谷澤英樹 (Hideki Tanizawa) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学遺伝子制御研究所ゲノム医生物学分野准教授

学位: 博士（工学）(2009年3月名古屋大学)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-2573-2473
J-GLOBAL ID: 202201015339128535
Researcher ID: B-2631-2008
researchmap会員ID: R000044394

研究キーワード

ゲノムの３次元構造

研究分野

ライフサイエンス / システムゲノム科学 /

経歴

2022年9月 - 現在

北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 准教授
2019年9月 - 2022年8月

University of Oregon, The Institute of Molecular Biology, Director of Genome Function Bioinformatic Services
2017年9月 - 2019年8月

The Wistar Institute, Bioinformatics Facility, Staff Scientist
2016年9月 - 2019年8月

The Wistar Institute, Associate Staff Scientist
2013年9月 - 2016年8月

The Wistar Institute, Research Fellow
2009年4月 - 2013年8月

The Wistar Institute, Postdoctoral Scientist

学歴

2005年4月 - 2009年3月

名古屋大学, 工学研究科

論文

Step-by-Step Protocol to Generate Hi-C Contact Maps Using the rfy_hic2 Pipeline.

Hideki Tanizawa, Claire Yik-Lok Chung, Shun-Ichiro Fuse, Tomomi Hayashi, Peter Weisel, Ken-Ichi Noma

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2856 133-155 2025年
Novel Role of Zinc-Finger Protein 518 in Heterochromatin Formation on alpha-Satellite DNA

Shinya Ohta, Jun-ichirou Ohzeki, Nobuko Sato, Hideki Tanizawa, Claire Chung, Ken-ichi Noma, Hiroshi Masumoto

Nucleic Acids Research 2024年11月査読有り
The RPD3L deacetylation complex is required for facultative heterochromatin repression in Neurospora crassa

Colleen C. Mumford, Hideki Tanizawa, Elizabeth T. Wiles, Kevin J. McNaught, Kirsty Jamieson, Kenta Tsukamoto, Eric U. Selker

Proceedings of the National Academy of Sciences 121(32) 2024年7月29日査読有り
A role for condensin-mediator interaction in mitotic chromosomal organization.

Osamu Iwasaki, Sanki Tashiro, Claire Chung, Tomomi Hayashi, Hideki Tanizawa, Xuebing Wang, Shinya Ohta, Yuko Fujioka, Joseph Han, Gabrielle Tabor …

bioRxiv : the preprint server for biology 2024年6月28日
METTL3-mediated chromatin contacts promote stress granule phase separation through metabolic reprogramming during senescence.

Chen Wang, Hideki Tanizawa, Connor Hill, Aaron Havas, Qiang Zhang, Liping Liao, Xue Hao, Xue Lei, Lu Wang, Hao Nie …

Nature communications 15(1) 5410-5410 2024年6月26日
Chemo-senolytic therapeutic potential against angiosarcoma

Xuebing Wang, Claire Yik-Lok Chung, Ai Yoshioka, Shinya Hashimoto, Haruki Jimbo, Hideki Tanizawa, Shinya Ohta, Takeshi Fukumoto, Ken-ichi Noma

Journal of Investigative Dermatology 2024年4月
Establishment of dsDNA-dsDNA interactions by the condensin complex.

Minzhe Tang, Georgii Pobegalov, Hideki Tanizawa, Zhuo A Chen, Juri Rappsilber, Maxim Molodtsov, Ken-Ichi Noma, Frank Uhlmann

Molecular cell 83(21) 3787-3800 2023年11月2日
Characterization of a new CCCTC-binding factor binding site as a dual regulator of Epstein-Barr virus latent infection

Sun Hee Lee, Kyoung-Dong Kim, Miyeon Cho, Sora Huh, Seong Ho An, Donghyun Seo, Kyuhyun Kang, Minhee Lee, Hideki Tanizawa, Inuk Jung …

PLOS Pathogens 19(1) e1011078-e1011078 2023年1月25日
Rec8 Cohesin-mediated Axis-loop chromatin architecture is required for meiotic recombination

Takeshi Sakuno, Sanki Tashiro, Hideki Tanizawa, Osamu Iwasaki, Da-Qiao Ding, Tokuko Haraguchi, Ken-ichi Noma, Yasushi Hiraoka

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 50(7) 3799-3816 2022年4月
The ACF chromatin-remodeling complex is essential for Polycomb repression

Elizabeth T. Wiles, Colleen C. Mumford, Kevin J. McNaught, Hideki Tanizawa, Eric U. Selker

