村田和義 (Kazuyoshi Murata) - マイポータル

基本情報

所属: 自然科学研究機構生命創成探究センター極限環境生命探査室特任教授

学位: 論文博士（理学）(1999年10月名古屋大学)

研究者番号: 20311201
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-9446-3652
J-GLOBAL ID: 201801015713859341
researchmap会員ID: B000346115

外部リンク: http://www.nips.ac.jp/struct

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年1月 - 現在

自然科学研究機構生命創成探究センター, 極限環境生命探索室, 特任教授
2009年12月 - 2020年12月

生理学研究所, 脳機能計測・支援センター, 准教授
2007年11月 - 2009年11月

ベイラー医科大学, 生化学・分子生物学部, 講師
2004年4月 - 2007年10月

マサチューセッツ工科大学, 生物工学科, リサーチサイエンティスト
2001年4月 - 2004年3月

産業技術総合研究所, 生物情報解析研究センター, 研究員
1998年6月 - 2001年3月

生理学研究所, 超微小形態生理研究部門, 助手
1994年4月 - 1998年5月

松下電器産業株式会社, 国際研究所, シニアリサーチアシスタント

学歴

1999年10月

名古屋大学, 大学院理学研究科, 論文博士（理学）
1991年4月 - 1993年3月

広島大学, 大学院生物圏科学研究科, 博士前期課程
1987年4月 - 1991年3月

広島大学, 生物生産学部, 生物生産学学科

論文

117

Six states of Enterococcus hirae V-type ATPase reveals non-uniform rotor rotation during turnover.

Raymond N Burton-Smith, Chihong Song, Hiroshi Ueno, Takeshi Murata, Ryota Iino, Kazuyoshi Murata

Communications biology 6(1) 755-755 2023年7月28日
The mitochondrial intermembrane space protein mitofissin drives mitochondrial fission required for mitophagy.

Tomoyuki Fukuda, Kentaro Furukawa, Tatsuro Maruyama, Shun-Ichi Yamashita, Daisuke Noshiro, Chihong Song, Yuta Ogasawara, Kentaro Okuyama, Jahangir Md Alam, Manabu Hayatsu …

Molecular cell 83(12) 2045-2058 2023年6月15日
Structure and its transformation of elliptical nege-like virus Tanay virus.

Kenta Okamoto, Chihong Song, Han Wang, Miako Sakaguchi, Christina Chalkiadaki, Naoyuki Miyazaki, Takeshi Nabeshima, Kouichi Morita, Shingo Inoue, Kazuyoshi Murata

The Journal of general virology 104(6) 2023年6月
The photosystem I supercomplex from a primordial green alga Ostreococcus tauri harbors three light-harvesting complex trimers.

Asako Ishii, Jianyu Shan, Xin Sheng, Eunchul Kim, Akimasa Watanabe, Makio Yokono, Chiyo Noda, Chihong Song, Kazuyoshi Murata, Zhenfeng Liu …

eLife 12 2023年3月23日
"Mamonoviridae", a proposed new family of the phylum Nucleocytoviricota.

Ruixuan Zhang, Masaharu Takemura, Kazuyoshi Murata, Hiroyuki Ogata

Archives of virology 168(3) 80-80 2023年2月5日
A novel capsid protein network allows the characteristic internal membrane structure of Marseilleviridae giant viruses.

Akane Chihara, Raymond N Burton-Smith, Naoko Kajimura, Kaoru Mitsuoka, Kenta Okamoto, Chihong Song, Kazuyoshi Murata

Scientific reports 12(1) 21428-21428 2022年12月11日
Durable gelfoams stabilized by compressible nanocomposite microgels.

Yuichiro Nishizawa, Takumi Watanabe, Tetsuya Noguchi, Masaya Takizawa, Chihong Song, Kazuyoshi Murata, Haruka Minato, Daisuke Suzuki

Chemical communications (Cambridge, England) 58(93) 12927-12930 2022年11月22日
Whole-cell observation of ZIO-stained Golgi apparatus in rat hepatocytes with serial block-face scanning electron microscope, SBF-SEM.

