柴田淳史 (Atsushi Shibata) - マイポータル

基本情報

所属: 慶應義塾大学薬学部　分子腫瘍薬学講座教授 (講座主任)
: 京都大学放射線生物研究センター客員教授

学位: 医学(東京医科歯科大学)

J-GLOBAL ID: 200901051146968505
researchmap会員ID: 6000019629

外部リンク: https://shibataxlab.com/

柴田研究室では人体のあらゆる場面で発生するDNAの傷が、どのように修復されるかを統合的に理解することで、DNA修復反応をmanipulation(操作)し、様々な医療の場面に応用することを目指しています。生命現象としてのDNA修復の解明が、がん治療を含めた様々な医療における応用に繋がることを信じて、私たちは日々研究に励んでいます。

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

慶應義塾大学, 薬学部分子腫瘍薬学講座, 教授
2019年4月 - 2023年3月

群馬大学, 未来先端研究機構シグナル伝達研究部門柴田研究室, 准教授（PI）
2017年4月 - 2019年3月

群馬大学, 大学院医学系研究科大学院教育研究支援センター・柴田研究室, 研究講師（PI）
2013年 - 2017年

群馬大学, 先端科学研究指導者育成ユニット, 助教（テニュアトラックPI）
2012年 - 2013年

University of Sussex, 日本学術振興会海外特別研究員
2006年 - 2012年

University of Sussex, 博士研究員
2006年 - 2007年

東京医科歯科大学, Medical and Dental Sciences Postdoctoral Degree (Ph.D, medicine)
2006年 - 2007年

東京医科歯科大学, 日本学術振興会特別研究員PD
2004年 - 2006年

東京医科歯科大学, 日本学術振興会特別研究員DC1

学歴

受賞

2020年3月

放射線影響研究奨励賞, 公益財団法人放射線影響協会
2017年

第24回 DNA複製・組換え・修復ワークショップ若手発表賞

柴田淳史
2017年

日本放射線影響学会第60回大会優秀演題発表賞

柴田淳史
2017年

放射線影響学会奨励賞

柴田淳史
2012年

Poster prize, Joint British Association for Cancer Research-Gray Institute

柴田淳史
2010年

Highly rated poster presentations, The AACR 101st Annual Meeting

柴田淳史

論文

105

MeCP2 deficiency leads to the γH2AX nano foci expansion after ionizing radiation

Hikaru Okumura, Ryota Hayashi, Daiki Unami, Mayu Isono, Motohiro Yamauchi, Kensuke Otsuka, Yu Kato, Takahiro Oike, Yuki Uchihara, Atsushi Shibata

DNA Repair 103790-103790 2024年11月
Involvement of the splicing factor SART1 in the BRCA1-dependent homologous recombination repair of DNA double-strand breaks

Kie Ozaki, Reona Kato, Takaaki Yasuhara, Yuki Uchihara, Miyako Hirakawa, Yu Abe, Hiroki Shibata, Reika Kawabata-Iwakawa, Aizhan Shakayeva, Palina Kot …

Scientific Reports 14(1) 2024年8月8日
Characterization of the signal transduction cascade for inflammatory gene expression in fibroblasts with ATM-ATR deficiencies after Ionizing radiation

Shunji Haruna, Ken Okuda, Akiko Shibata, Mayu Isono, Kohei Tateno, Hiro Sato, Takahiro Oike, Yuki Uchihara, Yu Kato, Atsushi Shibata

Radiotherapy and Oncology 194 110198-110198 2024年5月
Comprehensive single-cell analysis demonstrates radiotherapy-induced infiltration of macrophages expressing immunosuppressive genes into tumor in esophageal squamous cell carcinoma

Hidekazu Oyoshi, Junyan Du, Shunsuke A. Sakai, Riu Yamashita, Masayuki Okumura, Atsushi Motegi, Hidehiro Hojo, Masaki Nakamura, Hidenari Hirata, Hironori Sunakawa …

Science Advances 9(50) 2023年12月15日
Regulation of DNA damage-induced HLA class I presentation

