Eisuke Chikayama

Profile Information

Affiliation: Full Professor, Department of Information Systems, Nigata University of International and Information Studies
: RIKEN

Degree: Ph. D.

J-GLOBAL ID: 201001042134817872
researchmap Member ID: 6000025260

External link: http://www.nuis.ac.jp/~chikaya/index.html

Understanding biological systems in mathematical physics. Fundamental equations for living matter.

Research Interests

生物物理学;細胞シミュレーション;ニューラルネットワーク;NMR;MRI

Research Areas

Research History

Apr, 2017 - Present

Professor, Department of Information Systems, Niigata University of International and Information Studies
Sep, 2011 - Present

客員研究員, 理化学研究所(兼任)
Sep, 2019 - Aug, 2020

Visiting Professor, Institute of Organic Chemistry, Johannes Kepler University Linz
Sep, 2011 - Mar, 2017

Nigata University of International and Information Studies
Jan, 2011 - Aug, 2011

(独)理化学研究所次世代計算科学研究開発プログラム(兼任)
Jul, 2010 - Aug, 2011

Graduate School of Nanobioscience, Graduate, Yokohama City University
May, 2005 - Aug, 2011

(独)理化学研究所植物科学研究センター
May, 2000 - Apr, 2005

理化学研究所ゲノム科学総合研究センター
Feb, 2004 - Mar, 2004

Tokyo University of Agriculture and Technology

Education

Papers

Parameter Visualization of Benchtop Nuclear Magnetic Resonance Spectra toward Food Process Monitoring

Koki Hara, Shunji Yamada, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

Processes, Jun, 2022 Peer-reviewed
Materials Informatics Approach Using Domain Modelling For Exploring Structure-Property Relationships Of Polymers

Hara K, Yamada S, Kurotani A, Chikayama E, Kikuchi J

Scientific reports, 12(1) 10558-10558, Feb, 2022 Peer-reviewed
Signal Deconvolution and Generative Topographic Mapping Regression for Solid-State NMR of Multi-Component Materials

Shunji Yamada, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

International Journal of Molecular Sciences, 22(3) 1086-1086, Jan 22, 2021 Peer-reviewed
Signal Deconvolution and Noise Factor Analysis Based on a Combination of Time–Frequency Analysis and Probabilistic Sparse Matrix Factorization

Shunji Yamada, Atsushi Kurotani, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

International Journal of Molecular Sciences, Apr, 2020 Peer-reviewed
InterSpin: Integrated Supportive Webtools for Low- and High-Field NMR Analyses Toward Molecular Complexity

Yamada S, Ito K, Kurotani A, Yamada Y, Chikayama E, Kikuchi J

ACS Omega, 4(2) 3361-3369, 2019 Peer-reviewed
Exploratory machine-learned theoretical chemical shifts can closely predict metabolic mixture signals.

Ito K, Obuchi Y, Chikayama E, Date Y, Kikuchi J

Chemical science, 9(43) 8213-8220, Nov, 2018 Peer-reviewed
A survey of metabolic changes in potato leaves by NMR-based metabolic profiling in relation to resistance to late blight disease under field conditions

Satoru Tomita, Seishi Ikeda, Shogo Tsuda, Nobutaka Someya, Kenji Asano, Jun Kikuchi, Eisuke Chikayama, Hiroshi Ono, Yasuyo Sekiyama

MAGNETIC RESONANCE IN CHEMISTRY, 55(2) 120-127, Feb, 2017 Peer-reviewed
FoodPro: A web-based tool for evaluating covariance and correlation NMR spectra associated with food processes

Eisuke Chikayama, Ryo Yamashina, Keiko Komatsu, Yuuri Tsuboi, Kenji Sakata, Jun Kikuchi, Yasuyo Sekiyama

Metabolites, 6(4), Dec 1, 2016 Peer-reviewed
The Effect of Molecular Conformation on the Accuracy of Theoretical H-1 and C-13 Chemical Shifts Calculated by Ab Initio Methods for Metabolic Mixture Analysis

Eisuke Chikayama, Yudai Shimbo, Keiko Komatsu, Jun Kikuchi

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 120(14) 3479-3487, Apr, 2016 Peer-reviewed
Spin Couple: Development of a Web Tool for Analyzing Metabolite Mixtures via Two-Dimensional J-Resolved NMR Database

Jun Kikuchi, Yuuri Tsuboi, Keiko Komatsu, Masahiro Gomi, Eisuke Chikayama, Yasuhiro Date

ANALYTICAL CHEMISTRY, 88(1) 659-665, Jan, 2016 Peer-reviewed
Decomposition of multivariate function using the Heaviside step function

Eisuke Chikayama

SPRINGERPLUS, 3 704, Nov, 2014 Peer-reviewed
Solvable model for chemical oscillations

