塩田拓也 (Shiota Takuya) - マイポータル

基本情報

所属: 宮崎大学キャリアマネジメント推進機構テニュアトラック推進室テニュアトラック准教授

学位: 博士（理学）(名古屋大学)

J-GLOBAL ID: 201801013339815022
researchmap会員ID: B000291475

論文

Cryo-EM structures of the BAM–P2-visible SurA complex reveal dynamic and cooperative interactions in outer membrane protein assembly

Ryoji Miyazaki, Hidetaka Kohga, Nami Matsuoka, Yuki Maruno, Wataru Yoshimoto, Yutaro S. Takahashi, Dede Heri Yuli Yanto, Yudhi Nugraha, Hideki Shigematsu, Takuya Shiota …

2025年11月10日
Dual recognition of multiple signals in bacterial outer membrane proteins enhances assembly and maintains membrane integrity.

Edward M Germany, Nakajohn Thewasano, Kenichiro Imai, Yuki Maruno, Rebecca S Bamert, Christopher J Stubenrauch, Rhys A Dunstan, Yue Ding, Yukari Nakajima, XiangFeng Lai …

eLife 12 2024年1月16日
Categorization of Escherichia coli Outer Membrane Proteins by Dependence on Accessory Proteins of the β-barrel Assembly Machinery Complex.

Nakajohn Thewasano, Edward M Germany, Yuki Maruno, Yukari Nakajima, Takuya Shiota

The Journal of biological chemistry 104821-104821 2023年5月15日
Evidence for existence of an apoptosis-inducing BH3-only protein, sayonara, in Drosophila.

Yuko Ikegawa, Christophe Combet, Mathieu Groussin, Vincent Navratil, Sabrina Safar-Remali, Takuya Shiota, Abdel Aouacheria, Sa Kan Yoo

The EMBO journal 42(8) e110454 2023年4月17日
Substrate-dependent arrangements of the subunits of the BAM complex determined by neutron reflectometry.

Xiaoyu Chen, Yue Ding, Rebecca S Bamert, Anton P Le Brun, Anthony P Duff, Chun-Ming Wu, Hsien-Yi Hsu, Takuya Shiota, Trevor Lithgow, Hsin-Hui Shen

Biochimica et biophysica acta. Biomembranes 1863(9) 183587-183587 2021年9月1日
Characterization of BamA reconstituted into a solid-supported lipid bilayer as a platform for measuring dynamics during substrate protein assembly into the membrane.

Yue Ding, Takuya Shiota, Anton P Le Brun, Rhys A Dunstan, Bo Wang, Hsien-Yi Hsu, Trevor Lithgow, Hsin-Hui Shen

Biochimica et biophysica acta. Biomembranes 1862(9) 183317-183317 2020年5月4日査読有り
Structure of the mitochondrial import gate reveals distinct preprotein paths

Y. Araiso, A. Tsutsumi, J. Qiu, K. Imai, T. Shiota, J. Song, C. Lindau, L.-S. Wenz, H. Sakaue, K. Yunoki …

Nature 575(7782) 395-401 2019年10月査読有り
Porin Associates with Tom22 to Regulate the Mitochondrial Protein Gate Assembly.

Sakaue H, Shiota T, Ishizaka N, Kawano S, Tamura Y, Tan KS, Imai K, Motono C, Hirokawa T, Taki K …

Molecular cell 73(5) 1044-1055.e8 2019年3月査読有り
The WD40 Protein BamB Mediates Coupling of BAM Complexes into Assembly Precincts in the Bacterial Outer Membrane.

Sachith D Gunasinghe, Takuya Shiota, Christopher J Stubenrauch, Keith E Schulze, Chaille T Webb, Alex J Fulcher, Rhys A Dunstan, Iain D Hay, Thomas Naderer, Donna R Whelan …

Cell reports 23(9) 2782-2794 2018年5月29日査読有り
The TPR domain of BepA is required for productive interaction with substrate proteins and the β-barrel assembly machinery complex.

Daimon Y, Iwama-Masui C, Tanaka Y, Shiota T, Suzuki T, Miyazaki R, Sakurada H, Lithgow T, Dohmae N, Mori H …

Molecular microbiology 106(5) 760-776 2017年12月査読有り
Structural basis for substrate selection by the translocation and assembly module of the β-barrel assembly machinery

Takuya Shiota

Molecular Microbiology 2017年10月
BepA mediates productive transfer of substrate proteins to the β-barrel assembly machinery (BAM) complex.

