野口保 (Tamotsu Noguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 明治薬科大学数理科学部門生命情報科学研究室教授 (情報教育研究センター長)

連絡先: noguchitmy-pharm.ac.jp
研究者番号: 00357740
J-GLOBAL ID: 202001009747671480
researchmap会員ID: R000013752

外部リンク: https://u-lab.my-pharm.ac.jp/~noguchit/index.html

研究分野

経歴

2012年1月 - 現在

明治薬科大学, 薬学教育研究センター数理科学部門 (Professor)
2001年4月 - 2011年12月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 主任研究員、研究チーム長、副研究センター長、主幹研究員
2000年4月 - 2001年3月

ファルマデザイン株式会社, 主任研究員
1996年4月 - 2000年3月

新情報処理開発機構, 並列応用つくば研究室
1984年4月 - 1996年3月

富士通株式会社

学歴

1998年10月 - 2001年3月

大阪大学, 大学院基礎工学研究科, 情報数理系専攻
1981年4月 - 1983年3月

東京農工大学, 工学研究科, 応用物理学専攻
1977年4月 - 1981年3月

東京農工大学, 工学部, 応用物理学科

論文

Exon Elongation Added Intrinsically Disordered Regions to the Encoded Proteins and Facilitated the Emergence of the Last Eukaryotic Common Ancestor.

Satoshi Fukuchi, Tamotsu Noguchi, Hiroto Anbo, Keiichi Homma

Molecular biology and evolution 40(1) 2023年1月4日
A Privacy-Preserving Query System using Fully Homomorphic Encryption with Real-World Implementation for Medicine-Side Effect Search.

Yusheng Jiang, Tamotsu Noguchi, Nobuyuki Kanno, Yoshiko Yasumura, Takuya Suzuki, Yu Ishimaki, Hayato Yamana

Proceedings of the 21st International Conference on Information Integration and Web-based Applications & Services(iiWAS) 63-72 2019年
Both Intrinsically Disordered Regions and Structural Domains Evolve Rapidly in Immune-Related Mammalian Proteins.

Keiichi Homma, Hiroto Anbo, Tamotsu Noguchi, Satoshi Fukuchi

International journal of molecular sciences 19(12) 2018年12月4日
Codon usage is less optimized in eukaryotic gene segments encoding intrinsically disordered regions than in those encoding structural domains.

Keiichi Homma, Tamotsu Noguchi, Satoshi Fukuchi

Nucleic acids research 44(21) 10051-10061 2016年12月1日
Identifying protein short linear motifs by position-specific scoring matrix

Chun Fang, Tamotsu Noguchi, Hayato Yamana, Fuzhen Sun

Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics) 9713 LNCS 206-214 2016年
A Method for Systematic Assessment of Intrinsically Disordered Protein Regions by NMR.

Natsuko Goda, Kana Shimizu, Yohta Kuwahara, Takeshi Tenno, Tamotsu Noguchi, Takahisa Ikegami, Motonori Ota, Hidekazu Hiroaki

International journal of molecular sciences 16(7) 15743-60 2015年7月10日
Condensing position-specific scoring matrixs by the Kidera factors for ligand-binding site prediction.

Chun Fang, Tamotsu Noguchi, Hayato Yamana

International journal of data mining and bioinformatics 12(1) 70-84 2015年
Analysis of evolutionary conservation patterns and their influence on identifying protein functional sites.

Chun Fang, Tamotsu Noguchi, Hayato Yamana

Journal of bioinformatics and computational biology 12(5) 1440003-1440003 2014年10月
Simplified sequence-based method for ATP-binding prediction using contextual local evolutionary conservation.

Chun Fang, Tamotsu Noguchi, Hayato Yamana

Algorithms for molecular biology : AMB 9(1) 7-7 2014年3月11日
Analyzing conservation patterns and its influence on identifying protein functional

Chun Fang, Tamotsu Noguchi, Hayato Yamana

Proceedings of the 6th International Conference on Bioinformatics and Computational Biology, BICOB 2014 73-79 2014年
MFSPSSMpred: identifying short disorder-to-order binding regions in disordered proteins based on contextual local evolutionary conservation.

Chun Fang, Tamotsu Noguchi, Daisuke Tominaga, Hayato Yamana

BMC bioinformatics 14 300-300 2013年10月4日
ESPRESSO: a system for estimating protein expression and solubility in protein expression systems.

Shuichi Hirose, Tamotsu Noguchi

Proteomics 13(9) 1444-56 2013年5月
SCPSSMpred: A General Sequence-based Method for Ligand-binding Site Prediction

Fang Chun, Noguchi Tamotsu, Yamana Hayato

Information and Media Technologies 8(3) 890-897 2013年
SCPSSMpred: A General Sequence-based Method for Ligand-binding Site Prediction

Fang Chun, Noguchi Tamotsu, Yamana Hayato

IPSJ Transactions on Bioinformatics 6 35-42 2013年
Statistical analysis of features associated with protein expression/solubility in an in vivo Escherichia coli expression system and a wheat germ cell-free expression system.

Shuichi Hirose, Yoshifumi Kawamura, Kiyonobu Yokota, Toshihiro Kuroita, Tohru Natsume, Kazuo Komiya, Takeshi Tsutsumi, Yorimasa Suwa, Takao Isogai, Naoki Goshima …

Journal of biochemistry 150(1) 73-81 2011年7月
Development and evaluation of data-driven designed tags (DDTs) for controlling protein solubility.

Shuichi Hirose, Yoshifumi Kawamura, Masatoshi Mori, Kiyonobu Yokota, Tamotsu Noguchi, Naoki Goshima

New biotechnology 28(3) 225-31 2011年4月30日
SAHG, a comprehensive database of predicted structures of all human proteins.

Chie Motono, Junichi Nakata, Ryotaro Koike, Kana Shimizu, Matsuyuki Shirota, Takayuki Amemiya, Kentaro Tomii, Nozomi Nagano, Naofumi Sakaya, Kiyotaka Misoo …

Nucleic acids research 39(Database issue) D487-93 2011年1月
The DBCLS BioHackathon: standardization and interoperability for bioinformatics web services and workflows. The DBCLS BioHackathon Consortium*.

Toshiaki Katayama, Kazuharu Arakawa, Mitsuteru Nakao, Keiichiro Ono, Kiyoko F Aoki-Kinoshita, Yasunori Yamamoto, Atsuko Yamaguchi, Shuichi Kawashima, Hong-Woo Chun, Jan Aerts …

Journal of biomedical semantics 1(1) 8-8 2010年8月21日
Prediction of protein motions from amino acid sequence and its application to protein-protein interaction.

Shuichi Hirose, Kiyonobu Yokota, Yutaka Kuroda, Hiroshi Wako, Shigeru Endo, Satoru Kanai, Tamotsu Noguchi

BMC structural biology 10 20-20 2010年7月13日
POODLE-I: disordered region prediction by integrating POODLE series and structural information predictors based on a workflow approach.

Shuichi Hirose, Kana Shimizu, Tamotsu Noguchi

In silico biology 10(3) 185-91 2010年

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