Eisuke Chikayama, Yasuhiro Sunaga, Shigeho Noda, Hideo Yokota

JOURNAL OF MATHEMATICAL CHEMISTRY, 52(2) 399-406, Feb, 2014 Peer-reviewed
Exploring the conformational space of amorphous cellulose using NMR chemical shifts

Tetsuya Mori, Eisuke Chikayama, Yuuri Tsuboi, Nobuhiro Ishida, Noriko Shisa, Yoshiyuki Noritake, Shigeharu Moriya, Jun Kikuchi

CARBOHYDRATE POLYMERS, 90(3) 1197-1203, Oct, 2012 Peer-reviewed
Statistical approach for solid-state NMR spectra of cellulose derived from a series of variable parameters

Keiko Okushita, Takanori Komatsu, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

POLYMER JOURNAL, 44(8) 895-900, Aug, 2012 Peer-reviewed
Solubilization Mechanism and Characterization of the Structural Change of Bacterial Cellulose in Regenerated States through Ionic Liquid Treatment

Keiko Okushita, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

BIOMACROMOLECULES, 13(5) 1323-1330, May, 2012 Peer-reviewed
Deriving Metabolite Information from Biological Resources Using NMR-Based Metabolomics

SEKIYAMA Yasuyo, CHIKAYAMA Eisuke, KIKUCHI Jun

ぶんせき, (446) 81-88, Feb 5, 2012
ECOMICS: A Web-Based Toolkit for Investigating the Biomolecular Web in Ecosystems Using a Trans-omics Approach

Yoshiyuki Ogata, Eisuke Chikayama, Yusuke Morioka, R. Craig Everroad, Amiu Shino, Akihiro Matsushima, Hideaki Haruna, Shigeharu Moriya, Tetsuro Toyoda, Jun Kikuchi

PLOS ONE, 7(2) e30263, Feb, 2012 Peer-reviewed
研究開発を支えるNMRの役割リグノセルロースNMR解析技術の世界動向と将来展望

篠阿弥宇, 近山英輔, 菊地淳

ケミカルエンジニヤリング, 56(8) 608-613, Aug, 2011
Dynamic Omics Approach Identifies Nutrition-Mediated Microbial Interactions

Yumiko Nakanishi, Shinji Fukuda, Eisuke Chikayama, Yayoi Kimura, Hiroshi Ohno, Jun Kikuchi

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH, 10(2) 824-836, Feb, 2011 Peer-reviewed
Evaluation of a Semipolar Solvent System as a Step toward Heteronuclear Multidimensional NMR-Based Metabolomics for C-13-Labelled Bacteria, Plants, and Animals

Yasuyo Sekiyama, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

ANALYTICAL CHEMISTRY, 83(3) 719-726, Feb, 2011 Peer-reviewed

Misc.

Solid-state NMR Signal Deconvolution Method Based on T₂^* Relaxation for Macromolecular Samples with Structural and Compositional Diversity

山田隼嗣, 山田隼嗣, 近山英輔, 近山英輔, 菊地淳, 菊地淳, 菊地淳

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan, 59th, 2020
山積されるNMR情報のデータクレンジング法検討およびツール開発

山田隼嗣, 山田隼嗣, 黒谷篤, 近山英輔, 近山英輔, 菊地淳, 菊地淳, 菊地淳

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2019 ROMBUNNO.3E5a07 (WEB ONLY), Mar 5, 2019
山積されるNMR情報のデータクレンジング法検討およびツール開発

山田隼嗣, 山田隼嗣, 黒谷篤之, 近山英輔, 近山英輔, 菊地淳, 菊地淳, 菊地淳

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan, 57th 134‐135, Sep 3, 2018
卓上および高磁場NMR装置を利用した食品加工過程の分析評価情報ツール開発

CHIKAYAMA EISUKE, CHIKAYAMA EISUKE, YAMASHINA RYO, KOMATSU KEIKO, TSUBOI YURI, SAKATA KENJI, SEKIYAMA YASUYO, SEKIYAMA YASUYO, KAMEYAMA MAYUMI, KIKUCHI JUN …

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, 54th 308-309, Nov 6, 2015
代謝混合物の2D‐J NMRデータの解析webツールの開発と量子化学計算による帰属支援

NAKAYAMA KOYURU, TSUBOI YURI, DATE YASUHIRO, CHIKAYAMA EISUKE, KIKUCHI JUN

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2015 3C25A10 (WEB ONLY), Mar 5, 2015
代謝混合物のシグナル分離に有用な2D‐J NMRデータの解析支援webツールの開発

中山超, 中山超, 近山英輔, 伊達康博, 菊地淳

日本生物工学会大会講演要旨集, 66th 131-131, Aug 5, 2014
A Theory of Decomposition of Complex Chemical Networks using the Hill Functions

