小松崎民樹 (KOMATSUZAKI TAMIKI) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学電子科学研究所附属社会創造数学研究センターデータ数理研究分野教授

学位: 博士（理学）(総合研究大学院大学（分子科学研究所）)

研究者番号: 30270549
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-7175-8474
J-GLOBAL ID: 200901045012748380
researchmap会員ID: 1000371911

外部リンク: http://mlns.es.hokudai.ac.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年9月 - 現在

FlyWorks Inc., 技術アドバイザー
2023年4月 - 現在

情報計測オンラインセミナー運営委員会委員
2022年4月 - 現在

大阪大学先導的学際研究機構超次元ライフイメージング研究部門招へい教授
2021年11月 - 現在

東京大学客員共同研究員
2019年7月 - 現在

北海道大学人間知・脳・AI研究教育センター, 兼務教員
2018年10月 - 現在

北海道大学化学反応創成研究拠点 (WPI-ICReDD), PI
2018年4月 - 現在

北海道大学, 大学院総合化学院物質化学コース兼任, 教授
2015年4月 - 現在

北海道大学, 電子科学研究所附属社会創造数学研究センターデータ数理研究分野（改組）, 教授
2025年4月 - 2027年3月

日本生物物理学会代議員
2022年7月 - 2025年3月

大阪大学産業科学研究所, 特任教授
2022年4月 - 2025年3月

学術変革領域B「嫉妬の科学」外部アドバイザー
2022年4月 - 2024年3月

生物物理学会北海道支部長
2022年10月 - 2023年10月

日本化学会代議員
2022年11月 - 2023年3月

情報計測オンラインセミナー運営委員会委員長
2022年4月 - 2023年3月

SIAM Conference on Applications of Dynamical Systems (DS23) Organizing Committee
2021年6月 - 2022年11月

情報計測オンラインセミナー運営委員会副委員長
2021年10月 - 2022年3月

早稲田大学先進理工学部非常勤講師(集中講義)
2021年10月 - 2022年3月

東京大学大学院総合文化研究科非常勤講師(集中講義)
2020年10月 - 2021年3月

東京大学大学院理学研究科化学専攻非常勤講師 (集中講義)
2017年4月 - 2021年3月

北海道大学共同プロジェクト拠点「知識メディアラボラトリ」, 運営委員

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委員歴

2023年10月 - 現在

科学技術振興機構・創発アドバイザー
2019年6月 - 現在

科学技術振興機構・さきがけ「革新的な量子情報処理技術基盤の創出」, アドバイザー
2018年1月 - 現在

人工知能学会第２種研究会計測インフォマティクス研究会（Special Interest Group on Measurement Informatics: SIG-MEI）, 幹事
2017年2月 - 現在

“Scientific Reports” Division of Chemical Physics, Editorial Board
2025年 - 2026年3月

日本化学会, 学術賞・進歩賞審査委員長
2024年1月 - 2025年12月

生物物理学会, 「生物物理」編集委員長
2025年4月 - 2025年9月

JST/CREST 「生命力」領域, 外部評価委員
2024年 - 2025年3月

日本化学会, 学術賞・進歩賞審査副委員長
2024年1月 - 2024年12月

生物物理学会, 分野別専門委員（非線形・カオス・複雑系）
2019年12月 - 2023年12月

日本生物物理学会, Biophysics Physicobiology 副編集委員長
2013年1月 - 2023年12月

“Biophysics and Physicobiology”, Editorial Board
2023年2月 - 2023年9月

JST/ERATO, 選考パネルメンバー
2021年4月 - 2023年3月

分子科学研究所, 学会等連絡会議構成員
2017年4月 - 2022年3月

生物物理学会北海道支部, 幹事
2019年6月 - 2021年5月

日本生物物理学会, 副会長
2009年4月 - 2021年3月

（財）新世代研究所「バイオ単分子研究会」, 研究会委員
2020年8月 - 2020年12月

JST/創発的研究支援事業, 外部専門委員
2019年12月 - 2020年11月

Biophysical Reviews, Springer Nature IUPAB, Special Issue Editor
2019年4月 - 2019年9月

