富田耕造 (Tomita Kozo) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻教授

学位: 博士（工学）(1998年3月東京大学)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-7374-3898
J-GLOBAL ID: 201701015547134808
researchmap会員ID: B000272181

外部リンク: http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/rnabiology/

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

経歴

2016年4月 - 現在

東京大学大学院新領域創成科学研究科, メディカル情報生命専攻 RNA生物学分野, 教授
2015年4月 - 2016年3月

産業技術総合研究所バイオメディカル研究部門, RNAプロセシング特別研究チーム, 研究チーム長
2010年4月 - 2015年3月

産業技術総合研究所バイオメディカル研究部門, RNAプロセシング研究グループ, 研究グループ長
2007年10月 - 2011年3月

科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業「RNAと生体機能」, さきがけ研究員兼任
2005年4月 - 2010年3月

産業技術総合研究所生物機能工学研究部門, 機能性核酸研究グループ, 研究グループ長
2004年4月 - 2005年3月

産業技術総合研究所生物機能工学研究部門, 研究員
2002年3月 - 2004年3月

東京大学大学院新領域創成科学研究科, 特任研究員、助手
2000年9月 - 2002年3月

Washington大学医学部（米、Seattle）, 博士研究員
1999年9月 - 2000年8月

Yale 大学医学部（米、New Haven）, 博士研究員
1998年10月 - 1999年8月

IBMP du CNRS （仏、Strasbourg）, 博士研究員
1998年4月 - 1998年9月

東京大学大学院農学系研究科, 共同博士研究員

学歴

1995年4月 - 1998年3月

東京大学大学院, 工学系研究科, 化学生命工学専攻博士課程
1993年4月 - 1995年3月

東京大学大学院, 工学系研究科, 化学生命工学専攻修士課程
1991年4月 - 1993年3月

東京大学, 工学部, 工業化学科
1989年4月 - 1991年3月

東京大学, 理科一類

受賞

2010年4月

文部科学大臣表彰科学技術分野（研究部門）, 「酵素反応の動的分子機構の構造的研究」, 文部科学省

富田耕造
2008年12月

第6回日本分子生物学会三菱化学奨励賞, 「鋳型非依存的RNA合成酵素の進化・分子機構に関する研究」, 日本分子生物学会

富田耕造
2007年10月

第17回つくば奨励賞若手研究者部門, 「鋳型を用いないRNA合成酵素の分子構造基盤研究」, 茨城県科学振興財団

富田耕造

論文

Mechanistic insights into Lin28-dependent oligo-uridylylation of pre-let-7 by TUT4

Xiaojie Han, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nucleic Acids Research 2026年1月5日
Structures and mechanisms of U6 snRNA m6A modification by METTL16

Jue Ju, Kozo Tomita

Nature Communications 2025年8月21日
Selection of initiator tRNA and start codon by mammalian mitochondrial initiation factor 3 in leaderless mRNA translation

Muhoon Lee, Taisei Wakigawa, Qimin Jia, Chang Liu, Ruiyuan Huang, Shuai Huang, Asuteka Nagao, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita, Shintaro Iwasaki …

Nucleic Acids Research 2025年1月24日
Cryo-EM structure of human TUT1:U6 snRNA complex

Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nucleic Acids Research 2025年1月11日
Mechanism of activation of contact-dependent growth inhibition tRNase toxin by the amino acid biogenesis factor CysK in the bacterial competition system

Zhaohang Feng, Yuka Yashiro, Kozo Tomita

Nucleic Acids Research 2025年1月7日
Substrate specificity of Mycobacterium tuberculosis tRNA terminal nucleotidyltransferase toxin MenT3.

Jun Liu, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Nucleic acids research 52(10) 5987-6001 2024年6月10日
Mechanism of U6 snRNA oligouridylation by human TUT1.

Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nature communications 14(1) 4686-4686 2023年8月10日
Mechanism of tRNA recognition by heterotetrameric glycyl-tRNA synthetase from lactic acid bacteria.

Yasuha Nagato, Seisuke Yamashita, Azusa Ohashi, Haruyuki Furukawa, Kazuyuki Takai, Kozo Tomita, Chie Tomikawa

Journal of biochemistry 2023年6月1日
Structure of the Caenorhabditis elegans m6A methyltransferase METT10 that regulates SAM homeostasis.

Jue Ju, Tomohiko Aoyama, Yuka Yashiro, Seisuke Yamashita, Hidehito Kuroyanagi, Kozo Tomita

Nucleic acids research 2023年2月16日
Reversible RNA phosphorylation stabilizes tRNA for cellular thermotolerance.

Takayuki Ohira, Keiichi Minowa, Kei Sugiyama, Seisuke Yamashita, Yuriko Sakaguchi, Kenjyo Miyauchi, Ryo Noguchi, Akira Kaneko, Izumi Orita, Toshiaki Fukui …

Nature 605(7909) 372-379 2022年5月
Mechanistic insights into tRNA cleavage by a contact-dependent growth inhibitor protein and translation factors

Jing Wang, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Nucleic Acids Research 2022年4月12日査読有り最終著者責任著者
Molecular basis of glycyl-tRNAGly acetylation by TacT from Salmonella Typhimurium.

Yuka Yashiro, Chuqiao Zhang, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Cell reports 37(12) 110130-110130 2021年12月21日査読有り最終著者責任著者
Transfer RNA Synthesis and Regulation

Hiroyuki Hori, Akira Hirata, Takuya Ueda, Kimitsuna Watanabe, Chie Tomikawa, Kozo Tomita

eLS 1-20 2021年11月23日
Mechanism of aminoacyl-tRNA acetylation by an aminoacyl-tRNA acetyltransferase AtaT from enterohemorrhagic E. coli.

Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Nature communications 11(1) 5438-5438 2020年10月28日査読有り最終著者責任著者
The tRNA pseudouridine synthase TruB1 regulates the maturation of let-7 miRNA.

Ryota Kurimoto, Tomoki Chiba, Yoshiaki Ito, Takahide Matsushima, Yuki Yano, Kohei Miyata, Yuka Yashiro, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita, Hiroshi Asahara

The EMBO journal 39(20) e104708 2020年10月15日査読有り
Substrate specificities of Escherichia coli ItaT that acetylates aminoacyl-tRNAs.

Chuqiao Zhang, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Nucleic acids research 48(13) 7532-7544 2020年6月5日査読有り最終著者責任著者
Mechanistic insights into m6A modification of U6 snRNA by human METTL16.

Tomohiko Aoyama, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nucleic acids research 2020年4月8日査読有り最終著者責任著者
Crystal structure of human cytoplasmic tRNAHis-specific 5'-monomethylphosphate capping enzyme.

Yining Liu, Anna Martinez, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nucleic acids research 48(3) 1572-1582 2020年2月20日査読有り最終著者責任著者
in vitro yeast reconstituted translation system reveals function of eIF5A for synthesis of long polypeptide.

Taisho Abe, Riku Nagai, Shunta Shimazaki, Shunta Kondo, Satoshi Nishimura, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Hiroaki Imataka, Kozo Tomita, Nono Takeuchi-Tomita

Journal of biochemistry 167(5) 451-462 2020年2月13日査読有り
Crystal structure of the Lin28-interacting module of human terminal uridylyltransferase that regulates let-7 expression.

Kozo Tomita

Nature communications 10(1) 1960 2019年4月29日査読有り最終著者責任著者

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