大山拓次 (Ohyama Takuji) - マイポータル

基本情報

所属: 山梨大学大学院　総合研究部　生命環境学域生命農学系（生命工学）教授

学位: 博士（農学）(大阪府立大学)

研究者番号: 60423133
J-GLOBAL ID: 201801006775293078
researchmap会員ID: B000290083

外部リンク: https://takujioyama1970.wordpress.com/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 / 構造生物化学

経歴

2015年4月

生命環境学域生命環境学系(生命工学), 准教授
2012年4月 - 2015年3月

山梨大学生命環境学部, 生命工学科, 助教
2011年4月

大阪大学蛋白質研究所, 蛋白質結晶学研究室, 特任研究員
2008年10月 - 2011年3月

大阪大学蛋白質研究所, 蛋白質有機化学研究室, 特任研究員
2005年10月 - 2008年9月

大阪大学蛋白質研究所, 生体分子認識（タカラバイオ）寄附研究部門, 助教
2005年4月 - 2005年9月

生物分子工学研究所, 構造解析研究部門, 主任研究員
2001年4月 - 2005年3月

生物分子工学研究所, 構造解析研究部門, 研究員
1999年4月 - 2001年3月

生物分子工学研究所, 構造解析研究部門, ポストドクラルフェロー

委員歴

2016年8月 - 2018年7月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員等審査会専門委員、卓越研究員候補者選考委員会書面審査員及び国際事業委員会書面審査員・書面評価員

論文

Functional and Structural Insights into Human PPARα/δ/γ Subtype Selectivity of Bezafibrate, Fenofibric Acid, and Pemafibrate

Akihiro Honda, Shotaro Kamata, Makoto Akahane, Yui Machida, Kie Uchii, Yui Shiiyama, Yuki Habu, Saeka Miyawaki, Chihiro Kaneko, Takuji Oyama …

International Journal of Molecular Sciences 23(9) 4726 2022年4月25日査読有り
Pivotal role of a conserved histidine in Escherichia coli ribonuclease HI as proposed by X-ray crystallography

Zengwei Liao, Takuji Oyama, Yumi Kitagawa, Katsuo Katayanagi, Kosuke Morikawa, Masayuki Oda

Acta Crystallographica Section D Structural Biology 78(3) 390-398 2022年3月1日査読有り責任著者
Crystal structures of the ligand-binding domain of human peroxisome proliferator-activated receptor δ in complexes with phenylpropanoic acid derivatives and a pyridine carboxylic acid derivative.

Takuji Oyama, Kazuki Takiguchi, Hiroyuki Miyachi

Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 78(Pt 2) 81-87 2022年2月1日査読有り筆頭著者責任著者
Family D DNA polymerase interacts with GINS to promote CMG-helicase in the archaeal replisome

Keisuke Oki, Mariko Nagata, Takeshi Yamagami, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Takuji Oyama, Yoshizumi Ishino

Nucleic Acids Research 50(7) 3601-3615 2021年9月27日査読有り
Crystal structures of the human peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR)α ligand-binding domain in complexes with a series of phenylpropanoic acid derivatives generated by a ligand-exchange soaking method

Oyama T, Kamata S, Ishii I, Miyachi H

BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 44(9) 1202-1209 2021年9月1日査読有り
Structural basis for anti-non-alcoholic fatty liver disease and diabetic dyslipidemia drug saroglitazar as a PPAR α/γ dual agonist

Honda A, Kamata S, Satta C, Machida Y, Uchii K, Terasawa K, Nemoto A, Oyama T, Ishii I

BIOLOGICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN 44(9) 1210-1219 2021年9月1日査読有り
Preparation of co-crystals of human PPARα-LBD and ligand for high-resolution X-ray crystallography

Kamata S, Oyama T, Ishii I

STAR Protocols 2(1) 2021年3月19日査読有り
PPARα Ligand-Binding Domain Structures with Endogenous Fatty Acids and Fibrates

Kamata S, Oyama T, Saito K, Honda A, Yamamoto Y, Suda K, Ishikawa R, Itoh T, Watanabe Y, Shibata T …

iScience 23(11) 101727-101727 2020年11月20日査読有り
A crystallization and preliminary X-ray diffraction study of the Arabidopsis thaliana proliferating cell nuclear antigen (PCNA2) alone and in a complex with a PIP-box peptide from Flap endonuclease 1

Ewa Kowalska, Wojciech Strzalka, Takuji Oyama

Acta Biochimica Polonica 67(1) 49-52 2020年3月19日査読有り
Direct visualization of DNA baton pass between replication factors bound to PCNA

