ダネフラドスティン (Radostin Danev) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院医学系研究科教授

学位: Ph.D.(Sokendai)

通称等の別名: ラド
J-GLOBAL ID: 200901016459077822
researchmap会員ID: 5000092631

外部リンク: http://danevlab.m.u-tokyo.ac.jp/

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研究分野

経歴

2011年 - 2018年

Max Planck Institute of Biochemistry, Germany, Department of Molecular Structural Biology, Group Leader
2001年 - 2011年

生理学研究所岡崎統合バイオサイエンスセンター戦略的方法論研究領域（ナノ形態生理）, 研究員(科学研究)

論文

102

Smart parallel automated cryo-electron tomography.

Fabian Eisenstein, Yoshiyuki Fukuda, Radostin Danev

Nature methods 21(9) 1612-1615 2024年9月
Cryo-EM Structure of the Human Amylin 1 Receptor in Complex with CGRP and Gs Protein.

Jianjun Cao, Matthew J Belousoff, Radostin Danev, Arthur Christopoulos, Denise Wootten, Patrick M Sexton

Biochemistry 63(9) 1089-1096 2024年5月7日
Community recommendations on cryoEM data archiving and validation.

Gerard J Kleywegt, Paul D Adams, Sarah J Butcher, Catherine L Lawson, Alexis Rohou, Peter B Rosenthal, Sriram Subramaniam, Maya Topf, Sanja Abbott, Philip R Baldwin …

IUCrJ 11(Pt 2) 140-151 2024年3月1日
Xanomeline displays concomitant orthosteric and allosteric binding modes at the M4 mAChR.

Wessel A C Burger, Vi Pham, Ziva Vuckovic, Alexander S Powers, Jesse I Mobbs, Yianni Laloudakis, Alisa Glukhova, Denise Wootten, Andrew B Tobin, Patrick M Sexton …

Nature communications 14(1) 5440-5440 2023年9月6日
Structural insight into selectivity of amylin and calcitonin receptor agonists.

Jianjun Cao, Matthew J Belousoff, Elliot Gerrard, Radostin Danev, Madeleine M Fletcher, Emma Dal Maso, Herman Schreuder, Katrin Lorenz, Andreas Evers, Garima Tiwari …

Nature chemical biology 20(2) 162-169 2023年8月3日
Pharmacological hallmarks of allostery at the M4 muscarinic receptor elucidated through structure and dynamics.

Ziva Vuckovic, Jinan Wang, Vi Pham, Jesse I Mobbs, Matthew J Belousoff, Apurba Bhattarai, Wessel A C Burger, Geoff Thompson, Mahmuda Yeasmin, Vindhya Nawaratne …

eLife 12 2023年5月30日
Parallel cryo electron tomography on in situ lamellae.

Fabian Eisenstein, Haruaki Yanagisawa, Hiroka Kashihara, Masahide Kikkawa, Sachiko Tsukita, Radostin Danev

Nature methods 20(1) 131-138 2023年1月
Understanding VPAC receptor family peptide binding and selectivity.

Sarah J Piper, Giuseppe Deganutti, Jessica Lu, Peishen Zhao, Yi-Lynn Liang, Yao Lu, Madeleine M Fletcher, Mohammed Akhter Hossain, Arthur Christopoulos, Christopher A Reynolds …

Nature communications 13(1) 7013-7013 2022年11月16日
A structural basis for amylin receptor phenotype.

Jianjun Cao, Matthew J Belousoff, Yi-Lynn Liang, Rachel M Johnson, Tracy M Josephs, Madeleine M Fletcher, Arthur Christopoulos, Debbie L Hay, Radostin Danev, Denise Wootten …

Science (New York, N.Y.) 375(6587) eabm9609 2022年3月25日査読有り
Structural and functional diversity among agonist-bound states of the GLP-1 receptor.

Brian P Cary, Giuseppe Deganutti, Peishen Zhao, Tin T Truong, Sarah J Piper, Xinyu Liu, Matthew J Belousoff, Radostin Danev, Patrick M Sexton, Denise Wootten …

Nature chemical biology 18(3) 256-263 2022年3月査読有り
Dynamics of GLP-1R peptide agonist engagement are correlated with kinetics of G protein activation.

