磯部寛 (Hiroshi Isobe) - マイポータル

基本情報

所属: 岡山大学異分野基礎科学研究所

J-GLOBAL ID: 202101001737412407
researchmap会員ID: R000031689

研究分野

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 /

経歴

2016年4月 - 現在

岡山大学異分野基礎科学研究所, 特別契約職員准教授
2015年10月 - 2016年3月

岡山大学大学院自然科学研究科, 特別契約職員准教授
2012年8月 - 2015年9月

岡山大学大学院自然科学研究科, 特別契約職員助教

学歴

1993年4月 - 1996年3月

大阪大学理学部化学科

論文

Roles of the Flexible Primary Coordination Sphere of the Mn4CaOx Cluster: What Are the Immediate Decay Products of the S3 State?

Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

The journal of physical chemistry. B 126(38) 7212-7228 2022年9月29日
Elucidation of a multiple S3 intermediates model for water oxidation in the oxygen evolving complex of photosystem II. Calcium-assisted concerted O-O bond formation

K. Yamaguchi, K. Miyagawa, M. Shoji, H. Isobe, T. Kawakami

Chem. Phys. Lett. 806 140042-1-140042-12 2022年9月14日査読有り
Relative energies among S3 intermediates in the photosystem II revealed by DLPNO coupled cluster and hybrid DFT calculations. Possible pathways of water insertion in the S2 to S3 transition

K. Miyagawa, M. Shoji, H. Isobe, T. Kawakami, T. Nakajima, K. Yamaguchi

Chem. Phys. Lett. 793 139439-1-139439-12 2022年2月4日査読有り
Relative energies among proton-shifted S2 isomers in the photosystem II revealed by DLPNO coupled cluster and hybrid DFT calculations. Proton transfer coupled spin transitions of the CaMn4Ox cluster in OEC of PSII

K. Miyagawa, M. Shoji, H. Isobe, T. Kawakami, T. Nakajima, K. Yamaguchi

Chem. Phys. Lett. 790 139357-1-139357-11 2022年1月14日査読有り
Exploring reaction pathways for the structural rearrangements of the Mn cluster induced by water binding in the S3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II

Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry 405 112905-112905 2021年1月査読有り筆頭著者責任著者
An oxyl/oxo mechanism for oxygen-oxygen coupling in PSII revealed by an x-ray free-electron laser

Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Keitaro Yamashita, Yoshiki Nakajima, Go Ueno, Hongjie Li, Takahiro Yamane, Kunio Hirata, Yasufumi Umena, Shinichiro Yonekura …

Science 366(6463) 334-338 2019年10月18日査読有り
Spin, Valence, and Structural Isomerism in the S3 State of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II as a Manifestation of Multimetallic Cooperativity

Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

Journal of Chemical Theory and Computation 15(4) 2375-2391 2019年4月9日査読有り筆頭著者責任著者
Geometric and electronic structures of the synthetic Mn4CaO4 model compound mimicking the photosynthetic oxygen-evolving complex

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 18(16) 11330-11340 2016年4月
Chemical Equilibrium Models for the S3 State of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II

Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

Inorganic Chemistry 55(2) 502-511 2016年1月19日査読有り筆頭著者責任著者
Strong Coupling between the Hydrogen Bonding Environment and Redox Chemistry during the S2 to S3 Transition in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II

Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

The Journal of Physical Chemistry B 119(43) 13922-13933 2015年10月29日査読有り筆頭著者責任著者
Theoretical modelling of biomolecular systems I. Large-scale QM/MM calculations of hydrogen-bonding networks of the oxygen evolving complex of photosystem II

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Takahito Nakajima, Kizashi Yamaguchi

MOLECULAR PHYSICS 113(3-4) 359-384 2015年2月
Water Oxidation Chemistry of a Synthetic Dinuclear Ruthenium Complex Containing Redox-Active Quinone Ligands

Hiroshi Isobe, Koji Tanaka, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

Inorganic Chemistry 53(8) 3973-3984 2014年4月21日査読有り筆頭著者責任著者
2P257 光合成酸素発生中心(PSII-OEC)の立体構造と電荷状態変化についての理論的研究(18B. 光生物:光合成,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

Shoji Mitsuo, Isobe Hiroshi, Yamanaka Shusuke, Shen Jian-Ren, Yamaguchi Kizashi

生物物理 54(1) S237 2014年
Generalized approximate spin projection calculations of effective exchange integrals of the CaMn4O5 cluster in the S1 and S3 states of the oxygen evolving complex of photosystem II

H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, H. Mino, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi

Phys. Chem. Chem. Phys. 16(24) 11911-11923 2014年査読有り筆頭著者
Similarities of artificial photosystems by ruthenium oxo complexes and native water splitting systems.

