杉本直己 (Naoki Sugimoto) - マイポータル

基本情報

所属: 甲南大学フロンティアサイエンス学部生命化学科教授
: (兼任)先端生命工学研究所所長
: (兼任)
: 学校法人　甲南学園理事

学位: 理学士(1985年3月京都大学)
理学修士(1982年3月京都大学)
理学博士(1985年3月京都大学)

J-GLOBAL ID: 200901055455434049
researchmap会員ID: 1000110922

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研究キーワード

研究分野

経歴

2012年8月 - 現在

学校法人甲南学園, 理事
2012年8月 - 現在

甲南大学, フロンティアサイエンス学部生命化学科, 理事
2009年4月 - 現在

甲南大学, フロンティアサイエンス学部生命化学科, 教授
2004年4月 - 現在

甲南大学, 先端生命工学研究所, 所長
1994年4月 - 2009年3月

甲南大学, 理学部, 教授
2001年4月 - 2004年3月

甲南大学, ハイテクリサーチセンター, 所長
1991年4月 - 1994年3月

甲南大学, 理学部, 助教授
1988年4月 - 1991年3月

甲南大学, 理学部, 講師
1985年4月 - 1988年3月

ロチェスター大学, 博士研究員

学歴

- 1982年3月

京都大学, 理学研究科, 化学
- 1979年3月

京都大学, 理学部, 化学

委員歴

2005年4月 - 現在

社団法人兵庫工業会, 産業学術委員会
2001年3月 - 現在

日本化学会, 生命化学研究会監事
2001年3月 - 現在

日本化学会, バイオテクノロジー部会幹事
2000年4月 - 現在

近畿化学協会, 研究会運営委員
1992年4月 - 現在

近畿化学協会, 部会幹事
2017年11月 - 2020年8月

日本核酸化学会, 会長
2015年5月 - 2017年5月

日本化学会, 理事
2010年4月 - 2017年3月

社団法人日本学術振興会, 学術システム研究センター専門研究員
2013年3月 - 2015年2月

日本化学会, 生体機能関連部会監事
2010年4月 - 2013年3月

社団法人日本学術振興会, 研究成果の社会還元、普及事業推進委員会委員
2011年3月 - 2013年2月

日本化学会, 生体機能関連部会部会長
2007年3月 - 2011年2月

日本化学会, 生体機能関連部会副部会長
1998年3月 - 2001年2月

日本化学会, 生命化学研究会会長
1993年3月 - 1999年2月

日本化学会, 支部幹事
1996年3月 - 1998年2月

日本化学会, 機関誌編集委員
1995年3月 - 1998年2月

日本化学会, 生体機能関連化学部会幹事

受賞

2020年3月

第72回日本化学会賞, 分子クラウディング環境における非二重らせん核酸の化学, 公益社団法人日本化学会

杉本直己
2018年8月

The Imbach-Townsend Award, IS3NA（International Society for Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids）

N. Sugimoto
2016年6月

Keynote Lecture賞, European Chemistry Congress (Euro Chemistry2016)

Naoki Sugimoto
2015年10月

第39回井植文化賞（科学技術部門）, 公益財団法人井植記念会

杉本直己
2014年9月

平成26年度錯体化学会貢献賞, 錯体化学会

杉本直己
2013年9月

第25回ひらめき☆ときめきサイエンス推進賞, 独立行政法人日本学術振興会

杉本直己, 中野修一, 三好大輔, 臼井健二, 遠藤玉樹, 高橋俊太郎, 建石寿枝
2013年4月

長瀬研究振興賞, 公益財団法人長瀬科学技術振興財団

杉本直己
2011年10月

名誉講演者賞, The Chinese Academy of Sciences

杉本直己
2008年11月

第25回日本化学会学術賞, 日本化学会

杉本直己
2006年11月

兵庫県科学賞, 兵庫県

杉本直己
2005年11月

ICA Distinguished Scientist Award, ICA ：国際銅協会

杉本直己
2003年11月

堀場雅夫賞, 堀場製作所

杉本直己
1992年11月

第７回若い世代の特別講演者, 日本化学会

杉本直己
1990年11月

第６回化学のフロンティア, 日本化学会

杉本直己

論文

428

In-Cell Stability Prediction of RNA/DNA Hybrid Duplexes for Designing Oligonucleotides Aimed at Therapeutics.

Dipanwita Banerjee, Hisae Tateishi-Karimata, Maria Toplishek, Tatsuya Ohyama, Saptarshi Ghosh, Shuntaro Takahashi, Marko Trajkovski, Janez Plavec, Naoki Sugimoto

Journal of the American Chemical Society 145(43) 23503-23518 2023年11月1日
Quantification of the concentration in a droplet formed by liquid–liquid phase separation of G-quadruplex-forming RNA

Kohei Yokosawa, Mitsuki Tsuruta, Shinji Kajimoto, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi, Takakazu Nakabayashi

Chemical Physics Letters 826 140634 2023年9月
Theranostic approach to specifically targeting the interloop region of BCL2 i-motif DNA by crystal violet.

