門田満隆 (Mitsutaka Kadota) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所生命機能科学研究センター発生ゲノムシステム研究チーム技師

学位: 博士（生命科学）(2003年3月鳥取大学)

研究者番号: 50558111
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-1674-6697
J-GLOBAL ID: 202001017256482440
researchmap会員ID: R000000536

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

経歴

2023年4月 - 現在

理化学研究所生命機能科学研究センター, 発生ゲノムシステム研究チーム
2018年4月 - 2023年3月

理化学研究所生命機能科学研究センター分子配列比較解析チーム
2014年11月 - 2018年3月

理化学研究所ライフサイエンス技術基盤研究センター分子配列比較解析ユニット
2012年3月 - 2014年11月

理化学研究所発生・再生科学総合研究センターゲノム資源解析ユニット
2003年7月 - 2012年2月

Laboratory of Population Genetics, National Cancer Institute, National Institutes of Health
2003年1月 - 2003年7月

鳥取大学医学部ゲノム医工学講座

論文

Tracing genome size dynamics in sharks and rays with inclusive sequence analysis by the Squalomix Consortium

Shigehiro Kuraku, Yawako Kawaguchi, Ryo Misawa, Taiki Niwa, Mitsutaka Kadota, Kazuhiro Saito, Waichiro Godo, Tatsuya Sakamoto, Wataru Takagi, Sachiko Isobe …

2025年6月8日
RNA Dynamics Regulate Transcriptional Condensate Vivacity to Drive Gene Coordination

Koichi Ogami, Ming M. Zheng, Seiko Yoshino, Yohei Sugimoto, Mayu Seida, Toshiki Mori, Ryo Yoshizawa, Koh Onimaru, Mitsutaka Kadota, Shigehiro Kuraku …

2025年6月7日
3D Genome Constrains Breakpoints of Inversions That Can Act as Barriers to Gene Flow in the Stickleback

Yo Y. Yamasaki, Atsushi Toyoda, Mitsutaka Kadota, Shigehiro Kuraku, Jun Kitano

Molecular Ecology 2025年5月31日
Sharks and rays have the oldest vertebrate sex chromosome with unique sex determination mechanisms

Taiki Niwa, Yoshinobu Uno, Yuta Ohishi, Mitsutaka Kadota, Naotaka Aburatani, Itsuki Kiyatake, Daiki Katooka, Michikazu Yorozu, Nobutaka Tsuzuki, Atsushi Toyoda …

2025年3月14日
Gene-scalein vitroreconstitution reveals histone acetylation directly controls chromatin architecture

Yohsuke T. Fukai, Tomoya Kujirai, Masatoshi Wakamori, Setsuko Kanamura, Lisa Yamauchi, Somayeh Zeraati, Chiharu Tanegashima, Mitsutaka Kadota, Hitoshi Kurumizaka, Takashi Umehara …

2024年11月8日
Meta‐analysis of gonadal transcriptome provides novel insights into sex change mechanism across protogynous fishes

Ryo Nozu, Mitsutaka Kadota, Masaru Nakamura, Shigehiro Kuraku, Hidemasa Bono

Genes to Cells 2024年11月
Transcriptomic dysregulation and autistic-like behaviors in Kmt2c haploinsufficient mice rescued by an LSD1 inhibitor.

Takumi Nakamura, Toru Yoshihara, Chiharu Tanegashima, Mitsutaka Kadota, Yuki Kobayashi, Kurara Honda, Mizuho Ishiwata, Junko Ueda, Tomonori Hara, Moe Nakanishi …

Molecular psychiatry 2024年3月26日
Chromosomal DNA sequences of the Pacific saury genome: versatile resources for fishery science and comparative biology

Mana Sato, Kazuya Fukuda, Mitsutaka Kadota, Hatsune Makino-Itou, Kaori Tatsumi, Shinya Yamauchi, Shigehiro Kuraku

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 31(2) 2023年10月18日査読有り筆頭著者
Truncated radial glia as a common precursor in the late corticogenesis of gyrencephalic mammals

Merve Bilgic, Quan Wu, Taeko Suetsugu, Atsunori Shitamukai, Yuji Tsunekawa, Tomomi Shimogori, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku, Hiroshi Kiyonari …

eLife 12 2023年10月3日査読有り
Autocrine TGF-β-positive feedback in profibrotic AT2-lineage cells plays a crucial role in non-inflammatory lung fibrogenesis.

Yasunori Enomoto, Hiroaki Katsura, Takashi Fujimura, Akira Ogata, Saori Baba, Akira Yamaoka, Miho Kihara, Takaya Abe, Osamu Nishimura, Mitsutaka Kadota …

Nature communications 14(1) 4956-4956 2023年8月31日査読有り
Elasmobranch genome sequencing reveals evolutionary trends of vertebrate karyotypic organization.

