中村顕 (Akira Nakamura) - マイポータル

基本情報

所属: 学習院大学理学部生命科学科助教

学位: 博士（理学）(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201601011882245468
researchmap会員ID: B000266241

外部リンク: https://gses2.jp/lab/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2016年10月 - 現在

学習院大学, 理学部, 助教
2010年6月 - 2016年9月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任助教
2010年4月 - 2010年5月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任研究員
2007年4月 - 2010年3月

京都大学, 大学院理学研究科, 博士研究員
2006年4月 - 2007年3月

京都大学, 大学院理学研究科, 産学官連携研究員

学歴

2003年4月 - 2006年3月

京都大学, 大学院理学研究科, 化学専攻博士後期課程
2001年4月 - 2003年3月

京都大学, 大学院理学研究科, 化学専攻修士課程
1997年4月 - 2001年3月

京都大学, 理学部

委員歴

2019年4月 - 現在

学習院大学理学部, 放射線障害予防委員会委員
2021年4月 - 2023年3月

Photon Factory News 編集委員会, 外部編集委員
2020年4月 - 2022年3月

日本結晶学会, 男女共同参画推進委員
2014年4月 - 2015年3月

日本結晶学会, 平成26年度日本結晶学会年会実行委員

受賞

2012年3月

トピックス賞, 強磁場利用によるタンパク質結晶の高品質化, 日本農芸化学会

中村顕, 大塚淳, 宮園健一, 山村昭裕, 窪田恵子, 広瀬量一, 廣田憲之, 安宅光雄, 澤野頼子, 田之倉優

論文

Crystal structure of the AlbEF complex involved in subtilosin A biosynthesis

Kohki Ishida, Akira Nakamura, Shuichi Kojima

Structure 30(12) 1637-1646 2022年12月1日査読有り責任著者
Development of a novel peptide inhibitor of subtilisin BPN′

Kohki Ishida, Makoto Shimizu, Ayumi Wakasugi, Yuko Matsui, Akira Nakamura, Shuichi Kojima

FEBS Open Bio 12(11) 2057-2064 2022年11月1日査読有り責任著者
Highlighting the potential utility of MBP crystallization chaperone for Arabidopsis BIL1/BZR1 transcription factor-DNA complex

Shohei Nosaki, Tohru Terada, Akira Nakamura, Kei Hirabayashi, Yuqun Xu, Thi Bao Chau Bui, Takeshi Nakano, Masaru Tanokura, Takuya Miyakawa

Scientific Reports 11(1) 3879-3879 2021年2月査読有り
Identification of novel interacting regions involving calcineurin and nuclear factor of activated T cells.

Kitamura Noriko, Shindo Mayumi, Ohtsuka Jun, Nakamura Akira, Tanokura Masaru, Hiroi Takachika, Kaminuma Osamu

The FASEB Journal 34(2) 3197-3208 2020年2月11日査読有り
Methylene blue inhibits formation of tau fibrils but not of granular tau oligomers.

Soeda Yoshiyuki, Saito Marino, Maeda Sumihiro, Ishida Kohki, Nakamura Akira, Kojima Shuichi, Takashima Akihiko

Journal of Alzheimer's Disease 68(4) 1677-1686 2019年4月23日査読有り
Author Correction: Laminarinase from Flavobacterium sp. reveals the structural basis of thermostability and substrate specificity. (Scientific Reports (2017) DOI: 10.1038/s41598-017-11542-0)

Hui Min Qin, Takuya Miyakawa, Akira Inoue, Akira Nakamura, Ryuji Nishiyama, Takao Ojima, Masaru Tanokura

Scientific Reports 8(1) 2018年12月1日
Crystal structure of a Ca2+-dependent regulator of flagellar motility reveals the open-closed structural transition

Tomoki Shojima, Feng Hou, Yusuke Takahashi, Yoshitaka Matsumura, Masahiko Okai, Akira Nakamura, Katsutoshi Mizuno, Kazuo Inaba, Masaki Kojima, Takuya Miyakawa …

Scientific Reports 8(1) 204 2018年12月1日査読有り
Structural basis for brassinosteroid response by BIL1/BZR1.