Yuki Uchihara, Atsushi Shibata

DNA Repair 132 103590-103590 2023年12月
時空間解析による放射線治療による食道がん患者組織での免疫環境変化の解析

大吉秀和, 山下理宇, 茂木厚, 北條秀博, 小谷大輔, 小島隆嗣, 中村優香, 小嶋基寛, 鈴木絢子, 善光純子 …

日本癌治療学会学術集会抄録集 61回 O45-2 2023年10月
HLA Class I Expression Is Associated with DNA Damage and Immune Cell Infiltration into Dysplastic and Neoplastic Lesions in Ulcerative Colitis

Haruka Okami, Naoya Ozawa, Makoto Sohda, Takehiko Yokobori, Katsuya Osone, Bilguun Erkhem-Ochir, Gendensuren Dorjkhorloo, Takuya Shiraishi, Takuhisa Okada, Akihiko Sano …

International Journal of Molecular Sciences 24(17) 13648-13648 2023年9月4日
Calreticulin Upregulation in Cervical Cancer Tissues From Patients After 10 Gy Radiation Therapy

Kohei Okada, Hiro Sato, Takuya Kumazawa, Yasumasa Mori, Tiara Bunga Mayang Permata, Yuki Uchihara, Shin-ei Noda, Keiji Suzuki, Hayato Ikota, Hideaki Yokoo …

Advances in Radiation Oncology 8(3) 101159-101159 2023年5月
Analysis of the relationship between LET, γH2AX foci volume and cell killing effect of carbon ions using high-resolution imaging technology

Takahiro Oike, Sangeeta Kakoti, Makoto Sakai, Akihiko Matsumura, Tatsuya Ohno, Atsushi Shibata

Journal of Radiation Research 2023年1月7日
Radiosensitization by the Selective Pan-FGFR Inhibitor LY2874455.

Narisa Dewi Maulany Darwis, Eisuke Horigome, Shan Li, Akiko Adachi, Takahiro Oike, Atsushi Shibata, Yuka Hirota, Tatsuya Ohno

Cells 11(11) 2022年5月24日
DNA damage promotes HLA class I presentation by stimulating a pioneer round of translation-associated antigen production.

Yuki Uchihara, Tiara Bunga Mayang Permata, Hiro Sato, Reika Kawabata-Iwakawa, Sayako Katada, Wenchao Gu, Sangeeta Kakoti, Motohiro Yamauchi, Reona Kato, Soehartati Gondhowiardjo …

Molecular cell 82(14) 2557-2570 2022年5月13日
RAP80 suppresses the vulnerability of R-loops during DNA double-strand break repair

Takaaki Yasuhara, Reona Kato, Motohiro Yamauchi, Yuki Uchihara, Lee Zou, Kiyoshi Miyagawa, Atsushi Shibata

Cell Reports 38(5) 110335-110335 2022年2月
Carbon ion radiation and clustered DNA double-strand breaks

Atsushi Shibata

DNA Damage and Double Strand Breaks - Part A 117-130 2022年
64Cu-ATSM Predicts Efficacy of Carbon Ion Radiotherapy Associated with Cellular Antioxidant Capacity

Ankita Nachankar, Takahiro Oike, Hirofumi Hanaoka, Ayaka Kanai, Hiro Sato, Yukari Yoshida, Hideru Obinata, Makoto Sakai, Naoto Osu, Yuka Hirota …

Cancers 13(24) 6159-6159 2021年12月7日
Expression of non‑homologous end joining factor, Ku80, is negatively correlated with PD‑L1 expression in cancer cells after X‑ray irradiation

Takuya Kumazawa, Yasumasa Mori, Hiro Sato, Tiara Permata, Yuki Uchihara, Shin-Ei Noda, Kohei Okada, Sangeeta Kakoti, Keiji Suzuki, Hayato Ikota …

Oncology Letters 23(1) 29-29 2021年11月23日
Mechanism of chromosome rearrangement arising from single-strand breaks

Palina Kot, Takaaki Yasuhara, Atsushi Shibata, Miyako Hirakawa, Yu Abe, Motohiro Yamauchi, Naoki Matsuda

Biochemical and Biophysical Research Communications 572 191-196 2021年10月
Genome Maintenance Mechanisms at the Chromatin Level

Hirotomo Takatsuka, Atsushi Shibata, Masaaki Umeda

International Journal of Molecular Sciences 22(19) 10384-10384 2021年9月27日
ATM’s Role in the Repair of DNA Double-Strand Breaks

