栗﨑以久男 (Ikuo Kurisaki) - マイポータル

基本情報

所属: 早稲田大学理工学術院総合研究所主任研究員 (研究院准教授)

学位: 修士（生物学）(北海道大学)
博士（理学）(神戸大学)

J-GLOBAL ID: 200901052718844310
researchmap会員ID: 6000016136

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年7月 - 現在

早稲田大学理工学術院総合研究所, 主任研究員
2022年4月 - 2022年6月

神戸大学, 学術研究員
2018年4月 - 2022年3月

神戸大学, 特命講師
2015年4月 - 2018年3月

名古屋大学, 博士研究員
2012年4月 - 2015年4月

名古屋大学, 学術振興会特別研究員（PD）
2011年2月 - 2012年3月

名古屋大学, 博士研究員
2010年4月 - 2011年2月

立命館大学, 博士研究員
2009年4月 - 2010年3月

神戸大学, 学術振興会特別研究員（PD）
2008年4月 - 2009年3月

神戸大学, 各術振興会特別研究員（DC2）

学歴

2006年4月 - 2009年3月

神戸大学, 自然科学研究科, 地球惑星システム科学
2004年4月 - 2006年3月

北海道大学, 理学研究科, 生物科学専攻(生物学)
2000年4月 - 2004年3月

早稲田大学, 理工学部, 物理学科

論文

Simulation toolkits at the molecular scale for trans-scale thermal signaling

Ikuo Kurisaki, Madoka Suzuki

Computational and Structural Biotechnology Journal 2023年3月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Non-micelle-like Amyloid Aggregate Stabilizes Amyloid β (1-42) Growth Nuclei Formation

Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka

2022年12月10日
Thermal conductivity and conductance of protein in aqueoussolution: Effects of geometrical shape

Ikuo Kurisaki, Seiya Tanaka, Ichiro Mori, Toshihito Umegaki, Yoshiharu Mori, Shigenori Tanaka

Journal of Computational Chemistry 44(7) 857-868 2022年12月査読有り筆頭著者責任著者
Inhibition of Melittin Activity Using a Small Molecule with an Indole Ring

Sayuki Kanemitsu, Kenta Morita, Yudai Tominaga, Kanon Nishimura, Tomoko Yashiro, Haruka Sakurai, Yumemi Yamamoto, Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka, Masaki Matsui …

The Journal of Physical Chemistry B 126(31) 5793-5802 2022年8月11日査読有り
Computational Prediction of Heteromeric Protein Complex Disassembly Order with Hybrid Monte Carlo/Molecular Dynamics Simulation

Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka

Physical Chemistry Chemical Physics 2022年3月31日査読有り筆頭著者責任著者
Remarked Suppression of Aβ42 Protomer‐Protomer Dissociation Reaction Elucidated by Molecular Dynamics Simulation

Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics 2022年2月8日査読有り筆頭著者責任著者
Chloride Ions Stabilize Human Adult Hemoglobin in the T-State, Competing with Allosteric Interaction of Oxygen Molecules

Ikuo Kurisaki, Yume Takahashi, Yukichi Kitamura, Masataka Nagaoka

The Journal of Physical Chemistry B 2021年11月10日査読有り筆頭著者
Elucidating Microscopic Events Driven by GTP Hydrolysis Reaction in Ras-GAP System with Semi-reactive Molecular Dynamics Simulation: Alternative Role of Phosphate Binding Loop as Mechanical Energy Storage

Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka

Physical Chemistry Chemical Physics 23(46) 26151-26164 2021年11月査読有り筆頭著者責任著者
Reaction Pathway Sampling and Free-Energy Analyses for Multimeric Protein Complex Disassembly by Employing Hybrid Configuration Bias Monte Carlo/Molecular Dynamics Simulation

Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka

ACS Omega 2021年2月5日査読有り筆頭著者責任著者
ATP Converts A beta(42) Oligomer into Off-Pathway Species by Making Contact with Its Backbone Atoms Using Hydrophobic Adenosine

Ikuo Kurisaki, Shigenori Tanaka

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 123(46) 9922-9933 2019年11月査読有り筆頭著者責任著者
Na+ Binding Is Ineffective in Forming a Primary Substrate Pocket of Thrombin