JST/ERATO, 選考パネルメンバー
2018年4月 - 2018年9月

JST/ERATO, 選考パネルメンバー

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受賞

2021年9月

Finalist of FACSS Innovation award, On-the-fly Raman image microscopy by reinforcement machine learning, FACSS SciX2021

Tamiki Komatsuzaki, Koji Tabata, Hiroyuki Kawagoe, James Nicholas Taylor, Kentaro Mochizuki, Toshiki Kubo, Jean-Emmanuel Clement, Yasuaki Kumamoto, Atsuyoshi Nakamura, Yoshinori Harada, Katsumasa Fujita
2014年

科研費審査員表彰

小松崎民樹
2012年

Award, Bulletin of the Chemical Society of Japan (BCSJ)

小松崎民樹
2010年

Grant Award, Human Frontier Science Program (HFSP)

小松崎民樹

論文

180

Integrating spatial and chemical information enhances differentiation of non-alcoholic steatohepatitis states in Raman imaging.

Ryoya Kondo, Yuta Mizuno, Kentaro Mochizuki, Kosuke Hashimoto, Jean-Emmanuel Clément, Yasuaki Kumamoto, Katsumasa Fujita, Yoshinori Harada, Tamiki Komatsuzaki

Scientific reports 15(1) 35216-35216 2025年10月13日
Detecting existence of a hidden mediator between a pair of individual time series.

M Mohiuddin, Udoy S Basak, Md Motaleb Hossain, Sulimon Sattari, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki

Scientific reports 15(1) 21610-21610 2025年7月1日査読有り
Beyond the Nucleus: Cytoplasmic Dominance in Follicular Thyroid Carcinoma Detection Using Single-Cell Raman Imaging across Multiple Devices

Aurelien Pelissier, Kosuke Hashimoto, Kentaro Mochizuki, J. Nicholas Taylor, Jean-Emmanuel Clément, Yasuaki Kumamoto, Katsumasa Fujita, Yoshinori Harada, Tamiki Komatsuzaki

Analytical Chemistry 2025年7月1日査読有り
Risk-Averse Best Arm Set Identification with Fixed Budget and Fixed Confidence.

Shunta Nonaga, Koji Tabata, Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki

CoRR abs/2506.22253 2025年6月査読有り
Comparative Analysis of Reinforcement Learning Algorithms for Finding Reaction Pathways: Insights from a Large Benchmark Data Set

Yoshihiro Matsumura, Koji Tabata, Tamiki Komatsuzaki

Journal of Chemical Theory and Computation 21(7) 3523-3535 2025年4月8日査読有り
Enumeration Approach to Atom-to-Atom Mapping Accelerated by Ising Computing

Mohammad Ali, Yuta Mizuno, Seiji Akiyama, Yuuya Nagata, Tamiki Komatsuzaki

Journal of Chemical Information and Modeling 65(4) 1901-1910 2025年2月2日査読有り
Low-dimensional projection of reactivity classes in chemical reaction dynamics using supervised dimensionality reduction.

Ryoichi Tanaka, Yuta Mizuno, Takuro Tsutsumi, Mikito Toda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki

The Journal of chemical physics 161(15) 2024年10月21日査読有り
An attempt of Seibutsu-Butsuri in Kyoto IUPAB Congress 2024.

Tamiki Komatsuzaki

Biophysical reviews 16(5) 509-510 2024年10月査読有り
Multi-armed bandit algorithm for sequential experiments of molecular properties with dynamic feature selection.

Md Menhazul Abedin, Koji Tabata, Yoshihiro Matsumura, Tamiki Komatsuzaki

The Journal of chemical physics 161(1) 2024年7月7日査読有り
An encompassed representation of timescale hierarchies in first-order reaction network.