ELIFE 11 2022年3月
The three-dimensional structure of Epstein-Barr virus genome varies by latency type and is regulated by PARP1 enzymatic activity

Sarah M. Morgan, Hideki Tanizawa, Lisa Beatrice Caruso, Michael Hulse, Andrew Kossenkov, Jozef Madzo, Kelsey Keith, Yinfei Tan, Sarah Boyle, Paul M. Lieberman …

NATURE COMMUNICATIONS 13(1) 2022年1月
Epigenetic specifications of host chromosome docking sites for latent Epstein-Barr virus

Kim, K.-D., Tanizawa, H., De Leo, A., Vladimirova, O., Kossenkov, A., Lu, F., Showe, L.C., Noma, K.-I., Lieberman, P.M.

Nature Communications 11(1) 2020年
Involvement of condensin in cellular senescence through gene regulation and compartmental reorganization

Iwasaki, O., Tanizawa, H., Kim, K.-D., Kossenkov, A., Nacarelli, T., Tashiro, S., Majumdar, S., Showe, L.C., Zhang, R., Noma, K.-I.

Nature Communications 10(1) 2019年
ARID1A spatially partitions interphase chromosomes

Wu, S., Fatkhutdinov, N., Rosin, L., Luppino, J.M., Iwasaki, O., Tanizawa, H., Tang, H.-Y., Kossenkov, A.V., Gardini, A., Noma, K.-I. …

Science Advances 5(5) 2019年
Architectural alterations of the fission yeast genome during the cell cycle

Tanizawa, H., Kim, K.-D., Iwasaki, O., Noma, K.-I.

Nature Structural and Molecular Biology 24(11) 965-+ 2017年
Swi1^TimelessPrevents Repeat Instability at Fission Yeast Telomeres

Gadaleta, M.C., Das, M.M., Tanizawa, H., Chang, Y.-T., Noma, K.-I., Nakamura, T.M., Noguchi, E.

PLoS Genetics 12(3) 2016年
HMGB2 orchestrates the chromatin landscape of senescence-associated secretory phenotype gene loci

Aird, K.M., Iwasaki, O., Kossenkov, A.V., Tanizawa, H., Fatkhutdinov, N., Bitler, B.G., Le, L., Alicea, G., Yang, T.-L., Johnson, F.B. …

Journal of Cell Biology 215(3) 325-334 2016年
Transcription factors mediate condensin recruitment and global chromosomal organization in fission yeast

Kim, K.-D., Tanizawa, H., Iwasaki, O., Noma, K.-I.

Nature Genetics 48(10) 1242-1252 2016年
Interaction between TBP and Condensin Drives the Organization and Faithful Segregation of Mitotic Chromosomes

Iwasaki, O., Tanizawa, H., Kim, K.-D., Yokoyama, Y., Corcoran, C.J., Tanaka, A., Skordalakes, E., Showe, L.C., Noma, K.-I.

Molecular Cell 59(5) 755-767 2015年
Mapping of Long-Range Associations throughout the Fission Yeast Genome Reveals Global Genome Organization Linked to Transcriptional Regulation

Hideki Tanizawa, Osamu Iwasaki, Atsunari Tanaka, Joseph R. Capizzi, Priyankara Wickramasinghe, Mihee Lee, Zhiyan Fu, Ken-ichi Noma

BIOPHYSICAL JOURNAL 104(2) 425A-425A 2013年1月

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講演・口頭発表等

Mapping of long-range associations throughout the fission yeast genome reveals global genome organization linked to transcriptional regulation

Hideki Tanizawa

Biophysical Society 57th Annual Meeting 2013年2月2日
Predicting intrinsically flexible region of coiled coil

Hideki Tanizawa

2008年10月8日招待有り
Prediction system of coiled coil domain with heptad breaks regions: SOSUIcoil

Hideki Tanizawa

International Symposium on Recent Trends in Macromolecular Structure and Function 2008年1月7日招待有り
Amino acid sequence analysis of motor protein by physical finger print method

Hideki Tanizawa

Fifth East Asian Biophysics Symposium & forty-fourth Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2006年11月12日
Analysis of amino acid sequences of motor protein by physical finger print method

2006 Annual Meeting of CBI Society 2006年7月24日
New hypothesis of myosin binding based on Amino Acid Sequence

International Symposium on Frontiers of Computational Science 2005 2005年12月12日

所属学協会

2024年9月 - 現在

日本分子生物学会
2024年8月 - 現在

日本バイオインフォマティクス学会

谷澤英樹

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講演・口頭発表等

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