UTADA ANDREW SHINICHI (Andrew Shinichi Utada) - マイポータル

基本情報

所属: 筑波大学生命環境系准教授

学位: B.S.(1999年12月 Emory University)
Ph.D.(2007年6月 Harvard University, School of Engineering and Applied Sciences)

連絡先: utada.andrew.gmu.tsukuba.ac.jp
J-GLOBAL ID: 201601007493622763
researchmap会員ID: B000256201

研究キーワード

Biofilm, Complex Fluids, Microfluidics, Surface Motility

研究分野

自然科学一般 / 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 /

経歴

2016年 - 現在

Univ. of Tsukuba
2014年 - 2016年

Bio-Rad Digital Biology Center (R&D/Engineer)
2012年1月 - 2014年7月

University of California Los Angeles Dept. of Bioengineering
2010年 - 2012年

Capsum Senior Scientist (Senior Scientist)
2007年10月 - 2010年1月

東京大学生産技術研究所

学歴

2000年9月 - 2007年6月

Harvard University School of Engineering and Applied Sciences Engineering Sciences
1995年 - 1999年

Emory University

論文

Identification of lthB , a Gene Encoding a Putative Glycosyltransferase Family 8 Protein Required for Leptothrix Sheath Formation

Kunoh, Tatsuki, Yamamoto, Tatsuya, Ono, Erika, Sugimoto, Shinya, Takabe, Kyosuke, Takeda, Minoru, Utada, Andrew Shinichi, Nomura, Nobuhiko

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 2023年4月査読有り
Porous Pellicle Formation of a Filamentous Bacterium, Leptothrix

Tatsuki Kunoh, Tatsuya Yamamoto, Manoj Prasad, Erika Ono, Xiaojie Li, Shinya Sugimoto, Eiji Iida, Nozomu Obana, Minoru Takeda, Nobuhiko Nomura, Andrew S. Utada, Knut Rudi

Applied and Environmental Microbiology 2022年12月13日
Microdroplet-Based In Situ Characterization Of The Dynamic Evolution Of Amorphous Calcium Carbonate during Microbially Induced Calcium Carbonate Precipitation

Feng, Chunying, Zhao, Shufeng, Zong, Yiwu, He, Qing, Winarto, William, Zhang, Wenchao, Utada, Andrew S, Zhao, Kun

ENVIRONMENTAL SCIENCE & TECHNOLOGY 2022年8月査読有り責任著者
Alcanivorax borkumensis Biofilms Enhance Oil Degradation By Interfacial Tubulation

Prasad, M, Obana, N, Lin, S.-Z, Sakai, K, Blanch-Mercader, C, Prost, J, Nomura, N, Rupprecht, J.-F, Fattaccioli, J, Utada, Andrew Shinichi

Biorxiv 2022年8月責任著者
Crash landing of Vibrio cholerae by MSHA pili-assisted braking and anchoring in a viscoelastic environment

Zhang, Wenchao, Luo, Mei, Feng, Chunying, Liu, Huaqing, Zhang, Hong, Bennett, Rachel R, Utada, Andrew Shinichi, Liu, Zhi, Zhao, Kun

Elife 10 2021年7月査読有り
Leptothrix cholodnii Response to Nutrient Limitation

Kunoh, Tatsuki, Yamamoto, Tatsuya, Sugimoto, Shinya, Ono, Erika, Nomura, Nobuhiko, Utada, Andrew S

Front. Microbiol. 12 691563-691563 2021年6月査読有り
バイオサーファクタントによるバイオフィルム除去および形成抑制

高橋晃平, 久能, 樹, 野村, 暢彦, Andrew, S. Utada

バイオサイエンスとインダストリー（Ｂ＆Ｉ） 79巻(2号) 90-93 2021年3月
Competence-Stimulating-Peptide-Dependent Localized Cell Death and Extracellular DNA Production in Streptococcus mutans Biofilms

Nagasawa, Ryo, Yamamoto, Tatsuya, Utada, Andrew S, Nomura, Nobuhiko, Obana, Nozomu

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 86(23) 2020年12月査読有り
Fungal mycelia and bacterial thiamine establish a mutualistic growth mechanism

Gayan, Abeysinghe, Kuchira, Momoka, Masuo, Shunsuke, Takahashi, Kohei, Utada, Andrew S, Hagiwara, Daisuke, Nomura, Nobuhiko, Takaya, Naoki, Obana, Nozomu, Takeshita, Norio, Kudo, Gamon, Ninomiya, Akihiro

