花園祐矢 (Yuya HANAZONO) - マイポータル

基本情報

所属: 東京科学大学教育研究組織総合研究院難治研・バイオデータ科学研究部門分子構造情報学分野准教授

researchmap会員ID: R000029493

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

受賞

2025年1月

JAICI賞, 化学情報協会
2024年11月

進歩賞, 日本結晶学会
2022年9月

若手招待講演賞, 日本生物物理学会
2022年9月

Travel Fellowship Awards, IUPAB/NanoLSI Workshop on Computational Biophysics of Atomic Force Microscopy

論文

Structural basis of affinity maturation of anti-(4-hydroxy-3-nitrophenyl)acetyl antibodies.

Yoshida M., Hanazono Y., Numoto N., Yabuno S., Ito N., Azuma T., Oda M.

Archives of biochemistry and biophysics 775 110665 2026年1月査読有り
Design, synthesis and structural development of nonsecosteroidal VDR ligands based on the C,C'-diphenyl-m-carborane scaffold.

Mudiyanselage HNTN, Misawa T., Ochiai K., Demizu Y., Hanazono Y., Ito N., Fujii S.

European journal of medicinal chemistry 302(Pt 2) 118320 2026年1月査読有り
Structure-activity relationship and crystallographic analyses of non-secosteroidal vitamin D receptor ligands bearing diphenylsilane core as a hydrophobic pharmacophore

Mudiyanselage, HNTN, Misawa, T., Ochiai, K., Demizu, Y., Hanazono, Y., Ito, N., Fujii, S.

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY 128 118261 2025年10月査読有り
Crystal structures reveal how the multispecific antibody G2 achieves binding to different peptides

Hanazono, Y., Yabuno, S., Hayashi, T., Numoto, N., Kamatari, YO, Ito, N., Oda, M.

FEBS LETTERS 599(13) 1925-1934 2025年7月査読有り筆頭著者
Affinity-matured antibody with a disulfide bond in H-CDR3 loop.

Yoshida M., Hanazono Y., Numoto N., Nagao S., Yabuno S., Kitagawa Y., Sekiguchi H., Ito N., Azuma T., Oda M.

Archives of biochemistry and biophysics 758 110068 2024年6月査読有り
The role of the STAS domain in SLC26A9 for chloride ion transporter function.

Omori S., Hanazono Y., Nishi H., Kinoshita K.

Biophysical journal 123(12) 1751-1762 2024年5月査読有り筆頭著者
Description of peptide bond planarity from high-resolution neutron crystallography.

Yuya Hanazono, Yu Hirano, Taro Tamada, Kunio Miki

Biophys Physicobiol 20(3) e200035-e200035 2023年9月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Elevator motion of chloride ion transporter SLC26A9 induced by STAS domain

Omori Satoshi, Hanazono Yuya, Nishi Hafumi, Kinoshita Kengo

bioRxiv 2023年7月筆頭著者
Revisiting the concept of peptide bond planarity in an iron-sulfur protein by neutron structure analysis

Hanazono Yuya, Hirano Yu, Takeda Kazuki, Kusaka Katsuhiro, Tamada Taro, Miki Kunio

SCIENCE ADVANCES 8(20) eabn2276 2022年5月査読有り筆頭著者
Prediction of protein assemblies, the next frontier: The CASP14-CAPRI experiment.

Lensink MF, Brysbaert G, Mauri T, Nadzirin N, Velankar S, Chaleil RAG, Clarence T, Bates PA, Kong R, Liu B …

Proteins 89(12) 1800-1823 2021年8月査読有り
Split conformation of Chaetomium thermophilum Hsp104 disaggregase.

Yosuke Inoue, Yuya Hanazono, Kentaro Noi, Akihiro Kawamoto, Masato Kimatsuka, Ryuhei Harada, Kazuki Takeda, Ryoichi Kita, Natsuki Iwamasa, Kyoka Shibata …

Structure 29(7) 721-730 2021年7月査読有り筆頭著者
Characterization of perdeuterated high-potential iron-sulfur protein with high-resolution X-ray crystallography.

Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki

Proteins 88(2) 251-259 2020年2月査読有り筆頭著者
X-ray crystallographic studies on the hydrogen isotope effects of green fluorescent protein at sub-ångström resolutions.

