川島武士 (Takeshi Kawashima) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所生命情報研究センター助教

学位: 博士(理学)(京都大学理学研究科)

研究者番号: 10378531
J-GLOBAL ID: 201601010627507819
researchmap会員ID: B000254017

外部リンク: https://kaken.nii.ac.jp/d/r/10378531.ja.html

地球上の生物の多様性がどのように生み出されてきたか、これからどうなっていくのかに興味があります。

研究キーワード

研究分野

経歴

2017年3月 - 現在

国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 助教
2016年4月 - 2017年2月

国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 特任研究員
2015年4月 - 2016年3月

筑波大学, 生命環境系, 助教
2014年4月 - 2015年3月

学校法人沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックス・ユニット, スタッフサイエンティストIIIグループリーダー
2013年4月 - 2015年3月

自然科学研究機構基礎生物学研究所, 生物進化研究部門, 特別訪問研究員
2011年11月 - 2014年3月

学校法人沖縄科学技術大学院大学学園, マリンゲノミックス・ユニット, グループリーダー
2012年

沖縄科学技術大学院大学, 研究員
2010年4月 - 2011年10月

沖縄科学技術研究基盤整備機構, マリンゲノミックス・ユニット, グループリーダー
2008年4月 - 2010年3月

独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構, マリンゲノミックス・ユニット, 研究員
2006年4月 - 2008年3月

米国エネルギー省共同ゲノム研究所, ロークサー研究室, 日本学術振興会海外特別研究員、客員研究員
2003年12月 - 2006年3月

京都大学, 理学研究科動物学教室, 助手
2001年4月 - 2003年11月

京都大学, 化学研究所, 日本学術振興会特別研究員(PD)

学歴

委員歴

論文

Ancestral Stem Cell Reprogramming Genes Active in Hemichordate Regeneration

Tom Humphreys, Keith Weiser, Asuka Arimoto, Akane Sasaki, Gene Uenishi, Brent Fujimoto, Takeshi Kawashima, Kekoa Taparra, Janos Molnar, Noriyuki Satoh …

Frontiers in Ecology and Evolution 10 2022年2月15日
A sugar utilization phenotype contributes to the formation of genetic exchange communities in lactic acid bacteria.

Shinkuro Takenaka, Takeshi Kawashima, Masanori Arita

FEMS microbiology letters 368(17) 2021年9月14日
Host-Diet Effect on the Metabolism of Bifidobacterium

Maria Satti, Monica Modesto, Akihito Endo, Takeshi Kawashima, Paola Mattarelli, Masanori Arita

GENES 12(4) 2021年4月
Genetic Markers of Genome Rearrangements in Helicobacter pylori.

Mehwish Noureen, Takeshi Kawashima, Masanori Arita

Microorganisms 9(3) 2021年3月17日
BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research.

Rutger A Vos, Toshiaki Katayama, Hiroyuki Mishima, Shin Kawano, Shuichi Kawashima, Jin-Dong Kim, Yuki Moriya, Toshiaki Tokimatsu, Atsuko Yamaguchi, Yasunori Yamamoto …

F1000Research 9 136-136 2020年査読有り
Rearrangement analysis of multiple bacterial genomes.

Mehwish Noureen, Ipputa Tada, Takeshi Kawashima, Masanori Arita

BMC bioinformatics 20(Suppl 23) 631-631 2019年12月27日
BioHackathon series in 2013 and 2014: improvements of semantic interoperability in life science data and services [version 1; peer review: 2 approved with reservations]

Toshiaki Katayama, Shuichi Kawashima, Gos Micklem, Shin Kawano, Jin-Dong Kim, Simon Kocbek, Shinobu Okamoto, Yue Wang, Hongyan Wu, Atsuko Yamaguchi …

F1000Research 8 2019年9月23日査読有り
Uncovering Ecdysozoa-specific Sphingomyelin Synthase by Phylogenetic Analysis of Metazoan Sequences

Mitsuharu Sato, Masanori Arita, Takeshi Kawashima

Zoological Science 36(4) 316-321 2019年8月査読有り
Collaborative environmental DNA sampling from petal surfaces of flowering cherry Cerasus × yedoensis ‘Somei-yoshino’ across the Japanese archipelago

Tazro Ohta, Takeshi Kawashima, Natsuko Shinozaki, Akito Dobashi, Satoshi Hiraoka, Tatsuhiko Hoshino, Keiichi Kanno, Takafumi Kataoka, Shuichi Kawashima, Motomu Matsui …

the Journal of Plant Research. 131(4) 709-717 2018年7月査読有り
Two divergent Symbiodinium genomes reveal conservation of a gene cluster for sunscreen biosynthesis and recently lost genes.