Tanaka Koji, Isobe Hiroshi, Yamanaka Shusuke, Yamaguchi Kizashi

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 109(39) 15600-15605 2012年9月25日査読有り
Role of Perferryl–Oxo Oxidant in Alkane Hydroxylation Catalyzed by Cytochrome P450: A Hybrid Density Functional Study

Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi, Mitsutaka Okumura, Jiro Shimada

The Journal of Physical Chemistry B 116(16) 4713-4730 2012年4月26日査読有り筆頭著者責任著者
Theoretical illumination of water-inserted structures of the CaMn4O5 cluster in the S2 and S3 states of oxygen-evolving complex of photosystem II: full geometry optimizations by B3LYP hybrid density functional

H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi

Dalton Transactions 41(44) 13727-13727 2012年査読有り筆頭著者責任著者
Symmetry and broken symmetry in molecular orbital description of unstable molecules IV: comparison between single- and multi-reference computational results for antiaromtic molecules

Toru Saito, Satomichi Nishihara, Shusuke Yamanaka, Yasutaka Kitagawa, Takashi Kawakami, Satoru Yamada, Hiroshi Isobe, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi

THEORETICAL CHEMISTRY ACCOUNTS 130(4-6) 749-763 2011年12月査読有り
Unique Structural and Electronic Features of Perferryl–Oxo Oxidant in Cytochrome P450

Hiroshi Isobe, Syusuke Yamanaka, Mitsutaka Okumura, Kizashi Yamaguchi, Jiro Shimada

The Journal of Physical Chemistry B 115(36) 10730-10738 2011年9月15日査読有り筆頭著者責任著者
3D1112 P450ビタミンD3水酸化酵素変異体の副反応抑制機構 : 自由エネルギー及び量子化学計算(3D 蛋白質_構造機能相関2,日本生物物理学会第49回年会)

Shimada Jiro, Fukunishi Yoshifumi, Fukunishi Hiroaki, Yagi Hirotaka, Isobe Hiroshi, Okumura Mitsutaka, Yamaguchi Kizashi, Kamijo Ken'ichi

生物物理 51 S118 2011年

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MISC

Geometric, electronic and spin structures of the CaMn4O5 catalyst for water oxidation in oxygen-evolving photosystem II. Interplay between experiments and theoretical computations

Kizashi Yamaguchi, Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Takashi Kawakami, Koichi Miyagawa, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen

COORDINATION CHEMISTRY REVIEWS 471 2022年11月
光合成酸素発生マンガンクラスターの機能発現に見る「歪んだ椅子」型構造の重要性

70 2-13 2017年査読有り筆頭著者責任著者
Mechanistic Insights in Charge Transfer Induced Luminescence of 1,2-Dioxetanones with Substituents of Low Oxidation Potentials

Isobe, Hiroshi, Takano, Yu, Okumura, Mitsutaka, Kuramitsu, Seiki, Yamaguchi, Kizashi

Journal of the American Chemical Society 127(24) 8667-8679 2005年6月査読有り

書籍等出版物

金属錯体の量子・計算化学（錯体化学会選書１０）

磯部寛, 田中晃二

三共出版 2014年10月1日 (ISBN: 4782707096)

講演・口頭発表等

新たな水分子の結合によって誘起される高酸化状態Mnクラスターの構造緩和過程に関する理論的研究

磯部寛, 鈴木孝義, 沈建仁, 庄司光男, 山口兆

新学術領域「光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光―物質変換系の創製」第3回公開シンポジウム 2021年1月22日
Theoretical Analysis of the Electronic and Spin Structures of the Oxygen-Evolving Complex

Hiroshi Isobe, Misuto Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

International Conference on Artificial Photosynthesis-2019 (ICARP2019) 2019年11月23日
光合成Mnクラスターの構造変化とスピン転移の相関および基質活性化に関する理論的研究

磯部寛

新学術領域「光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光―物質変換系の創製」第2回公開シンポジウム 2019年1月13日
Density Functional Study on Chemical Equilibria in the S3 State of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II

Hiroshi Isobe, Misuto Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

5th International Workshop on Solar Energy for Sustainability 2018年3月20日
Geometric and Electronic Structures of the Mn4CaO5 in the Oxygen-Evolving Complex

Hiroshi Isobe

Japan-France Joint Workshop on the Structure and Function of Photosystem II 2017年12月7日
光合成マンガンクラスターの構造と電子状態に関する理論的研究

磯部寛

第7回NTChemワークショップ 2017年3月15日
Density Functional Study on Structural Trends of the Mn4CaO5 Cluster in Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II

Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

17th International Congress on Photosynthesis Research 2016年8月7日
Magneto-Structural Correlations. I. Magnetic Interaction Parameters in the S2 state of the Oxygen-Evolving Complex in Photosystem II

H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi

16th International Congress on Photosynthesis Research 2013年8月13日
Theoretical Study of Artificial and Natural Water Oxidation

H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, K. Tanaka, J.-R. Shen, K. Yamaguchi

The 1st Awaji International Workshop on Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications 2013年6月16日
PSIIにおけるCaMn4O5クラスターの理論計算

磯部寛, 庄司光男, 山中秀介, 梅名泰史, 川上恵典, 沈建仁, 神谷信夫, 山口兆

第54回日本植物生理学会年会 2013年3月21日
Redox properties of ruthenium complexes containing quinone ligands: a hybrid density functional study

Hiroshi Isobe, Koji Tanaka, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

Okayama University International Symposium “Structure and Dynamics of photosynthetic Systems” 2012年10月22日

所属学協会

2001年2月 - 現在

日本化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

光合成マンガンクラスターの機能発現と連動したアミノ酸配位子の経時的構造変化の役割

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2027年3月

磯部寛
光合成マンガンクラスターに酸素発生機能をもたらす基本原理の抽出と検証

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

磯部寛
光合成マンガンクラスターに酸素発生機能をもたらす基本原理の抽出と検証

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年4月 - 2020年3月

磯部寛
光合成系Ⅱにおける水分解反応の学理解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究 2012年 - 2017年

沈建仁, 野口巧, 山口兆, 庄司光男, 菅倫寛, 秋田総理, 三野広幸, 加藤祐樹, 磯部寛