柴田穣 (Yutaka Shibata) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学大学院理学研究科・理学部化学専攻物理化学講座有機物理化学研究室准教授

学位: 博士（理学）(大阪大学)

J-GLOBAL ID: 201201096869979199
researchmap会員ID: 7000000467

外部リンク: http://db.tohoku.ac.jp/whois/detail/27408bb228393e990d55fcf3635a731e.html

研究分野

論文

117

Revealing the diversity of in vivo photosystem I light-harvesting antennae

Xianjun Zhang, Rin Taniguchi, Shen Ye, Yutaka Shibata

Plant Physiology 198(2) 2025年5月30日
Access to the Antenna System of Photosystem I via Single-Molecule Excitation–Emission Spectroscopy

Xianjun Zhang, Rin Taniguchi, Ryo Nagao, Tatsuya Tomo, Takumi Noguchi, Shen Ye, Yutaka Shibata

The Journal of Physical Chemistry B 128(11) 2664-2674 2024年3月8日
Development of Line-Detected UV–Vis Absorption Microscope and Its Application to Quantitative Evaluation of Lithium Surface Reactivity

Ken-ichi Inoue, Jianxin Mao, Rika Okamoto, Yutaka Shibata, Wenbo Song, Shen Ye

Analytical Chemistry 2023年2月24日
An oxygenic photosynthetic mechanism for using infrared in an Antarctic alga

Makiko Kosugi, Masato Kawasaki, Yutaka Shibata

Journal of the Atomic Energy Society of Japan 65(11) 670-673 2023年
Accumulation of quenched LHCII around PSI in Chlamydomonas cells in state2 revealed by cryo-fluorescence lifetime imaging

Yuki Fujita, XianJun Zhang, Ahmed Mohamed, Shen Ye, Yutaka Shibata

Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology 236 112584-112584 2022年11月
State transition is quiet around pyrenoid and LHCII phosphorylation is not essential for thylakoid deformation in Chlamydomonas 137c

XianJun Zhang, Yuki Fujita, Naoya Kaneda, Ryutaro Tokutsu, Shen Ye, Jun Minagawa, Yutaka Shibata

Proceedings of the National Academy of Sciences 119(37) 2022年9月6日
Exciton quenching by oxidized chlorophyll Z across the two adjacent monomers in a photosystem II core dimer

Ahmed Mohamed, Shunsuke Nishi, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Shigeru Itoh, Hiroshi Fukumura, Yutaka Shibata

Photosynthesis Research 2022年8月17日
Uphill energy transfer mechanism for photosynthesis in the Antarctic alga

Makiko Kosugi, Masato Kawasaki, Yutaka Shibata, Kojiro Hara, Shinichi Takaichi, Toshio Moriya, Naruhiko Adachi, Yasuhiro Kamei, Yasuhiro Kashino, Sakae Kudoh …

2021年8月5日
High-Speed Excitation-Spectral Microscopy Uncovers In Situ Rearrangement of Light-Harvesting Apparatus in Chlamydomonas during State Transitions at Submicron Precision

Xian Jun Zhang, Yuki Fujita, Ryutaro Tokutsu, Jun Minagawa, Shen Ye, Yutaka Shibata

Plant and Cell Physiology 2021年4月2日
Chlamydomonas State Transition Is Quiet Around Pyrenoid and Independent from Thylakoid Deformation

XianJun Zhang, Yuki Fujita, Naoya Kaneda, Ryutaro Tokutsu, Shen Ye, Jun Minagawa, Yutaka Shibata

bioRxiv 2021年1月査読有り
A gold nanoparticle conjugate with photosystem I and photosystem II for development of a biohybrid water-splitting photocatalyst

Kousuke Kawahara, Natsuko Inoue-Kahino, Keisuke Namie, Yuki Kato, Tatsuya Tomo, Yutaka Shibata, Yasuhiro Kashino, Takumi Noguchi

Biomedical Spectroscopy and Imaging 9(1-2) 73-81 2020年5月15日査読有り
Development of a Multicolor Line-Focus Microscope for Rapid Acquisitions of Excitation Spectra

