村田亜沙子 (Asako Murata) - マイポータル

基本情報

所属: 九州大学大学院総合理工学研究院准教授

学位: 博士（生命科学）(2006年3月東京大学)

研究者番号: 50557121
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-2073-7272
J-GLOBAL ID: 201901010950382300
Researcher ID: E-9536-2016
researchmap会員ID: B000380981

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

九州大学, 大学院総合理工学研究院, 准教授
2019年12月 - 2022年3月

大阪大学, 産業科学研究所, 准教授
2012年12月 - 2019年11月

大阪大学, 産業科学研究所, 助教
2010年6月 - 2012年11月

大阪大学, 産業科学研究所, 特任研究員
2010年3月 - 2010年5月

京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 研究員
2008年3月 - 2010年2月

京都大学, 化学研究所, 博士研究員
2006年6月 - 2008年2月

米国ベイラー医科大学, 生化学・分子生物学科, 博士研究員
2006年4月 - 2006年5月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 客員共同研究員

学歴

2004年4月 - 2006年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科博士後期課程, メディカルゲノム専攻
2003年4月 - 2004年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科博士後期課程, 先端生命科学専攻
2001年4月 - 2003年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科博士前期課程, 先端生命科学専攻
1997年4月 - 2001年3月

筑波大学, 第二学群, 生物学類

論文

Clustering on Surface Plasmon Resonance Profiles to Improve Hit Assignment of Small Molecules Targeting CAG Repeat DNA

Qingwen Chen, Takeshi Yamada, Hiroaki Santo, Eitaro Murakami, Asako Murata, Yasuyuki Matsushita, Kazuhiko Nakatani

Advanced Intelligent Discovery 2025年1月15日
A machine learning approach toward generating the focused molecule library targeting CAG repeat DNA

Qingwen Chen, Takeshi Yamada, Asako Murata, Ayako Sugai, Yasuyuki Matsushita, Kazuhiko Nakatani

Digital Discovery 3 243-248 2024年1月査読有り
A New Small Molecule DoNA Binding to CAG Repeat RNA

Qingwen Chen, Takeshi Yamada, Koichi Miyagawa, Asako Murata, Mitsuo Shoji, Kazuhiko Nakatani

Bioorganic & Medicinal Chemistry 98 117580 2023年12月査読有り
FUS regulates RAN translation through modulating the G-quadruplex structure of GGGGCC repeat RNA in C9orf72-linked ALS/FTD.

Yuzo Fujino, Morio Ueyama, Taro Ishiguro, Daisaku Ozawa, Hayato Ito, Toshihiko Sugiki, Asako Murata, Akira Ishiguro, Tania Gendron, Kohji Mori …

eLife 12 2023年7月18日査読有り
Inhibitory Effects of Mismatch Binding Molecules on the Repair Reaction of Uracil-Containing DNA

Anisa Ulhusna, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani

BIOCHEMISTRY 61 2522-2530 2022年10月査読有り
Method for Identifying Sequence Motifs in Pre-miRNAs for Small-Molecule Binding

Yusuke Takashima, Asako Murata, Kei Iida, Ayako Sugai, Masatoshi Hagiwara, Kazuhiko Nakatani

ACS CHEMICAL BIOLOGY 17(10) 2817-2827 2022年9月23日責任著者
Premature translation termination mediated non-ER stress induced ATF6 activation by a ligand-dependent ribosomal frameshifting circuit

Hsiu-Ting Hsu, Asako Murata, Chikara Dohno, Kazuhiko Nakatani, KungYao Chang

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 50(9) 5369-5383 2022年5月査読有り
Mismatch binding ligand upregulated back-splicing reaction producing circular RNA in a cellular model

Lu Ni, Takeshi Yamada, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani

CHEMICAL COMMUNICATIONS 58(22) 3629-3632 2022年3月
HT-SELEX-based identification of binding pre-miRNA hairpin-motif for small molecules

Sanjukta Mukherjee, Asako Murata, Ryoga Ishida, Ayako Sugai, Chikara Dohno, Michiaki Hamada, Sudhir Krishna, Kazuhiko Nakatani

MOLECULAR THERAPY-NUCLEIC ACIDS 27 165-174 2022年3月査読有り
2-Amino-1,8-naphthyridine Dimer (ANP77), a High-Affinity Binder to the Internal Loops of C/CC and T/CC Sites in Double-Stranded DNA

Bimolendu Das, Konami Nagano, Gota Kawai, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani

JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY 87(1) 340-350 2021年12月査読有り
A small-molecule fluorescence probe ANP77 for sensing RNA internal loop of C, U and A/CC motifs and their binding molecules

Bimolendu Das, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani

Nucleic Acids Research 49(15) 8462-8470 2021年9月7日査読有り
Speeding drug discovery targeting RNAs: An iterative “RNA selection-compounds screening cycle“ for exploring RNA-small molecule pairs

Tomoko Furuzono, Asako Murata, Satoshi Okuda, Kenji Mizutani, Tsuyoshi Adachi, Kazuhiko Nakatani

Bioorganic & Medicinal Chemistry 36 116070-116070 2021年4月査読有り
Small Molecule-Induced Dimerization of Hairpin RNA Interfered with the Dicer Cleavage Reaction.