Giuseppe Deganutti, Yi-Lynn Liang, Xin Zhang, Maryam Khoshouei, Lachlan Clydesdale, Matthew J Belousoff, Hari Venugopal, Tin T Truong, Alisa Glukhova, Andrew N Keller …

Nature communications 13(1) 92-92 2022年1月10日査読有り
Cryo-EM structure of the dual incretin receptor agonist, peptide-19, in complex with the glucagon-like peptide-1 receptor.

Rachel M Johnson, Xin Zhang, Sarah J Piper, Theodore J Nettleton, Teresa H Vandekolk, Christopher J Langmead, Radostin Danev, Patrick M Sexton, Denise Wootten

Biochemical and biophysical research communications 578 84-90 2021年9月16日査読有り
Positive allosteric mechanisms of adenosine A1 receptor-mediated analgesia.

Christopher J Draper-Joyce, Rebecca Bhola, Jinan Wang, Apurba Bhattarai, Anh T N Nguyen, India Cowie-Kent, Kelly O'Sullivan, Ling Yeong Chia, Hariprasad Venugopal, Celine Valant …

Nature 2021年9月8日査読有り
Routine sub-2.5 Å cryo-EM structure determination of GPCRs.

Radostin Danev, Matthew Belousoff, Yi-Lynn Liang, Xin Zhang, Fabian Eisenstein, Denise Wootten, Patrick M Sexton

Nature communications 12(1) 4333-4333 2021年7月15日査読有り筆頭著者責任著者
Structure and dynamics of semaglutide- and taspoglutide-bound GLP-1R-Gs complexes.

Xin Zhang, Matthew J Belousoff, Yi-Lynn Liang, Radostin Danev, Patrick M Sexton, Denise Wootten

Cell reports 36(2) 109374-109374 2021年7月13日査読有り責任著者
Structures of the human cholecystokinin 1 (CCK1) receptor bound to Gs and Gq mimetic proteins provide insight into mechanisms of G protein selectivity.

Jesse I Mobbs, Matthew J Belousoff, Kaleeckal G Harikumar, Sarah J Piper, Xiaomeng Xu, Sebastian G B Furness, Hari Venugopal, Arthur Christopoulos, Radostin Danev, Denise Wootten …

PLoS biology 19(6) e3001295 2021年6月査読有り
Cryo-EM Performance Testing of Hardware and Data Acquisition Strategies.

Radostin Danev, Haruaki Yanagisawa, Masahide Kikkawa

Microscopy (Oxford, England) 2021年5月10日査読有り筆頭著者責任著者
Evolving cryo-EM structural approaches for GPCR drug discovery.

Xin Zhang, Rachel M Johnson, Ieva Drulyte, Lingbo Yu, Abhay Kotecha, Radostin Danev, Denise Wootten, Patrick M Sexton, Matthew J Belousoff

Structure (London, England : 1993) 2021年5月2日査読有り
Structure and dynamics of the CGRP receptor in apo and peptide-bound forms.

Tracy M Josephs, Matthew J Belousoff, Yi-Lynn Liang, Sarah J Piper, Jianjun Cao, Daniel J Garama, Katie Leach, Karen J Gregory, Arthur Christopoulos, Debbie L Hay …

Science (New York, N.Y.) 2021年2月18日査読有り責任著者
Differential GLP-1R Binding and Activation by Peptide and Non-peptide Agonists.

Xin Zhang, Matthew J Belousoff, Peishen Zhao, Albert J Kooistra, Tin T Truong, Sheng Yu Ang, Christina Rye Underwood, Thomas Egebjerg, Petr Šenel, Gregory D Stewart …

Molecular cell 80(3) 485-500 2020年11月5日査読有り責任著者

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MISC

Phase contrast single particle analysis of small protein complexes at atomic resolutions

M. Khoshouei, L. Liang, M. Radjainia, W. Baumeister, R. Danev

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 46 S91-S91 2017年7月
Charting Cellular Landscapes in Molecular Detail by in Situ Cryo-Electron Tomography

Juergen Plitzko, Julia Mahamid, Benjamin D. Engel, Sahradha Albert, Miroslava Schaffer, Jan Arnold, Yoshiyuki Fukuda, Radostin Danev, Wolfgang Baumeister