Sakar Jana, Yutaka Shibata

Biophysical Journal 118 36-43 2020年1月査読有り責任著者
Identification of assembly precursors to photosystems emitting fluorescence at 683 nm and 687 nm by cryogenic fluorescence microspectroscopy

Tomofumi Chiba, Yutaka Shibata

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 1860 2019年12月査読有り責任著者
Enhanced Fluorescence Emission and Magnetic Alignment Control of Biphasic Functionalized Composite Janus Particles

Naonari Sakamoto, Yutaro Hirai, Tsunenobu Onodera, Takuma Dezawa, Yutaka Shibata, Hitoshi Kasai, Hidetoshi Oikawa, Hiroshi Yabu

Particle & Particle Systems Characterization 36(1) 1800311-1800311 2019年1月査読有り
Redox-state dependent blinking of single photosystem I trimers at around liquid-nitrogen temperature

Sankar Jana, Ting Du, Ryo Nagao, Takumi Noguchi, Yutaka Shibata

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 1860 30-40 2019年1月査読有り責任著者
Fabrication of Au-conjugated polymer hybridized nanoparticles and their optical properties

Naonari Sakamoto, Tsunenobu Onodera, Hidetoshi Oikawa, Takuma Dezawa, Yutaka Shibata

e-J. Surf. Sci., Nanotech. in press 2018年11月査読有り
Imaging of intracellular rearrangement of photosynthetic proteins in Chlamydomonas cells upon state transition

Yuki Fujita, Wakana Ito, Kento Washiyama, Yutaka Shibata

Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology 185 111-116 2018年8月査読有り責任著者
Red shift in the spectrum of a chlorophyll species is essential for the drought-induced dissipation of excess light energy in a poikilohydric moss, Bryum argenteum

Yutaka Shibata, Ahmed Mohamed, Koichiro Taniyama, Kentaro Kanatani, Makiko Kosugi, Hiroshi Fukumura

PHOTOSYNTHESIS RESEARCH 136(2) 229-243 2018年5月査読有り
Single bovine serum albumin molecule can hold plural blue-emissive gold nanoclusters: A quantitative study with two-photon excitation

Hamza Al Kindi, Ahmed Mohamed, Shinji Kajimoto, Nurbosyn Zhanpeisov, Hideyuki Horino, Yutaka Shibata, Izabela I. Rzeznicka, Hiroshi Fukumura

Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry 357 168-174 2018年4月15日査読有り
InVivo Energy Transfer from Bacteriochlorophyllc, d, e, or f to Bacteriochlorophylla in Wild-Type and Mutant Cells of the Green Sulfur Bacterium Chlorobaculum limnaeum

Harada Jiro, Shibata Yutaka, Teramura Misato, Mizoguchi Tadashi, Kinoshita Yusuke, Yamamoto Ken, Tamiaki Hitoshi

CHEMPHOTOCHEM 2(3) 190-195 2018年3月査読有り

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MISC

Protein-protected Au nanoclusters for deep-tissue imaging

RZEZNICKA Izabela, SHIBATA Yutaka, FUKUMURA Hiroshi

芝浦工業大学特別教育・研究報告集(CD-ROM) 2016 118‐121 2017年7月31日
光合成系の光捕集過程を構造に立脚して理解する：理論と実験の融合で見えてきたこと

柴田穣

日本物理学会誌 69(9) 639-643 2014年9月
開口数0.9を持つ極低温顕微鏡の開発

柴田穣, 加藤渉, 浪江慶祐

分光研究 63(3) 103-105 2014年
26aXC-1 植物型光合成反応中心の光捕集過程 : 構造情報に基づく理解2(26aXC 化学物理1,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

柴田穣, 西俊輔, 川上恵典, 沈建仁, Renger Thomas

日本物理学会講演概要集 68(1) 414-414 2013年3月26日
光合成系での光捕集過程を構造に立脚して理解する

柴田穣

光合成研究 21(3) 128-134 2011年12月1日
27pHC-12 結晶構造情報に基づくシミュレーションによる光化学系II反応中心の時間分解蛍光スペクトルの解析(27pHC 非線形光学/超高速現象,領域5(光物性))

