Tama Florence (Florence Tama) - マイポータル

基本情報

所属: 名古屋大学

J-GLOBAL ID: 201801011889764686
researchmap会員ID: B000337729

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

経歴

2015年3月 - 現在

Nagoya University, Professor
2013年1月 - 現在

RIKEN - Center for Computational Sciences, Team Leader
2006年1月 - 2012年12月

University of Arizona, Assistant Professor
2001年1月 - 2005年10月

The Scripps Research Institute, Post-Doctoral researcher

論文

Single-Cell Fluorescence Analysis of Lipid Droplet Compositional Dynamics during Triacylglycerol Catabolism.

Junwei Wang, Keiji Kajiwara, Manish Kesherwani, Florence Tama, Yuki Ohsaki, Shigehiro Yamaguchi, Masayasu Taki

Journal of the American Chemical Society 2025年10月9日
Flexible Fitting to Infer Atomistic-Precision Models of Large-Amplitude Conformational Dynamics in Biomolecules from High-Speed Atomic Force Microscopy Imaging.

Romain Amyot, Osamu Miyashita, Xuan Wu, Kazusa Takeda, Noriyuki Kodera, Hiroki Konno, Florence Tama, Holger Flechsig

ACS nano 19(38) 34065-34079 2025年9月30日
Modeling Conformational Transitions of Biomolecules from Atomic Force Microscopy Images using Normal Mode Analysis.

Xuan Wu, Osamu Miyashita, Florence Tama

The journal of physical chemistry. B 2024年9月25日
Stereochemistry-Dependent Labeling of Organelles with a Near-Infrared-Emissive Phosphorus-Bridged Rhodamine Dye in Live-Cell Imaging.

Qian Wu, Masayasu Taki, Yoshiki Tanaka, Manish Kesherwani, Quan Manh Phung, Sawako Enoki, Yasushi Okada, Florence Tama, Shigehiro Yamaguchi

Angewandte Chemie (International ed. in English) e202400711 2024年2月5日
Data Science for Integrated Dynamic Structural Biology—the 21st IUPAB Congress session summary commentary

Florence Tama, Jianhan Chen

Biophysical Reviews 2024年査読有り招待有り筆頭著者
Structure determination using high-order spatial correlations in single-particle X-ray scattering.

Wenyang Zhao, Osamu Miyashita, Miki Nakano, Florence Tama

IUCrJ 11(Pt 1) 92-108 2024年1月1日
Advancing cryo-electron microscopy data analysis through accelerated simulation-based flexible fitting approaches.

Osamu Miyashita, Florence Tama

Current opinion in structural biology 82 102653-102653 2023年7月12日査読有り責任著者
Molecular size dependence on achievable resolution from XFEL single-particle 3D reconstruction.

Miki Nakano, Osamu Miyashita, Florence Tama

Structural dynamics 10(2) 024101-024101 2023年3月査読有り責任著者
MDSPACE: Extracting Continuous Conformational Landscapes from Cryo-EM Single Particle Datasets Using 3D-to-2D Flexible Fitting based on Molecular Dynamics Simulation.

Rémi Vuillemot, Alex Mirzaei, Mohamad Harastani, Ilyes Hamitouche, Léo Fréchin, Bruno P Klaholz, Osamu Miyashita, Florence Tama, Isabelle Rouiller, Slavica Jonic

Journal of molecular biology 435(9) 167951-167951 2023年1月10日査読有り
SWEET13 transport of sucrose, but not gibberellin, restores male fertility in Arabidopsis sweet13;14.

Reika Isoda, Zoltan Palmai, Akira Yoshinari, Li-Qing Chen, Florence Tama, Wolf B Frommer, Masayoshi Nakamura

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(42) e2207558119 2022年10月18日査読有り
CRY2 isoform selectivity of a circadian clock modulator with antiglioblastoma efficacy.

Simon Miller, Manish Kesherwani, Priscilla Chan, Yoshiko Nagai, Moeri Yagi, Jamie Cope, Florence Tama, Steve A Kay, Tsuyoshi Hirota

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(40) e2203936119 2022年10月4日査読有り
Three-dimensional structure determination of gold nanotriangles in solution using X-ray free-electron laser single-particle analysis

Miki Nakano, Osamu Miyashita, Yasumasa Joti, Akihiro Suzuki, Hideyuki Mitomo, Yoshiya Niida, Ying Yang, Hirokatsu Yumoto, Takahisa Koyama, Kensuke Tono …

Optica 2022年6月6日査読有り最終著者責任著者
Light-Control over Casein Kinase 1δ Activity with Photopharmacology: A Clear Case for Arylazopyrazole-Based Inhibitors.

