川口茜 (Akane Kawaguchi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所分子生命史研究室助教 (助教)

学位: バイオサイエンス博士(2014年3月奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科)

J-GLOBAL ID: 202201020420478390
researchmap会員ID: R000033888

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 発生生物学 /

経歴

2022年7月 - 現在

国立遺伝学研究所, 分子生命史研究室 (主宰：工樂樹洋先生), 助教 (助教)
2017年1月 - 2022年6月

オーストリア分子病理研究所, Animal regeneration (Dr. Elly Tanaka Lab), ポスドク研究員
2015年11月 - 2016年12月

ドレスデン再生医療研究センター, (Dr. Elly Tanaka Lab), ポスドク研究員
2014年4月 - 2015年10月

長浜バイオ大学, アニマルバイオサイエンス学科（荻野研究室）, CREST研究員

学歴

2011年4月 - 2014年3月

奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 博士課程（荻野肇先生）
2009年4月 - 2011年3月

奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 修士課程（荻野肇先生）
2009年3月

長浜バイオ大学, バイオサイエンス学科（和田修一先生）

受賞

論文

A chromatin code for limb segment identity in axolotl limb regeneration.

Akane Kawaguchi, Jingkui Wang, Dunja Knapp, Prayag Murawala, Sergej Nowoshilow, Wouter Masselink, Yuka Taniguchi-Sugiura, Ji-Feng Fei, Elly M Tanaka

Developmental cell 2024年5月21日筆頭著者
Development of a heat-stable alkaline phosphatase reporter system for cis-regulatory analysis and its application to 3D digital imaging of Xenopus embryonic tissues.

Kiyo Sakagami, Takeshi Igawa, Kaori Saikawa, Yusuke Sakaguchi, Nusrat Hossain, Chiho Kato, Kazuhito Kinemori, Nanoka Suzuki, Makoto Suzuki, Akane Kawaguchi …

Development, growth & differentiation 2024年3月4日
Chromatin organization and behavior in HRAS-transformed mouse fibroblasts

Aoi Otsuka, Katsuhiko Minami, Koichi Higashi, Akane Kawaguchi, Sachiko Tamura, Satoru Ide, Michael J. Hendzel, Ken Kurokawa, Kazuhiro Maeshima

Chromosoma 2023年11月21日査読有り
The shh limb enhancer is activated in patterned limb regeneration but not in hypomorphic limb regeneration in Xenopus laevis

Reimi Tada, Takuya Higashidate, Takanori Amano, Shoma Ishikawa, Chifuyu Yokoyama, Suzu Kobari, Saki Nara, Koshiro Ishida, Akane Kawaguchi, Haruki Ochi …

Developmental Biology 500 22-30 2023年5月
Emergence of novel cephalopod gene regulation and expression through large-scale genome reorganization.

Hannah Schmidbaur, Akane Kawaguchi, Tereza Clarence, Xiao Fu, Oi Pui Hoang, Bob Zimmermann, Elena A Ritschard, Anton Weissenbacher, Jamie S Foster, Spencer V Nyholm …

Nature communications 13(1) 2172-2172 2022年4月21日査読有り筆頭著者
Squalomix: shark and ray genome analysis consortium and its data sharing platform.

Osamu Nishimura, John Rozewicki, Kazuaki Yamaguchi, Kaori Tatsumi, Yuta Ohishi, Tazro Ohta, Masaru Yagura, Taiki Niwa, Chiharu Tanegashima, Akinori Teramura …

F1000Research 11 1077-1077 2022年
The giant axolotl genome uncovers the evolution, scaling, and transcriptional control of complex gene loci.

Siegfried Schloissnig, Akane Kawaguchi, Sergej Nowoshilow, Francisco Falcon, Leo Otsuki, Pietro Tardivo, Nataliya Timoshevskaya, Melissa C Keinath, Jeramiah James Smith, S Randal Voss …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118(15) 2021年4月13日筆頭著者
Giant lungfish genome elucidates the conquest of land by vertebrates.

Axel Meyer, Siegfried Schloissnig, Paolo Franchini, Kang Du, Joost M Woltering, Iker Irisarri, Wai Yee Wong, Sergej Nowoshilow, Susanne Kneitz, Akane Kawaguchi …

Nature 590(7845) 284-289 2021年2月
Noncanonical Hox, Etv4, and Gli3 gene activities give insight into unique limb patterning in salamanders.