Mayanagi K, Ishino S, Shirai T, Oyama T, Kiyonari S, Kohda D, Morikawa K, Ishino Y

Scientific Reports 8(1) 16209-16209 2018年11月1日査読有り
Atomic structure of an archaeal GAN suggests its dual roles as an exonuclease in DNA repair and a CMG component in DNA replication

T. Oyama, S. Ishino, T. Shirai, T. Yamagami, M. Nagata, H. Ogino, M. Kusunoki, Y. Ishino

Nucleic Acids Research 44(19) 9505-9517 2016年9月1日査読有り
細胞内の巨大な分子モーター「ダイニン」の構造解析

放射光 29(2) 2016年4月1日
Integrated molecular mechanism directing nucleosome reorganization by human FACT

Yasuo Tsunaka, Yoshie Fujiwara, Takuji Oyama, Susumu Hirose, Kosuke Morikawa

GENES & DEVELOPMENT 30(6) 673-686 2016年3月査読有り
Different structures of the two peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPAR gamma) ligand-binding domains in homodimeric complex with partial agonist, but not full agonist

Masao Ohashi, Takuji Oyama, Hiroyuki Miyachi

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 25(13) 2639-2644 2015年7月査読有り
Peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPAR gamma) has multiple binding points that accommodate ligands in various conformations: Structurally similar PPAR gamma partial agonists bind to PPAR gamma LBD in different conformations

Masao Ohashi, Kanae Gamo, Takuji Oyama, Hiroyuki Miyachi

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 25(14) 2758-2762 2015年7月査読有り
Disordered interdomain region of Gins is important for functional tetramer formation to stimulate MCM helicase in Thermoplasma acidophilum

Ogino H, Ishino S, Oyama T, Kohda D, Ishino Y

Biosci. Biotechnol. Biochem. 79(3) 432-438 2015年3月1日査読有り
Structural design and synthesis of arylalkynyl amide-type peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPAR gamma)-selective antagonists based on the helix12-folding inhibition hypothesis

Masao Ohashi, Kanae Gamo, Yuta Tanaka, Minoru Waki, Yoko Beniyama, Kenji Matsuno, Jun Wada, Masafumi Tenta, Jun Eguchi, Makoto Makishima …

EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY 90 53-67 2015年1月査読有り
Modification of Chimeric (2S, 3S)-butanediol Dehydrogenase Based on Structural Information

Tomohito Shimegi, Kaito Mochizuki, Takuji Oyama, Takashi Ohtsuki, Masami Kusunoki, Sadaharu Ui

PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS 22(3) 226-233 2015年査読有り
Structure of the Entire Stalk Region of the Dynein Motor Domain

Yosuke Nishikawa, Takuji Oyama, Narutoshi Kamiya, Takahide Kon, Yoko Y. Toyoshima, Haruki Nakamura, Genji Kurisu

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 426(19) 3232-3245 2014年9月査読有り
Molecular dynamics study-guided identification of cyclic amine structures as novel hydrophobic tail components of hPPARgamma agonists

Tanaka Y, Gamo K, Oyama T, Ohashi M, Waki M, Matsuno K, Matsuura N, Tokiwa H, Miyachi H

Bioorg. Med. Chem. 24(16) 4001-4005 2014年8月1日査読有り

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MISC

FACTを介したクロマチンリモデリングの分子機構

津中康央, 藤原芳江, 大山拓次, 広瀬進, 森川耿右

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 89回 [2P-276] 2016年9月
FACTを介したクロマチンリモデリングの分子機構

津中康央, 藤原芳江, 大山拓次, 広瀬進, 森川耿右

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 89回 [2P-276] 2016年9月
新規PPARγアンタゴニスト/インバースアゴニストの創製

大橋雅生, 蒲生佳奈恵, 田中雄大, 紅山容子, 脇稔, 松浦信康, 槇島誠, 大山拓次, 松野研司, 天田雅文 …

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 134th 2014年
好熱性アーキアThermoplasma acidophilum における複製ヘリカーゼの分岐進化した活性化メカニズム

尾木野弘実, 石野園子, 真柳浩太, 大山拓次, 白井剛, 森川耿右, HAUGLAND, Gyri Teien, BIRKELAND Nils‐Kare, 神田大輔 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2P-0128 (WEB ONLY) 2013年
水溶性向上を指向したα‐ベンジルフェニルプロピオン酸型PPARγ選択的パーシャルアゴニストの創製