Ikuo Kurisaki, Masataka Nagaoka

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 120(46) 11873-11879 2016年11月査読有り筆頭著者
Bound Na+ is a Negative Effecter for Thrombin-Substrate Stereospecific Complex Formation

Ikuo Kurisaki, Masayoshi Takayanagi, Masataka Nagaoka

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 120(20) 4540-4547 2016年5月査読有り筆頭著者
Dewetting of S1-Pocket via Water Channel upon Thrombin-Substrate Association Reaction

Ikuo Kurisaki, Chantal Barberot, Masayoshi Takayanagi, Masataka Nagaoka

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 119(52) 15807-15812 2015年12月査読有り筆頭著者
Toward Understanding Allosteric Activation of Thrombin: A Conjecture for Important Roles of Unbound Na+ Molecules around Thrombin

Ikuo Kurisaki, Masayoshi Takayanagi, Masataka Nagaoka

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 119(9) 3635-3642 2015年3月査読有り筆頭著者
Explicit solvation modulates intra- and inter-molecular interactions within DNA: Electronic aspects revealed by the ab initio fragment molecular orbital (FMO) method

Kaori Fukuzawa, Ikuo Kurisaki, Chiduru Watanabe, Yoshio Okiyama, Yuji Mochizuki, Shigenori Tanaka, Yuto Komeiji

Computational and Theoretical Chemistry 1054 29-37 2015年2月査読有り
Combined Mechanism of Conformational Selection and Induced Fit in U1A-RNA Molecular Recognition

Ikuo Kurisaki, Masayoshi Takayanagi, Masataka Nagaoka

BIOCHEMISTRY 53(22) 3646-3657 2014年6月査読有り筆頭著者
Non-site-specific allosteric effect of oxygen on human hemoglobin under high oxygen partial pressure

Masayoshi Takayanagi, Ikuo Kurisaki, Masataka Nagaoka

SCIENTIFIC REPORTS 4 2014年4月査読有り
Accuracy of the fragment molecular orbital (FMO) calculations for DNA: Total energy, molecular orbital, and inter-fragment interaction energy

Kaori Fukuzawa, Chiduru Watanabe, Ikuo Kurisaki, Naoki Taguchi, Yuji Mochizuki, Tatsuya Nakano, Shigenori Tanaka, Yuto Komeiji

COMPUTATIONAL AND THEORETICAL CHEMISTRY 1034 7-16 2014年4月査読有り
Oxygen Entry through Multiple Pathways in T-State Human Hemoglobin

Masayoshi Takayanagi, Ikuo Kurisaki, Masataka Nagaoka

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 117(20) 6082-6091 2013年5月査読有り
Antigen-antibody interactions of influenza virus hemagglutinin revealed by the fragment molecular orbital calculation

Akio Yoshioka, Kazutomo Takematsu, Ikuo Kurisaki, Kaori Fukuzawa, Yuji Mochizuki, Tatsuya Nakano, Eri Nobusawa, Katsuhisa Nakajima, Shigenori Tanaka

Theoretical Chemistry Accounts 130(4-6) 1197-1202 2011年12月査読有り

もっとみる

MISC

Protein large-scale motions revealed by quantum beams -a new era in understanding protein dynamics-

Naoki Yamamoto, Rintaro Inoue, Ikuo Kurisaki, Tatsuhito Matsuo, Yuki Hishikawa, Wenyang Zhao, Hiroshi Sekiguchi

Biophysics and Physicobiology 19 n/a-n/a 2022年8月
分子夾雑系理解に向けたシミュレーション手法の開発と応用

栗﨑以久男, 田中成典

生物物理 62(4) 215-218 2022年8月査読有り筆頭著者責任著者
若手の声・八尾徹先生の海外バイオ研究動向調査レポートの紹介

栗崎以久男

49(4) 2009年
Pumilio：神経系の形成・可塑性を制御するRNA結合タンパク質

栗崎以久男

ファルマシア 9 2005年

書籍等出版物

Amberによる生体高分子シミュレーション入門

Amber研究会 (担当:分担執筆, 範囲:「2.1 まずはAmberを使ってみる –インスタントプロトコル-」，栗崎以久男; 「3. Frequently Asked Question (FAQ)」，中村卓，栗崎以久男)

サイエンスハウス 2011年6月 (ISBN: 486281008X)
The Fragment Molecular Orbital Method: Practical Applications to Large Molecular Systems

(担当:分担執筆)

CPC Press 2009年5月