Constanze Bickelmann, Gabriela Neiva Frota-Lima, Sandra Karla Triepel, Akane Kawaguchi, Igor Schneider, Nadia Belinda Fröbisch

Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution 330(3) 138-147 2018年5月
Draft genome of Dugesia japonica provides insights into conserved regulatory elements of the brain restriction gene nou-darake in planarians.

Yang An, Akane Kawaguchi, Chen Zhao, Atsushi Toyoda, Ali Sharifi-Zarchi, Seyed Ahmad Mousavi, Reza Bagherzadeh, Takeshi Inoue, Hajime Ogino, Asao Fujiyama …

Zoological letters 4 24-24 2018年
Co-accumulation of cis-regulatory and coding mutations during the pseudogenization of the Xenopus laevis homoeologs six6.L and six6.S.

Haruki Ochi, Akane Kawaguchi, Mikio Tanouchi, Nanoka Suzuki, Tatsuki Kumada, Yui Iwata, Hajime Ogino

Developmental biology 427(1) 84-92 2017年7月1日
Asymmetrically reduced expression of hand1 homeologs involving a single nucleotide substitution in a cis-regulatory element.

Haruki Ochi, Nanoka Suzuki, Akane Kawaguchi, Hajime Ogino

Developmental biology 425(2) 152-160 2017年5月15日
Live Imaging of Axolotl Digit Regeneration Reveals Spatiotemporal Choreography of Diverse Connective Tissue Progenitor Pools.

Joshua D Currie, Akane Kawaguchi, Ricardo Moreno Traspas, Maritta Schuez, Osvaldo Chara, Elly M Tanaka

Developmental cell 39(4) 411-423 2016年11月21日
Epigenetic modification maintains intrinsic limb-cell identity in Xenopus limb bud regeneration.

Shinichi Hayashi, Akane Kawaguchi, Ikuo Uchiyama, Aiko Kawasumi-Kita, Takuya Kobayashi, Hiroyo Nishide, Rio Tsutsumi, Kazuhiko Tsuru, Takeshi Inoue, Hajime Ogino …

Developmental biology 406(2) 271-82 2015年10月15日
Application of the cis-regulatory region of a heat-shock protein 70 gene to heat-inducible gene expression in the ascidian Ciona intestinalis.

Akane Kawaguchi, Nanami Utsumi, Maki Morita, Aya Ohya, Shuichi Wada

Genesis (New York, N.Y. : 2000) 53(1) 170-82 2015年1月
Evolution of a tissue-specific silencer underlies divergence in the expression of pax2 and pax8 paralogues.

Haruki Ochi, Tomoko Tamai, Hiroki Nagano, Akane Kawaguchi, Norihiro Sudou, Hajime Ogino

Nature communications 3 848-848 2012年5月22日
Comparative expression analysis of the H3K27 demethylases, JMJD3 and UTX, with the H3K27 methylase, EZH2, in Xenopus.

Akane Kawaguchi, Haruki Ochi, Norihiro Sudou, Hajime Ogino

The International journal of developmental biology 56(4) 295-300 2012年

MISC

DNAの核内立体構造を捉える

川口茜

月刊「細胞」 55(2) 2023年1月招待有り
Chromosome Conformation Capture for Large Genomes.

Akane Kawaguchi, Elly M Tanaka

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2562 291-318 2023年招待有り
ゲノム倍加後のコード配列進化におけるエンハンサー減衰変異の促進的役割

荻野肇, 越智陽城, 川口茜

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
ヒストン脱メチル化因子Jmjd3による眼形成遺伝子pax6の発現制御

川口茜, 越智陽城, 須藤則広, 荻野肇

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 87th 2015年
The H3K27 demethylase, Jmjd3, is essential for activation of pax6 during eye development

Akane Kawaguchi, Haruki Ochi, Hajime Ogino

GENES & GENETIC SYSTEMS 360(6) 360 2015年招待有り筆頭著者
ヒストンH3K27脱メチル化因子による細胞分化コンピテンスの制御