Yutaka Nagahata, Masato Kobayashi, Mikito Toda, Satoshi Maeda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 121(21) e2317781121 2024年5月21日査読有り
Flow zoometry of Drosophila

Walker Peterson, Joshua Arenson, Soichiro Hata, Laura Kacenauskaite, Tsubasa Kobayashi, Takuya Otsuka, Hanqing Wang, Yayoi Wada, Kotaro Hiramatsu, Zhikai He …

2024年4月5日査読有り
On-the-fly Raman microscopy guaranteeing the accuracy of discrimination.

Koji Tabata, Hiroyuki Kawagoe, J Nicholas Taylor, Kentaro Mochizuki, Toshiki Kubo, Jean-Emmanuel Clement, Yasuaki Kumamoto, Yoshinori Harada, Atsuyoshi Nakamura, Katsumasa Fujita …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 121(12) e2304866121 2024年3月19日査読有り
Subdomain dynamics enable chemical chain reactions in non-ribosomal peptide synthetases.

Xun Sun, Jonas Alfermann, Hao Li, Maxwell B Watkins, Yi-Tsao Chen, Thomas E Morrell, Florian Mayerthaler, Chia-Ying Wang, Tamiki Komatsuzaki, Jhih-Wei Chu …

Nature chemistry 16(2) 259-268 2024年2月査読有り
On-the-fly Raman microscopy guaranteeing the accuracy of discrimination

Tamiki Komatsuzaki

BIOMEDICAL SPECTROSCOPY, MICROSCOPY, AND IMAGING III 13006 2024年査読有り
A round table at IUPAB Congress in Kyoto 2024: Dreaming the next 50 years in our biophysics

Kumiko Hayashi, Gerhard Hummer, Jerelle A. Joseph, Rong Li, Takeharu Nagai, Shuichi Onami, Feng Zhang, Akira Kitamura, Yuichi Togashi, Akira Kakugo …

Biophysics and Physicobiology 21(Supplemental2) n/a-n/a 2024年査読有り
Gaussian process classification bandits.

Tatsuya Hayashi, Naoki Ito, Koji Tabata, Atsuyoshi Nakamura, Katsumasa Fujita, Yoshinori Harada, Tamiki Komatsuzaki

Pattern Recognit. 149 110224-110224 2024年査読有り
Inferring the roles of individuals in collective systems using information-theoretic measures of influence.

Sulimon Sattari, Udoy S Basak, M Mohiuddin, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki

Biophysics and physicobiology 21(Supplemental) e211014 2024年査読有り
Correction for Extrinsic Background in Raman Hyperspectral Images.

J Nicholas Taylor, Aurélien Pélissier, Kentaro Mochizuki, Kosuke Hashimoto, Yasuaki Kumamoto, Yoshinori Harada, Katsumasa Fujita, Thomas Bocklitz, Tamiki Komatsuzaki

Analytical chemistry 2023年8月10日査読有り
Comparison of particle image velocimetry and the underlying agents dynamics in collectively moving self propelled particles.

Udoy S Basak, Sulimon Sattari, Md Motaleb Hossain, Kazuki Horikawa, Mikito Toda, Tamiki Komatsuzaki

Scientific reports 13(1) 12566-12566 2023年8月2日査読有り
Differentiability of cell types enhanced by detrending a non-homogeneous pattern in a line-illumination Raman microscope.