Nosaki Shohei, Miyakawa Takuya, Xu Yuqun, Nakamura Akira, Hirabayashi Kei, Asami Tadao, Nakano Takeshi, Tanokura Masaru

Nature Plants 4(10) 771-776 2018年10月査読有り
Structural analysis of HTL and D14 proteins reveals the basis for ligand selectivity in Striga.

Xu Yuqun, Miyakawa Takuya, Nosaki Shohei, Nakamura Akira, Lyu Ying, Nakamura Hidemitsu, Ohto Umeharu, Ishida Hanako, Shimizu Toshiyuki, Asami Tadao …

Nature Communications 9 3947 2018年9月査読有り
Structural basis for controlling the enzymatic properties of polymannuronate preferred alginate lyase FlAlyA from the PL-7 family

Hui-Min Qin, Takuya Miyakawa, Akira Inoue, Ryuji Nishiyama, Akira Nakamura, Atsuko Asano, Takao Ojima, Masaru Tanokura

Chemical Communications 54(5) 555-558 2018年1月査読有り
Engineering a short-chain dehydrogenase/reductase for the stereoselective production of (2S, 3R, 4S)-4-hydroxyisoleucine with three asymmetric centers

Xuan Shi, Takuya Miyakawa, Akira Nakamura, Feng Hou, Makoto Hibi, Jun Ogawa, Yeondae Kwon, Masaru Tanokura

SCIENTIFIC REPORTS 7 13703 2017年10月査読有り
Laminarinase from Flavobacterium sp reveals the structural basis of thermostability and substrate specificity

Hui-Min Qin, Takuya Miyakawa, Akira Inoue, Akira Nakamura, Ryuji Nishiyama, Takao Ojima, Masaru Tanokura

SCIENTIFIC REPORTS 7 11425 2017年9月査読有り
Studies on the regulatory mechanism of isocitrate dehydrogenase 2 using acetylation mimics

Yuqun Xu, Lingwen Liu, Akira Nakamura, Shinichi Someya, Takuya Miyakawa, Masaru Tanokura

SCIENTIFIC REPORTS 7 9785 2017年8月査読有り
Structure and Polymannuronate Specificity of a Eukaryotic Member of Polysaccharide Lyase Family 14

Hui-Min Qin, Takuya Miyakawa, Akira Inoue, Ryuji Nishiyama, Akira Nakamura, Atsuko Asano, Yoriko Sawano, Takao Ojima, Masaru Tanokura

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 292(6) 2182-2190 2017年2月査読有り
構造情報に基づく4-HIL合成酵素の立体選択性の制御

石玄, 宮川拓也, 中村顕, 侯峰, 日比慎, 小川順, 田之倉優

バイオイメージング 25(2) 86-86 2016年8月
Structural basis of unique ligand specificity of KAI2-like protein from parasitic weed Striga hermonthica

Yuqun Xu, Takuya Miyakawa, Hidemitsu Nakamura, Akira Nakamura, Yusaku Imamura, Tadao Asami, Masaru Tanokura

Scientific Reports 6 31386 2016年8月査読有り
In-situ and real-time growth observation of high-quality protein crystals under quasi-microgravity on earth

Akira Nakamura, Jun Ohtsuka, Tatsuki Kashiwagi, Nobutaka Numoto, Noriyuki Hirota, Takahiro Ode, Hidehiko Okada, Koji Nagata, Motosuke Kiyohara, Ei-ichiro Suzuki …

SCIENTIFIC REPORTS 6 22127 2016年2月査読有り
Yam Tuber Storage Protein Reduces Plant Oxidants Using the Coupled Reactions as Carbonic Anhydrase and Dehydroascorbate Reductase

You-Lin Xue, Takuya Miyakawa, Akira Nakamura, Ken-ichi Hatano, Yoriko Sawano, Masaru Tanokura

