小林慎 (Kobayashi Shin) - マイポータル

基本情報

所属: 産業技術総合研究所・細胞分子工学研究部門動的創薬モダリティ研究グループ主任研究員

連絡先: kobayashi.shinaist.go.jp
J-GLOBAL ID: 201801015979112250
researchmap会員ID: B000325477

外部リンク: http://staff.aist.go.jp/kobayashi.shin/

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研究分野

経歴

2018年 - 現在

東邦大学, 理学部生物学科, 非常勤講師
2017年 - 現在

産業技術総合研究所, 創薬分子プロファイリング研究センター, 主任研究員
2011年 - 2021年3月

東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 非常勤講師
2011年 - 2015年

さきがけ研究員兼任
2008年 - 2011年

東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, MTTプログラム特任講師
2003年 - 2008年

大阪大学, 微生物病研究所附属遺伝情報実験センター, COE特任助教
1999年 - 2003年

東京工業大学, バイオ研究基盤支援総合センター, CREST研究員

学歴

1996年 - 1999年

東京工業大学大学院博士課程, 生命理工学研究科, バイオサイエンス専攻
1994年 - 1996年

東京工業大学大学院修士課程, 生命理工学研究科, バイオサイエンス専攻
1990年 - 1994年

東京工業大学, 生命理工学部, 生命理学科

論文

Momiji Embryonic Stem Cell System Enabling Live Imaging of Random X-Chromosome Inactivation In Vitro During Embryonic Development.

Koshiguchi M, Yonezawa N, Hatano Y, Yamagata K, Kobayashi S

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2025年11月12日招待有り最終著者責任著者
The Competitive Loss of Cerebellar Granule and Purkinje Cells Driven by X-Linked Mosaicism in a Female Mouse Model of CASK-Related Disorders

Takuma Mori, Zhou Mengyun, Ken Kunugitani, Taichi Akatsuka, Yukina Yoshida, Emi Kouyama-Suzuki, Shin Kobayashi, Yoshinori Shirai, Katsuhiko Tabuchi

Cells 14(10) 735 2025年5月査読有り
A system to analyze the initiation of random X-chromosome inactivation using time-lapse imaging of single cells

Manami Koshiguchi, Nao Yonezawa, Yu Hatano, Hikaru Suenaga, Kazuo Yamagata, Shin Kobayashi

Scientific Reports 14(1) 2024年9月2日査読有り責任著者
Epigenome editing reveals core DNA methylation for imprinting control in the Dlk1-Dio3 imprinted domain.

Shin Kobayashi

Nucleic acids research 2022年5月1日査読有り
Early reactivation of clustered genes on the inactive X chromosome during somatic cell reprogramming.

Shiho Aizawa, Ken Nishimura, Gonzalo Seminario Mondejar, Arun Kumar, Phuong Linh Bui, Yen Thi Hai Tran, Akihiro Kuno, Masafumi Muratani, Shin Kobayashi, Tsukasa Nabekura …

Stem cell reports 17(1) 53-67 2022年1月11日査読有り
Development of an in vitro carcinogenesis model of human papillomavirus-induced cervical adenocarcinoma

Mengzhu Zhang, Tohru Kiyono, Kazunori Aoki, Naoki Goshima, Shin Kobayashi, Kengo Hiranuma, Kouya Shiraishi, Hideyuki Saya, Tomomi Nakahara

CANCER SCIENCE 2021年12月査読有り
Visualization of X chromosome reactivation in mouse primordial germ cells in vivo.

Yoshikazu Haramoto, Mino Sakata, Shin Kobayashi

Biology open 10(4) 2021年4月15日査読有り最終著者責任著者
Female mice lacking Ftx lncRNA exhibit impaired X-chromosome inactivation and a microphthalmialike phenotype

Shin Kobayashi

Nature Communications 9 2018年9月20日査読有り最終著者責任著者
Epigenetic differences between naïve and primed pluripotent stem cells

Takahashi S, Kobayashi S, Hiratani I

Cell Mol Life Sci 75(7) 1191-1203 2018年4月査読有り責任著者
Live Imaging of X-Chromosome Inactivation and Reactivation Kinetics

Shin Kobayashi

Methods in Molecular Biology 1861 73-89 2018年査読有り最終著者責任著者
Live imaging of X chromosome inactivation and reactivation dynamics

Shin Kobayashi

DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION 59(6) 493-500 2017年8月査読有り最終著者責任著者
Live imaging of X chromosome reactivation dynamics in early mouse development can discriminate naïve from primed pluripotent stem cells