大橋雅生, 大山拓次, 和久剛, 片岡健, 八代正和, 許南浩, 宮地弘幸

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 30th 73 2012年11月1日
水性の向上を指向した新規PPARγ選択的アゴニストの創製

大橋雅生, 和久剛, 大山拓次, 片岡健, 許南浩, 宮地弘幸

日本薬学会年会要旨集 132nd(2) 166 2012年3月5日
ピレン環を有するPPARα/δデュアルアゴニストの二面的蛍光特性

伴慎太郎, 大山拓次, 西尾淑暢, 森川耿右, 橋本祐一, 宮地弘幸

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 30th 2012年
The 2.8-angstrom Crystal Structure of the Dynein Motor Domain

Takahide Kon, Takuji Oyama, Rieko Shimo-Kon, Kazuo Sutoh, Genji Kurisu

BIOPHYSICAL JOURNAL 102(3) 367A-368A 2012年1月
Thermoplasma acidophilum由来Cdc6/Orc1とホモ4量体のGINSによるMCMの相乗的な活性化

尾木野弘実, 石野園子, 真柳浩太, 大山拓次, 白井剛, 森川耿右, HAUGLAND, Gyri Teien, BIRKELAND Nils‐Kare, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 3P-0193 (WEB ONLY) 2012年
脊椎動物動原体構成因子CENP‐S/X,CENP‐T/W複合体の構造細胞生化学と溶液動態解析

西野達哉, 鈴木應志, 竹内康造, 堀哲也, 宮城篤, 大山拓次, 森川耿右, 深川竜郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 11th 84 2011年5月27日
Structural cell biochemistry of a novel histone fold vertebrate kinetochore complex: CENP-TW and CENP-SX form a heterotetramer.

T. Nishino, K. Takeuchi, K. E. Gascoigne, A. Suzuki, T. Hori, T. Oyama, K. Morikawa, I. M. Cheeseman, T. Fukagawa

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 22 2011年
DNA複製開始に必須の古細菌由来GINS複合体の結晶構造とホモロジーモデル

大山拓次, 白井剛, 齋藤美保子, 石野良純, 森川耿右

生化学 ROMBUNNO.1P-0097 2010年
超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensisの複製フォーク複合体解明に向けてのMCM,GINS複合体解析

藤野誠司, 石野園子, 井田梨沙, 尾木野弘実, 冨田宏矢, 金井保, 跡見晴幸, 真柳浩太, 大山拓次, 森川耿右 …

生化学 ROMBUNNO.2P-0483 2010年
RecQに関連する古細菌由来Hjmヘリカーゼの結晶構造とその機能

大山拓次, 真柳浩太, 白井剛, 藤兼亮輔, 石野良純, 森川耿右

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 9th 94 2009年4月24日
PEROXISOME PROLIFERATOR-ACTIVATED RECEPTOR (PPAR) AGONISTS WITH 3,4-DIHYDRO-2H-BENZO[e][1,3]OXAZINE AND 2,3,4,5-TETRAHYDROBENZO[f][1,4]OXAZEPINE SKELETONS: EFFECTS OF CYCLIZATION OF LINKER MOIETY ON PPAR-AGONISTIC ACTIVITY (vol 75, pg 2187, 2008)

Kenji Ohgane, Jun-ichi Kasuga, Takuji Oyama, Yuko Hirakawa, Kosuke Morikawa, Makoto Makishima, Yuichi Hashimoto, Hiroyuki Miyachi

HETEROCYCLES 75(11) 2891-+ 2008年11月
リガンドの共通部分構造を認識する脂質シグナル系タンパク質部位の探索

塩生くらら, 和久剛, 大山拓次, 白木琢磨, 白井剛, 森川耿右

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 8th 2008年
不安定な分子の電子顕微鏡構造解析―クランプはめ込み中間状態の構造

鈴木博文, 宮田知子, 大山拓次, 真柳浩太, 石野良純, 森川耿右

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 7th 18 2007年5月7日
DNA複製に関わるAAA₊タンパク質複合体の電子顕微鏡構造解析

鈴木博文, 宮田知子, 大山拓次, 真柳浩太, 石野良純, 森川耿右

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 6th 17 2006年3月31日
電子顕微鏡単粒子解析によってとらえたDNAクランプはめ込み複合体中のクランプ開環構造

宮田知子, 鈴木博文, 大山拓次, 真柳浩太, 石野良純, 森川こう右

日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 56 2005年11月25日
超好熱性アーキアPyrococcus furiosus HjmヘリカーゼのDNA結合様式解析