Sinjan Das, Shuntaro Takahashi, Tatsuya Ohyama, Sudipta Bhowmik, Naoki Sugimoto

Scientific reports 13(1) 14338 2023年9月1日
Nearest-neighbor parameters for the prediction of RNA duplex stability in diverse in vitro and cellular-like crowding conditions.

Saptarshi Ghosh, Shuntaro Takahashi, Dipanwita Banerjee, Tatsuya Ohyama, Tamaki Endoh, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto

Nucleic acids research 51(9) 4101-4111 2023年5月22日
Simple and fast screening for structure-selective G-quadruplex ligands.

Yoshiki Hashimoto, Yoshiki Imagawa, Kaho Nagano, Ryuichi Maeda, Naho Nagahama, Takeru Torii, Natsuki Kinoshita, Nagisa Takamiya, Keiko Kawauchi, Hisae Tatesishi-Karimata …

Chemical communications (Cambridge, England) 59(33) 4891-4894 2023年4月20日
Endogenous G-quadruplex-forming RNAs inhibit the activity of SARS-CoV-2 RNA polymerase.

Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

Chemical communications (Cambridge, England) 59(7) 872-875 2023年1月19日
Cladogenetic Orthogonal Light-Up Aptamers for Simultaneous Detection of Multiple Small Molecules in Cells.

Tamaki Endoh, Jia-Heng Tan, Shuo-Bin Chen, Naoki Sugimoto

Analytical chemistry 95(2) 976-985 2023年1月17日
High-temperature adaptation of an OsNRT2.3 allele is thermoregulated by small RNAs

Y. Zhang, H. Tateishi-Karimata, T. Endoh, Q. J, Kexin Li, X. Fan, Y. Ma, L. Gao, H. Lu, Z. Wang …

Science Advances 8(47) 9785 2022年11月24日
Controlling liquid-liquid phase separation of G-quadruplex-forming RNAs in a sequence-specific manner.

Mitsuki Tsuruta, Takeru Torii, Kazuki Kohata, Keiko Kawauchi, Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto, Daisuke Miyoshi

Chemical communications (Cambridge, England) 58(93) 12931-12934 2022年11月22日
Pressure-temperature control of activity of RNA polymerase ribozyme.

Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

Biophysical chemistry 292 106914-106914 2022年10月21日
DNA methylation is regulated by both the stability and topology of G-quadruplex

S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto

Chemical Communications 58(89) 12459-12462 2022年10月7日
Volumetric strategy for quantitatively elucidating local hydration network around a G-quadruplex

S. Matsumoto, S. Takahashi, S. Bhowmik, T. Ohyama, N. Sugimoto

Anal. Chem 94(20) 7400-7407 2022年5月
Replication Control of Human Telomere G-Quadruplex DNA by G-Quadruplex Ligands Dependent on Solution Environment

Shuntaro Takahashi, Sudipta Bhowmik, Shinobu Sato, Shigeori Takenaka, Naoki Sugimoto

Life 12(4) 553-553 2022年4月7日
Ruthenium Polypyridyl Complex Bound to a Unimolecular Chair-Form G-Quadruplex.

Kane T McQuaid, Shuntaro Takahashi, Lena Baumgaertner, David J Cardin, Neil G Paterson, James P Hall, Naoki Sugimoto, Christine J Cardin

Journal of the American Chemical Society 144(13) 5956-5964 2022年4月6日
Applicability of the nearest-neighbour model for pseudoknot RNAs

S. Satpathi, T. Endoh, N. Sugimoto

Chem. Commun 58(40) 5952-5955 2022年4月
細胞内での核酸の挙動を明らかにする熱力学的解析

高橋俊太郎, 杉本直己

熱測定 49 14-19 2022年1月25日
Dielectricity of a molecularly crowded solution accelerates NTP misincorporation during RNA-dependent RNA polymerization by T7 RNA polymerase

S. Takahashi, S. Matsumoto, P. Chilka, S. Ghosh, H. Okura, N. Sugimoto

Sci. Rep. 12(1) 1149-1149 2022年1月21日
Effect of DNA modifications on the transition bet and non-canoncial DNA stransures in CpG islands during senescence

S.Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, N. Sugimoto

RSC Adv. 11(59) 37205-37217 2021年12月20日
Intramolecular G-quadruplex-hairpin loop structure competition of a GC-rich exon region in the TMPRSS2 gen

W. Sugimoto, N. Kinoshita, M. Nakata, T. Ohyama, H. Tateishi-Karimata, T. Nishikata, N. Sugimoto, D. Miyoshi, K. Kawauchi

Chem. Commun. 58(1) 38-51 2021年11月15日
Correction to 'Improved nearest-neighbor parameters for the stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition'.