Kobayashi S, Hosoi Y, Shiura H, Yamagata K, Takahashi S, Fujihara Y, Kohda T, Okabe M, Ishino F

Development 143(16) 2958-2964 2016年8月査読有り筆頭著者責任著者
Ftx is dispensable for imprinted X-chromosome inactivation in preimplantation mouse embryos

Miki Soma, Yoshitaka Fujihara, Masaru Okabe, Fumitoshi Ishino, Shin Kobayashi

SCIENTIFIC REPORTS 4 5181 2014年6月査読有り最終著者責任著者
Identification of an Imprinted Gene Cluster in the X-Inactivation Center

Shin Kobayashi, Yasushi Totoki, Miki Soma, Kazuya Matsumoto, Yoshitaka Fujihara, Atsushi Toyoda, Yoshiyuki Sakaki, Masaru Okabe, Fumitoshi Ishino

PLoS ONE 8(8) e71222 2013年8月6日査読有り筆頭著者責任著者
The X-linked imprinted gene family Fthl17 shows predominantly female expression following the two-cell stage in mouse embryos

Shin Kobayashi, Yoshitaka Fujihara, Nathan Mise, Kazuhiro Kaseda, Kuniya Abe, Fumitoshi Ishino, Masaru Okabe

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 38(11) 3672-3681 2010年6月査読有り筆頭著者責任著者
Epigenetic gene regulation in male and female development

Shin Kobayashi

Genes & Genetic Systems 2010年
Comparison of gene expression in male and female mouse blastocysts revealed imprinting of the X-linked gene, Rhox5/Pem, at preimplantation stages

S Kobayashi, A Isotani, N Mise, M Yamamoto, Y Fujihara, K Kaseda, T Nakanishi, M Ikawa, H Hamada, K Abe …

CURRENT BIOLOGY 16(2) 166-172 2006年1月査読有り筆頭著者
Aberrant regulation of imprinted gene expression in Gtl2(lacZ) mice

Y Sekita, H Wagatsuma, M Irie, S Kobayashi, T Kohda, J Matsuda, M Yokoyama, A Ogura, K Schuster-Gossler, A Gossler …

CYTOGENETIC AND GENOME RESEARCH 113(1-4) 223-229 2006年査読有り
Genomic imprinting of XX spermatogonia and XX oocytes recovered from XX <-> XY chimeric testes

A Isotani, T Nakanishi, S Kobayashi, J Lee, S Chuma, N Nakatsuji, F Ishino, M Okabe

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 102(11) 4039-4044 2005年3月査読有り
Genomic imprinting of IGF2, p57(KIP2) and PEG1/MEST in a marsupial, the tammar wallaby

S Suzuki, MB Renfree, AJ Pask, G Shaw, S Kobayashi, T Kohda, T Kaneko-Ishino, F Ishino

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 122(2) 213-222 2005年2月査読有り

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MISC

Region- and cell-type-specific cell-autonomous cell death by X chromosome inactivation in CASK heterozygote knockout female.

Takuma Mori, Mengyun Zhou, Taichi Akatsuka, Ken Kunugitani, Yukina Yoshida, Qi Guo, Shin Kobayashi, Katsuhiko Tabuchi

2024年7月
非メンデル遺伝とＸ染色体不活性化異常「医学のあゆみ

医学のあゆみ特集「Ｘ染色体不活性化と疾患 ―新たな展開―」 283(9) 653-858 2022年招待有り
生殖細胞初期化におけるＸ染色体再活性化のイメージング

医学のあゆみ 283(9) 865-870 2022年招待有り
Female mice lacking Ftx lncRNA exhibit impaired X-chromosome inactivation and a microphthalmia-like phenotype (vol 9, 3829, 2018)

Hosoi Yusuke, Soma Miki, Shiura Hirosuke, Sado Takashi, Hasuwa Hidetoshi, Abe Kuniya, Kohda Takashi, Ishino Fumitoshi, Kobayashi Shin

NATURE COMMUNICATIONS 9 2018年10月31日査読有り
マウス着床前胚において雌でのみ発現するsmall RNAの探索

相馬未來, 十時泰, 松本和也, 藤原祥高, 豊田敦, 榊佳之, 岡部勝, 石野史敏, 小林慎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 3W9II-3 (WEB ONLY) 2012年
着床前に雌特異的発現を示すFat45ファミリー遺伝子の解析

小林慎, 藤原祥高, 三瀬名丹, かせ田一弘, 阿部訓也, 石野史敏, 岡部勝

生化学 2008年
雌雄胚盤胞の遺伝子発現比較により新たにみつけたX染色体上のインプリント遺伝子Rhox5/Pem (日本の遺伝学の潮流--日本遺伝学会第78回大会ハイライト) -- (シンポジウム発生分化のジェネティクスとエピジェネティクス)

小林慎, 磯谷綾子, 藤原祥高

生物の科学「遺伝」別冊 (21) 64-69,37 2007年3月
Genomic imprinting of XX germ cells recovered from XX <-> XY chimeric testes.