柴田穣, 西俊輔, 野地智康, 川上恵典, 沈建仁, Renaer Thomas

日本物理学会講演概要集 66(1) 794-794 2011年3月3日
23pED-2 植物型光合成反応中心の光捕集過程 : 構造情報に基づく理解(23pED 光応答・化学反応・ダイナミクス,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

柴田穣, 西俊輔, 山岸篤史, 小村理行

日本物理学会講演概要集 65(1) 409-409 2010年3月1日
光合成反応中心における光誘起電荷分離のエネルギーギャップ△Gの奇妙な温度依存性

柴田穣, 伊藤繁, 池上勇

2008年12月1日
23pYD-2 極低温1分子蛍光の偏光異方性解析による、色素巨大会合体でできた光合成アンテナ複合体クロロゾーム内部の遷移双極子分布の解明(生物物理,領域12,ソフトマター物理,科学物理,生物物理)

柴田穣, 佐賀佳央, 立石新悟, 中林正助, 民秋均, 伊藤繁

日本物理学会講演概要集 63(1) 357-357 2008年2月29日
Investigation of Photoprotection Mechanism and Its Diversity in Dry Lichen Studied by Fluorescence Lifetime Analysis

KOMURA Masayuki, SHIBATA Yutaka, IWASAKI Ikuko, ITOH Shigeru

Journal of plant research 119 95-96 2006年12月1日
15pTA-5 光合成アンテナ色素超分子クロロソームの極低温 1 分子観測(生物物理, 領域 12)

柴田穣, 佐賀佳央, 民秋均, 伊藤繁

日本物理学会講演概要集 59(2) 313-313 2004年8月25日
Temperature dependence of delayed-fluorescence dynamics of ether-treated PSI reaction center

Y Shibata, T Kasahara, S Akai, S Itoh, Ikegami, I

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 45 S43-S43 2004年
蛋白質ナノスペースにおける超高速光反応フェムト秒蛍光減衰にみられる量子ビート

又賀昇, CHOSROWJAN H, 柴田穣, 谷口誠治

日本化学会講演予稿集 81st(1) 2002年
光活性蛋白質PYPのナノスペースにおけるフェムト秒-ピコ秒蛍光ダイナミクスと量子ビート

CHOSROWJAN H, 又賀昇, 柴田穣, 谷口誠治, 今元泰, 徳永史生

日本化学会講演予稿集 81st(1) 2002年
時間分解ホールバーニング分光法による蛋白質構造揺らぎの時間領域観測

柴田穣

生物物理 40(5) 331-335 2000年9月25日
Time-Domain Observation of Conformational Fluctuation of Protein by Time-Resolved Hole-Burning Spectroscopy

Yutaka Shibata

Science Progress 83 193-208 2000年8月1日
22pZ-6 時間分解ホールバーニング分光による酵素蛋白質の構造揺らぎ

柴田穣

日本物理学会講演概要集 55(1) 282-282 2000年3月10日
水溶性ポルフィリン会合体のフェムト秒励起状態ダイナミクス

三浦篤志, 松村和夫, 玉井尚登, CHOSROWJAN H, 柴田穣, 又賀昇

光化学討論会講演要旨集 1999 1999年
26p-S-9 フェムト秒蛍光測定によるZnポルフィリン誘導体-ナフチルイミド超分子系の高励起状態からの電子移動ダイナミクス

柴田穣, コスロービアンハイク, 又賀昇, 大須賀篤弘

日本物理学会講演概要集 53(2) 826-826 1998年9月5日
6p-YL-8 時間分解過渡的ホールバーニング分光による色素-溶媒系の遅い揺らぎの観察

栗田厚, 松本一紀, 柴田穣, 櫛田孝司

日本物理学会講演概要集 52(2) 766-766 1997年9月16日

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書籍等出版物

植物生理学・発生学

Lincoln Taiz, Eduardo Zeiger, Ian Max Moller, Angus, Murphy (担当:共訳, 範囲:7章)