LIFE SCIENCE ALLIANCE 3(12) 2020年9月査読有り
Leptothrix属細菌の分泌ナノ繊維を介した生存戦略

久能, 樹, 山本達也, Andrew, S. Utada, 野村暢彦

バイオサイエンスとインダストリー（Ｂ＆Ｉ） 78巻(4号) 329-331 2020年7月
時空間的な制御技術が生み出す細菌挙動解析

高橋晃平, 久能, 樹, Andrew, S. Utada

日本生物工学会誌 98巻(7号) 350-352 2020年7月
特集 ERATO野村集団微生物制御プロジェクトについて～細菌の集団形成と社会性の創発～（後編）第98巻第7号 346–367（2020）

野村, 暢彦, 高橋, 晃平, 久能, 樹, Andrew, S. Utada, 重藤, 真介, 菊池, 洋輔, 田岡, 東, 八幡, 穣, 竹下, 典男

生物工学会誌第 98巻第 7号 346–367．2020 2020年7月
Synergy between Sophorolipid Biosurfactant and SDS Increases the Efficiency of P. aeruginosa Biofilm Disruption.

Bac V G Nguyen, Toshiki Nagakubo, Masanori Toyofuku, Nobuhiko Nomura, Andrew S Utada

Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids 36(23) 6411-6420 2020年6月16日査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Polyfunctional Nanofibril Appendages Mediate Attachment, Filamentation, and Filament Adaptability in Leptothrix cholodnii

Tatsuki Kunoh, Kana Morinaga, Shinya Sugimoto, Shun Miyazaki, Masanori Toyofuku, Kenji Iwasaki, Nobuhiko Nomura, Andrew S. Utada

ACS Nano 14(5) 5288-5297 2020年5月26日査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Point Mutations Lead to Increased Levels of c-di-GMP and Phenotypic Changes to the Colony Biofilm Morphology in Alcanivorax borkumensis SK2

Prasad, Manoj, Obana, Nozomu, Sakai, Kaori, Nagakubo, Toshiki, Miyazaki, Shun, Toyofuku, Masanori, Fattaccioli, Jacques, Nomura, Nobuhiko, Utada, Andrew S

Microbes and environments 2019年3月査読有り責任著者
Point Mutations Lead to Increased Levels of c-di-GMP and Phenotypic Changes to the Colony Biofilm Morphology in Alcanivorax borkumensis SK2

Manoj Prasad, Nozomu Obana, Kaori Sakai, Toshiki Nagakubo, Shun Miyazaki, Masanori Toyofuku, Jacques Fattaccioli, Nobuhiko Nomura, Andrew S. Utada

Microbes and Environments 34(1) 104-107 2019年査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Multiparameter mechanical and morphometric screening of cells

Mahdokht Masaeli, Dewal Gupta, Sean O'Byrne, Henry T. K. Tse, Daniel R. Gossett, Peter Tseng, Andrew S. Utada, Hea-Jin Jung, Stephen Young, Amander T. Clark, Dino Di Carlo

Scientific Reports 6 2016年12月査読有り
C-di-GMP Regulates Motile to Sessile Transition by Modulating MshA Pili Biogenesis and Near-Surface Motility Behavior in Vibrio cholerae

Christopher J. Jones, Andrew Utada, Kimberly R. Davis, Wiriya Thongsomboon, David Zamorano Sanchez, Vinita Banakar, Lynette Cegelski, Gerard C. L. Wong, Fitnat H. Yildiz

PLoS Pathogens 11(10) 2015年10月査読有り
Living in the matrix: assembly and control of Vibrio cholerae biofilms

Jennifer K. Teschler, David Zamorano-Sanchez, Andrew S. Utada, Christopher J. A. Warner, Gerard C. L. Wong, Roger G. Linington, Fitnat H. Yildiz

NATURE REVIEWS MICROBIOLOGY 13(5) 255-268 2015年5月査読有り
Vibrio cholerae use pili and flagella synergistically to effect motility switching and conditional surface attachment

Andrew S. Utada, Rachel R. Bennett, Jiunn C. N. Fong, Maxsim L. Gibiansky, Fitnat H. Yildiz, Ramin Golestanian, Gerard C. L. Wong

