Ghelfi Andrea (Andrea Ghelfi) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ センター System Developer

J-GLOBAL ID: 202101007036548175
researchmap会員ID: R000015936

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年6月 - 現在

国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ センター, System Developer
2017年3月 - 2021年5月

公益財団法人かずさDNA研究所

論文

Hayai-Annotation: A functional gene prediction tool that integrates orthologs and gene ontology for network analysis in plant species

Andrea Ghelfi, Sachiko Isobe

Computational and Structural Biotechnology Journal 27 117-126 2025年12月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Benchmarking Hayai-Annotation Plants: A Re-evaluation Using Standard Evaluation Metrics

Andrea Ghelfi, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe

2023年9月12日
Plant GARDEN: a portal website for cross-searching between different types of genomic and genetic resources in a wide variety of plant species.

Hisako Ichihara, Manabu Yamada, Mitsuyo Kohara, Hideki Hirakawa, Andrea Ghelfi, Takuro Tamura, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Sachiko Shirasawa, Samatchaya Yamashita …

BMC plant biology 23(1) 391-391 2023年8月12日査読有り
An improved reference genome for Trifolium subterraneum L. provides insight into molecular diversity and intra-specific phylogeny.

Kenta Shirasawa, Roger Moraga, Andrea Ghelfi, Hideki Hirakawa, Hideki Nagasaki, Kioumars Ghamkhar, Brent A Barrett, Andrew G Griffiths, Sachiko N Isobe

Frontiers in plant science 14 1103857-1103857 2023年査読有り
Chromosome-scale genome assembly of Eustoma grandiflorum, the first complete genome sequence in the genus Eustoma

Kenta Shirasawa, Ryohei Arimoto, Hideki Hirakawa, Motoyuki Ishimorai, Andrea Ghelfi, Masami Miyasaka, Makoto Endo, Saneyuki Kawabata, Sachiko N Isobe

G3 Genes|Genomes|Genetics 13(2) 2022年12月19日査読有り
De novo whole-genome assembly in an interspecific hybrid table grape, 'Shine Muscat'.

Kenta Shirasawa, Hideki Hirakawa, Akifumi Azuma, Fumiya Taniguchi, Toshiya Yamamoto, Akihiko Sato, Andrea Ghelfi, Sachiko N Isobe

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 29(6) 2022年12月1日査読有り
Plant GARDEN: a portal website for accessing plant genome, DNA marker, and SNP information

H. Ichihara, H. Hirakawa, A. Ghelfi, M. Kohara, M. Yamada, T. Tamura, A. Nakaya, Y. Nakamura, S. Shirasawa, E. Sugihara …

Acta Horticulturae (1339) 415-418 2022年4月査読有り
Genome features of common vetch (Vicia sativa) in natural habitats

Kenta Shirasawa, Shunichi Kosugi, Kazuhiro Sasaki, Andrea Ghelfi, Koei Okazaki, Atsushi Toyoda, Hideki Hirakawa, Sachiko Isobe

Plant Direct 5(10) e352 2021年10月査読有り
Genome sequence of Hydrangea macrophylla and its application in analysis of the double flower phenotype

Kenji Nashima, Kenta Shirasawa, Andrea Ghelfi, Hideki Hirakawa, Sachiko Isobe, Takuro Suyama, Takuya Wada, Takeshi Kurokura, Tatuya Uemachi, Mirai Azuma …

DNA Research 28(1) 2021年1月19日査読有り
KusakiDB v1.0: a novel approach for validation and completeness of protein orthologous groups

Andrea Ghelfi, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe

bioRxiv 2020年11月10日筆頭著者責任著者
Phased genome sequence of an interspecific hybrid flowering cherry, ‘Somei-Yoshino’ (Cerasus × yedoensis)

Kenta Shirasawa, Tomoya Esumi, Hideki Hirakawa, Hideyuki Tanaka, Akihiro Itai, Andrea Ghelfi, Hideki Nagasaki, Sachiko Isobe

DNA Research 26(5) 379-389 2019年10月1日査読有り
世界における植物ゲノム解析の現状と課題

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI Andrea, 藤代継一, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

トーゴーの日2018 1 2018年10月5日
Killer Applications in Plant GARDEN: Integration of Bioinformatics Tools for Plant Science and Breeding

GHELFI Andrea, 藤代継一, 白澤健太, 原田大士郎, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

トーゴーの日2018 1 2018年10月5日
Triportheus albus Cope, 1872 in the Blackwater, Clearwater, and Whitewater of the Amazon: A Case of Phenotypic Plasticity?