MOLECULAR PLANT 8(7) 1115-1118 2015年7月査読有り
Structural optimization of SadA, an Fe(II)- and alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase targeting biocatalytic synthesis of N-succinyl-L-threo-3, 4-dimethoxyphenylserine

Hui-Min Qin, Takuya Miyakawa, Akira Nakamura, Makoto Hibi, Jun Ogawa, Masaru Tanokura

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 450(4) 1458-1461 2014年8月査読有り
1SBP-02 微小重力下の結晶化(1SBP 次世代タンパク質結晶化手法,シンポジウム,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

田之倉優, 中村顕

生物物理 54(1) S121 2014年

もっとみる

MISC

擬似的微小重力環境の設計と結晶化

中村顕, 平林佳, 田之倉優

日本結晶学会誌 59(4) 182-187 2017年8月査読有り招待有り
高品質タンパク質結晶の取得を目指した高磁場・磁気力場利用法の開拓

中村顕, 田之倉優

東京大学低温センター年報 (7) 42-45 2016年11月
構造情報に基づく4-HIL合成酵素の立体選択性の制御

SHI Xuan, 宮川拓也, 中村顕, HOU Feng, 日比慎, 小川順, 田之倉優

バイオイメージング 25(2) 2016年
磁気力場を用いた高品質タンパク質結晶の取得

中村顕, 田之倉優

東京大学低温センター年報 (6) 60-63 2015年12月
高磁気力を利用した高効率・高品位タンパク質結晶生成システムの開発

廣田憲之, 中村顕, 岡田秀彦, 田之倉優, 和田仁, 和田仁

材料の科学と工学 52(5) 157-160 2015年10月20日
世界結晶年記念シンポジウム：タンパク質結晶学の歴史（第14回日本蛋白質科学会年会）

中村顕

日本結晶学会誌 56(6) 370-371 2014年12月招待有り
高磁気力環境を利用した高効率・高品位タンパク質結晶生成システムの開発とその利用

廣田憲之, 中村顕, 岡田秀彦, 田之倉優, 和田仁

低温工学 49(1) 19-24 (J-STAGE)-24 2014年
磁気力場を用いたタンパク質結晶化装置の開発

中村顕, 大塚淳, 田之倉優

東京大学低温センター年報 (4) 42-45 2013年12月
磁気力場を用いたタンパク質結晶化

中村顕, 大塚淳, 宮園健一, 田之倉優

東京大学低温センター年報 (3) 29-33 2013年3月
4-HIL合成に有用なAMKP還元酵素のX線結晶構造解析

SHI Xuan, 宮川拓也, 中村顕, 候峰, 日比慎, 小川順, 田之倉優

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2013 2013年
超伝導マグネットを用いた高効率･高品位タンパク質結晶生成システムの開発と産業用酵素への適用

柏木立己, 高橋一敏, 山本麻以, 石川弘紀, 鈴木基孝, 横山敬一, 田口精一, 鈴木榮一郎, 田之倉優, 中村顕 …

平成23年度日本結晶学会年会 2012年11月
Development of the system for high throughput high quality protein crystal growth using high magnetic forces.

N. Hirota, H. Wada, M. Kiyohara, M. Tanokura, A. Kita, E. Suzuki, H. Okada, T. Ode, A. Nakamura, J. Ohtsuka …

International Conference of the Asian Union of Magnetics Societies 2012年10月
Development of he device for high throughput high quality protein crystal growth using high magnetic forces with the aid of optical microscope

N. Hirota, H. Wada, M. Kiyohara, M. Tanokura, A. Kita, E. Suzuki, H. Okada, T. Ode, A. Nakamura, J. Ohtsuka …

5th International Workshop on Material Analysis and Proceeding in Magnetic Fields 2012年5月
LL Application of High-Field Superconducting Magnet to Protein Crystallization

Hitoshi Wada, Noriyuki Hirota, Shinji Matsumoto, Hidehiko Okada, Motosuke Kiyohara, Takahiro Ode, Masaru Tanokura, Akira Nakamura, Jun Ohtsuka, Akiko Kita …

SUPERCONDUCTIVITY CENTENNIAL CONFERENCE 2011 36 953-957 2012年
Conformational changes upon activation of a replication initiator protein, RepE.