荻野肇, 須藤則広, 川口茜, 越智陽城

日本動物学会大会予稿集 85th 2014年
ヒストン脱メチル化因子Jmjd3による眼形成遺伝子Pax6の発現制御

川口茜, 越智陽城, 須藤則広, 荻野肇

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 86th 2014年
ヒストンのメチル化制御はツメガエル幼生の尾部再生に必要である

川口茜, 荻野肇

日本動物学会大会予稿集 85th 2014年
Differential use of paralogous genes via evolution of cis-regulatory elements for divergent expression specificities

Haruki Ochi, Akane Kawaguchi, Hajime Ogino

New Principles in Developmental Processes 2014年査読有り招待有り
ツメガエル幼生の尾部再生時におけるヒストンメチル化制御因子の働き

川口茜, 川口茜, 越智陽城, 須藤則広, 荻野肇

日本動物学会大会予稿集 84th 2013年
Functional analysis of the histone H3K27 methyltransferase and demethylase in Xenopus embryonic development

Akane Kawaguchi, Haruki Ochi, Norihiro Sudou, Makoto Okano, Hajime Ogino

DIFFERENTIATION 80 S28-S28 2010年11月
Evolution of a fail-safe regulatory system for kidney development

Haruki Ochi, Chihiro Uchiyama, Akane Kawaguchi, Hajime Ogino

DIFFERENTIATION 80 S27-S27 2010年11月

講演・口頭発表等

核内染色体高次構造の"プロポーショナル"なサイズ変化と拘束性

川口茜

国立遺伝学研究所 2024 年度 NIG-JOINT 研究会第 2 回「倍数性研究会＋サイズ生物学研究会」ジョイント研究会 2024年9月招待有り
エピゲノム・クロマチン制御から紐解く器官再生の普遍原理

川口茜

令和6年遺伝研究会クロマチン・細胞核構造の動的変換とゲノム機能制御 2024年9月招待有り
Epigenetic Dynamics から紐解く脊椎動物の再生と進化

川口茜

日本動物学会年会長崎大会シンポジウム12：水生動物から考える発生・再生・進化における核内イベントの役割 2024年9月招待有り
脊椎動物の転写制御とゲノムの進化が多面的な表現型を付与する意義の研究

川口茜

日本発生生物学会第一回JSDB Frontiers Prize受賞記念講演 2024年6月招待有り
Epigenetic Profilingから有尾両生類の再生能力を紐解く

川口茜

国立遺伝学研究所第2回ゲノムモデリング研究会 2024年2月招待有り
A chromatin code for limb segment identity in regeneration

川口茜

分子生物学会年会第46回神戸大会シンポジウム「生命の3ドメインから切り開くクロマチン進化学」 2023年12月招待有り
巨大染色体のChromatin dynamicsからアホロートルの四肢再生能力に迫る

川口茜

東京工業大学セミナー 2023年10月招待有り
両生類の発生・再生における多階層な転写制御機構の解析

川口茜

動物学会山形大会年会シンポジウム「新技術×両生類から生まれる新たなコンセプト」 2023年9月招待有り
巨大染色体の相互作用地図から我々は何を学ぶのか：染色体制御の普遍性と特殊進化の理解に挑む

川口茜

学変(B) 性染色体サイクル: 第一回領域班会議 2023年2月招待有り
アホロートルから再生四肢再生能力を学ぶ

川口茜

オンラインセミナー「デジタル進化生物セミナー」 2022年12月8日招待有り
アホロートルの巨大染色体の転写制御から再生四肢再生能力を紐解く

川口茜

第193回 n-bio バイオセミナー 2022年11月22日招待有り
巨大染色体の相互作用地図から染色体制御の普遍性と特殊進化の理解に挑む

川口茜

Tokyo Vertebrate Morphology Meeting（慈恵医科大学） 2022年7月招待有り
Dynamics of the positional identity during limb regeneration

川口茜

広島大学両生類研究所内部セミナー 2022年1月15日招待有り
クロマチン構造から四肢の位置情報の再構築原理を紐解く

Kawaguchi Akane

国立遺伝学研究所バイオロジカルセミナー 2022年1月6日招待有り
Epigenetic landscapes and positional identity in axolotl limb regeneration

Kawaguchi A, Wang J, Tanaka E.M

EMBOWorkshop: The Evolution of Animal Genomes 2021年9月
Chromosome landscape and positional identity in axolotl limb regeneration.