Kohei Johkura, Nobuteru Usuda, Yoshihiro Tanaka, Motoaki Fukasawa, Kazuyoshi Murata, Toru Noda, Nobuhiko Ohno

Microscopy (Oxford, England) 71(5) 262-270 2022年10月6日
Connectome of the lamina reveals the circuit for early color processing in the visual pathway of a butterfly.

Atsuko Matsushita, Finlay Stewart, Marko Ilić, Pei-Ju Chen, Daiki Wakita, Naoyuki Miyazaki, Kazuyoshi Murata, Michiyo Kinoshita, Gregor Belušič, Kentaro Arikawa

Current biology : CB 32(10) 2291-2299 2022年5月23日
Atomic Structure of the Human Sapovirus Capsid Reveals a Unique Capsid Protein Conformation in Caliciviruses.

Naoyuki Miyazaki, Chihong Song, Tomoichiro Oka, Motohiro Miki, Kosuke Murakami, Kenji Iwasaki, Kazuhiko Katayama, Kazuyoshi Murata

Journal of virology 96(9) e0029822 2022年5月11日
Particle Morphology of Medusavirus Inside and Outside the Cells Reveals a New Maturation Process of Giant Viruses.

Ryoto Watanabe, Chihong Song, Yoko Kayama, Masaharu Takemura, Kazuyoshi Murata

Journal of virology 96(7) e0185321 2022年4月13日
Acid-stable capsid structure of Helicobacter pylori bacteriophage KHP30 by single-particle cryoelectron microscopy.

Ryosuke Kamiya, Jumpei Uchiyama, Shigenobu Matsuzaki, Kazuyoshi Murata, Kenji Iwasaki, Naoyuki Miyazaki

Structure (London, England : 1993) 30(2) 300-312 2022年2月3日
Desiccation-induced fibrous condensation of CAHS protein from an anhydrobiotic tardigrade.

Maho Yagi-Utsumi, Kazuhiro Aoki, Hiroki Watanabe, Chihong Song, Seiji Nishimura, Tadashi Satoh, Saeko Yanaka, Christian Ganser, Sae Tanaka, Vincent Schnapka …

Scientific reports 11(1) 21328-21328 2021年11月4日
Nasal delivery of single-domain antibody improves symptoms of SARS-CoV-2 infection in an animal model.

Kei Haga, Reiko Takai-Todaka, Yuta Matsumura, Chihong Song, Tomomi Takano, Takuto Tojo, Atsushi Nagami, Yuki Ishida, Hidekazu Masaki, Masayuki Tsuchiya …

PLoS pathogens 17(10) e1009542 2021年10月
Morphological and Taxonomic Properties of the Newly Isolated Cotonvirus japonicus, a New Lineage of the Subfamily Megavirinae.

Haruna Takahashi, Sho Fukaya, Chihong Song, Kazuyoshi Murata, Masaharu Takemura

Journal of virology 95(18) e0091921 2021年8月25日
Structural basis of LhcbM5-mediated state transitions in green algae.

Xiaowei Pan, Ryutaro Tokutsu, Anjie Li, Kenji Takizawa, Chihong Song, Kazuyoshi Murata, Tomohito Yamasaki, Zhenfeng Liu, Jun Minagawa, Mei Li

Nature plants 7(8) 1119-1131 2021年8月
A novel characteristic of a phytoplankton as a potential source of straight-chain alkanes.

Naomi Harada, Yuu Hirose, Song Chihong, Hirofumi Kurita, Miyako Sato, Jonaotaro Onodera, Kazuyoshi Murata, Fumihiro Itoh

Scientific reports 11(1) 14190-14190 2021年7月19日
Structural Fluctuations of the Human Proteasome α7 Homo-Tetradecamer Double Ring Imply the Proteasomal α-Ring Assembly Mechanism.

Chihong Song, Tadashi Satoh, Taichiro Sekiguchi, Koichi Kato, Kazuyoshi Murata

International journal of molecular sciences 22(9) 4519-4519 2021年4月26日
Below 3 Å structure of apoferritin using a multipurpose TEM with a side entry cryoholder.

Yoko Kayama, Raymond N Burton-Smith, Chihong Song, Naoya Terahara, Takayuki Kato, Kazuyoshi Murata

Scientific reports 11(1) 8395-8395 2021年4月16日
A dynein-associated photoreceptor protein prevents ciliary acclimation to blue light.