中村顕, 三木邦夫

SPring-8 Research Frontiers 2008 38-39 2009年招待有り
プラスミドDNAの複製開始反応を制御するメカニズム

中村顕, 三木邦夫

化学と生物 46(6) 380-385 2008年6月1日

書籍等出版物

超伝導現象と高温超伝導体

中村顕, 田之倉優 (担当:分担執筆, 範囲:第２編材料と応用第７章計測診断機器への応用第２節超伝導磁石の強力磁場を用いたタンパク質結晶の高品質化機器の開発)

株式会社エヌ・ティー・エス 2013年3月

講演・口頭発表等

Subtilisinとペプチド性阻害剤との複合体結晶構造解析

中村顕, 石田航基, 植本実津希, 小高孝太, 小島修一

日本結晶学会令和5年度年会 2023年10月28日
リゾクチシン生合成に関わるアミノ酸リガーゼの構造解析

坂井みずき, 麻生小夏, 瀧田陽菜, 岡田哲二, 中村顕

日本結晶学会令和5年度年会 2023年10月27日
出芽酵母Mgs1タンパク質のDNA結合部位の探索と生化学的解析

太田哲人, 赤沼元気, 中村顕, 松本彩花, 高畠晴, 菱田卓

日本遺伝学会第95回大会 2023年9月6日
抗菌ペプチドRhizocticinの生合成に関するRhiMタンパク質の構造機能解析

坂井みずき, 友池史明, 岡田哲二, 中村顕

日本蛋白質科学会第23回年会 2023年7月5日
抗生物質リゾクチシンの生合成に関するRhiCタンパク質の構造機能解析

坂井みずき, 中村顕, 小島修一

日本蛋白質科学会第22回年会 2022年6月9日
ペプチド性抗生物質生合成に関わる糖転移酵素の構造解析

中村顕, 久保田里奈, 籾山瑞季, 出村奏恵, 小島修一

第94回日本生化学会大会 2021年11月5日招待有り
特徴的な化学結合を形成するペプチド性抗生物質の生合成酵素の構造解析

中村顕, 松浦辰信, 深谷翼, 椎名彩圭, 関友梨栄, 関口和樹, 籾山瑞季, 小島修一

第93回日本生化学会大会 2020年9月16日招待有り
リゾクチシン生合成酵素の結晶構造解析

中村顕, 松浦辰信, 椎名彩圭, 関友梨栄, 関口和樹, 籾山瑞季, 小島修一

日本結晶学会令和元年（2019年）度年会 2019年11月20日
X線結晶構造解析に基づくSubtilisinにおける成熟過程の分析

石田航基, 西本亜香音, 中村顕, 小島修一

日本結晶学会令和元年（2019年）度年会 2019年11月19日
プロセッシング前の状態の結晶構造に基づくSubtilisinの成熟過程の解析

石田航基, 西本亜香音, 中村顕, 小島修一

第92回日本生化学会大会 2019年9月18日
植物特異的なBZR転写因子ファミリーのDNA結合特異性の構造基盤

野﨑翔平, 宮川拓也, 徐玉群, 中村顕, 平林佳, 浅見忠男, 中野雄司, 田之倉優

日本農芸化学会関東支部 2018年度支部大会 2018年10月13日
乾燥・高温ストレス応答転写因子DREB2AのDNA認識機構

中村顕, 支月華, 宮川拓也, 澤野頼子, 浅野敦子, 松澤朱里, 林泰奈, 佐久間洋, 溝井順哉, 篠崎和子, 田之倉優

日本結晶学会平成28年度年会 2016年11月18日
強磁場・高磁気力環境を利用したタンパク質結晶化装置の開発とその利用

中村顕

日本学術振興会第169委員会第51回研究会 2016年11月8日招待有り
地球上での磁気的擬似微小重力条件におけるタンパク質結晶成長のその場観察

田之倉優, 中村顕, 廣田憲之, 和田仁

16th International Conference on the Crystallization of Biological Macromolecules (ICCBM-16) 2016年7月5日
寄生植物Striga hermonthica由来D14Lタンパク質の構造機能解析