Kazuaki Yamaguchi, Yoshinobu Uno, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Ryo Nozu, Kiyomi Murakumo, Rui Matsumoto, Keiichi Sato, Shigehiro Kuraku

Genome research 2023年8月17日査読有り
Meta-analysis of gonadal transcriptome provides novel insights into sex change mechanism across protogynous fishes

Ryo Nozu, Mitsutaka Kadota, Masaru Nakamura, Shigehiro Kuraku, Hidemasa Bono

bioRxiv 2023.07.09.545663 2023年7月10日
Single-cell transcriptome atlas of Drosophila gastrula 2.0.

Shunta Sakaguchi, Sonoko Mizuno, Yasushi Okochi, Chiharu Tanegashima, Osamu Nishimura, Tadashi Uemura, Mitsutaka Kadota, Honda Naoki, Takefumi Kondo

Cell reports 112707-112707 2023年7月3日査読有り
Shark and ray genome size estimation: methodological optimization for inclusive and controllable biodiversity genomics

Mitsutaka Kadota, Kaori Tatsumi, Kazuaki Yamaguchi, Yoshinobu Uno, Shigehiro Kuraku

2023年2月24日
Squalomix: shark and ray genome analysis consortium and its data sharing platform

Osamu Nishimura, John Rozewicki, Kazuaki Yamaguchi, Kaori Tatsumi, Yuta Ohishi, Tazro Ohta, Masaru Yagura, Taiki Niwa, Chiharu Tanegashima, Akinori Teramura …

F1000Research 11 1077-1077 2022年9月21日査読有り
Molecular and morphological investigations on the renal mechanisms enabling euryhalinity of red stingray Hemitrygon akajei

Naotaka Aburatani, Wataru Takagi, Marty Kwok-Shing Wong, Shigehiro Kuraku, Chiharu Tanegashima, Mitsutaka Kadota, Kazuhiro Saito, Waichiro Godo, Tatsuya Sakamoto, Susumu Hyodo

Frontiers in Physiology 13 2022年8月9日査読有り
Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover in Takifugu pufferfish

Ahammad Kabir, Risa Ieda, Sho Hosoya, Daigaku Fujikawa, Kazufumi Atsumi, Shota Tajima, Aoi Nozawa, Takashi Koyama, Shotaro Hirase, Osamu Nakamura …

Proceedings of the National Academy of Sciences 119(23) e2121469119 2022年6月7日査読有り
Single cell transcriptomics of ferrets reveal a common temporal pattern of progenitors in brain development of gyrencephalic mammals

Merve Bilgic, Quan Wu, Taeko Suetsugu, Yuji Tsunekawa, Atsunori Sitamukai, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku, Fumio Matsuzaki

BioRxiv 2022年5月6日
Evolution of variable lymphocyte receptor B antibody loci in jawless vertebrates

Sabyasachi Das, Jonathan P. Rast, Jianxu Li, Mitsutaka Kadota, John A. Donald, Shigehiro Kuraku, Masayuki Hirano, Max D. Cooper

Proceedings of the National Academy of Sciences 118(50) e2116522118-e2116522118 2021年12月14日査読有り
Technical considerations in Hi-C scaffolding and evaluation of chromosome-scale genome assemblies.

Kazuaki Yamaguchi, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Yuta Ohishi, Yuki Naito, Shigehiro Kuraku

Molecular ecology 2021年8月25日査読有り筆頭著者

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MISC

T2T時代の全ゲノム解析を支えるDNAシークエンス以外の要素：核DNA分子のサイズ計測とクロマチン構造の捕捉

工樂樹洋, 西村理, 門田満隆

Jxiv 2023年2月
iconHi-C protocol (v1.1) https://doi.org/10.6084/m9.figshare.14669751.v1

2021年5月筆頭著者
iconHi-C Protocol (ver. 1.0) v1 (protocols.io.4mjgu4n)

Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Hisashi Miura, Kaori Tanaka, Ichiro Hiratani, Shigehiro Kuraku

protocols.io 2019年6月23日
TChIP-Seq: Cell-Type-Specific Epigenome Profiling

Mari Mito, Mitsutaka Kadota, Shinichi Nakagawa, Shintaro Iwasaki

Journal of Visualized Experiments (143) 2019年1月23日

書籍等出版物

ChIP-seq実験を成功に導くための秘訣：ChIP条件の最適化とサンプルQCについて

田中かおり, 門田満隆 (担当:分担執筆)

実験医学 2016年10月 (ISBN: 9784758101561)
ヒストン修飾や転写因子の結合領域を同定するコツやポイント

門田満隆, 蓑田亜希子 (担当:分担執筆)

実験医学別冊・次世代シークエンス解析スタンダード 2014年 (ISBN: 9784758101912)

門田満隆

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