Atsushi Shibata, Penny A. Jeggo

Genes 12(9) 1370-1370 2021年8月31日
Modulation of immune responses by DNA damage signaling

Yuki Uchihara, Tiara Bunga Mayang Permata, Hiro Sato, Atsushi Shibata

DNA Repair 104 103135-103135 2021年8月
High linear energy transfer carbon-ion irradiation upregulates PD-L1 expression more significantly than X-rays in human osteosarcoma U2OS cells

Tiara Bunga Mayang Permata, Hiro Sato, Wenchao Gu, Sangeeta Kakoti, Yuki Uchihara, Yukihiko Yoshimatsu, Itaru Sato, Reona Kato, Motohiro Yamauchi, Keiji Suzuki …

Journal of Radiation Research 62(5) 773-781 2021年7月1日

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MISC

放射線照射によって生じたDNA二本鎖切断同士のペアリングの制御機構

山内基弘, 柴田淳史, 鈴木啓司, 鈴木正敏, 新美敦子, 近藤久義, 三浦美和, 平川美弥子, 辻田啓子, 山下俊一 …

日本保健物理学会研究発表会講演要旨集 50th 103 2017年
重粒子線照射に特徴的なDNA損傷形態の研究

新美敦子, 柴田淳史

放射線生物研究 = Radiation biology research communications : 放射線生物研究会機関誌 51(4) 315-323 2016年12月
ATMとDNA‐PKによるDNA二本鎖切断同士の会合の抑制

山内基弘, 柴田淳史, 鈴木啓司, 鈴木正敏, 新美敦子, 近藤久義, 三浦美和, 平川美弥子, 山下俊一, 松田尚樹

原子爆弾後障害研究会特集号 57th 184‐186 2016年9月25日
ATMとDNA-PKによるDNA二本鎖切断同士の会合の抑制 (特集第57回原子爆弾後障害研究会講演集)

山内基弘, 柴田淳史, 鈴木啓司, 鈴木正敏, 新美敦子, 近藤久義, 三浦美和, 平川美弥子, 山下俊一, 松田尚樹

長崎医学会雑誌 91 184-186 2016年9月
DNA Double-Strand Break Repair Pathway Choice Is Directed by Distinct MRE11 Nuclease Activities (vol 53, pg 7, 2014)

Atsushi Shibata, Davide Moiani, Andrew S. Arvai, Jefferson Perry, Shane M. Harding, Marie-Michelle Genois, Ranjan Maity, Sari van Rossum-Fikkert, Aryandi Kertokalio, Filippo Romoli …

MOLECULAR CELL 53(2) 361-361 2014年1月
放射線照射誘発DNA二本鎖切断における修復経路決定機構

柴田淳史

放射線生物研究 48(3) 235-255 2013年9月
The role of ATM signalling in DNA double strand break repair

Penelope Ann Jeggo, Aaron A. Goodarzi, Atsushi Shibata, Markus Lobrich

FASEB JOURNAL 24 2010年4月
Parp-1欠損マウスの加齢個体における自然突然変異の解析

柴田淳史, 能美健彦, 寺岡弘文, 中釜斉, 杉村隆, 鈴木宏志, 益谷美都子

日本癌学会総会記事 64回 468-469 2005年9月
ヒト胚細胞腫瘍細胞株におけるpoly(ADP-ribose)合成酵素(PARP)-1の遺伝子及び機能異常の解析

荻野秀樹, 柴田淳史, 中釜斉, 杉村隆, 益谷美都子

日本癌学会総会記事 63回 78-78 2004年9月
Parp-1欠損マウスにおけるin vivo突然変異解析

柴田淳史, 鎌田宣夫, 増村健一, 能美健彦, 小林静子, 寺岡弘文, 中釜斉, 杉村隆, 鈴木宏志

日本癌学会総会記事 62nd 2003年
ポリ(ADP-リボース)グリコヒドロラーゼ遺伝子欠損ES細胞株におけるアルキル化剤とガンマ線に対する感受性亢進

野崎中成, 藤原久子, 郡司明美, 柴田淳史, 鎌田宣夫, 寺社下浩一, 落谷孝広, 中釜斉, 杉村隆, 益谷美都子

日本癌学会総会記事 61回 51-51 2002年10月
NAD+とADP-リボースの新しい生理機能ポリ(ADP-リボース)代謝の生体内での役割

益谷美都子, 野崎中成, 鎌田宣夫, 藤原久子, 郡司明美, 柴田淳史, 中釜斉, 杉村隆, 寺社下浩一, 鈴木宏志

生化学 74(8) 620-620 2002年8月
gpt delta/Parp-1欠損マウスにおけるN-nitrosobis(hydroxypropyl)amine投与後の突然変異