Osamu Kutomi, Ryosuke Yamamoto, Keiko Hirose, Katsutoshi Mizuno, Yuuhei Nakagiri, Hiroshi Imai, Akira Noga, Jagan Mohan Obbineni, Noemi Zimmermann, Masako Nakajima …

Science advances 7(9) 2021年2月

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MISC

200

In situ cryo-electron tomography: a new method to elucidate cytoplasmic zoning at the molecular level.

Lin Chen, Yuko Fukata, Kazuyoshi Murata

Journal of biochemistry 175(2) 187-193 2024年2月25日
ピロリ菌ファージ:分離から構造決定まで

内山淳平, 神谷亮佑, 宮崎直幸, 村田和義, 岩崎憲治, 松崎茂展

日本ヘリコバクター学会誌 25(2) 2024年
Cryo-electron Microscopy of Protein Cages.

Raymond N Burton-Smith, Kazuyoshi Murata

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2671 173-210 2023年
巨大ウイルスの一種メドゥーサウイルス : そのゲノムならびに粒子構造に関する特殊性—Medusavirus, One of Giant Viruses : Its Genome and Particle Structure

武村政春, 深谷将, 緒方博之, 村田和義

化学と生物 : 日本農芸化学会会誌 : 生命・食・環境 / 日本農芸化学会編 60(6) 290-294 2022年6月
生命分子動態機能解析システムと組み合わせたクライオEM研究支援—Cryo-EM Research Support Combined with Biomolecular Dynamic Function Analysis System—特集クライオ電子顕微鏡の現在

宋致宖, 村田和義

顕微鏡 = Microscopy / 「顕微鏡」編集委員会編 57(3) 113-117 2022年
Cryo-electron microscopy of the giant viruses.

Raymond N Burton-Smith, Kazuyoshi Murata

Microscopy (Oxford, England) 70(6) 477-486 2021年11月24日
Let's Start Structural Analysis of Biomolecules with Cryo-Electron Microscopy

Chihong SONG, Kazuyoshi MURATA

Nihon Kessho Gakkaishi 63(2) 80-88 2021年5月31日
クライオTEM観察によるMycobacteroides属における種間基礎形態の比較検討(Comparison of cell morphology between the species in genus Mycobacteroides examined with cryo-TEM)

山田博之, 近松絹代, 青野昭男, 村田和義, 宮崎直幸, 香山容子, 藤原永年, 前田伸司, 御手洗聡

日本細菌学雑誌 76(1) 75-75 2021年2月
Progress in environmental high-voltage transmission electron microscopy for nanomaterials.

Nobuo Tanaka, Takeshi Fujita, Yoshimasa Takahashi, Jun Yamasaki, Kazuyoshi Murata, Shigeo Arai

Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences 378(2186) 20190602-20190602 2020年12月11日
クライオ超高圧電子顕微鏡による巨大ウイルスの構造研究—Structural study of a giant virus by cryo-HVEM

レイモンドバートンスミス, 千原あかね, 梶村直子, 光岡薫, 岡本健太, 宋致宖, 村田和義

大阪大学超高圧電子顕微鏡センター年報 (49) 16-20 2020年
cryo-TEM観察によるMycobacteriaceae科5属の菌体基礎形態情報の比較検討(Comparison of cryo-TEM cell morphology data between species in 5 genera in family Mycobacteriaceae)

山田博之, 近松絹代, 青野昭男, 村田和義, 宮崎直幸, 香山容子, 藤原永年, 前田伸司, 御手洗聡

日本細菌学雑誌 75(1) 123-123 2020年1月
cryo-TEM観察によるMycobacteriaceae科5属の菌体基礎形態情報の比較検討(Comparison of cryo-TEM cell morphology data between species in 5 genera in family Mycobacteriaceae)