NATURE COMMUNICATIONS 5 2014年9月査読有り

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講演・口頭発表等

Biofilms on High Fat Diets Cooperate to Stay Fit

Utada, Andrew Shinichi

第96回日本細菌学会招待有り
腸管粘液層模倣系における腸内細菌の定着とバイオフィルム形成の解析

野村佳祐, 野村暢彦, 尾花, 望, Andrew, S. Utada

第96回日本細菌学会総会口頭発表日本細菌学会
嫌気的環境を形成するマイクロ流体デバイスを用いた緑膿菌バイオフィルム形成の解析

野村佳祐, 野村暢彦, 尾花望, 豊福雅典, Andrew, Utada

第57回緑膿菌感染症研究会緑膿菌感染症研究会
脱窒分担細菌の位置関係を制御した人工細菌凝集体の脱窒活性の解析

野村佳祐, 野村暢彦, 小川和義, Andrew, Utada

環境バイオテクノロジー学会2022年度大会環境バイオテクノロジー学会
腸管粘液層模倣系における腸内細菌の定着とバイオフィルム形成の解析

野村佳祐, 野村暢彦, 尾花, 望, Andrew, Utada

2022年日本細菌学会関東支部インターラボセミナー-微生物生態を可視化する様々な解析技術- 日本細菌学会関東支部
A high-throughput screening of mutant libraries combining microfluidics and FACS

Shufeng, Zhao, Masuo, Shunsuke, Andrew, Utada

2022年日本細菌学会関東支部インターラボセミナー-微生物生態を可視化する様々な解析技術- 日本細菌学会関東支部
A high-throughput screening of mutant libraries combining microfluidics and FACS

Shufeng, Zhao, Masuo, Shunsuke, Andrew, Utada

日本微生物生態学会第35回大会日本微生物生態学会
A high-throughput screening of mutant libraries combining microfluidics and FACS

Shufeng, Zhao, Masuo, Shunsuke, Andrew, Utada

環境バイオテクノロジー学会2022年度大会環境バイオテクノロジー学会
糸状性細菌Leptothrix属細菌によるペリクル形成

久能, 樹, 小野, 絵里香, Li, Xiaojie, 山本, 達也, Manoj, Prasad, 杉本, 真也, 尾花, 望, 野村, 暢彦, Utada, Andrew S

第74回日本生物工学会大会 2022年10月17日
Leptothrix属細菌の糸状成長に関わる因子の同定

小野, 絵里香, 山本, 達也, 尾花, 望, 杉本, 真也, Utada, Andrew S, 久能, 樹, 野村, 暢彦

第74回日本生物工学会大会 2022年10月17日
Leptothrix属細菌の網目状ペリクル形成に関与する因子の同定

小野, 絵里香, 山本, 達也, 尾花, 望, 杉本, 真也, Utada, Andrew S, 久能, 樹, 野村, 暢彦

日本バイオフィルム学会第36回学術集会 2022年9月24日
Biofilm formation strategies: Sticking around without being stuck

Utada, Andrew Shinichi

日本農芸化学かい２０２２年度京都大会招待有り
模擬皮膚表面上で皮膚細菌が形成する複合バイオフィルムの解析

中山瑞鵬, 釣流香織, 野村, 暢彦, Andrew, S Utada, 尾花, 望

第35回日本細菌学会総会 2022年3月
細菌の糸状成長に必須な鞘形成メカニズムの解明

小野絵里香, 山本, 達也, 杉本, 真也, Andrew, Utada, 久能, 樹, 野村, 暢彦

第56回日本水環境学会年会 2022年3月
微生物局在を制御した人工細菌凝集体の代謝活性の解析

野村佳祐, 高橋晃平, 豊福雅典, 小川和義, Andrew, Utada, 野村, 暢彦

第56回日本水環境学会年会 2022年3月
疎水性シグナルを包括した脂質二重膜小胞によるクォーラムセンシング誘導

中嶋勇人, 豊福雅典, Andrew, S. Utada, 野村, 暢彦

日本農芸化学会2022年度大会 2022年3月
Leptothrix属細菌の糸状成長に必須な鞘形成メカニズムの解明

小野絵里香, 山本達也, 森永花菜, Prasad, Manoj, 飯田, 栄治, 杉本, 真也, 野村, 暢彦, Andrew, S. Utada, 久能, 樹

JST ERATO 野村集団微生物制御プロジェクト終了シンポジウム 2021年12月
マイクロ流体ドロップレッドを用いた細菌付着評価システムの開発

高橋晃平, Manoj, Prasad, 野村, 暢彦, Andrew, S. Utada

JST ERATO 野村集団微生物制御プロジェクト終了シンポジウム 2021年12月
QS signal transmission using unilamellar vesicles

Nakajima, Yuto, Toyofuku, Masanori, Utada, Andrew, Nomura, Nobuhiko

EMBO Workshop Bacterial membrane vesicles: Biogenesis, functions and medical applications 2021年11月 Department of Bacteriology I, National Institute of Infectious Diseases, JP
凹凸構造表面上で皮膚細菌が形成する複合バイオフィルムの解析

中山瑞鵬, 釣流香織, 野村, 暢彦, Andrew, S Utada, 尾花, 望

第104回日本細菌学会関東支部総会 2021年10月