Yang Tai, Kiyofumi Takaba, Yuya Hanazono, Hoang Anh Dao, Kunio Miki, Kazuki Takeda

Acta Crystallogr D Struct Biol 75(12) 1096-1106 2019年12月査読有り
Subatomic resolution X-ray structures of green fluorescent protein.

Kiyofumi Takaba, Yang Tai, Haruhiko Eki, Hoang-Anh Dao, Yuya Hanazono, Kazuya Hasegawa, Kunio Miki, Kazuki Takeda

IUCrJ 6(3) 387-400 2019年5月査読有り
Co-translational folding of α-helical proteins: structural studies of intermediate-length variants of the λ repressor.

Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki

FEBS Open Bio 8(8) 1312-1321 2018年8月査読有り筆頭著者
Crystallographic characterization of the high-potential iron-sulfur protein in the oxidized state at 0.8 Å resolution.

Hiraku Ohno, Kazuki Takeda, Satomi Niwa, Tomotaka Tsujinaka, Yuya Hanazono, Yu Hirano, Kunio Miki

PLoS One 12(5) e0178183-e0178183 2017年5月査読有り
Structural studies of the N-terminal fragments of the WW domain: Insights into co-translational folding of a beta-sheet protein.

Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki

Sci Rep 6 34654-34654 2016年10月査読有り筆頭著者
Characterization of the Nqo5 subunit of bacterial complex I in the isolated state.

Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Kunio Miki

FEBS Open Bio 6(7) 687-695 2016年6月査読有り筆頭著者
Crystal structures of chitin binding domains of chitinase from Thermococcus kodakarensis KOD1.

Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Satomi Niwa, Masahito Hibi, Naoya Takahashi, Tamotsu Kanai, Haruyuki Atomi, Kunio Miki

FEBS Lett 590(2) 298-304 2016年1月査読有り筆頭著者
Nonequivalence observed for the 16-meric structure of a small heat shock protein, SpHsp16.0, from Schizosaccharomyces pombe.

Yuya Hanazono, Kazuki Takeda, Toshihiko Oka, Tetsuya Abe, Taichi Tomonari, Nobuhiko Akiyama, Yoshiki Aikawa, Masafumi Yohda, Kunio Miki

Structure 21(2) 220-228 2013年2月査読有り筆頭著者

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MISC

AIをベースにしたタンパク質の第一原理分子動力学

花園祐矢

ファルマシア 61(7) 683-683 2025年7月査読有り招待有り
高分解能中性子結晶構造解析によるペプチド結合多様性の解明

花園祐矢

日本結晶学会誌 67(2) 97-104 2025年5月査読有り招待有り
高分解能中性子構造解析によるペプチド平面の再検討

花園祐矢

生物物理 63(4) 205-206 2023年8月査読有り招待有り
高分解能中性子構造から明らかになったタンパク質中のペプチド結合における新しい描像

花園祐矢, 平野優, 玉田太郎, 三木邦夫

日本結晶学会誌 64(3) 2022年8月査読有り招待有り

講演・口頭発表等

High-resolution neutron crystallography reveals context-dependent distortions of peptide-bond geometry in high-potential iron–sulfur protein

Yuya Hanazono, Yu Hirano, Taro Tamada, Kunio Miki

Asian Crystallographic Association Meeting 2025 (AsCA 2025)
Conformational heterogeneity in the PDZ1 domain of human syntenin-1 revealed by systematic comparison of ten crystal structures

Natsuno Ando, Yuya Hanazono, Koya Sakuma, Nobutaka Numoto, Takeshi Tenno, Atsunori Oshima, Nobutoshi Ito, Hidekazu Hiroaki

Asian Crystallographic Association Meeting 2025 (AsCA 2025)
抗コロナウイルス薬の開発を志向した二価性PDZドメイン阻害剤の設計

安藤夏乃, 天野剛志, 濱嶋竜生, 高木春樺, 花園祐矢, 沼本修孝, 鈴木陽一, 伊藤暢聡, 廣明秀一

第25回日本蛋白質科学会年会
抗ニトロフェニル抗体の親和性成熟に伴うトレードオフの要因解析

藪野沙彩, 花園祐矢, 伊藤暢聡, 東隆親, 織田昌幸

第3回日本抗体学会学術大会
親和性成熟過程にある抗体の結晶構造と熱力学解析から見える抗原認識の変化

由田睦, 花園祐矢, 伊藤暢聡, 東隆親, 織田昌幸

第3回日本抗体学会学術大会
抗コロナウイルス薬の開発を志向した二価性PDZドメイン阻害剤の設計

安藤夏乃, 天野剛志, 濱嶋竜生, 高木春樺, 花園祐矢, 沼本修孝, 鈴木陽一, 伊藤暢聡, 廣明秀一

第47回日本分子生物学会
高分解能中性子結晶構造解析によるペプチド結合多様性の解明

花園祐矢

令和6年度日本結晶学会年会招待有り
Structural analysis of amide protons using high-resolution neutron crystallography