山田博之, 近松絹代, 青野昭男, 村田和義, 宮崎直幸, 香山容子, 藤原永年, 前田伸司, 御手洗聡

日本細菌学雑誌 75(1) 123-123 2020年1月
混合性能を向上させたマイクロリアクタによる脂質-高分子複合ナノ粒子の超極小化

鈴木亮佑, ソン・チホン, 村田和義, 福島昭二

日本DDS学会学術集会プログラム予稿集 35回 129-129 2019年6月
ゲノム情報に基づくシアノバクテリアの光合成アンテナ調節の進化の解析

広瀬侑, SONG Chihong, 渡辺麻衣, 村田和義, 池内昌彦, 浴俊彦

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 13th 66 2019年3月6日
金ナノ粒子を用いた生体分子モーターの高速・高精度1分子イメージング

安藤潤, 安藤潤, 中村彰彦, 中村彰彦, VISOOTSAT Akasit, 山本真由子, SONG Chihong, 村田和義, 飯野亮太, 飯野亮太

応用物理学会春季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 66th ROMBUNNO.9a‐W641‐11-659 2019年2月25日
クライオ電子顕微鏡研究の歴史

村田和義

KEK Proceedings (Web) (2018-11) 13‐80 (WEB ONLY) 2019年2月
フィコエリスロシアニンとロッド型フィコビリソームを制御する新しいタイプの補色順化

広瀬侑, SONG Chihong, 渡辺麻衣, 米川千夏, 村田和義, 池内昌彦, 浴俊彦

日本植物生理学会年会(Web) 60th 553 (WEB ONLY) 2019年
Eh V‐ATPaseの全複合体構造解析に向けた電子顕微鏡密度マップからの原子モデル構築

山守優, 角田潤, 角田潤, ソンチホン, 富井健太郎, 村田和義, 村田和義, 飯野亮太, 飯野亮太

日本細胞生物学会大会(Web) 71st ROMBUNNO.1P‐032 (WEB ONLY) 2019年
クライオ電子顕微鏡によるウイルス粒子構造およびその感染機構の構造解析

村田和義

日本解剖学会総会・全国学術集会講演プログラム・抄録集 124th 100 2019年
【生きてるものは全部観る!イメージングの選び方・使い方100+】(第11章)画像解析周波数フィルタリング逆空間での画像処理

村田和義

実験医学 36(20) 3552-3553 2018年12月

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講演・口頭発表等

基礎研究-Helicobacter属細菌の病原性ピロリ菌ファージ分離から構造決定まで

内山淳平, 神谷亮佑, 宮崎直幸, 村田和義, 岩崎憲治, 松崎茂展

日本ヘリコバクター学会学術集会プログラム・抄録集 2023年6月 (一社)日本ヘリコバクター学会
Synthesis of hydrogel/solid composite microgels by seeded emulsion polymerization in the presence of polyelectrolytes microgels

Takumi Watanabe, Song Chihong, Kazuyoshi Murata, Takuma Kureha, Daisuke Suzuki

ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 2018年3月 AMER CHEMICAL SOC
MORPHOLOGICAL AND MOLECULAR EVOLUTIONAL ANALYSES OF ITCH FOCUSED ON THE GASTRIN-RELEASING PEPTIDE SYSTEM IN MAMMALS

Keiko Takanami, Keita Satoh, Kazuyoshi Murata, Tatsuya Sakamoto, Hirotaka Sakamoto

ACTA DERMATO-VENEREOLOGICA 2017年9月 ACTA DERMATO-VENEREOLOGICA
Ultrastructure of the olfactory sensory unit consisting of 100 receptor neurons for nestmate-nonnestmate discrimination in Camponotus japonicus

Yusuke Takeichi, Kouji Yasuyama, Naoyuki Miyazaki, Kazuyoshi Murata, Masaru K. Hojo, Kanako Inoue, Mamiko Ozaki

CHEMICAL SENSES 2016年11月 OXFORD UNIV PRESS
Three-Dimensional Structure of Innexin GAP Junction Channels Studied by Electron Crystallography

Atsunori Oshima, Tomohiro Matsuzawa, Kazuyoshi Murata, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

BIOPHYSICAL JOURNAL 2016年2月 CELL PRESS
Folded structure of cell surface in dry seeds: Real or artifact?