José D. A. Araújo, Andrea Ghelfi, Adalberto L. Val

Frontiers in Genetics 8 2017年8月31日査読有り
Functional Categorization of Transcriptome in the Species Symphysodon aequifasciatus Pellegrin 1904 (Perciformes: Cichlidae) Exposed to Benzo[a]pyrene and Phenanthrene

Renato de Souza Pinto Lemgruber, Nislanha Ana dos Anjos Marshall, Andrea Ghelfi, Daniel Barros Fagundes, Adalberto Luis Val

PLoS ONE 8(12) e81083-e81083 2013年12月3日査読有り
Cloning, expression, molecular modelling and docking analysis of glutathione transferase from Saccharum officinarum

A. Ghelfi, S.A. Gaziola, M.C. Cia, S.M. Chabregas, M.C. Falco, P.R. Kuser-Falcão, R.A. Azevedo

Annals of Applied Biology 159(2) 267-280 2011年9月査読有り筆頭著者

MISC

植物ゲノム統合データベースPlant GARDEN、微生物、メタボローム統合データベース間の連携検索システムの開発

平川英樹, 藤澤貴智, 守屋勇樹, 信定知江, 長崎英樹, 森宙史, 福島敦史, Ghelfi Andrea, 市原寿子, 中村保一 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
生食用ブドウ品種「シャインマスカット」のゲノム解読

東暁史, 谷口郁也, 白澤健太, 平川英樹, 山本俊哉, 佐藤明彦, ANDREA Ghelfi, ANDREA Ghelfi, 磯部祥子

農研機構果樹茶業研究部門成果情報(Web) 2022 2022年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2021年度・第4四半期版)

市原寿子, 平川英樹, GHELFI A., 小原光代, 山田学, 田村卓郎, 中谷明弘, 中村保一, 白澤沙知子, 杉原英志 …

育種学研究 24 2022年
植物ゲノムポータルサイト「Plant GARDEN」の使い方

市原寿子, 平川英樹, GHELFI Andrea, 小原光代, 山田学, 田村卓郎, 中谷明弘, 中村保一, 白澤沙智子, 杉原英志 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
野外環境で自生するヤハズエンドウのゲノムから植物の栽培化を考える

白澤健太, 小杉俊一, 小杉俊一, 佐々木和浩, 佐々木和浩, GHELFI A., GHELFI A., 岡崎孝映, 豊田敦, 平川英樹 …

育種学研究 23 2021年
植物ゲノム情報ポータルサイトPlantGARDENの正規版公開

市原寿子, 原田大士朗, GHELFI A., 小原光代, 山田学, 白澤沙知子, FAWCETT J., 田村卓郎, 杉原英志, 中谷明弘 …

育種学研究 22 2020年
植物ゲノム情報ポータルサイトPlantGARDENの開発

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI A., 藤代継一, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

育種学研究 21 2019年
Hi-Cを用いたサブクローバゲノムのPseudomolecules構築

磯部祥子, 白澤健太, GHELFI Andrea, MORAGA Roger, 平川英樹, 長崎英樹, GRIFFITHS Andrew, JACOBS Jeanne, GHAMKHAR Kioumars

育種学研究 21 2019年
植物ゲノム情報ポータルサイトPlantGARDENの拡張

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI A., 山田学, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

育種学研究 21 2019年
サクラ「ソメイヨシノ」の全ゲノム配列の解読

白澤健太, 江角智也, 平川英樹, 田中秀幸, 板井章浩, GHELFI Andrea, 長崎英樹, 磯部祥子

園芸学研究別冊 18(1) 2019年
植物ゲノム情報ポータルサイト・PlantGARDENの開発と植物ゲノム解析の現状

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI A., 藤代継一, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

育種学研究 20 2018年
植物ゲノム情報ポータルサイト・PlantGARDENの開発にむけて

原田大士朗, 市原寿子, 中谷明弘, GHELFI Andrea, 藤代継一, 小原光代, 平川英樹, 田畑哲之, 磯部祥子

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
植物ゲノム情報統合ポータルサイトPlant GARDENの構築

平川英樹, 原田大士朗, GHELFI Andrea, FAWCETT Jeffrey, 白澤沙知子, 市原寿子, 中谷明弘, 磯部祥子, 田畑哲之

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
栽培イチゴ(Fragaria×ananassa)MAGIC集団を用いた完着期果実の遺伝子発現プロファイリング

永野聡一郎, 平川英樹, 和田卓也, 田崎公久, 前田ふみ, GHELFI Andrea, 森美幸, 鶴見理沙, 津金胤昭, 坪根正雄 …

園芸学研究別冊 16(2) 2017年

Ghelfi Andrea

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