Yuya Hanazono

Japan-Taiwan Bilateral Seminar on Crystallography: “Frontier of Crystallography” 招待有り
Structure-activity relationship (SAR) study of non-secosteroidal diphenyl-carborane based VDR ligands

Hansaka N. Thilakarathne N. M., Takashi Misawa, Yosuke Demizu, Yuya Hanazono, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Shinya Fujii

4th Switzerland-Japan Biomolecular Chemistry Symposium (SJBCS2024)
Structure-activity relationship (SAR) study of hydrophobic moiety of nonsecosteroidal VDR ligands using diphenylsilane scaffold

Hansaka N. Thilakarathne N. M., Takashi Misawa, Yosuke Demizu, Yuya Hanazono, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Shinya Fujii

21st IUPAB Congress 2024
抗コロナウイルス薬の開発を志向したPDZドメイン阻害剤の探索

安藤夏乃, 天野剛志, 濱嶋竜生, 高木春樺, 花園祐矢, 沼本修孝, 伊藤暢聡, 廣明秀一

第24回日本蛋白質科学会年会
Crystal structure of B lymphocyte associated co-receptor human CD72-CTLD

Purnima Liyanage, Nobutaka Numoto, Yuya Hanazono, Takeshi Tsubata, Nobutoshi Ito

第24回日本蛋白質科学会年会
Structure-activity relationship (SAR) study of hydrophobic moiety of nonsecosteroidal VDR ligands using diphenylsilane scaffold

Hansaka N. Thilakarathne N. M., Takashi Misawa, Yosuke Demizu, Yuya Hanazono, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Shinya Fujii

第24回日本蛋白質科学会年会
ジフェニルシラン構造を基盤としたVDRリガンドの疎水性部位の構造展開と結合様式の解析

Thilakarathne N.M., Hansaka N., 影近弘之, 藤井晋也, 花園祐矢, 伊藤暢聡, 三澤隆史, 出水庸介

生体医歯工学共同研究拠点成果報告書東京医科歯科大学生体材料工学研究所
Structure-activity relationship (SAR) study of hydrophobic moiety of nonsecosteroidal VDR ligands using diphenylsilane scaffold

Hansaka N. Thilakarathne N. M., Takashi Misawa, Yosuke Demizu, Yuya Hanazono, Nobutoshi Ito, Hiroyuki Kagechika, Shinya Fujii

日本薬学会第144回年会
ペプチド結合の非平面性の解明：高分解能中性子結晶構造解析による新視点

花園祐矢, 平野優, 竹田一旗, 日下勝弘, 玉田太郎, 三木邦夫

2023年度量子ビームサイエンスフェスタ招待有り
Fine structure analysis of protein: Unraveling molecular details through ultra-high-resolution X-ray and neutron crystallography

Yuya Hanazono, Yu Hirano, Nobutoshi Ito, Taro Tamada, Kunio Miki

The 18th International Symposium of the Institute Network for Biomedical Sciences
超高分解能X線構造解析と高分解能中性子構造解析

花園祐矢

バイオインタラクション研究会第19回ワークショップ招待有り
高分解能中性子構造から明らかになったペプチド結合の非平面性

花園祐矢, 平野優, 竹田一旗, 日下勝弘, 玉田太郎, 三木邦夫

令和4年度日本結晶学会年会
高分解能中性子結晶構造解析によるペプチド結合平面性の再検証

平野優, 花園祐矢, 竹田一旗, 日下勝弘, 玉田太郎, 三木邦夫

第22回日本中性子学会年会

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共同研究・競争的資金等の研究課題

高分解能X線および中性子線回折による高電位鉄硫黄タンパク質の酸化還元反応の理解

文部科学省/日本学術振興会研究活動スタート支援 2020年 - 2021年

花園祐矢
電子状態から読み解く鉄硫黄タンパク質の酸化還元反応

文部科学省/日本学術振興会基盤研究(C)