Dipanwita Banerjee, Hisae Tateishi-Karimata, Tatsuya Ohyama, Saptarshi Ghosh, Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Naoki Sugimoto

Nucleic acids research 49(18) 10796-10799 2021年10月11日

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MISC

398

核酸の二次構造を標的としたドロプレットの分解

鶴田充生, 取井猛流, 小畠一起, 川内敬子, 建石(狩俣)寿枝, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 102nd 2022年
グアニン四重らせん構造選択的化合物の開発に向けたスクリーニングシステムの構築

橋本佳樹, 取井猛流, 藤田ひな, 川内敬子, 建石寿枝, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 102nd 2022年
フロントランナーに聞く「令和の時代も進化を続ける核酸化学」

神谷真子, 建石寿枝, 永次史, 山吉麻子, 杉本直己

CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学―ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬―」 41 2-13 2021年10月
遺伝子発現における核酸の新機能

松本咲, 杉本直己

CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学―ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬―」 41 146-154 2021年10月査読有り
細胞内の核酸物理化学

高橋俊太郎, 杉本直己

CSJカレントレビュー「進化を続ける核酸化学―ゲノム編集、非二重らせん、核酸医薬―」 41 14-21 2021年10月査読有り
Roles of non-canonical structures of nucleic acids in cancer and neurodegenerative diseases

建石寿枝, 杉本直己

49(14) 7839-7855 2021年8月20日責任著者
がん関連mRNAと光線力学療法

三好大輔, 杉本直己

CSJカレントレビュー「生体分子と疾患」（化学同人） 39 75-83 2021年8月査読有り責任著者
Chemical Biology of Double Helical and Non-Double Helical Nucleic Acids: “To B or Not To B, That Is the Question”

Naoki Sugimoto, Tamaki Endoh, Shuntaro Takahashi, Hisae Tateishi-Karimata

Bulletin of the Chemical Society of Japan 94(7) 1970-1998 2021年7月15日査読有り
分子夾雑によって制御される核酸機能と疾患発症

松本咲, 杉本直己

月刊細胞 53(6) 4-7 2021年4月30日査読有り
New Insights into the Functions of Nucleic Acids Controlled by Cellular Microenvironments

S.Matsumoto, N. Sugimoto

Topics in Current Chemistry 379(17) 2021年3月30日
rDNA由来のDNA G4とRGGペプチドの相互作用による液-液相分離現象の解析

月生雅也, 取井猛流, 建石寿枝, 西方敬人, 杉本直己, 三好大輔, 川内敬子

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
rDNAの四重らせん構造形成の分子機構の解明

取井猛流, 杉本渉, 建石寿枝, 鶴田充生, 月生雅也, 村嶋貴之, 西方敬人, 杉本直己, 三好大輔, 川内敬子

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
脱ワトソン・クリックの核酸化学(69):神経変性疾患に関連するRNA四重鎖とジペプチドリピートの分子シミュレーションによる相互作用の解析

大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己, 杉本直己

日本化学会春季年会講演予稿集(Web) 101st 2021年
Watson-Crick versus Hoogsteen Base Pairs: Chemical Strategy to Encode and Express Genetic Information in Life

S. Takahashi, N. Sugimoto

Acc. Chem. Res., 54 2021年
クラウディングの実験と理論 (相分離生物学の全貌) -- (生物学的相分離の理論)

建石寿枝, 杉本直己

現代化学 : 増刊 (46) 195-200 2020年11月
短鎖G4RNAとRGGペプチドの相互作用による液-液相分離現象

小畠一起, 杉本渉, 川内敬子, 杉本直己, 杉本直己, 三好大輔

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 100th 2020年
脱ワトソン・クリックの核酸化学(63):分子シミュレーションによるGGGGCCリピートのRNA四重鎖とジペプチドリピートの集積メカニズムの解析

大山達也, 建石寿枝, 田中成典, 杉本直己, 杉本直己

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM) 100th 2020年
rRNA転写阻害による核小体崩壊メカニズムの解明

杉本渉, 豊田駿, 建石寿枝, 杉本直己, 岩根敦子, 岩根敦子, 岩根敦子, 三好大輔, 川内敬子

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th (Web) 2020年
Effect of chemical environment changes in cell on DNA structures and functions

Hisae Tateishi-Karimata, Naoki Sugimoto

Science Impact Ltd 2020(7) 25-27 2020年査読有り
Stability Prediction of Canonical and Non-canonical Structures of Nucleic Acids in Various Molecular Environments and Cells

S. Takahashi, N. Sugimoto

Chem. Soc. Rev 49 8439-8468 2020年