川又生吹 (Ibuki Kawamata) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院理学研究科物理学・宇宙物理学専攻准教授

学位: 博士（情報理工学）(2014年3月東京大学大学院情報理工学研究科)

研究者番号: 30733977
J-GLOBAL ID: 201801005123148380
researchmap会員ID: B000333861

外部リンク: https://ibuki-kawamata.org/

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年12月 - 現在

京都大学, 大学院理学研究科物理学・宇宙物理学専攻, 准教授
2020年2月 - 2023年11月

お茶の水女子大学, 基幹研究院自然科学, 助教クロスアポイントメント（兼任）
2016年4月 - 2023年11月

東北大学, 大学院工学研究科ロボティクス専攻, 助教
2017年4月 - 2018年3月

Technical University of Munich (Visiting researcher)
2014年4月 - 2016年3月

東北大学大学院工学研究科バイオロボティクス専攻
2011年4月 - 2014年3月

日本学術振興会特別研究員 DC1

学歴

2009年4月 - 2014年3月

東京大学大学院情報理工学系研究科コンピュータ科学
2005年4月 - 2009年3月

東京大学理学部情報科学科

委員歴

2023年11月

BIOMOD 2023, 会計委員
2023年11月

CBI学会2023年フォーカストセッションFS07「分子ロボティクス研究会」, モデレーター
2023年10月

CBI学会2023年大会, プログラム委員
2023年9月

the 29th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA29), Program Committee
2023年9月

the 29th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA29), Local Organization Committee
2023年9月

DNAナノ構造体のモデル化および可視化のためのソフトウェア講習, 主催
2023年6月 - 2023年8月

分子ロボティクス夏の学校2023, 実行委員
2023年

分子ロボティクス研究会, 幹事（ウェブ担当）
2022年1月 - 2022年12月

CBI学会2022年大会, プログラム委員
2022年1月 - 2022年12月

知能分子ロボティクス調査研究会, 主査
2022年5月 - 2022年11月

第6回分子ロボティクス年次大会, 大会実行委員長
2019年11月 - 2022年10月

「細胞を創る」研究会, 評議員
2022年4月 - 2022年9月

分子ロボティクス夏の学校2022, 実行委員
2022年4月 - 2022年9月

BIOMOD Japan Open 2021, 運営チーム、チームEメンター
2021年1月 - 2021年12月

知能分子ロボティクス調査研究会, 副主査
2021年1月 - 2021年12月

CBI学会2021年大会, プログラム委員
2021年1月 - 2021年12月

Nano and Micro Scale Fabrication for Molecular Cybernetics and Molecular Robotics, Special Issue Editor
2021年8月 - 2021年11月

BIOMOD Japan Open 2021, 委員、チームDメンター
2021年6月 - 2021年11月

第5回分子ロボティクス年次大会, プログラム委員
2021年6月 - 2021年8月

分子ロボティクス夏の学校2021, 実行委員

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受賞

論文

Chemo-mechanical forces modulate the topology dynamics of mesoscale DNA assemblies

Deepak Karna, Eriko Mano, Jiahao Ji, Ibuki Kawamata, Yuki Suzuki, Hanbin Mao

Nature Communications 14(1) 2023年10月13日査読有り責任著者
Multi-Reconfigurable DNA Origami Nanolattice Driven by the Combination of Orthogonal Signals

Kotaro Watanabe, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Yuki Suzuki

JACS Au 3(5) 1435-1442 2023年4月27日査読有り
Collective Cargo Transport and Sorting with Molecular Swarms

Nathanael Aubert-Kato, Geoff Nitschke, Ibuki Kawamata, Akira Kakugo

The 2023 Conference on Artificial Life 2023年査読有り
Self-replication and Mutation of Polymeric Molecules Simulated by Simplified Chemistry

Taisei Mori, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata

2022 Tenth International Symposium on Computing and Networking Workshops (CANDARW) 2022年11月査読有り
Algorithmic Design of 3D Wireframe RNA Polyhedra

Antti Elonen, Ashwin Karthick Natarajan, Ibuki Kawamata, Lukas Oesinghaus, Abdulmelik Mohammed, Jani Seitsonen, Yuki Suzuki, Friedrich C. Simmel, Anton Kuzyk, Pekka Orponen

ACS Nano 2022年9月30日査読有り
Lipid bilayer-assisted dynamic self-assembly of hexagonal DNA origami blocks into monolayer crystalline structures with designed geometries

Yuki Suzuki, Ibuki Kawamata, Kotaro Watanabe, Eriko Mano

iScience 25(5) 104292-104292 2022年5月査読有り
Algorithmic design of 3D wireframe RNA polyhedra

2022年4月28日
Autonomous and Programmable Strand Generator Implemented as DNA and Enzymatic Chemical Reaction Cascade

40(2) 723-736 2022年2月27日査読有り筆頭著者責任著者
Web Server with a Simple Interface for Coarse-grained Molecular Dynamics of DNA Nanostructures