Albert M Schulte, Dušan Kolarski, Vidya Sundaram, Ashutosh Srivastava, Florence Tama, Ben L Feringa, Wiktor Szymanski

International journal of molecular sciences 23(10) 2022年5月10日査読有り
High-resolution structure of phosphoketolase from Bifidobacterium longum determined by cryo-EM single-particle analysis.

Kunio Nakata, Naoyuki Miyazaki, Hiroki Yamaguchi, Mika Hirose, Tatsuki Kashiwagi, Nidamarthi H V Kutumbarao, Osamu Miyashita, Florence Tama, Hiroshi Miyano, Toshimi Mizukoshi …

Journal of structural biology 214(2) 107842-107842 2022年2月15日査読有り
NMMD: Efficient cryo-EM flexible fitting based on simultaneous Normal Mode and Molecular Dynamics atomic displacements.

Rémi Vuillemot, Osamu Miyashita, Florence Tama, Isabelle Rouiller, Slavica Jonic

Journal of molecular biology 434(7) 167483-167483 2022年2月9日査読有り
Structures of human pannexin-1 in nanodiscs reveal gating mediated by dynamic movement of the N terminus and phospholipids.

Maki Kuzuya, Hidemi Hirano, Kenichi Hayashida, Masakatsu Watanabe, Kazumi Kobayashi, Tohru Terada, Md Iqbal Mahmood, Florence Tama, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi …

Science signaling 15(720) eabg6941 2022年2月8日査読有り
Identifying Structural Properties of Proteins from X-ray Free Electron Laser Diffraction Patterns

Paula Olaya, Silvina Caino-Lores, Vanessa Lama, Ria Patel, Ariel Keller Rorabaugh, Osamu Miyashita, Florence Tama, Michela Taufer

2022 IEEE 18TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON E-SCIENCE (ESCIENCE 2022) 21-31 2022年査読有り
A Methodology to Generate Efficient Neural Networks for Classification of Scientific Datasets

Ria Patel, Ariel Keller Rorabaugh, Paula Olaya, Silvina Caino-Lores, Georgia Channing, Catherine Schuman, Osamu Miyashita, Florence Tama, Michela Taufer

2022 IEEE 18TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON E-SCIENCE (ESCIENCE 2022) 389-390 2022年査読有り
A hybrid approach to study large conformational transitions of biomolecules from single particle XFEL diffraction data.

Han Asi, Bhaskar Dasgupta, Tetsuro Nagai, Osamu Miyashita, Florence Tama

Frontiers in molecular biosciences 9 913860-913860 2022年査読有り最終著者責任著者
Protocol for Retrieving Three-Dimensional Biological Shapes for a Few XFEL Single-Particle Diffraction Patterns.

Sandhya P Tiwari, Florence Tama, Osamu Miyashita

Journal of chemical information and modeling 61(8) 4108-4119 2021年8月23日査読有り

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MISC

ショ糖かジベレリンか?-二つの基質の輸送活性を切り分けたSWEET13の機能解明

礒田玲華, PALMAI Zoltan, 吉成晃, CHEN Li-Qing, TAMA Florence, TAMA Florence, TAMA Florence, FROMMER Wolf B., FROMMER Wolf B., 中村匡良

日本植物生理学会年会(Web) 64th 2023年
糖輸送体SWEETの基質選択性を操作する

礒田玲華, PALMAI Zoltan, 吉成晃, CHEN Li-Qing, TAMA Florence, TAMA Florence, TAMA Florence, FROMMER Wolf B., FROMMER Wolf B., 中村匡良

トランスポーター研究会年会抄録集 17th (Web) 2023年

共同研究・競争的資金等の研究課題

データ融合シミュレーションによるタンパク質の動的構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

TAMA FLORENCE, 宮下治
Database of Molecular Shapes and Diffraction Patterns for X-ray Free Electron Laser Data Analysis

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

TAMA FLORENCE
動的構造生命科学研究領域における海外ネットワーク形成を目指した支援活動

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年11月 - 2019年3月

神田大輔, 安藤敏夫, 白川昌宏, 西田紀貴, 杉田有治, 塚崎智也, 甲斐荘正恒, TAMA FLORENCE, 稲垣冬彦
マルチレゾリューション法を用いたタンパク質複合体の高解像度動的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年7月 - 2019年3月

杉田有治, TAMA FLORENCE
コンピューティングを活用した寄生植物ストライガを抑制する生命機能分子の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2017年11月 - 2018年3月

TAMA FLORENCE, RAKERS CHRISTIN