Abdul Halim Bhuiyan, Jean-Emmanuel Clément, Zannatul Ferdous, Kentaro Mochizuki, Koji Tabata, James Nicholas Taylor, Yasuaki Kumamoto, Yoshinori Harada, Thomas Bocklitz, Katsumasa Fujita …

The Analyst 148(15) 3574-3583 2023年7月26日査読有り

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MISC

318

IUPAB京都2024年会議における座談会：我々の生物物理学の次の50年を夢見て（前半）

林久美子, Gerhard HUMMER, Jerelle A. JOSEPH, Rong LI, 永井健治, 大浪修一, Feng ZHANG, 北村朗, 冨樫祐一, 角五彰 …

生物物理 65(1) 35-46 2025年5月
IUPAB京都2024年会議における座談会：我々の生物物理学の次の50年を夢見て（後半）

林久美子, Gerhard HUMMER, Jerelle A. JOSEPH, Rong LI, 永井健治, 大浪修一, Feng ZHANG, 北村朗, 冨樫祐一, 角五彰 …

生物物理 65(2) 101-112 2025年5月
Quantum algorithm for dynamic mode decomposition integrated with a quantum differential equation solver

Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki

Physical Review Research 6(4) 2024年10月11日
Low-Dimensional Projection of Reactive Islands in Chemical Reaction Dynamics Using a Supervised Dimensionality Reduction Method

Ryoichi Tanaka, Yuta Mizuno, Takuro Tsutsumi, Mikito Toda, Tetsuya Taketsugu, Tamiki Komatsuzaki

arXiv 2024年3月
Finding optimal pathways in chemical reaction networks using Ising machines

Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki

Physical Review Research 2024年1月29日
逐次ラマン計測による迅速診断

田畑公次, 川越寛之, TAYLOR J., 望月健太郎, 久保俊貴, CLEMENT Jean-Emmanuel, 熊本康昭, 原田義規, 中村篤祥, 藤田克昌 …

人工知能学会全国大会論文集(Web) 38th 2024年
Modes of information flow in collective cohesion

Sulimon Sattari, Udoy S. Basak, Ryan G. James, Louis W. Perrin, James P. Crutchfield, Tamiki Komatsuzaki

SCIENCE ADVANCES 8(6) eabj1720 2022年2月査読有り
バンディットラマン顕微鏡:強化学習を用いた迅速診断

田畑公次, 田畑公次, 川越寛之, TALYER James Nicholas, 望月健太郎, 久保俊貴, CLEMENT Jean-Emmanuel, 熊本康昭, 熊本康昭, 原田義規 …

日本分光学会年次講演会(CD-ROM) 2022 2022年
On-the-flyラマン顕微鏡による迅速診断

田畑公次, 田畑公次, 川越寛之, TALYER James Nicholas, 望月健太郎, 久保俊貴, CLEMENT Jean-Emmanuel, 熊本康昭, 熊本康昭, 原田義規 …

レーザ顕微鏡研究会講演会抄録集 47th (CD-ROM) 2022年
バンディットアルゴリズムによる顕微ラマン診断の迅速化

田畑公次, 田畑公次, 川越寛之, TALYER James Nicholas, 望月健太郎, 久保俊貴, CLEMENT Jean-Emmanuel, 熊本康昭, 熊本康昭, 原田義規 …

Optics & Photonics Japan講演予稿集(CD-ROM) 2022 2022年
A Note on Enumeration by Fair Sampling

Tamiki Komatsuzaki

arXiv 2021年4月5日査読有り
イジング計算機を用いた化学反応経路解析法とその性能評価

水野雄太, 水野雄太, 水野雄太, 小松崎民樹, 小松崎民樹

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 15th 2021年
ラマン分光イメージングにおける化学的空間不均一性に基づいたファジークラスタリング手法の開発

近藤僚哉, TAYLOR James N., CLEMENT Jean-Emmanuel, 水野雄太, 水野雄太, 水野雄太, 藤田克昌, 原田義規, 小松崎民樹, 小松崎民樹 …

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 15th 2021年
主成分分析により抽出した少数自由度におけるハミルトン系の構成

田中綾一, 水野雄太, 水野雄太, 堤拓朗, TSITSVERO Mikhail, 武次徹也, 武次徹也, 小松崎民樹, 小松崎民樹

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 15th 2021年
反応ネットワークの観測時間階層構造と各階層の類似部分構造