Mol. Microbiol. 106 760-776 2017年査読有り
Defining the structural characteristics of annexin V binding to a mimetic apoptotic membrane

Jingxiong Lu, Anton P. Le Brun, Seong Hoong Chow, Takuya Shiota, Bo Wang, Tsung-Wu Lin, Guei-Sheung Liu, Hsin-Hui Shen

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 44(8) 697-708 2015年12月査読有り
Evidence of Distinct Channel Conformations and Substrate Binding Affinities for the Mitochondrial Outer Membrane Protein Translocase Pore Tom40

Adam J. Kuszak, Daniel Jacobs, Philip A. Gurnev, Takuya Shiota, John M. Louis, Trevor Lithgow, Sergey M. Bezrukov, Tatiana K. Rostovtseva, Susan K. Buchanan

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 290(43) 26204-26217 2015年10月査読有り
Molecular architecture of the active mitochondrial protein gate

Takuya Shiota, Kenichiro Imai, Jian Qiu, Victoria L. Hewitt, Khershing Tan, Hsin-Hui Shen, Noriyuki Sakiyama, Yoshinori Fukasawa, Sikander Hayat, Megumi Kamiya …

SCIENCE 349(6255) 1544-1548 2015年9月査読有り
Conserved features in TamA enable interaction with TamB to drive the activity of the translocation and assembly module

Joel Selkrig, Matthew J. Belousoff, Stephen J. Headey, Eva Heinz, Takuya Shiota, Hsin-Hui Shen, Simone A. Beckham, Rebecca S. Bamert, Minh-Duy Phan, Mark A. Schembri …

SCIENTIFIC REPORTS 5 12905 2015年8月査読有り
Mitochondrial Biogenesis: Cell-Cycle-Dependent Investment in Making Mitochondria

Takuya Shiota, Ana Traven, Trevor Lithgow

CURRENT BIOLOGY 25(2) R78-R80 2015年1月査読有り
Reconstitution of a nanomachine driving the assembly of proteins into bacterial outer membranes

Hsin-Hui Shen, Denisse L. Leyton, Takuya Shiota, Matthew J. Belousoff, Nicholas Noinaj, Jingxiong Lu, Stephen A. Holt, Khershing Tan, Joel Selkrig, Chaille T. Webb …

NATURE COMMUNICATIONS 5 5078 2014年10月査読有り
Intramolecular Disulfide Bond of Tim22 Protein Maintains Integrity of the TIM22 Complex in the Mitochondrial Inner Membrane*

Hiroaki Okamoto, Akiko Miyagawa, Takuya Shiota, Yasushi Tamura, Toshiya Endo

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 289(8) 4827-4838 2014年2月査読有り
Tam41 Is a CDP-Diacylglycerol Synthase Required for Cardiolipin Biosynthesis in Mitochondria

Yasushi Tamura, Yoshihiro Harada, Shuh-ichi Nishikawa, Koji Yamano, Megumi Kamiya, Takuya Shiota, Takuya Kuroda, Osamu Kuge, Hiromi Sesaki, Kenichiro Imai …

CELL METABOLISM 17(5) 709-718 2013年5月査読有り

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MISC

大腸菌表層ストレス応答:インプットとアウトプットに働くプロテアーゼの機能

秋山芳展, 秋山光市郎, 岩間(舛井)千草, 大門康志, 檜作洋平, 水野慎也, 宮崎亮次, 森博幸, 禾晃和, 塩田拓也 …

Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications (33) 2019年
ミトコンドリアポリンタンパク質Por1による外膜透過装置TOM複合体のアセンブリー制御

阪上春花, 塩田拓也, 石坂直也, 田村康, 遠藤斗志也

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [2T13a-07(2P 2018年9月
ミトコンドリアポリンタンパク質Por1は外膜透過装置TOM複合体のアセンブリー調節因子として機能する

阪上春花, 石坂直也, 塩田拓也, 田村康, 遠藤斗志也

生命科学系学会合同年次大会 2017年度 [2P-0271] 2017年12月
[Molecular architecture and function of mitochondrial protein entry gate].

Shiota T

Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society 89(2) 282-285 2017年4月査読有り
Tom22のミトコンドリア局在化におけるPor1の役割の解明

石坂直也, 塩田拓也, 田村康, 遠藤斗志也

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [2P0021]-[2P0021] 2015年12月
Close Up実験法 Series228 動的なタンパク質相互作用の「スナップショット」を撮る~in vivoにおける部位特異的光架橋法

塩田拓也, 西川周一, 遠藤斗志也

実験医学 30(11) 1799-1805 2012年7月1日

共同研究・競争的資金等の研究課題

βバレル型膜タンパク質輸送装置が周辺から受ける影響の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2025年11月 - 2028年3月

塩田拓也, MACZUGA NICHOLAS
αヘリカル膜タンパク質のミトコンドリア膜への膜挿入機構の構造生物学的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

竹田弘法, 塩田拓也
NR, QCM-D, AFMを駆使したタンパク質輸送装置の「超」複合体の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(海外連携研究) 2024年9月 - 2027年3月

塩田拓也, 荒磯裕平, 宮崎亮次, 青木英莉子
EMMアセンブリーアッセイによるグラム陰性菌制御法の創出

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進/創発的研究支援事業 2021年 - 2027年

塩田拓也
中性子反射率法による生体膜解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

塩田拓也
中性子反射率法を中心とした多角的な解析によるグラム陰性菌の膜生合成解析

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2021年10月 - 2024年3月

塩田拓也, 田岡東, 宮崎亮次, 竹田弘法
試験管内アッセイ系による大腸菌外膜タンパク質膜組込み装置の分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2019年4月 - 2021年3月

塩田拓也
病原性大腸菌等の細菌における膜環境の変化と連動した膜タンパク質形成機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2021年3月

塚崎智也, 塩田拓也, 西山賢一
EMMアセンブリーアッセイによる大腸菌βバレル型膜タンパク質の膜挿入機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2018年8月 - 2020年3月

塩田拓也

塩田拓也

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