Eiichi Shoguchi, Girish Beedessee, Ipputa Tada, Kanako Hisata, Takeshi Kawashima, Takeshi Takeuchi, Nana Arakaki, Manabu Fujie, Ryo Koyanagi, Michael C Roy …

BMC genomics 19(1) 458-458 2018年6月14日査読有り
Independent evolution of genomic characters during major metazoan transitions

Oleg Simakov, Takeshi Kawashima

DEVELOPMENTAL BIOLOGY 427(2) 179-192 2017年7月査読有り
Bivalve-specific gene expansion in the pearl oyster genome: implications of adaptation to a sessile lifestyle.

Takeuchi T, Koyanagi R, Gyoja F, Kanda M, Hisata K, Fujie M, Goto H, Yamasaki S, Nagai K, Morino Y …

Zoological letters 2 3-3 2016年査読有り
Molecular basis of canalization in an ascidian species complex adapted to different thermal conditions

Atsuko Sato, Takeshi Kawashima, Manabu Fujie, Samantha Hughes, Noriyuki Satoh, Sebastian M. Shimeld

SCIENTIFIC REPORTS 5 16717 2015年11月査読有り
Hemichordate genomes and deuterostome origins

Oleg Simakov, Takeshi Kawashima, Ferdinand Marletaz, Jerry Jenkins, Ryo Koyanagi, Therese Mitros, Kanako Hisata, Jessen Bredeson, Eiichi Shoguchi, Fuki Gyoja …

NATURE 527(7579) 459-+ 2015年11月査読有り
On a Possible Evolutionary Link of the Stomochord of Hemichordates to Pharyngeal Organs of Chordates

Noriyuki Satoh, Kunifumi Tagawa, Christopher J. Lowe, Jr-Kai Yu, Takeshi Kawashima, Hiroki Takahashi, Michio Ogasawara, Marc Kirschner, Kanako Hisata, Yi-Hsien Su …

GENESIS 52(12) 925-934 2014年12月査読有り
Comparative genome sequencing reveals genomic signature of extreme desiccation tolerance in the anhydrobiotic midge

Oleg Gusev, Yoshitaka Suetsugu, Richard Cornette, Takeshi Kawashima, Maria D. Logacheva, Alexey S. Kondrashov, Aleksey A. Penin, Rie Hatanaka, Shingo Kikuta, Sachiko Shimura …

NATURE COMMUNICATIONS 5 4784 2014年9月査読有り
A cDNA Resource for Gene Expression Studies of a Hemichordate, Ptychodera flava

Kuni Tagawa, Asuka Arimito, Akane Sasaki, Mizuki Izumi, Satoko Fujita, Tom Humphreys, Asao Fujiyama, Hiroshi Kagoshima, Tadasu Shin-, Yuji Kohara …

ZOOLOGICAL SCIENCE 31(7) 414-420 2014年7月査読有り
Massive Gene Transfer and Extensive RNA Editing of a Symbiotic Dinoflagellate Plastid Genome

Sutada Mungpakdee, Chuya Shinzato, Takeshi Takeuchi, Takeshi Kawashima, Ryo Koyanagi, Kanako Hisata, Makiko Tanaka, Hiroki Goto, Manabu Fujie, Senjie Lin …

GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION 6(6) 1408-1420 2014年6月査読有り
Initiating the Mollusk Genomics Annotation Community: Toward Creating the Complete Curated Gene-set of the Japanese Pearl Oyster, Pinctada fucata

Takeshi Kawashima, Takeshi Takeuchi, Ryo Koyanagi, Shigeharu Kinoshita, Hirotoshi Endo, Kazuyoshi Endo

ZOOLOGICAL SCIENCE 30(10) 794-796 2013年10月査読有り
MarinegenomicsDB: An integrated genome viewer for community-based annotation of genomes

Ryo Koyanagi, Takeshi Takeuchi, Kanako Hisata, Fuki Gyoja, Eiichi Shoguchi, Nori Satoh, Takeshi Kawashima