Asako Murata, Yuki Mori, Yue Di, Ayako Sugai, Bimolendu Das, Yusuke Takashima, Kazuhiko Nakatani

Biochemistry 60(4) 245-249 2021年2月2日査読有り筆頭著者
The dimeric form of 1,3-diaminoisoquinoline derivative rescued the mis-splicing of Atp2a1 and Clcn1 genes in myotonic dystrophy type 1 mouse model.

Kazuhiko Nakatani, Jun Matsumoto, Masayuki Nakamori, Tatsumasa Okamoto, Asako Murata, Chikara Dohno

Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) 2020年5月25日査読有り
A slipped-CAG DNA-binding small molecule induces trinucleotide-repeat contractions in vivo.

Masayuki Nakamori, Gagan B Panigrahi, Stella Lanni, Terence Gall-Duncan, Hideki Hayakawa, Hana Tanaka, Jennifer Luo, Takahiro Otabe, Jinxing Li, Akihiro Sakata …

Nature genetics 52(2) 146-159 2020年2月査読有り
RT-Hpro-PCR: A MicroRNA Detection System Using a Primer with a DNA Tag

Takei Fumie, Akiyama Misaki, Murata Asako, Sugai Ayako, Nakatani Kazuhiko, Yamashita Ichiro

CHEMBIOCHEM 21(4) 2019年11月7日査読有り
Structural insights into synthetic ligands targeting A–A pairs in disease-related CAG RNA repeats

Mukherjee, S, Błaszczyk, L, Rypniewski, W, Falschlunger, C, Micura, R, Murata, A, Dohno, C, Nakatani, K, Kiliszek, A

Nucl. Acids Res. 47(20) 10906-10913 2019年11月査読有り
Modulating RNA secondary and tertiary structures by mismatch binding ligands

Murata Asako, Nakamori Masayuki, Nakatani Kazuhiko

METHODS 167 78-91 2019年9月1日査読有り筆頭著者
Inhibition of pre-miRNA-136 processing by Dicer with small molecule BzDANP suggested the formation of ternary complex of pre-miR-136-BzDANP-Dicer

Otabe Takahiro, Nagano Konami, Kawai Gota, Murata Asako, Nakatani Kazuhiko

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY 27(10) 2140-2148 2019年5月15日査読有り
A Dimeric 2,9-Diamino-1,10-phenanthroline Derivative Improves Alternative Splicing in Myotonic Dystrophy Type 1 Cell and Mouse Models

Li Jinxing, Nakamori Masayuki, Matsumoto Jun, Murata Asako, Dohno Chikara, Kiliszek Agnieszka, Taylor Katarzyna, Sobczak Krzysztof, Nakatani Kazuhiko

CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL 24(68) 18115-18122 2018年12月5日査読有り

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MISC

次世代を担う女性研究者マイクロRNA前駆体を標的とする低分子化合物の探索研究

村田亜沙子

化学工業 67(4) 275-280 2016年4月招待有り筆頭著者
アカデミア創薬研究の今を知る《注目の標的からの創薬展開》6.顕在化した創薬標的マイクロRNA(miRNA)

村田亜沙子, 中谷和彦

実験医学 32(2) 160-165 2014年2月招待有り筆頭著者
生理活性物質による創薬標的同定のコツ

佐藤慎一, 村田亜沙子, 白川貴詩, 上杉志成

実験医学別冊創薬研究のためのタンパク質・プロテオミクス解析 141-146 2010年7月招待有り
ケミカルジェネティクス:化学が教えてくれる生命機能海洋天然物のケミカルジェネティクス

佐藤慎一, 村田亜沙子, 上杉志成

細胞工学 28(4) 332-337 2009年4月招待有り
iPS細胞誕生後 iPS細胞作製を効率化する化合物

村田亜沙子, 上杉志成

現代化学 (452) 37-39 2008年10月招待有り筆頭著者
Identification of the Cardiac Beta-Adrenergic Receptor Protein: Solubilization and Purification by Affinity Chromatography

佐藤慎一, 村田亜沙子, 上杉志成

蛋白質核酸酵素 52(13) 1782-1783 2007年10月招待有り
ゲノムを臨床につなげる薬の世界生物医学研究を加速するケミカルゲノミクス

村田亜沙子, 佐藤慎一, 上杉志成, 上杉志成

最新医学 62 2205-2213 2007年9月招待有り筆頭著者

主要な講演・口頭発表等

115

Interaction between a small molecule, NA, and an RNA with the ACG/AUA internal loop