永幡裕, 武次徹也, 武次徹也, 前田理, 前田理, 小松崎民樹, 小松崎民樹

分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 15th 2021年
Inferring Domain of Interactions among Elements from Ensemble of Trajectories II. -Effects of finite length trajectories and external noise

Udoy S. Basak, Sulimon Sattari, Hossain M. Motaleb, Kazuki Horikawa, Tamiki Komatsuzaki

2020年9月18日査読有り
タンパク質・DNA間の結合に新機構を発見分子の揺らぎを利用するラチェットの可能性

嶋本伸雄, 戸田幹人, 奈良重俊, 小松崎民樹, 鎌形清人, 杵淵隆, 富澤純一

東北大学多元物質科学研究所研究発表会講演予稿集 20th 2020年査読有り
大沢さん追悼：50年先への千里眼（1）大沢文夫氏を追悼する総会シンポジウム「今後の生物物理学―50年先への千里眼」を企画して

小松崎民樹

生物物理 60(2) 122-122 2020年査読有り
バンディット問題の方策を用いたモンテカルロ木探索による最適属性集合探索

中村篤祥, ペリシエオレリアン, 田畑公次, 小松崎民樹

日本細胞生物学会大会(Web) 71st ROMBUNNO.1SEp‐07 (WEB ONLY) 2019年査読有り
機械学習による非アルコール性脂肪性肝疾患モデルのラマン分光分析

原田義規, Cahyadi Harsono, Helal Khalifa, 岡嶋亮, 田畑公次, Taylor Nick, 熊本康昭, 高松哲郎, 小松崎民樹, 田中秀央

日本病理学会会誌 107(1) 368-368 2018年4月

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書籍等出版物

Minorities and Small Numbers from Molecules to Organisms in Biology-Toward a New Understanding of Biological Phenomena

小松崎民樹

Springer 2018年11月査読有り
化学反応理論の普遍性：GRRMに期するもの

小松崎民樹

IQCE NEWS (量子化学探索研究所) 2018年査読有り
【少数性生物学ってなんだ?少数の因子が生命システムを制御する】少数と個性分子の数と生命らしさ

冨樫祐一, 新海創也, 小松崎民樹

(株)羊土社 2017年12月
少数性生物学

小松崎民樹 (担当:共著, 範囲:第5章「少数の個性～分子にも個性？～」)

株式会社日本評論社 2017年査読有り
Advances in Chemical Physics

Meysam Tavakoli, J. Nicholas Taylor, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Steve Pressé (担当:共著, 範囲:Single Molecule Data Analysis: An Introduction)

Wiley 2017年査読有り
Single Molecule Data Analysis: An Introduction

Meysam Tavakoli, J. Nicholas Taylor, Chun-Biu Li, Tamiki Komatsuzaki, Steve Pressé (担当:共著)

2016年6月1日査読有り
化学反応の行き先を変える“スイッチ” エネルギーの上昇で反応経路が切り替わる新現象

寺本央, 戸田幹人, 河野裕彦, 高橋正彦, 小松崎民樹

化学同人 2016年
化学反応の行き先を変える“スイッチ”─エネルギーの上昇で反応経路が切り替わる新現象

寺本央, 戸田幹人, 河野裕彦, 高橋正彦, 小松崎民樹 (担当:共著)

月刊「化学」71(5) 2016年
Dynamics of chemical reaction around a saddle point: What divides reacting and non-reacting trajectories?

Shinnosuke Kawai, Tamiki Komatsuzaki (担当:共著)

RSC Theoretical and Computational Chemistry Series 2014年3月27日
生命動態システム科学 II.数理生物学 1.理論(5)トップダウンとボトムアップの橋渡し

小松崎民樹

金原一郎記念医学医療振興財団 2014年
Dynamics of Chemical Reaction around a Saddle Point - What divides reacting and non-reacting trajectories?