A Isotani, T Nakanishi, S Kobayashi, J Lee, S Chuma, N Nakatsuji, F Ishino, M Okabe

BIOLOGY OF REPRODUCTION 239-239 2005年
有袋類ワラビーにおけるIGF2,P57KIP2,PEG1/MESTのゲノミックインプリンティング

鈴木俊介, RENFREE M, PASK A, SHAW G, 小林慎, 幸田尚, 金児(石野)知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 27th 463 2004年11月25日
有袋目ワラビーにおけるインプリンティング遺伝子PEG1/MESTの解析

鈴木俊介, 小林慎, 幸田尚, SHAW G, RENFREE M, 金児(石野)知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 26th 711 2003年11月25日
マウス新規インプリンティング遺伝子の探索および解析

橋本昌和, 小林慎, 幸田尚, 松田潤一郎, 金児(石野)知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 26th 667 2003年11月25日
父親由来,母親由来のゲノムの機能ゲノムインプリンティングと母性行動

石野史敏, 三吉直樹, 小林慎, 幸田尚, 金児(石野)知子

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 23rd 230 2000年11月25日
新規インプリンティング遺伝子PEG10の解析

小野竜一, 小林慎, 合阪幸三, 幸田尚, 金児(石野)知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 23rd 608 2000年11月25日
DNA chipを用いたインプリンティング遺伝子の体系的スクリーニング

小林慎, 小野竜一, 我妻広貴, 市川仁, 小倉淳郎, 幸田尚, 大木操, 石野, 金児知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 23rd 717 2000年11月25日
Silver‐Russell症候群におけるPEG1/MEST遺伝子の変異解析

小林慎, 上村拓, 新川詔夫, 山田正夫, 山崎亮, 幸田尚, 石野(金児)知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 22nd 743 1999年11月22日
ヒトIGF2RとWT1のPolymorphic Imprintingについて

野村将志, 小林慎, 合阪幸三, 幸田尚, 石野(金児) 知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 593-593 1998年12月1日
PEG3遺伝子のgliomaにおけるがん抑制遺伝子としての働き

幸田尚, 淺井昭雄, 黒岩義巳, 小林慎, 桐野高明, 合阪幸三, 石野(金児) 知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 225-225 1998年12月1日
インプリントされた遺伝子群の体系的解析からみたゲノミック・インプリンティングの生物学的意義

石野史敏, 黒岩義巳, 三吉直樹, 小林慎, 奥津倫久, 幸田尚, 石野(金児)知子

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 20th 229 1997年12月
ヒト7番染色体に初めて同定されたインプリンティング遺伝子PEG1/MESTの解析

小林慎, 上村拓, 三吉直樹, 黒岩義巳, 堤治, 合阪幸三, 幸田尚, 石野(金児)知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 20th 523 1997年12月
インプリンティング遺伝子Peg1/Mestの解析

小林慎, 三吉直樹, 黒岩義巳, 幸田尚, SURANI M A, 石野知子, 石野史敏

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 18th 338 1995年11月

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共同研究・競争的資金等の研究課題

新規幹細胞の探索にＸ染色体再活性がマーカーとなりうることを示す。

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2022年6月 - 2025年3月

小林慎
Ｘ染色体不活性化をモデルとしたヘテロクロマチン化維持機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2021年4月 - 2023年3月

小林慎
表現型がメンデル遺伝則に従わないヒト疾患のエピジェネティクス研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

小林慎, 三浦史仁, 石野史敏, 廣瀬伸一
長鎖ノンコ―ディングRNAが制御する個体発生とヘテロクロマチン形成メカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

小林慎
性ホルモン依存しない性差を示す疾患モデルマウスの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年4月 - 2020年3月

小林慎
表現型が雌雄差を示す長鎖ノンコーディング RNAノックアウトマウスの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

小林慎, 幸田尚, 石野史敏
X染色体不活性化を制御する新規non-codingRNAの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

小林慎
表現型に性差を示すlong ncRNA Fat60 KOマウスの機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年4月 - 2017年3月

小林慎
疾患モデル動物における長鎖非コードRNAの機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

小林慎, 幸田尚
X染色体再活性化ライブメージング技術を用いた幹細胞研究

科学技術振興機構さきがけ 2011年 - 2014年

小林慎

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