Aina Fujiwara, Qingwen Chen, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani, Gota Kawai

第50回国際核酸化学シンポジウム 2023年11月1日
Machine learning assisted classification of small molecules targeting CAG repeat DNA

Qingwen Chen, Takeshi Yamada, Asako Murata, Yasuyuki Matsushita, Kazuhiko Nakatani

第49回国際核酸化学シンポジウム 2022年11月3日
Evaluation of the effect of small-molecule binding to mRNA on ribosomal frameshifting in SARS-CoV-2

Asako Murata, Hiyori Fujii, Risa Anami, Ayako Sugai, Kazuhiko Nakatani

第49回国際核酸化学シンポジウム 2022年11月3日
A Fluorescence Probe ANP77 for Sensing RNA Internal Loops and Their Binding Molecules

Bimolendu Das, Asako Murata, Kazuhiko Nakatani

第49回国際核酸化学シンポジウム 2022年11月3日
A rapid method for obtaining the interacting pairs of RNA-small molecule and its statistical analysis

Yusuke Takashima, Asako Murata, Ayako Sugai, Kazuhiko Nakatani

第49回国際核酸化学シンポジウム 2022年11月2日
Comprehensive analysis of small molecule-target RNA pairs toward profiling small-molecule binders of RNA

Asako Murata, Yusuke Takashima, Ayumu Asai, Kazuhiko Nakatani

第44回分子生物学会年会 (MBSJ2020) 招待有り
RNAを標的とする低分子の探索と応用

村田亜沙子

核酸化学若手フォーラム2021 招待有り
Comprehensive Analysis of Dicer Substrates by High-Throughput Sequencing Identified New Target RNA Motifs for Small Molecules

Asako Murata, Yusuke Takashima, Kei Iida, Ayako Sugai, Masatoshi Hagiwara, Kazuhiko Nakatani

第43回分子生物学会年会 (MBSJ2020) 招待有り
小分子による–1リボソーマルフレームシフト誘起とタンパク質の輸送・局在制御への応用

村田亜沙子, 松本咲, 洪昌峰, 中谷和彦

第38回分子生物学会年会第88回日本生化学会合同大会招待有り
RNAの構造・機能を制御する小分子化合物の開発

村田亜沙子

日本化学会第94春季年会招待有り
Fluorescent indicator displacement assay for the discovery of RNA-binding ligands

Asako Murata, Yasue Harada, Takeo Fukuzumi, Shiori Umemoto, Seongwang Im, Masaki Hagihara, Kazuhiko Nakatani

第34回分子生物学会年会招待有り

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担当経験のある科目(授業)

2023年 - 現在

核酸化学 (九州大学)
2024年4月 - 2025年9月

機能生物化学特別講義I (福岡大学)
2014年 - 2021年

ゲノム化学 (大阪大学)
2017年 - 2018年

化学要論 (大阪大学)

所属学協会

2025年2月 - 現在

日本薬学会
2023年6月 - 現在

情報計算化学生物学会（CBI学会）
2018年 - 現在

日本核酸化学会
2012年 - 現在

日本ケミカルバイオロジー学会
2002年12月 - 現在

日本化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

低分子化合物－RNAペアの網羅的探索手法の確立と獲得ビッグデータの情報科学解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

村田亜沙子
低分子が誘起する新奇RNA立体構造の実証

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2024年3月

村田亜沙子
小分子で駆動する－１リボソームフレームシフトとタンパク質の輸送局在制御への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

村田亜沙子
－１リボソーマルフレームシフトによる細胞内タンパク質の輸送・局在制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2015年4月 - 2019年3月

村田亜沙子
リピート結合分子をプローブとしたトリヌクレオチドリピート病の化学生物学研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別推進研究特別推進研究 2014年 - 2018年

中谷和彦, 堂野主税, 村田亜沙子, 中森雅之, 武井史恵
小分子化合物によるマイクロRNA生成効率の調節

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

村田亜沙子
８位置換プリン化合物ライブラリーの合成とリボスイッチリエンジニアリング

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2011年4月 - 2015年3月

中谷和彦, 武井史恵, 萩原正規, 堂野主税, 村田亜沙子, 福澄岳雄, 相川春夫
非内在性マイクロＲＮＡの創成と遺伝子発現制御

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2011年 - 2012年

村田亜沙子

産業財産権

特許第6246125号多能性細胞を選別するための方法

上杉志成, 平田直, 村田亜沙子, チャンヨンテ, 中辻憲夫, 末盛博文, 川瀬栄八郎, 山内香織, 植田和光, 藤林悠人, 山中伸弥, 中川誠人

村田亜沙子

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

主要な講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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