Shinnosuke Kawai, Tamiki Komatsuzaki (担当:共著, 範囲:Reaction Rate Constant Computations; Theories and Applications, CHAPTER 7)

RSC Publishing 2013年11月
ラグランジュ協同構造 : 流体の流れに隠れた骨格

ピーコックトーマス, ハラージョージ, 小松崎民樹

丸善 2013年11月
ラグランジュ協同構造―流体の流れに隠れた骨格

小松崎民樹 (担当:単訳)

2013年
Reaction Rate Constant Computations; Theories and Applications

Shinnosuke Kawai, Tamiki Komatsuzaki (担当:共著, 範囲:Dynamics of Chemical Reaction around a Saddle Point - What divides reacting and non-reacting trajectories?)

RSC 2013年
SINGLE-MOLECULE BIOPHYSICS EXPERIMENT AND THEORY ADVANCES IN CHEMICAL PHYSICS VOLUME 146 PREFACE

T. Komatsuzaki, M. Kawakami, S. Takahashi, H. Yang, R. J. Silbey (担当:共著)

SINGLE-MOLECULE BIOPHYSICS: EXPERIMENT AND THEORY 2012年
MULTIDIMENSIONAL ENERGY LANDSCAPES IN SINGLE-MOLECULE BIOPHYSICS

Akinori Baba, Tamiki Komatsuzaki (担当:共著)

WILEY-BLACKWELL 2012年
Advances in Chemical Physics 146

Akinori Baba, Tamiki Komatsuzaki (担当:共著, 範囲:Multidimensional Energy Landscapes in Single Molecule Biophysics)

John-Wiley& Sons, Inc. 2012年
Preface

Tamiki Komatsuzaki, Tamiki Komatsuzaki, Masaru Kawakami, Masaru Kawakami, Satoshi Takahashi, Satoshi Takahashi, Haw Yang, Robert J. Silbey

Wiley 2011年11月23日
PREFACE

Tamiki Komatsuzaki, R. Stephen Berry, David M. Leitner

Elsevier 2011年7月1日
法双曲不変多様体崩壊のシナリオ (力学系--理論から応用へ、応用から理論へ--RIMS研究集会報告集)

寺本央, 小松崎民樹

京都大学数理解析研究所 2011年5月

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講演・口頭発表等

462

Risk-Averse Best Arm Set Identification with Fixed Budget and Fixed Confidence

Shunta Nonaga, Koji Tabata, Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki

The 17th Asian Conference on Machine Learning（ACML2026) 2025年12月9日
ガウス過程に基づく事後分布サンプリングを用いた能動的CTスキャン方式

孫宏謀, 本多淳也, 工藤博幸, 小松崎民樹

第28回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2025) 2025年11月13日
一次反応ネットワークにおける時間階層の包括的表現法

永幡裕, 小林正人, 戸田幹人, 前田理, 武次徹也, 小松崎⺠樹

日本コンピュータ化学会2025年秋季年会 2025年11月8日
計測介入型AIが拓く生物学の展開

小松崎民樹

第63回日本生物物理学会年会 2025年9月26日
Ensemble of Deep Neural Network Models for Drug Screening Using 3D Images of Drosophila Larvae

Md Al Mehedi Hasan, Jean-Emmanuel Clemen, Walker Peterson, Tsubasa Kobayashi, Soichiro Hata, Takuya Otsuka, Koji Tabata, Masahiro Sonoshita, Keisuke Goda, Tamiki Komatsuzaki