Eisuke Chikayama, R. Craig Everroad

May 22, 2014
Decomposition of a Nonlinear Multivariate Function using the Heaviside Step Function

Eisuke Chikayama

Apr 11, 2014
NMRメタボロミクスによるジャガイモ疫病抵抗性マーカーの探索

関山恭代, 池田成志, 津田昌吾, 染谷信孝, 近山英輔, 菊地淳, 小野裕嗣

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2013 WEB ONLY 3A46A11, Mar 5, 2013
セルロースの物理化学特性情報の抽出技術構築に基づく複合微生物系による分解様式の評価

奥下慶子, 飯倉智弘, 伊達康博, 尾形善之, 近山英輔, 菊地淳

日本生物工学会大会講演要旨集, 63rd 121-121, Aug 25, 2011
バイオマス分解・代謝プロセスの解明を支援するECOMICSウェブツールの開発とその適用例

森岡祐介, 尾形善之, 飯倉智弘, 近山英輔, 菊地淳

日本生物工学会大会講演要旨集, 63rd 74-74, Aug 25, 2011
多成分・構造多型の不均一なバイオマスをプロファイル化する

菊地淳, 尾形善之, 森哲哉, 石田亘広, 志佐倫子, 守屋繁春, 近山英輔

日本生物工学会大会講演要旨集, 63rd 92-92, Aug 25, 2011
マルチオーミクス解析による腸内環境分子間ネットワークの構築

加藤完, 福田真嗣, 伊達康博, 近山英輔, 尾形善之, 中西裕美子, 坪井裕理, 守屋繁春, 常田聡, 菊地淳 …

腸内細菌学雑誌, 25(2) 55-55, Apr, 2011
植物生育環境・代謝システムに対するトランスオミクス解析手法の提案

尾形善之, 近山英輔, 森岡祐介, 菊地淳

日本植物生理学会年会要旨集, 52nd 248, Mar 11, 2011
微生物共培養時における代謝システムのオミックス解析

中西裕美子, 福田真嗣, 近山英輔, 木村弥生, 大野博司, 菊地淳

日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011 260, Mar 5, 2011
廃水廃棄物バイオプロセスにおける,バイオマス基質と分解微生物の相関解析―Ecomicsの活用―

森岡祐介, 尾形善之, 飯倉智弘, 山澤哲, 近山英輔, 菊地淳

日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011 9, Mar 5, 2011
種々の生物におけるイオノーム・メタボローム・バイオマスの相関解析

菊地淳, 伊達康博, 坪井裕理, 近山英輔

日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011 160, Mar 5, 2011
衣食住へのバイオマス活用促進に向けた異種相関解析技術の構築

菊地淳, 伊達康博, 坂田研二, 福田真嗣, 近山英輔

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, 49th 96-97, Nov 15, 2010
野外集団における植物‐昆虫‐共生細菌間相互作用に介在する化学物質と昆虫遺伝形質の共相関解析

佐々木宏和, 土田努, 坪井裕理, 近山英輔, 菊地淳

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, 49th 400-401, Nov 15, 2010
第一原理量子化学計算と古典分子動力学計算による化学シフト・構造相関の評価

近山英輔, 尾形善之, 森岡祐介, 菊地淳

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, 49th 412-413, Nov 15, 2010

Books and Other Publications

メタボロミクス:その解析技術と臨床・創薬応用研究の最前線 (遺伝子医学MOOK 16号)

近山英輔, 赤木謙一, 菊地淳, 田口良 (Role: Contributor, NMRメタボロミクス解析ソフトウエア)

メディカルドゥ, Feb, 2010 (ISBN: 4944157460)

Presentations

非線形関数のステップ関数表示の公式

近山英輔

日本生物物理学会第51回年会, Oct 28, 2013
NMRメタボロミクスによるジャガイモ疫病抵抗性マーカーの探索

関山恭代, 池田成志, 津田昌吾, 染谷信孝, 近山英輔, 菊地淳, 小野裕嗣

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), Mar 5, 2013
Hill式による非線形自励力学系の近似計算

近山英輔

日本生物物理学会第50回年会, Sep 22, 2012
NMR-based metabolite profiling in potato and rice plants

Y. Sekiyama, S. Ikeda, S. Tsuda, N. Someya, E. Chikayama, J. Kikuchi, H. Ono

METABOLOMICS 2012, Jun 25, 2012
Evaluation of cellulose degradation properties in microbial ecosystem by solution and solid-state NMR

Keiko Okushita, Tomohiro iikura, Yasuhiro Date, Yoshiyuki Ogata, Eisuke Chikayama, Jun Kikuchi