吉永亜耶, 藤兼亮輔, 大山拓次, 森川こう右, 品川日出夫, 石野良純

日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 2005年

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書籍等出版物

グルタミン酸受容体とシナプス構成因子

大山拓次

日本結晶学会誌 2014年7月1日

講演・口頭発表等

核内受容体PPARリガンド結合ドメインー難溶性リガンド複合体の網羅的結晶構造決定に向けて

大山拓次

日本薬学会第142年会一般シンポジウム 2022年3月26日日本薬学会
プレスリリース：アーキア（古細菌）のDNA合成酵素が鋳型DNAの二本鎖を解く機能に貢献！〜アーキア（古細菌）がどのように DNA を複製するのかを解明〜

2021年9月29日
核内受容体PPARδリガンド結合ドメインとパーシャルアゴニストJK122の複合体結晶構造

大山拓次, 中村仁美, 春日淳一, 宮地弘幸, 楠木正巳

日本生化学会関東支部例会 2013年6月15日日本生化学会関東支部例会
細胞質ダイニンモータードメインの結晶構造

大山拓次, 昆隆英, 下-昆理恵子, 須藤和夫, 栗栖源嗣

平成23年度日本結晶学会年会 2011年11月25日日本結晶学会年会
立体構造からみたDNA複製および修復の分子機構：クランプローディング複合体を中心に

大山拓次, 森川耿右

第６回日本蛋白質科学会年会シンポジウム 2006年4月26日日本蛋白質科学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

生体内代謝産物をモニターする転写制御機構の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業学術創成研究費 2006年 - 2010年

森川耿右, 村山明子, 楯真一, 木村圭志, 大山拓次, 白木琢磨, 高尾敏文

社会貢献活動

令和2年度優秀教育賞（ベスト・ティーチング・アワード）

その他

山梨大学 2021年6月15日 - 2021年6月15日
第14回日本化学連合シンポジウムにて講演

講師

日本化学連合第14回日本化学連合シンポジウム 2021年3月9日 - 2021年3月9日
日経ビジネス「振り回される高校３年生問われる大学の意義」インタビュー

取材協力

日経BP 日経ビジネス日経ビジネスNo.2067 2020年11月23日 - 2020年11月23日
読売新聞「教育ルネサンス動画で学ぶ<3>大学は実習や対面に活用」インタビュー

取材協力

読売新聞教育ルネサンス読売新聞（全国面） 2020年10月22日 - 2020年10月22日
UTY「トビラの向こう」出演の案内

その他

山梨大学 twitter 山梨大学twitter 2020年10月1日
国立情報学研究所主催のサイバーシンポジウムで講演

その他

山梨大学トップページトピックス山梨大学トピックス 2020年9月16日 - 2020年9月16日
国立情報学研究所サイバーシンポジウム（2020年第16回）での講演

講師

国立情報学研究所 2020年第16回サイバーシンポジウム国立情報学研究所サイバーシンポジウム 2020年9月11日 - 2020年9月11日
新型コロナウイルス感染症への効果的な感染症対策を講じている大学等の事例での紹介

その他

山梨大学トップページトピックス山梨大学トピックス 2020年9月10日
大学における新型コロナウイルス感染症対策の好事例について

その他

文部科学省 HPトピックス文部科学省ウェブページ 2020年8月11日 - 2020年8月11日
タンパク質：構造が機能を物語る

講師

（株）フロムページ夢ナビライブ201９東京東京ビッグサイト 2019年6月8日 - 2019年6月8日
タンパク質：構造が機能を物語る

講師

（株）フロムページ夢ナビライブ2018名古屋 2018年7月28日 - 2018年7月28日
タンパク質：構造が機能を物語る

講師

（株）フロムページ夢ナビライブ2018東京 2018年7月14日 - 2018年7月14日
タンパク質：構造が機能を物語る

講師

（株）フロムページ夢ナビライブ2017東京 2017年7月22日 - 2017年7月22日
タンパク質：構造が機能を物語る

講師

（株）フロムページ夢ナビライブ2016東京 2016年7月9日 - 2016年7月9日

メディア報道

UTYテレビ山梨スゴろく「トビラの向こう第3回：大学教育現場の挑戦」出演

UTYテレビ山梨スゴろく「トビラの向こう第3回：大学教育現場の挑戦」 UTYテレビ山梨地上デジタル放送 2020年10月7日テレビ・ラジオ番組
山梨大学Future seed ライブ

FM FUJI 山梨大学Future seed ライブ 2016年8月4日テレビ・ラジオ番組

大山拓次

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研究分野

経歴

委員歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

メディア報道

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