BIOPHYSICAL JOURNAL 110(3) 2A-2A 2016年2月
ボルタ位相差クライオ透過電子顕微鏡

福田善之, Danev Radostin, Baumeister Wolfgang

顕微鏡 = Microscopy 51(1) 43-47 2016年
Zernike Phase-Contrast Electron Tomography of Microtubule-Related Complexes in Axonemes

Haixin Sui, Radostin Danev, Rebecca Fisher, Jie He, Chyongere Hsie, Michael Marko

BIOPHYSICAL JOURNAL 106(2) 599A-599A 2014年1月
Visualization of BrdU-labelled DNA in cyanobacterial cells by Hilbert differential contrast transmission electron microscopy

K. Nitta, K. Nagayama, R. Danev, Y. Kaneko

JOURNAL OF MICROSCOPY-OXFORD 234(2) 118-123 2009年5月
ZERNIKE PHASE CONTRAST ELECTRON MICROSCOPY VISUALIZES DETAILED ULTRASTRUCTURES OF VITRIFIED BIOLOGICAL SPECIMENS

Yoshiyuki Fukuda, Yugo Fukazawa, Radostin S. Danev, Ryuichi Shigemoto, Kuniaki Nagayama

JOURNAL OF PHYSIOLOGICAL SCIENCES 59 529-529 2009年
Cyanobacterial subcellular structures visualized by Hilbert differential contrast transmission electron microscopy

Yasuko Kaneko, Radostin Danev, Koji Nitta, Hitoshi Nakamoto, Kuniaki Nagayama

CELL STRUCTURE AND FUNCTION 30 116-116 2005年6月
WS3-5 Observation of in vivo nucleic acids in ice embedded whole bacterial cells(THE 46TH ANNUAL MEETING OF THE JAPAN SOCIETY OF HISTOCHEMISTRY AND CYTOCHEMISTRY) :

Kaneko Yasuko, Nitta Koji, Danev Radostin, Nagayama Kuniaki

Acta histochemica et cytochemica 38(6) S11 2005年
IIA-17 位相差電子顕微鏡を使用した高コントラスト観察による生物試料観察の限界打破(技術,一般演題発表,第46回日本組織細胞化学会総会・学術集会)

臼田信光, 厚沢季美江, 谷口孝喜, Radostin Danev, 永山國昭

日本組織細胞化学会総会プログラムおよび抄録集 (46) 88-88 2005年
IIA-19 位相差電子顕微鏡の組織化学への適用(技術,一般演題発表,第46回日本組織細胞化学会総会・学術集会)

厚沢季美江, 中沢綾美, Radostin Danev, 臼田信光, 永山國昭

日本組織細胞化学会総会プログラムおよび抄録集 (46) 89-89 2005年
W5-3 電子位相顕微鏡による無染色標本の観察(電子位相顕微鏡法の展開,ワークショップ5,第44回日本組織細胞化学会第35回日本臨床電子顕微鏡学会合同学術集会)

臼田信光, 中沢綾美, Danev Radostin, 永山國昭

日本組織細胞化学会総会プログラムおよび抄録集 (44) 53-53 2003年
A novel phase-contrast transmission electron microscopy producing high-contrast topographic images of weak objects

R Danev, H Okawara, N Usuda, K Kametani, K Nagayama

JOURNAL OF BIOLOGICAL PHYSICS 28(4) 627-635 2002年
複素電子顕微鏡の開発

DANEV R, 杉谷正三, 村田和義, 永山国昭

生理学研究所年報 20 15 1999年12月1日
複素電子顕微鏡による1分子構造解析

永山国昭, DANEV R, 杉谷正三, 村田和義

タンパク質構造討論会講演要旨集 50th 60-62 1999年6月15日

書籍等出版物

Single-particle cryo-EM of biological macromolecules

Glaeser, Robert M., Nogales, Eva, Chiu, Wah

IOP Publishing 2021年 (ISBN: 9780750330374)

共同研究・競争的資金等の研究課題

Gタンパク質共役受容体超複合体を解明するための新しいクライオ電子顕微鏡法

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2021年4月 - 2023年3月

Danev Radostin, EISENSTEIN FABIAN
Adaptive optics approach for high-throughput, high-resolution cryo-electron microscopy of biological macromolecules and complexes

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2019年4月 - 2020年3月

Danev Radostin

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