講談社 2017年2月
テイツ/ザイガー植物生理学・発生学第6版

柴田穣 (担当:共訳, 範囲:7章)

講談社 2017年
光合成のエネルギー変換と物質変換

柴田穣 (担当:分担執筆, 範囲:高速分光による電子とエネルギー移動解析)

化学同人 2015年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

南極藻類に見つかったアップヒル型励起エネルギー移動メカニズムと進化プロセスの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

小杉真貴子, 柴田穣, 米田勇祐
単粒子分光解析による過渡的光合成超複合体のエネルギー移動過程の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2026年3月

柴田穣
RNAプローブと網羅的単一分子分光による新規合成途上光合成色素タンパク質の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2023年3月

柴田穣
ハイスループット単一分子分光による光合成タンパク質のassembly中間体の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

柴田穣, 高橋裕一郎, 鞆達也
極低温顕微分光による光合成研究の新展開

科学研究費補助金（基盤研究Ｂ） 2015年4月 - 2018年3月

柴田穣
振電バンド観測による光合成タンパク質の１分子振動分光

海外特別研究員奨励費 2015年9月 - 2017年9月

柴田穣
励起スペクトル−蛍光スペクトル同時取得可能な走査型光学顕微鏡の開発

科学研究費補助金（挑戦的萌芽研究） 2014年4月 - 2016年3月

柴田穣
新開発の極低温蛍光顕微鏡で観測する光合成タンパク質の動的性質

科学研究費補助金（基盤研究Ｂ） 2012年4月 - 2015年3月

柴田穣
微気象観測と生理学的実験手法を用いた、南極陸上生物の生理生態の解明

科学研究費補助金（若手研究Ｂ） 2012年4月 - 2014年3月

小杉真貴子
１分子蛍光分光による光合成タンパク質の光捕集機構の解明

山田科学振興財団研究援助金 2012年4月 - 2013年3月

柴田穣
極低温２光子励起顕微鏡による光合成系光エネルギー捕集ダイナミクスの観測

科学研究費補助金（若手研究Ｂ） 2009年4月 - 2012年3月

柴田穣
室温から極低温までのピコ・フェムト秒蛍光分光による光合成反応初期過程の研究

科学研究費補助金（若手研究Ｂ） 2005年4月 - 2007年3月

柴田穣
新型低エネルギー光合成植物の作成:人為進化への試み

科学研究費補助金（基盤研究Ｂ） 2005年4月 - 2007年3月

伊藤繁
新型光合成の機能と構造から反応中心構築原理を探る

科学研究費補助金（基盤研究Ｂ） 2003年4月 - 2005年3月

伊藤繁
光合成タンパク質複合体の構造形成過程の追跡

科学研究費補助金（若手研究Ｂ） 2002年4月 - 2004年3月

柴田穣
蛋白質ナノスペースにおいて超高速・高効率光反応が特異的に起こるのは何故か

科学研究費補助金（基盤研究Ｃ） 2001年4月 - 2003年3月

又賀昇
フェムト秒蛍光測定による亜鉛クロロフィルを使う光合成生物の光化学反応の解析

島津科学技術振興財団研究開発助成金 2001年4月 - 2002年3月

柴田穣
時間分解ホールバーニング分光法を用いた蛋白質構造ダイナミクスの研究

科学研究費補助金（特定領域研究） 1999年4月 - 2001年3月

柴田穣
分子内プロトン移動過程における分子振動の選択的励起の効果

さきがけ研究２１ 1997年10月 - 2000年9月

柴田穣
時間分解ホ-ルバ-ニングによる蛋白質の構造ダイナミクスの研究

科学研究費補助金（奨励研究Ａ） 1998年4月 - 1999年3月

柴田穣

社会貢献活動

化学への招待

その他

2012年8月3日 - 2012年8月4日

その他

１分子蛍光分光による光合成タンパク質の光捕集機構の解明

2012年10月 - 2012年10月

１分子蛍光分光による光合成タンパク質の光捕集機構の解明

柴田穣

基本情報

研究分野

論文

MISC

書籍等出版物

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

その他

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