第63回日本生物物理学会年会 2025年9月25日
量子動的モード分解アルゴリズムを用いた力学系解析法

水野雄太, 北野鵬志, 小松崎民樹

日本物理学会第80回年次大会 2025年9月17日
テンソルネットワークによる古典リウヴィル方程式の数値解法

北野鵬志, 高橋拓矢, 田中綾一, 小松崎民樹, 水野雄太

日本物理学会第80回年次大会 2025年9月17日
リー正準変換摂動理論による実在分子の化学反応動力学における反応座標解析

田中綾一, 水野雄太, ウメルウメール, ストウブルーベン, 武次徹也, 小松崎民樹

第19回分子科学討論会2025 2025年9月10日
多目的最適化による求核性211Atアスタチン化の反応条件探索

北野鵬志, 水野雄太, 向峯あかり, 橋場峻一, 中島孝平, 田畑公次, 小川美香子, 小松崎民樹

第19回分子科学討論会2025 2025年9月9日
計測介⼊型インフォマティクスの未来展望

小松崎民樹

CREST「社会課題解決を志向した⾰新的計測・解析システムの創出」領域計測インフォマティクスシンポジウム 2025年9月11日
化学反応動力学・速度論の作用素論的力学系解析

水野雄太, 北野鵬志, 小松崎民樹

第27回理論化学討論会 2025年7月24日
Multi-objective Blackbox Optimization of Reaction Conditions of Nucleophilic 211At-astatination

Tomoyuki Kitano, Yuta Mizuno, Akari Mukaimine, Shunnichi Hashiba, Kohei Nakajima, Koji Tabata, Mikako Ogawa, Tamiki Komatsuzaki

40th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics 2025年6月5日
An encompassed representation of timescale hierarchies in first-order reaction network

Nagahata Yutaka, Kobayashi Masato, Toda Mikito, Maeda Satoshi, Taketsugu Tetsuya, Komatsuzaki Tamiki

40th Symposium on Chemical Kinetics and Dynamics 2025年6月4日
時間予算制約と行動予算制約下におけるバンディットアルゴリズム

菊池健太, 田畑公次, 小松崎民樹

2025年度人工知能学会全国大会（第39回） 2025年5月29日
Trackingアルゴリズムを用いたバンディットオンラインクラスタリング

瀧川颯士, 田畑公次, 小松崎民樹

2025年度人工知能学会全国大会（第39回） 2025年5月28日
線形バンディットを用いた高次元ベイズ最適化アルゴリズム

野村祐介, 田畑公次, 小松崎民樹

2025年度人工知能学会全国大会（第39回） 2025年5月28日
固定信頼度設定下におけるリスク回避型多目的バンディット

野永竣太, 田畑公次, 水野雄太, 小松崎民樹

2025年度人工知能学会全国大会（第39回） 2025年5月27日
分子動力学における時間発展演算子のテンソルネットワークによる縮約

北野鵬志, 水野雄太, 小松崎民樹

第47回ケモインフォマティクス討論会 2024年12月17日
Detecting existence of a hidden mediator between a pair of individual time series

Md. Mohiuddin, Udoy S. Basak, Sulimon Sattari, Tamiki Komatsuzaki

25th RIES-HOKUDAI International Symposium 2024年12月10日
The Method for Finding Optimal Drugs While Reducing Risk

Shunta Nonaga, Koji Tabata, Yuta Mizuno, Tamiki Komatsuzaki

25th RIES-HOKUDAI International Symposium 2024年12月10日

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担当経験のある科目(授業)

2021年9月 - 2022年3月

集中講義早稲田大学理工学術院「システム生物学「分子と生命をつなぐ理論」」
2021年4月 - 2022年3月

集中講義東京大学大学院総合文化研究科「数理自然科学特殊講義Ⅱ」
2020年9月 - 2021年3月

集中講義物理化学特論II「On-the-fly Raman image microscopy by reinforcement machine learning」 (東京大学大学大学院理学研究科)
2015年4月 - 2016年3月