Daisuke Yamauchi, Yasuko Kaneko, Daisuke Tamaoki, Keita Goto, Ichirou Karahara, Kazuyoshi Murata, Akihisa Takeuchi, Kentaro Uesugi, Yumie Takahara, Tomonori Nakai, Yoshinobu Mineyuki

Microscopy 2016年 Oxford University Press
Ultimate recovery of low-frequencies in thin-film ZPC-TEM by inverse projector

Yukinori Nagatani, Kazuyoshi Murata, Yoshitaka Kimori, Toshiaki Itoh, Zempei Saitoh, Mitsuru Ikeda, Naoyuki Miyazaki, Masahiro Ohara, Kuniaki Nagayama

Microscopy and Microanalysis 2014年8月1日 Cambridge University Press
1P007 Structural analysis of C. elegans innexin-6 gap junction channels by electron microscopy(01A. Protein:Structure,Poster)

Matsuzawa Tomohiro, Murata Kazuyoshi, Nishikawa Kouki, Fujiyoshi Yoshinori, Oshima Atsunori

生物物理 2013年一般社団法人日本生物物理学会
3P302 生物試料中でのGFP-CLの観察(27.バイオイメージング,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Murata Kazuyoshi, Miyazaki Naoyuki, Ueno Ryusuke, Minoda Hiroki, Yamamoto Naoki, Nagayama Kuniaki

生物物理 2013年一般社団法人日本生物物理学会
3P303 蛍光蛋白質における光および電子発光の電子線活性化(27.バイオイメージング,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))

Nagayama Kuniaki, Murata Kazuyoshi, Minoda Hiroki, Ueno Ryusuke, Yamamoto Naoki

生物物理 2013年一般社団法人日本生物物理学会
1H1534 位相差電子顕微鏡用の帯電防止位相板(バイオイメージング,口頭発表,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

2012年
3E0948 単粒子クライオ電子顕微鏡解析によるサポウイルスキャプシドの8-A^^○構造(蛋白質-構造,口頭発表,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

Miyazaki Naoyuki, Taylor David, Houseman Grant, Murakami Kosuke, Nagayama Kuniaki, Katayama Kazuhiko, Murata Kazuyoshi

生物物理 2012年一般社団法人日本生物物理学会
Zernike Phase Contrast Cryo-Electron Microscopy of Virus Particles

W. Chiu, R. H. Rochat, X. Liu, K. Murata, H. Khant, K. Nagayama, Frazer Rixon

Microscopy and Microanalysis 2012年

共同研究・競争的資金等の研究課題

植物における過剰光ストレス応答の総合研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2021年7月 - 2026年3月

皆川純, 村田和義, 山本大輔
光合成における過剰エネルギー散逸のシグナルとメカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2021年4月 - 2025年3月

皆川純, 村田和義
水圏生態系における巨大ウイルスの生態ならびに宿主との相互作用の包括的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

武村政春, 村田和義, 緒方博之
巨大ウイルスの構造からみるウイルス多様性と系統進化の研究２

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

村田和義
巨大ウイルスの構造からみるウイルス多様性と系統進化の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

村田和義
Eh V-ATPaseのNa+選択ポンプ機構の構造基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

村田和義, 村田武士, 上野博史, 飯野亮太
無エンベロープウイルスの動的構造秩序形成の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年4月 - 2018年3月

村田和義
サルマラリア原虫が感染したヒト赤血球の微細構造と接着能の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(Ｃ) 2015年10月 - 2018年3月

坂口美亜子, 川合覚, 金子修, 村田和義
ファージ普遍形質導入によるMRSA進化メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

内山淳平, 松崎茂展, 黒川健児, 宮崎直幸, 村田和義, 内山伊代
細胞選択能の付与によるがん特異的ネクローシス誘導化合物の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2018年3月

國安明彦, 村田和義, 牧瀬正樹, アラップワディ, パスカリーニレナータ
ロタウイルスの感染と増殖における構造秩序形成の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

村田和義
天然膜中におけるイオンチャネルの構造動態解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

村田和義, 國安明彦
ハイブリッドペプチドを活用した非アポトーシス型細胞死のケミカルバイオロジー

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

國安明彦, 村田和義
クライオ位相差電顕トモグラフィーによる興奮収縮連関の構造的基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2011年 - 2013年

村田和義, 國安明彦
融合タンパク質による電子顕微鏡用分子ラベルの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業奨励研究(A) 2000年 - 2001年

村田和義

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