Yudai Yamashita, Kotaro Watanabe, Satoshi Murata, Ibuki Kawamata

Chem-Bio Informatics Journal 21 28-38 2021年4月30日査読有り最終著者責任著者
Chemo-Mechanical Modulation of Cell Motions Using DNA Nanosprings

Deepak Karna, Morgan Stilgenbauer, Sagun Jonchhe, Kazuya Ankai, Ibuki Kawamata, Yunxi Cui, Yao-Rong Zheng, Yuki Suzuki, Hanbin Mao

Bioconjugate Chemistry 32(2) 311-317 2021年2月17日査読有り
大学の枠を超えたオンライン生体分子デザインコンペティションの取り組み

村田智, 葛谷明紀, 藤原慶, 平順一, 川又生吹, 佐藤佑介, 瀧ノ上正浩, 野村 M, 慎一郎, 角五彰 …

工学教育 69(4) 31-39 2021年査読有り
Cascaded pattern formation in hydrogel medium using the polymerisation approach

Keita Abe, Satoshi Murata, Ibuki Kawamata

Soft Matter 17(25) 6160-6167 2021年査読有り最終著者責任著者
A large, square-shaped, DNA origami nanopore with sealing function on a giant vesicle membrane

Shoji Iwabuchi, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Shin-ichiro M. Nomura

Chemical Communications 57(24) 2990-2993 2021年査読有り
DNA Ring Motif with Flexible Joints

Shiyun Liu, Satoshi Murata, Ibuki Kawamata

Micromachines 11(11) 987-987 2020年10月31日査読有り最終著者責任著者
Large Deformation of a DNA-Origami Nanoarm Induced by the Cumulative Actuation of Tension-Adjustable Modules.

Yuki Suzuki, Ibuki Kawamata, Kohei Mizuno, Satoshi Murata

Angewandte Chemie (International ed. in English) 59(15) 6230-6234 2020年4月6日査読有り責任著者
Turing-completeness of asynchronous non-camouflage cellular automata

Tatsuya Yamashita, Teijiro Isokawa, Ferdinand Peper, Ibuki Kawamata, Masami Hagiya

Information and Computation 104539-104539 2020年3月査読有り
Design Automation of Polyomino Set That Self-Assembles into a Desired Shape

Matsumura, Yuta, Kawamata, Ibuki, Murata, Satoshi

26th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA 26) 174 8:1-8:15 2020年査読有り
DNA Origami “Quick” Refolding Inside of a Micron-Sized Compartment

Taiki Watanabe, Yusuke Sato, Hayato Otaka, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Shin-Ichiro M. Nomura

Molecules 25(1) 8 2020年1月査読有り
Isothermal amplification of specific DNA molecules inside giant unilamellar vesicles

Yusuke Sato, Ken Komiya, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Shin-ichiro M. Nomura

CHEMICAL COMMUNICATIONS 55(62) 9084-9087 2019年8月査読有り
Pattern Formation on Discrete Gel Matrix Based on DNA Computing

Hosoya Takuto, Kawamata Ibuki, Nomura Shin-ichiro M, Murata Satoshi

NEW GENERATION COMPUTING 37(1) 97-111 2019年1月査読有り

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MISC

DNA オリガミ法で作るナノ構造体

川又生吹

化学とマイクロ・ナノシステム学会誌 2023年10月筆頭著者最終著者責任著者
口頭発表O7 『分子ロボティクス/レギュラトリサイエンス』

川又生吹

CBI学会誌 10 40 2022年12月筆頭著者最終著者責任著者
口頭発表O8 『創薬応用 (3)/分子ロボティクス』

本間光貴, 川又生吹

CBI学会誌 10 41 2022年12月最終著者
第6回分子ロボティクス年次大会活動報告

川又生吹

学術変革領域（A) Molecular Cybernetics News Letter 分子サイバネティクスニュースレター 8 8-9 2022年12月筆頭著者最終著者責任著者
Advancement of Computer-aided Design Software and Simulation tools for Nucleic acid Nanostructures and DNA Origami

Ibuki Kawamata

DNA Origami: Structures, Technology, and Applications 2022年5月筆頭著者最終著者責任著者
Development of Browser-Based Software for Intuitively Manipulating and Integrating DNA Nanostructures

2021年9月査読有り筆頭著者責任著者
新刊情報 "DNA origami入門基礎から学ぶDNAナノ構造体の設計技法"

川又生吹

分子サイバネティクスニュースレター 1 5 2021年
研究最前線 "Cascaded pattern formation in hydrogel medium using the polymerisation approach"

川又生吹

分子サイバネティクスニュースレター 3 1 2021年
口頭発表３「ADME・毒性 / バイオインフォマティックス / 分子ロボティクス / その他」

夏目やよい, 川又生吹

CBI学会誌 9(4) 37-37 2021年
<口頭発表3> 分子ロボティクス

佐藤佑介, 川又生吹, 小宮健

CBI学会誌 8(4) 26-27 2020年12月
Programmable reactions and diffusion using DNA for pattern formation in hydrogel medium

Keita Abe, Ibuki Kawamata, Shin Ichiro, M. Nomura, Satoshi Murata

Molecular Systems Design and Engineering 4 639-643 2019年6月1日
マイクロ流路デバイスによるゲル微粒子の合成とゲルオートマトンへの応用

