessandro Bonetti, Federico Agostini, Ana Maria Suzuki, Kosuke Hashimoto, Giovanni Pascarella, Juliette Gimenez, Leonie Roos, Alex J Nash, Marco Ghilotti, Christopher J F Cameron …

Nature communications 11(1) 1018-1018 2020年2月24日査読有り
Centromere-specific antibody-mediated karyotyping of Okinawan Oikopleura dioica suggests the presence of three chromosomes

Andrew W. Liu, Yongkai Tan, Aki Masunaga, Charles Plessy, Nicholas M. Luscombe

F1000Research 9 780 2020年
Transcriptome profiling of hiPSC-derived LSECs with nanoCAGE

Mathieu Danoy, Stéphane Poulain, Yuta Koui, Yannick Tauran, Benedikt Scheidecker, Taketomo Kido, Atsushi Miyajima, Yasuyuki Sakai, Charles Plessy, Eric Leclerc

Molecular Omics 2020年
Linking FANTOM5 CAGE peaks to annotations with CAGEscan.

Nicolas Bertin, Mickaël Mendez, Akira Hasegawa, Marina Lizio, Imad Abugessaisa, Jessica Severin, Mizuho Sakai-Ohno, Timo Lassmann, Takeya Kasukawa, Hideya Kawaji …

Scientific data 4(1) 170147-170147 2017年10月3日査読有り
clonotypeR--high throughput analysis of T cell antigen receptor sequences

Charles Plessy

2015年10月8日
Targeted reduction of highly abundant transcripts with pseudo-random primers

Charles Plessy

2015年9月29日
Characterization of novel transcripts of human papillomavirus type 16 using cap analysis gene expression technology.

Taguchi A, Nagasaka K, Kawana K, Hashimoto K, Kusumoto-Matsuo R, Plessy C, Thomas M, Nakamura H, Bonetti A, Oda K …

2015年2月
Digital expression profiling of the compartmentalized translatome of Purkinje neurons.

Kratz A, Beguin P, Kaneko M, Chimura T, Suzuki AM, Matsunaga A, Kato S, Bertin N, Lassmann T, Vigot R …

Genome Research 24(8) 1396-1410 2014年6月
Multiplicity of 5' cap structures present on short RNAs.

Abdelhamid RF, Plessy C, Yamauchi Y, Taoka M, de Hoon M, Gingeras TR, Isobe T, Carninci P

PloS one 9(7) e102895 2014年
Mesencephalic dopaminergic neurons express a repertoire of olfactory receptors and respond to odorant-like molecules.

Grison A, Zucchelli S, Urzì A, Zamparo I, Lazarevic D, Pascarella G, Roncaglia P, Giorgetti A, Garcia-Esparcia P, Vlachouli C …

2014年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

マイクロ流体アプローチによる１細胞トランスクリプトーム解析とその応用展開

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2016年5月 - 2021年3月

藤井輝夫, 長阪一憲, PLESSY Charles, Kim SooHyeon
Single cell transcriptome analysis

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2013年4月 - 2016年3月

PLESSY Charles
プルキンエ細胞の分割されたトランスラトームのデジタル表現プロファイリング

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2013年4月 - 2015年3月

PLESSY Charles, KRATZ Anton, クラッツアントン

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