柴田淳史, 鎌田宣夫, 野崎中成, 藤原久子, 増村健一, 能美健彦, 小林静子, 鈴木宏志, 益谷美都子

日本癌学会総会記事 61st 2002年
gpt deltaマウスにおける変異検出系としてのSpi^- assayの改良-プラーク形成時のマグネシウムイオン添加の影響-

柴田淳史, 益谷美都子, 野崎中成, 鎌田宣夫, 藤原久子, 増村健一, 小林静子, 鈴木宏志, 能美健彦

日本環境変異原学会大会プログラム・要旨集 31st 2002年
Parp-1欠損マウス骨髄細胞のin vivoにおける自然突然変異

柴田淳史, 鎌田宣夫, 野崎中成, 藤原久子, 増村健一, 能美健彦, 小林静子, 鈴木宏志, 益谷美都子

日本癌学会総会記事 60th 2001年

講演・口頭発表等

RAP80 suppresses deleterious repair of double-strand break in transcribed genome

柴田淳史

第10回 International Symposium on DNA Damage Response & Human Disease (isDDRHD) 2019年11月招待有り
DNA二本鎖切断修復経路の決定メカニズム

柴田淳史

日本核酸医薬学会生物セッション第4回サテライトシンポジウム 2019年10月招待有り
Pursuing High-Quality Radiobiology & Radiation Oncology in Indonesia: from basics – clinics – publication

柴田淳史

IROS Annual Scientific Meeting 2019年10月招待有り
Regulation of DSB repair pathway choice and its downstream signaling

柴田淳史

第78回日本癌学会学術総会シンポジウム「発がん微小環境におけるDNA修復欠損の役割」 2019年9月招待有り
Regulation of transcription-associated end-joining mediated by MRE11, BRCA1, Polθ and LIG1/3

柴田淳史

16th International Congress of Radiation Research 2019 2019年8月
Regulation of DNA damage signalling-dependent PD-L1 expression in cancer cells

柴田淳史

16th International Congress of Radiation Research 2019 2019年8月
転写共役型DNA二本鎖切断修復経路の分子機構

柴田淳史

第８回DNA損傷応答ワークショップ 2019年4月3日
DNA二本鎖切断修復の経路選択性とその変化に伴うシグナル伝達の研究：DNA損傷から免疫治療標的分子PD-L1発現制御機構まで

柴田淳史

がん研究所・吉田富三記念講堂 2019年3月
超高解像度蛍光顕微鏡を使った重粒子線誘発 DNA 二本鎖切断修復機構の解析

柴田淳史

茨城大学理学部公開シンポジウム・第 12 回Quantum Medicine 研究会 2019年2月
G1 期細胞における転写共役型DNA二本鎖切断修復経路選択機構

柴田淳史

国立遺伝学研究所研究集会 2019年2月
がん治療時の免疫応答に関わるDNA損傷依存的PD-L1発現調節機構の研究

柴田淳史

第21回菅原・大西記念癌治療増感シンポジウム 2019年2月
RAP80 suppresses Artemis-dependent deleterious rejoining during transcription-associated DNA double-strand break repair in the G1 phase

柴田淳史

Keystone Symposia: DNA Replication and Genome Instability: From Mechanism to Disease 2019年1月
DNA損傷応答により誘導されるPD-L1発現制御機構

柴田淳史

第７回 AAA（Academy of Aging and CArdiovascular-Diabetes Research）研究会（田辺三菱製薬共催） 2019年1月
Elucidation of the molecular mechanism underlying PD-L1 expression in response to DNA damage

柴田淳史

The 34th Radiation Biology Center International Symposium / The 2nd International Symposium on Radiation Therapeutics and Biology”Molecular Targets and Precision Cancer Medicine: From basic research toward translation” 2018年11月招待有り
Elucidation of PD-L1 expression in cancer cells after radiotherapy