徐玉群, 宮川拓也, 中村英光, 中村顕, 大塚淳, 浅見忠男, 浅見忠男, 田之倉優

バイオイメージング 2015年9月15日
寄生植物Striga hermonthica由来D14Lタンパク質の構造機能解析

XU Yuqun, 宮川拓也, 中村英光, 中村顕, 大塚淳, 浅見忠男, 田之倉優

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015年3月5日
強磁場・高磁気力環境下におけるタンパク質結晶成長

中村顕, 廣田憲之, 和田仁, 田之倉優

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2015年3月5日
微小重力条件下でのタンパク質結晶化

田之倉優, 中村顕

日本生物物理学会 2014年8月20日
ヤム塊茎貯蔵タンパク質dioscorinの炭酸脱水‐デヒドロアスコルビン酸還元共役反応の解析

宮川拓也, 薛友林, 中村顕, 秦野賢一, 澤野頼子, 田之倉優

バイオイメージング 2014年7月25日
磁気力場を利用した高品質タンパク質結晶取得と結晶成長のリアルタイム観察

中村顕, 大塚淳, 廣田憲之, 和田仁, 田之倉優

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 2014年5月26日

もっとみる

担当経験のある科目(授業)

2017年4月 - 現在

生命科学実験2 (学習院大学理学部生命科学科)
2017年4月 - 現在

基礎科学実験1（生命科学） (学習院大学理学部生命科学科)
2016年10月 - 現在

生命科学実験1 (学習院大学理学部生命科学科)
2022年4月 - 2023年3月

生命科学演習2 (学習院大学理学部生命科学科)
2022年4月 - 2023年3月

生命科学演習1 (学習院大学理学部生命科学科)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

新奇糖転移酵素によるS-結合型糖鎖修飾の構造基盤の解明

日本学術振興会科研費基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

中村顕
小胞体ストレス応答センサータンパク質ＰＥＲＫの活性化機構の解明

日本学術振興会科研費若手研究(B) 2012年4月 - 2014年3月

中村顕

産業財産権

特許6044112 磁気力場発生装置

岡田秀彦, 廣田憲之, 和田仁, 松本真治, 清原元輔, 大出孝博, 清原耕輔, 田之倉優, 中村顕, 大塚淳
特許5943409 結晶化プレート

清原元輔, 大出孝博, 清原耕輔, 和田仁, 廣田憲之, 田之倉優, 澤野頼子, 中村顕, 大塚淳, 宮園健一
特許5896550 結晶化プレート

清原元輔, 大出孝博, 清原耕輔, 和田仁, 廣田憲之, 田之倉優, 澤野頼子, 中村顕, 大塚淳, 宮園健一
特許5657326 強磁場中顕微鏡観察装置

大出孝博, 清原元輔, 田之倉優, 澤野頼子, 中村顕, 大塚淳, 宮園健一, 和田仁, 廣田憲之
特開2013-066404 結晶化プレートの観察装置

清原元輔, 大出孝博, 清原耕輔, 和田仁, 廣田憲之, 田之倉優, 澤野頼子, 中村顕, 大塚淳, 宮園健一
特開2013-067528 結晶化プレートの観察装置

清原元輔, 大出孝博, 清原耕輔, 和田仁, 廣田憲之, 田之倉優, 澤野頼子, 中村顕, 大塚淳, 宮園健一
特開2012-076963 強磁場中結晶生成装置

清原元輔, 大出孝博, 田之倉優, 澤野頼子, 中村顕, 大塚淳, 宮園健一, 和田仁, 廣田憲之

中村顕

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

メニュー

共著者の一覧