西諒也, 川又生吹, 宮元展義

高分子学会予稿集(CD-ROM) 67(2) ROMBUNNO.1Pb020 2018年8月29日
自己集合サイズがプログラム可能なDNAナノモジュールの設計

LIU Shiyun, 安部桂太, 内田健央, 遠藤佑真, 秋田賢, 市堰翔成, 荒舘笙, 斎藤正崇, 吉川太陽, 福地成彦 …

形の科学シンポジウム講演予稿集(Web) 85th 23‐24 (WEB ONLY) 2018年6月
DNA反応拡散系によるハイドロゲル媒質中への濃度勾配パターンの形成と制御

安部桂太, 川又生吹, 鈴木勇輝, 野村M, 慎一郎, 村田智

形の科学シンポジウム講演予稿集(Web) 85th 39‐40 (WEB ONLY) 2018年6月
DNAオリガミを用いて膜に穴を開ける:φ12nm人工チャネルの設計と機能評価

岩渕祥璽, 片山航一郎, 川又生吹, 鈴木勇輝, 村田智, 野村M.慎一郎

形の科学シンポジウム講演予稿集(Web) 85th 11‐12 (WEB ONLY) 2018年6月
Non natural tiny-wet machine: Molecular robot

Sato Yusuke, Sato Yusuke, Hiratsuka Yuichi, Kawamata Ibuki, Murata Satoshi, Nomura M. Shin-Ichiro

MHS 2017 - 28th 2017 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science 2018-January 1-3 2018年2月28日
環境応答能を有するらせん状DNAオリガミナノ構造体の構築

水野康平, 鈴木勇輝, 川又生吹, 野村慎一郎, 村田智

自律分散システム・シンポジウム(CD-ROM) 30th ROMBUNNO.1A1‐3 2018年1月28日
DNA反応拡散系によるゲル媒質中でのパターン形成

安部桂太, 川又生吹, 鈴木勇輝, 野村M, 慎一郎, 村田智

自律分散システム・シンポジウム(CD-ROM) 30th ROMBUNNO.1A1‐2 2018年1月28日
Robustness of DNA Strand Displacement Systems (accepted)

Takashi Nakakuki, Jun-ichi Imura, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata

5th IFAC Conference on Analysis and Control of Chaotic Systems 2018年
臨床検査は人工知能AIをどのように利用できるか 4.アメーバ型分子ロボットの可能性

佐藤佑介, 佐藤佑介, 川又生吹, 野村M.慎一郎

医療と検査機器・試薬 40(3) 190‐194 2017年6月10日

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書籍等出版物

DNA origami入門: 基礎から学ぶDNAナノ構造の設計技法

川又生吹, 鈴木勇輝, 村田智 (担当:共著, 範囲:全13章中11章)

2021年5月
分子ロボティクス概論 : 分子のデザインでシステムをつくる

分子ロボティクス研究会, 村田, 智

CBI学会 2019年 (ISBN: 9784990907648)
DNA分子デザインのすべて : BIOMOD虎の巻

分子ロボティクス研究会

情報計算化学生物学会 2016年 (ISBN: 9784990907679)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

分子シミュレーションと実験自動化による大規模DNA構造体設計手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2026年3月

川又生吹
ミニマル人工脳のための記憶・学習分子回路の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2020年11月 - 2025年3月

中茎隆, 嶋田直彦, 小宮健, 川又生吹
時空間分子プログラミングの新展開

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2020年4月 - 2025年3月

村田智, 川又生吹
分子群ロボティクス：分子群ロボットによる仕事の検証と社会実装課題の提案

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2021年4月 - 2024年3月

角五彰, オベル加藤ナタナエル, 川又生吹
DNAオリガミ超分子の合理設計に向けた新規プラットフォーム開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2021年3月

川又生吹
DNA膜モチーフによる人工膜システムの創成

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2018年6月 - 2020年3月

村田智, 川又生吹
分子ロボティクスによる糖尿病モデルマウス血糖値制御法の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2017年4月 - 2020年3月

小長谷明彦, 池田将, 湯川博, 川又生吹, 野口洋文, 柳澤実穂, 豊田太郎, 梅田民樹
分子ロボットの行動プログラミングのための制御系構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2015年4月 - 2019年3月

村田智, 中茎隆, 川又生吹
構造化ゲルと化学反応場の協働による運動創発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年6月 - 2017年3月

萩谷昌己, 村田智, 浅沼浩之, 菅原研, 有村隆志, 宮元展義, 原雄介, 濱田省吾, 川又生吹, 浜田省吾
核酸を用いたプログラム可能な反応拡散系の設計および実装に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2014年8月 - 2016年3月

川又生吹
ＤＮＡナノエンジニアリングによる分子ロボティクスの創成

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2010年4月 - 2015年3月

村田智, 葛谷明紀, 瀧ノ上正浩, 関山浩介, 野村慎一郎, 藤本健造, 竹内昌治, 小林聡, 川又生吹, 森田雅宗, 浜田省吾

川又生吹

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