柴田淳史

International Particle Medicine Research Symposium 2018年10月招待有り
Elucidation of the molecular mechanism underlying PD-L1 expression after DNA damage for precision radioimmunotherapy

柴田淳史

The 3rd FARO Meeting 2018 2018年9月招待有り
転写活性領域に生じたDNA二本鎖切断に対するゲノム安定維持機構

柴田淳史

日本遺伝学会第90回大会 2018年9月招待有り
Investigating the molecular mechanism underlying PD-L1 expression after DNA damage for precision radioimmunotherapy

柴田淳史

第77回日本癌学会学術総会 2018年9月招待有り
転写活性領域におけるDNA二本鎖切断修復とその修復経路選択機構

柴田淳史

第56回生物部会学術大会・第47回放射線による制癌シンポジウム 2018年7月
RAP80 regulates transcription-associated DNA end resection in G1

柴田淳史

Gordon Research Conference Genomic Instability,Chromosome Replication, Repair and Architecture 2018年7月

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

人工ウィルスにより抗腫瘍免疫を起動する新規免疫療法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

中島菜花子, 長田健介, 柴田淳史
ヒト遺伝子破壊株を用いた高ＬＥＴ線誘発ＤＳＢの修復とゲノム情報への影響の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

黒沢綾, 柴田淳史
全ゲノム領域に共通した正確なDNA修復を保証するDSB修復経路選択機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

柴田淳史, 山内基弘, 宮成悠介, 安原崇哲
非自己核酸が誘発するHLA提示およびISGs発現誘導を介した免疫惹起機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2023年3月

柴田淳史
遺伝子領域間に引き起こされる転写共役型染色体転座経路の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2020年7月 - 2022年3月

柴田淳史, 山内基弘, 安原崇哲
多能性幹細胞傷害後のクロマチン変換が及ぼすDNA損傷発生機構および修復経路の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

柴田淳史
2型糖尿病個別化療法の確立を目指した糖尿病における分化転換の分子基盤の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2022年3月

沖田直之, 樋上賀一, 柴田淳史
転写共役型相同組換え修復の開始を導く分子メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2017年4月 - 2021年3月

柴田淳史
2型糖尿病個別化療法の確立を目指した糖尿病における分化転換の分子基盤の研究

科学研究費助成事業基盤研究C・分担 2018年 - 2021年

沖田直之
がん重粒子線治療の高度化と治療個別化の為の基礎的・臨床的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2020年3月

中野隆史, 白井克幸, 岡本雅彦, 田巻倫明, 柴田淳史, 若月優, 鈴木義行, 野田真永, 齋藤淳一, 河村英将, 鳥飼幸太
転写共役型相同組換え修復の開始を導く分子メカニズムの解明

科学研究費助成事業若手研究A・代表 2017年 - 2020年

柴田淳史
がん重粒子線治療の高度化と治療個別化の為の基礎的・臨床的研究

科学研究費助成事業基盤研究B・分担 2016年 - 2019年

中野隆史
DNA修復経路操作を可能とする創薬開発に向けた分子標的の探索

公益財団法人武田科学振興財団 2019年度ビジョナリーリサーチ助成（ホップ 2019年

柴田淳史
染色体転座生成を導く二つのDNA二本鎖切断シグナル間の相互干渉の証明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

新美敦子, 柴田淳史, 山内基弘
1細胞イメージングを使った放射線照射細胞の運命決定の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2018年3月

新美敦子, 柴田淳史, 山内基弘
ユビキチン依存的DNA-PK活性化が導く抗がん剤感受性のメカニズム解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

逆井良, 柴田淳史
相同組換え修復開始を導くクロマチン構造変換後のpseudo転写構造形成の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2014年4月 - 2018年3月

柴田淳史
G0/G1 静止期におけるDNA 二本鎖切断修復機構の解明

三菱財団平成30年度自然科学助成 2018年

柴田淳史
超高解像度顕微鏡を用いた重粒子線誘発DNAクラスター損傷修復の可視化

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2017年3月

磯野真由, 柴田淳史
部位特異的制限酵素I-PpoIを応用したPCRによる染色体転座検出法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2017年3月

柴田淳史, 山内基弘

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研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

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