Zoological Science 30(10) 797-800 2013年10月査読有り

もっとみる

MISC

腕足動物における殻体タンパク質のプロテオーム解析

磯和幸延, 更科功, 紀藤圭治, 大島健志朗, 服部正平, 川島武士, 藤江学, 佐藤矩行, 遠藤一佳

日本古生物学会年会講演予稿集 2016 44 2016年6月24日
A cDNA Resource for Gene Expression Studies of a Hemichordate, Ptychodera flava (vol 31, pg 414, 2014)

Kuni Tagawa, Asuka Arimoto, Akane Sasaki, Mizuki Izumi, Satoko Fujita, Tom Humphreys, Asao Fujiyama, Hiroshi Kagoshima, Tadasu Shin-, Yuji Kohara …

ZOOLOGICAL SCIENCE 31(12) 862-862 2014年12月
ネムリユスリカゲノムゲノム解析から見えてきた極限環境適応の進化

黄川田隆洋, GUSEV Oleg, 末次克行, CORNETTE Richard, 川島武士, LOGACHEVA Maria, KONDRASHOV Alexey, KONDRASHOV Alexey, PENIN Aleksey, 畑中理恵 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th WEB ONLY 2P-0032 2014年
全動物門のゲノム解読にむけて 1:総論

佐藤矩行, 坂本竜哉, 坂本浩隆, 遠藤一佳, 後藤太一郎, 鈴木隆仁, 古屋秀隆, 笹倉靖徳, 彦坂(片山)智恵, 川島武士 …

日本動物学会大会予稿集 84th 165 2013年8月12日
アコヤガイ・ドラフトゲノム解読

竹内猛, 川島武士, 小柳亮, 行者蕗, 藤江学, 宇佐美剛志, 田中牧子, 生田哲朗, 將口栄一, 藤原真幸 …

日本水産学会大会講演要旨集 2011 59 2011年9月28日
Domain shuffling and Evolution of the vertebrates

Hiroshi Wada, Takeshi Kawashima

GENES & GENETIC SYSTEMS 84(6) 463-463 2009年12月
クラゲのゲノムが語る進化の"取捨選択" (特集驚異のクラゲ)

川島武士, 新里宙也

科学 79(4) 405-408 2009年4月
The amphioxus genome illuminates vertebrate origins and cephalochordate biology (vol 18, pg 1100, 2008)

Linda Z. Holland, Ricard Albalat, Kaoru Azumi, Elia Benito-Gutierrez, Matthew J. Blow, Marianne Bronner-Fraser, Frederic Brunet, Thomas Butts, Simona Candiani, Larry J. Dishaw …

GENOME RESEARCH 18(8) 1380-1380 2008年8月
Urochordate genomes

Satoh N, Kawashima T, Shoguchi E, Satou Y, Volff J

Vertebrate Genomes 2 198-212 2006年査読有り
Genome science of Ciona intestinalis: Its recent progress

Nori Satoh, Yutaka Satou, Takeshi Kawashima, Eiichi Shoguchi

ZOOLOGICAL SCIENCE 22(12) 1377-1378 2005年12月
The comprehensive prediction of peptide receptor genes in the Ciona intestinalis genome

Toshio Sekiguchi, Takeshi Kawashima, Makoto Hamaguchi, Yutaka Satou, Honoo Satake, Nori Satoh

ZOOLOGICAL SCIENCE 22(12) 1498-1498 2005年12月
発生・進化メカニズムホヤ発生ゲノム科学の新展開 (ゲノムから生命システムへ) -- (ゲノムから生物学)

川島武士, 將口栄一, 佐藤ゆたか

蛋白質核酸酵素 50(16) 2153-2159,2032 2005年12月
ホヤのゲノムから見た脊索動物の進化 (特集・分子進化学の現在)

濱口誠, 佐藤矩行, 川島武士

生体の科学 55(3) 247-251 2004年5月
A group of zygotic genes expressed in B7.6 endodermalstrand cells in the ascidian, Halocynthia roretzi(Developmental Biology)Proceedings of the Seventy-First Annual Meeting of the Zoological Society of Japan :

Kawashima T., Kawashima S., Ishikawa H., Kawamura H., Nishikata T., Makabe K.W.

Zoological science 17 66-66 2000年
Musashi homologue in the ascidian, H.roretzi, is expressed in the neural tissue of the embryo(Developmental Biology)(Proceedings of the Sixty-Ninth Annual Meeting of the Zoological Society of Japan) :

Kawashima T., Sasakura Y., Ogasawara M., Makabe K.W.

