富田耕造 (Tomita Kozo) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻教授

学位: 博士（工学）(1998年3月東京大学)

J-GLOBAL ID: 201701015547134808
researchmap会員ID: B000272181

外部リンク: http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/rnabiology/

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

経歴

2016年4月 - 現在

東京大学大学院新領域創成科学研究科, メディカル情報生命専攻 RNA生物学分野, 教授
2015年4月 - 2016年3月

産業技術総合研究所バイオメディカル研究部門, RNAプロセシング特別研究チーム, 研究チーム長
2010年4月 - 2015年3月

産業技術総合研究所バイオメディカル研究部門, RNAプロセシング研究グループ, 研究グループ長
2007年10月 - 2011年3月

科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業「RNAと生体機能」, さきがけ研究員兼任
2005年4月 - 2010年3月

産業技術総合研究所生物機能工学研究部門, 機能性核酸研究グループ, 研究グループ長
2004年4月 - 2005年3月

産業技術総合研究所生物機能工学研究部門, 研究員
2002年3月 - 2004年3月

東京大学大学院新領域創成科学研究科, 特任研究員、助手
2000年9月 - 2002年3月

Washington大学医学部（米、Seattle）, 博士研究員
1999年9月 - 2000年8月

Yale 大学医学部（米、New Haven）, 博士研究員
1998年10月 - 1999年8月

IBMP du CNRS （仏、Strasbourg）, 博士研究員
1998年4月 - 1998年9月

東京大学大学院農学系研究科, 共同博士研究員

学歴

1995年4月 - 1998年3月

東京大学大学院, 工学系研究科, 化学生命工学専攻博士課程
1993年4月 - 1995年3月

東京大学大学院, 工学系研究科, 化学生命工学専攻修士課程
1991年4月 - 1993年3月

東京大学, 工学部, 工業化学科
1989年4月 - 1991年3月

東京大学, 理科一類

受賞

2010年4月

文部科学大臣表彰科学技術分野（研究部門）, 「酵素反応の動的分子機構の構造的研究」, 文部科学省

富田耕造
2008年12月

第6回日本分子生物学会三菱化学奨励賞, 「鋳型非依存的RNA合成酵素の進化・分子機構に関する研究」, 日本分子生物学会

富田耕造
2007年10月

第17回つくば奨励賞若手研究者部門, 「鋳型を用いないRNA合成酵素の分子構造基盤研究」, 茨城県科学振興財団

富田耕造

論文

Mechanism of U6 snRNA oligouridylation by human TUT1.

Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nature communications 14(1) 4686-4686 2023年8月10日
Mechanism of tRNA recognition by heterotetrameric glycyl-tRNA synthetase from lactic acid bacteria.

Yasuha Nagato, Seisuke Yamashita, Azusa Ohashi, Haruyuki Furukawa, Kazuyuki Takai, Kozo Tomita, Chie Tomikawa

Journal of biochemistry 2023年6月1日
Structure of the Caenorhabditis elegans m6A methyltransferase METT10 that regulates SAM homeostasis.

Jue Ju, Tomohiko Aoyama, Yuka Yashiro, Seisuke Yamashita, Hidehito Kuroyanagi, Kozo Tomita

Nucleic acids research 2023年2月16日
Reversible RNA phosphorylation stabilizes tRNA for cellular thermotolerance.

Takayuki Ohira, Keiichi Minowa, Kei Sugiyama, Seisuke Yamashita, Yuriko Sakaguchi, Kenjyo Miyauchi, Ryo Noguchi, Akira Kaneko, Izumi Orita, Toshiaki Fukui …

Nature 605(7909) 372-379 2022年5月
Mechanistic insights into tRNA cleavage by a contact-dependent growth inhibitor protein and translation factors

Jing Wang, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Nucleic Acids Research 2022年4月12日査読有り最終著者責任著者
Molecular basis of glycyl-tRNAGly acetylation by TacT from Salmonella Typhimurium.

Yuka Yashiro, Chuqiao Zhang, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Cell reports 37(12) 110130-110130 2021年12月21日査読有り最終著者責任著者
Transfer RNA Synthesis and Regulation

Hiroyuki Hori, Akira Hirata, Takuya Ueda, Kimitsuna Watanabe, Chie Tomikawa, Kozo Tomita

eLS 1-20 2021年11月23日
Mechanism of aminoacyl-tRNA acetylation by an aminoacyl-tRNA acetyltransferase AtaT from enterohemorrhagic E. coli.

Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Nature communications 11(1) 5438-5438 2020年10月28日査読有り最終著者責任著者
The tRNA pseudouridine synthase TruB1 regulates the maturation of let-7 miRNA.

Ryota Kurimoto, Tomoki Chiba, Yoshiaki Ito, Takahide Matsushima, Yuki Yano, Kohei Miyata, Yuka Yashiro, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita, Hiroshi Asahara

The EMBO journal 39(20) e104708 2020年10月15日査読有り
Substrate specificities of Escherichia coli ItaT that acetylates aminoacyl-tRNAs.

Chuqiao Zhang, Yuka Yashiro, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Kozo Tomita

Nucleic acids research 48(13) 7532-7544 2020年6月5日査読有り最終著者責任著者
Mechanistic insights into m6A modification of U6 snRNA by human METTL16.

Tomohiko Aoyama, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nucleic acids research 2020年4月8日査読有り最終著者責任著者
Crystal structure of human cytoplasmic tRNAHis-specific 5'-monomethylphosphate capping enzyme.

Yining Liu, Anna Martinez, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nucleic acids research 48(3) 1572-1582 2020年2月20日査読有り最終著者責任著者
in vitro yeast reconstituted translation system reveals function of eIF5A for synthesis of long polypeptide.

Taisho Abe, Riku Nagai, Shunta Shimazaki, Shunta Kondo, Satoshi Nishimura, Yuriko Sakaguchi, Tsutomu Suzuki, Hiroaki Imataka, Kozo Tomita, Nono Takeuchi-Tomita

Journal of biochemistry 167(5) 451-462 2020年2月13日査読有り
Crystal structure of the Lin28-interacting module of human terminal uridylyltransferase that regulates let-7 expression.

Yamashita S, Nagaike T, Tomita K

Nature communications 10(1) 1960 2019年4月査読有り最終著者責任著者
Acetate-dependent tRNA acetylation required for decoding fidelity in protein synthesis.

Takaaki Taniguchi, Kenjyo Miyauchi, Yuriko Sakaguchi, Seisuke Yamashita, Akiko Soma, Kozo Tomita, Tsutomu Suzuki

Nature chemical biology 14(11) 1010-1020 2018年11月査読有り
Crystal Structure of the Enterohemorrhagic Escherichia coli AtaT-AtaR Toxin-Antitoxin Complex.

Yashiro Y, Yamashita S, Tomita K

Structure (London, England : 1993) 27(3) 476-484 2018年11月査読有り最終著者責任著者
Human BCDIN3D Is a Cytoplasmic tRNA^His-Specific 5'-Monophosphate Methyltransferase.

Tomita K, Liu Y

Frontiers in genetics 9 305 2018年8月3日査読有り筆頭著者責任著者
Function and Regulation of Human Terminal Uridylyltransferases.

Yashiro Y, Tomita K

Frontiers in genetics 9 538-538 2018年査読有り最終著者責任著者
Synthetic mRNA devices that detect endogenous proteins and distinguish mammalian cells

Shunsuke Kawasaki, Yoshihiko Fujita, Takashi Nagaike, Kozo Tomita, Hirohide Saito

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 45(12) e117 2017年7月査読有り
Crystal structures of U6 snRNA-specific terminal uridylyltransferase

Seisuke Yamashita, Yuko Takagi, Takashi Nagaike, Kozo Tomita

NATURE COMMUNICATIONS 8 15788 2017年6月査読有り最終著者責任著者

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MISC

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鋳型非依存的RNA合成酵素の特異性の分子基盤

富田耕造

生化學 84(5) 355-359 2012年5月25日
Molecular basis for peptide-bond formation by an aminoacyl-tRNA protein transferase

Kazunori Watanabe, Yukimatsu Toh, Kozo Tomita

Seikagaku 81(4) 294-298 2009年
tRNAを使うリボソームによらないペブチド結合形成反応

渡邉和則, 富田耕造

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蛋白質核酸酵素 48(16) 2286-2292 2003年12月
ショウジョウバエミトコンドリアにおけるコドン認識機構

富田耕造, 上田卓也, 横堀伸一, 石和貞男, 渡辺公綱

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ncRNA作動エレメントの配列構造の同定

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RNA合成酵素複合体の機能構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2010年 - 2013年

富田耕造
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富田耕造