Kawaguchi A, Schloissnig S, Nowoshilow S, Falcon S, Otsuki L, Tardivo P, Timoshevskaya A, Keinath M, Smith J.J, Voss S. R, Tanaka E. M

新学術領域進化制約方向性(倉谷代表) 国際オンラインセミナー 2021年3月招待有り
巨大染色体の相互作用地図から紐解くアホロートルの再生能

Kawaguchi A, Schloissnig S, Nowoshilow S, Falcon F, Tanaka E. M

日本動物学会第 91 回大会オンラインシンポジウム 2020年9月招待有り
Positional memory during Axolotl limb regeneration

Kawaguchi A, Schloissnig S, Tanaka E. M

ViennaBioCenter Recess2019 2019年10月
Positional memory during Axolotl limb regeneration

Kawaguchi A, Schloissnig S, Sergej Nowoshilow, Francisco Falcon, Tanaka E. M

EMBO Workshop: Limb Development and Regeneration: New Tools for a Classic Model System 2019年7月
ヒストン脱メチル化因子 Jmjd3 による眼発生遺伝子 Pax6 の発現制御

川口茜, 越智陽城, 須藤則広, 荻野肇

日本遺伝学会第 87 回年会 2015年9月招待有り

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担当経験のある科目(授業)

2023年12月

総合研究大学院大学講義「発生生物学2: Developmental Biology II」 (総合研究大学院大学)
2015年10月 - 2015年11月

アニマルサイエンス専門実習 III (3回生対象) 外部講師 (長浜バイオ大学)
2014年4月 - 2014年7月

アニマルサイエンス専門実習 III (3回生対象) 外部講師 (長浜バイオ大学)
2013年4月 - 2014年3月

アニマルサイエンス専門実習 III (3回生対象) 外部講師 (長浜バイオ大学)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

発生的拘束を生み出す染色体立体構造に比較クロマチン解析から迫る

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

川口茜
再生とがんを司る多階層な高次染色体構造による転写調節機構の解明

公益財団法人内藤記念科学振興財団内藤記念次世代育成支援研究助成金 2023年3月 - 2025年12月
細胞移動の生物学的意義を問う〜ストレスが生殖細胞の核に与えるインパクト〜

情報・システム研究機構戦略的研究プロジェクト 2024年4月 - 2025年3月

川口茜, 齋藤大介, 石原圭介
非モデル動物の染色体三次元構造の制御と進化的制約

(公財) アステラス病態代謝研究会研究助成金 2023年1月 - 2024年12月
細胞移動の生物学的意義を問う〜ストレスが生殖細胞の核に与えるインパクト〜

情報・システム研究機構戦略的研究プロジェクト 2023年6月 - 2024年3月

川口茜, 齋藤大介, 石原圭介
海洋から汽水へ : 脊椎動物の生息領域拡大戦略をゲノム制御から理解する

東京大学大気海洋研究所学際連携研究学際連携研究 2023年4月 - 2024年3月

川口茜, 高木亙, 工樂樹洋, 兵藤晋
がん抑制因子の重複はPeto’s paradoxを説明するのか

公益財団法人上原記念生命科学財団研究奨励金研究奨励金 2023年4月 - 2024年3月
軟骨魚類における遺伝子導入・ゲノム編集技術の確立

一般財団法人中辻創智社研究費助成公募 2022年8月 - 2023年3月
細胞記憶を司るクロマチン制御機構の包括的解明とその器官再生研究への応用

日本学術振興会海外特別研究員制度 2018年4月 - 2020年3月
三次元構造の再生能力に種差を与える分子機構の研究

上原科学記念財団ポスドクフェローシップ 2016年4月 - 2017年3月
脊椎動物の四肢再生能力に種差をもたらすメカニズムの研究

山田科学財団海外留学長期派遣サポート 2015年11月 - 2016年3月
travel support (Marine Biological Laboratory、US)

奈良先端科学技術財団海外留学サポート 2013年

社会貢献活動

富士高校みらい講座 - 20年後の発生・再生生物学 –

出演, 講師

2023年7月
83

LinkedIn – キャリアインタビュー

取材協力

LinkedIn 2022年5月
発生学会海外だより #11

取材協力

日本発生生物学会 2022年2月

川口茜

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研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

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