越智杏奈 (Anna Ochi) - マイポータル

基本情報

所属: 立命館大学生命科学部特任助教

学位: 博士（工学）(愛媛大学)

研究者番号: 60542339
J-GLOBAL ID: 202101000381641400
researchmap会員ID: R000030429

経歴

2023年4月 - 現在

立命館大学, 生命科学部, 特任助教
2020年4月 - 2023年3月

立命館大学, 生命科学部, 日本学術振興会特別研究員（RPD）
2011年4月 - 2013年6月

北海道大学, 大学院工学研究院, 日本学術振興会特別研究員（PD）
2009年4月 - 2010年3月

愛媛大学, 大学院理工学研究科, 日本学術振興会特別研究員（PD）
2008年4月 - 2009年3月

愛媛大学, 大学院理工学研究科, 日本学術振興会特別研究員（DC2）

受賞

2024年11月

第97回日本生化学会大会, 若手優秀発表賞, Geobacter sulfurreducens PCA 由来ポリスルフィド硫黄転移酵素 ExtH の分子間 S-S 架橋二量体の解析, 日本生化学会

工藤碧斗, 藤田大樹, 青野陸, 井上真男, 青野陸, 越智杏奈, 三原久明
2024年11月

International Travel Award, Kinetic analysis of TmsA, a key enzyme in trimethylselenonium demethylation that drives environmental selenium cycling, Trace Elements in Man and Animals

Kanako SOWA, Anna OCHI, Masao INOUE, Riku AONO, Soichi SATO, Yasumitsu OGRA, Hisaaki MIHARA
2024年11月

International Travel Award, Intracellular formation of submicrometer-sized spherical elemental selenium by a novel selenite-reducing bacterium isolated from seleniferous soil, Trace Elements in Man and Animals

Haruka Kamide, Anna Ochi, Hibiki Ueda, Kano Shibamoto, Daiki Fujioka, Masao Inoue, Riku Aono, Tomoya Imai, N. Tejo Prakash, Hisaaki Mihara
2024年10月

メタルバイオサイエンス研究会2024 実行委員長賞, セレン蓄積土壌から単離された新奇亜セレン酸還元細菌による球形元素状セレンの細胞内形成, メタルバイオサイエンス研究会

上出遥, 越智杏奈, 植田響輝, 横山文秋, 藤岡大毅, 芝本佳永, 井上真男, 青野陸, 今井友也, N. Tejo Prakash, 三原久明
2024年6月

学生優秀発表賞, 有機セレン新奇代謝系の細菌鍵酵素 TmsA の速度論的解析, 日本ビタミン学会

曽羽香南子, 越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明
2024年6月

ベストポスター賞, セレン蓄積土壌由来Cellulomonas sp. D3aにおける元素状セレンナノ粒子形成, 日本微量栄養素学会

上出遥, 芝本佳永, 越智杏奈, 藤岡大毅, 井上真男, 青野陸, 今井友也, N. Tejo Prakash, 三原久明
2023年10月

メタルバイオサイエンス研究会2023 実行委員長賞, 大腸菌における細胞外元素状セレンナノ粒子形成と細胞膜構造の関係性

芝本佳永, 越智杏奈, 豊竹洋佑, 藤岡大毅, 青野陸, 井上真男, 今井友也, 三原久明
2023年8月

極限環境生物学会2023年度 (第24回) 年会ポスター賞, 好熱性メタン生成アーキアMethanothermococcus okinawensisの遺伝子組換え系の構築

田中颯太, 青野陸, 井上真男, 越智杏奈, 三原久明
2022年10月

生命金属科学研究推進賞, 土壌微生物由来トリメチルセレノニウム脱メチル化酵素の発見と機能解析, メタルバイオサイエンス研究会

内田透梧, 越智杏奈, 高野将光, 井上真男, 青野陸, 佐藤聡一, 小椋康光, 三原久明
2022年10月

生命金属科学研究推進賞, トリメチルセレノニウム資化に関与する遺伝子クラスターの転写制御機構の解明, メタルバイオサイエンス研究会

萱場亮太, 越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 寺部千夏, 田中麻衣, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明
2022年7月

The 8th International Symposium on Metallomics, Young Presentation Award, "Functional analysis of a novel molybdenum-dependent methionine sulfoxide reductase from Bacillus species"

Kyohei Kojima, Yuka Kuzuno, Anna Ochi, Riku Aono, Masao Inoue, Ryuta Tobe, Yoichi Takeda, N. Tejo, Prakash, Hisaaki Mihara
2022年7月

The 8th International Symposium on Metallomics, Impressive Research Award, "Biogenic extracellular selenium particles are wrapped within membrane vesicles in Escherichia coli"

Kano Shibamoto, Anna Ochi, Yosuke Toyotake, Riku Aono, Masao Inoue, Tomoya Imai, Hisaaki Mihara
2021年10月