ISNMR 2011, Nov 15, 2011
連続体のパターン選択を考慮した運動方程式の近似表現

近山英輔

日本生物物理学会第49回年会, Sep 16, 2011
多成分・構造多型の不均一なバイオマスをプロファイル化する

菊地淳, 尾形善之, 森哲哉, 石田亘広, 志佐倫子, 守屋繁春, 近山英輔

日本生物工学会大会講演要旨集, Aug 25, 2011
バイオマス分解・代謝プロセスの解明を支援するECOMICSウェブツールの開発とその適用例

森岡祐介, 尾形善之, 飯倉智弘, 近山英輔, 菊地淳

日本生物工学会大会講演要旨集, Aug 25, 2011
セルロースの物理化学特性情報の抽出技術構築に基づく複合微生物系による分解様式の評価

奥下慶子, 飯倉智弘, 伊達康博, 尾形善之, 近山英輔, 菊地淳

日本生物工学会大会講演要旨集, Aug 25, 2011
マルチオーミクス解析による腸内環境分子間ネットワークの構築

加藤完, 福田真嗣, 伊達康博, 近山英輔, 尾形善之, 中西裕美子, 坪井裕理, 守屋繁春, 常田聡, 菊地淳, 大野博司

腸内細菌学雑誌, Apr, 2011
植物生育環境・代謝システムに対するトランスオミクス解析手法の提案

尾形善之, 近山英輔, 森岡祐介, 菊地淳

日本植物生理学会年会要旨集, Mar 11, 2011
種々の生物におけるイオノーム・メタボローム・バイオマスの相関解析

菊地淳, 伊達康博, 坪井裕理, 近山英輔

日本農芸化学会大会講演要旨集, Mar 5, 2011
微生物共培養時における代謝システムのオミックス解析

中西裕美子, 福田真嗣, 近山英輔, 木村弥生, 大野博司, 菊地淳

日本農芸化学会大会講演要旨集, Mar 5, 2011
廃水廃棄物バイオプロセスにおける,バイオマス基質と分解微生物の相関解析―Ecomicsの活用―

森岡祐介, 尾形善之, 飯倉智弘, 山澤哲, 近山英輔, 菊地淳

日本農芸化学会大会講演要旨集, Mar 5, 2011
衣食住へのバイオマス活用促進に向けた異種相関解析技術の構築

菊地淳, 伊達康博, 坂田研二, 福田真嗣, 近山英輔

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, Nov 15, 2010
野外集団における植物‐昆虫‐共生細菌間相互作用に介在する化学物質と昆虫遺伝形質の共相関解析

佐々木宏和, 土田努, 坪井裕理, 近山英輔, 菊地淳

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, Nov 15, 2010
第一原理量子化学計算と古典分子動力学計算による化学シフト・構造相関の評価

近山英輔, 尾形善之, 森岡祐介, 菊地淳

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, Nov 15, 2010
発現遺伝子情報に基づく腸内環境評価系の構築

加藤完, 福田真嗣, 伊達康博, 近山英輔, 中西裕美子, 坪井裕理, 守屋繁春, 常田聡, 菊地淳, 大野博司

腸内細菌学雑誌, Apr, 2010
日本各地の自然環境下における植物‐昆虫―共生細菌間相互作用に介在する化学物質と昆虫遺伝形質の共相関解析

佐々木宏和, 土田努, 坪井裕理, 近山英輔, 松本正吾, 菊地淳

日本農芸化学会大会講演要旨集, Mar 5, 2010
¹³C標識生体サンプルを用いた比較メタボローム解析と植物抽出過程における代謝物プロファイリング

関山恭代, 近山英輔, 菊地淳

Abstr Annu Meet NMR Soc Jpn, Nov 10, 2009

Teaching Experience

Professional Memberships

Research Projects

Challenge on data driven research foundation by merging formalism and AI

Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory), Japan Society for the Promotion of Science, Jun, 2023 - Mar, 2026
複合現実デバイスを装着した術者視界への高分解能機能的MRIデータの付加

新潟大学脳研究所共同利用・共同研究, 新潟大学, Apr, 2018 - Mar, 2019

近山英輔
3次元細胞シミュレーション専用機の開発

科学研究費助成事業, 日本学術振興会, Apr, 2016 - Mar, 2019

近山英輔
食品のプロファイル解析プラットフォームの構築と実証研究

平成26年度「農林水産業の革新的技術緊急展開事業（うち技術革新を加速化する最先端分析技術の応用）」, 農林水産省, Mar, 2015 - Mar, 2016

亀山真由美
大規模ゲノムデータを基盤とした情報解析手法の開発

新潟大学脳研究所共同利用・共同研究, 新潟大学, Apr, 2013 - Mar, 2014

近山英輔

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