Zoological science 15 81-81 1998年

書籍等出版物

動物の事典

末光, 隆志

朝倉書店 2020年11月 (ISBN: 9784254171662)
Encyclopedia of bioinformatics and computational biology

Ranganathan, Shoba, Gribskov, Michael Ray, 中井, 謙太, Schönbach, Christian, Cannataro, Mario, Gaëta, Bruno Andrë, Khan, Mohammad Asif

Elsevier 2019年 (ISBN: 9780128114148)
動物学の百科事典

日本動物学会編 (担当:分担執筆, 範囲:1-13「分子生物学と動物学」)

丸善出版 2018年9月
Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology - 1st Edition

川島武士 (担当:分担執筆, 範囲:Comparative and Evolutionary Genomics)

Elsevier 2018年3月
次世代シーケンサー活用術: トップランナーの最新研究事例に学ぶ

佐藤矩行, 将口栄一, 新里宙也, 竹内猛, 川島武士 (担当:分担執筆, 範囲:7章海洋生物のゲノム解読とその広がり)

化学同人 2015年2月
Comparative Genomics: Basic and Applied Research

川島武士, 将口栄一, 佐藤ゆたか, 佐藤矩行 (担当:分担執筆, 範囲:Comparative Genomics of Invertebrates)

CRC Press 2007年12月
遺伝子とゲノムの進化 (シリーズ進化学 (2))

川島武士, 佐藤矩行 (担当:分担執筆, 範囲:第４章多細胞生物の進化とゲノム)

岩波書店 2005年11月
進化学事典

川島武士 (担当:分担執筆, 範囲:真核生物のゲノム、他、3項目)

共立出版

講演・口頭発表等

オープンサイエンスの代表例DDBJの一員として動物のゲノムを比較解析

川島武士

オムニバスセミナー 2019（R1） 2019年7月19日招待有り
Research for the evolution of metabolic pathways utilizing metabolome data

川島武士

The 16th Korea-Japan-China Bioinformatics Symposium 2018 2018年8月31日招待有り
Highlight Track: Independent evolution of genomic characters during major metazoan transitions

川島武士

Highlight Track 2017年9月28日日本バイオインフォマティクス学会
来るべき将来における動物学と情報科学との関係を考える

川島武士

動物学と情報学の境界領域を切り開く 2017年9月22日
トランスクリプトームデータを利用した天然化合物注釈方法の開発

川島武士

日本進化学会第19回大会 2017年8月25日日本進化学会
遺伝子発現データと質量分析データの相互比較による化合物アノテーションの試み

川島武士

NGS現場の会第五回研究会 2017年5月23日 NGS現場の会
真核生物の代謝経路進化研究を再考する

川島武士

GEM Simposium 2017年3月28日国立遺伝学研究所招待有り
ホヤ、ナメクジウオ、そして…下から見たJGI

川島武士

Genome Informatics Workshop 2008 2008年7月11日 Kazusa DNA Res. Inst 招待有り

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

複雑ネットワークの視点からの新規細胞タイプの進化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2018年4月 - 2023年3月

和田洋, 矢田哲士, 川島武士, 市瀬夏洋
貝殻のミューゼオミクス：博物館の収蔵標本を活かすための実験的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2022年3月

佐々木猛智, スティアマルガデフィン, 川島武士, 藤田敏彦, 西秋良宏
乳酸菌とビフィズス菌の基準ゲノム作成と公開

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2017年6月 - 2021年3月

有田正規, 川島武士
カタユウレイボヤにおける被嚢細胞の遺伝子発現解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2010年 - 2012年

川島武士, 中島啓介, 山田力志, 広瀬祐一
ホヤとナメクジウオの比較ゲノム解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2005年 - 2006年

川島武士
ホヤ胚の遺伝子発現情報の網羅的解析:データベース構築とクラスタリング解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2001年 - 2003年

川島武士
日本近海の浅海域を北海道から沖縄までつなぐリアルタイム生命観測ネットワークの構築をめざしたコミュニティ形成

情報システム研究機構平成29年度未来型投資プログラム調査研究(FS)

川島武士

社会貢献活動

臨海ハッカソン2017

講師, 企画, 運営参加・支援, 報告書執筆

臨海ハック臨海ハッカソン2017 お茶の水女子大学館山湾岸教育センター 2017年6月12日 - 2017年6月16日

川島武士

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

メニュー

共著者の一覧