集中講義、物理学特別講義第三「分子データ科学」 (中央大学理学部物理学科)
2009年4月 - 2010年3月

集中講義、医科学特論「1分子生物学：我々は1分子時系列情報から何が学べるのか」 (福井大学医学部)
2006年4月 - 2007年3月

集中講義「化学反応における選択性と統計性」 (広島大学理学部)
2004年4月 - 2005年3月

集中講義「化学反応における選択性と統計性の起源」 (茨城大学大学院理工学研究科)
2003年4月 - 2004年3月

集中講義、相関基礎科学特殊講義XII「化学反応の動力学とカオス：なぜ反応は生起するのか」 (東京大学教養部・大学院総合文化研究科)
物理学I (北海道大学)
化学I (北海道大学)
基礎化学Ｉ (北海道大学)
環境と人間：光・バイオ・分子で拓くナノテクノロジー (北海道大学)
生化学II (北海道大学医学部)
ナノ物性化学 (北海道大学理学部化学科)
分子情報解析学特論 (北海道大学大学院生命科学院)
生命分子科学概論 (北海道大学大学院生命科学院)
地球と環境 (神戸大学大学院自然科学研究科)
創発計算論 (神戸大学大学院自然科学研究科)
生物情報特論 (神戸大学大学院自然科学研究科)
非線形科学 (神戸大学理学部地球惑星科学科)

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

個体差を活かした計測介入型の迅速スクリーニング計測基盤

科学技術振興機構 CREST 革新的計測解析 2023年10月 - 2029年3月
細胞集団とシンギュラリティ細胞のデータ駆動型数理解析技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年6月 - 2023年3月

小松崎民樹, 中村篤祥, 小野峻佑
一細胞ラマン計測と情報科学の融合による細胞診断の迅速解析技術の開発

科学技術振興機構 CREST 2016年10月 - 2022年3月

小松崎民樹
１細胞ラマン分光イメージングのための情報計測技術

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2018年11月 - 2021年3月

小松崎民樹, CLEMENT JEAN-EMMANUEL
データサイエンスと非線形科学の融合による新たな非平衡現象の探求

二国間交流事業共同研究・セミナー 2018年4月 - 2020年3月

小松崎民樹
生命動態システムに対する分子データ科学の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

小松崎民樹
1細胞ラマン分光イメージングに基づく細胞場の分子データ科学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年4月 - 2019年3月

小松崎民樹
細胞の集団と少数性のシステム生物学

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2019年3月

小松崎民樹
多階層システム生物学におけるデータ駆動科学の展開

新学術領域研究 2017年4月 - 2018年3月

小松崎民樹
少数系から複雑反応ネットワークを含む遷移状態概念の深化と制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2015年7月 - 2018年3月

小松崎民樹, 寺本央
多階層システム生物学におけるデータ駆動科学の展開

新学術領域研究 2016年4月 - 2017年3月

小松崎民樹
少数性生物学ー個と多数の狭間が織りなす生命現象の探求ー

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2016年3月

永井健治, 上田泰己, 石島秋彦, 今田勝巳, 前島一博, 野地博行, 冨樫祐一, 新井由之, 松田知己, 吉村成弘, 堀川一樹, 渡邉朋信, 藤田克昌, 金原数, 山東信介, 竹内昌治, 小松崎民樹, 岡田康志, 原田慶恵
分子個性を彫り出すシステム生物学の探求

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2016年3月

小松崎民樹, 李振風, 河合信之輔
階層性と頑健性をもつ生命動態システムの解析基盤構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

小松崎民樹, 李振風, 寺本央
少数分子反応ネットワーク理論の構築－少数性と階層性の観点からのモデリング－

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2016年3月

冨樫祐一, 小松崎民樹, 李振風, 寺本央, 新海創也, 津川暁, 中川正基
生体機能システムの頑健性と適応性の基本原理の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2011年

小松崎民樹
単一量子ドットのブリンキング機構の解明・制御に向けた新しい解析理論の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2009年 - 2011年

李振風, 小松崎民樹
生体機能における時空間階層を繋ぐ選択性と統計性の動的構築原理の創出

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2009年 - 2011年

小松崎民樹, 李振風, 寺本央
1分子時系列情報に基づく革新的マルチスケールモデリング

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2009年 - 2010年

李振風, 小松崎民樹
複雑反応系に対するダイナミックス理論の基礎構築

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

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小松崎民樹

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