第32回日本微量元素学会学術集会優秀演題賞, 大腸菌が生成・排出するセレンナノ粒子の透過型電子顕微鏡解析

芝本佳永, 越智杏奈, 豊竹洋佑, 青野陸, 井上真男, 今井友也, 三原久明

論文

SECIS element variability and its role in selenocysteine versus cysteine utilization in SelD enzymes

Masao Inoue, Riku Aono, Anna Ochi, Yukiko Izu, Toma Rani Majumder, Ming Li, Hisaaki Mihara

Metallomics Research 4(3) reg26-reg36 2025年1月査読有り
Comparative studies on substrate specificity of succinic semialdehyde reductase from Gluconobacter oxydans and glyoxylate reductase from Acetobacter aceti

Toma Rani Majumder, Masao Inoue, Riku Aono, Anna Ochi, Hisaaki Mihara

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 88(9) 1069-1072 2024年6月13日
Effects of genetic disruption in thioredoxin and glutathione systems on selenium nanoparticle formation, selenite sensitivity, and selenoprotein biosynthesis in Escherichia coli

Anna Ochi, Hisaaki Mihara

Metallomics Research 4(1) 14-20 2024年4月査読有り筆頭著者
Comparison of Nutritional Availability of Biogenic Selenium Nanoparticles and Chemically Synthesized Selenium Nanoparticles.

Kazuaki Takahashi, Anna Ochi, Hisaaki Mihara, Yasumitsu Ogra

Biological trace element research 2023年1月17日査読有り
Transfer RNA Modification Enzymes from Thermophiles and Their Modified Nucleosides in tRNA.

Hiroyuki Hori, Takuya Kawamura, Takako Awai, Anna Ochi, Ryota Yamagami, Chie Tomikawa, Akira Hirata

Microorganisms 6(4) 2018年10月20日査読有り
Effects of polyamines from Thermus thermophilus, an extreme-thermophilic eubacterium, on tRNA methylation by tRNA (Gm18) methyltransferase (TrmH).

Hiroyuki Hori, Yusuke Terui, Chisato Nakamoto, Chikako Iwashita, Anna Ochi, Kazunori Watanabe, Tairo Oshima

Journal of biochemistry 159(5) 509-17 2016年5月査読有り
Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI).

Hiroyuki Takuma, Natsumi Ushio, Masayuki Minoji, Ai Kazayama, Naoki Shigi, Akira Hirata, Chie Tomikawa, Anna Ochi, Hiroyuki Hori

The Journal of biological chemistry 290(9) 5912-25 2015年2月27日査読有り
The catalytic domain of topological knot tRNA methyltransferase (TrmH) discriminates between substrate tRNA and nonsubstrate tRNA via an induced-fit process.

Anna Ochi, Koki Makabe, Ryota Yamagami, Akira Hirata, Reiko Sakaguchi, Ya-Ming Hou, Kazunori Watanabe, Osamu Nureki, Kunihiro Kuwajima, Hiroyuki Hori

The Journal of biological chemistry 288(35) 25562-25574 2013年8月30日査読有り筆頭著者
Engineering of class I lactate-polymerizing polyhydroxyalkanoate synthases from Ralstonia eutropha that synthesize lactate-based polyester with a block nature.

Anna Ochi, Ken'ichiro Matsumoto, Takashi Ooba, Kohei Sakai, Takeharu Tsuge, Seiichi Taguchi

Applied microbiology and biotechnology 97(8) 3441-7 2013年4月査読有り筆頭著者
The tRNA recognition mechanism of folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO).

Ryota Yamagami, Koki Yamashita, Hiroshi Nishimasu, Chie Tomikawa, Anna Ochi, Chikako Iwashita, Akira Hirata, Ryuichiro Ishitani, Osamu Nureki, Hiroyuki Hori

The Journal of biological chemistry 287(51) 42480-94 2012年12月14日査読有り
Substrate tRNA recognition mechanism of a multisite-specific tRNA methyltransferase, Aquifex aeolicus Trm1, based on the X-ray crystal structure.

Takako Awai, Anna Ochi, Ihsanawati, Toru Sengoku, Akira Hirata, Yoshitaka Bessho, Shigeyuki Yokoyama, Hiroyuki Hori

The Journal of biological chemistry 286(40) 35236-46 2011年10月7日査読有り
Pseudouridine at position 55 in tRNA controls the contents of other modified nucleotides for low-temperature adaptation in the extreme-thermophilic eubacterium Thermus thermophilus.

Kazuo Ishida, Takashi Kunibayashi, Chie Tomikawa, Anna Ochi, Tamotsu Kanai, Akira Hirata, Chikako Iwashita, Hiroyuki Hori

Nucleic acids research 39(6) 2304-18 2011年3月査読有り
Flexible recognition of the tRNA G18 methylation target site by TrmH methyltransferase through first binding and induced fit processes.

Anna Ochi, Koki Makabe, Kunihiro Kuwajima, Hiroyuki Hori

The Journal of biological chemistry 285(12) 9018-29 2010年3月19日査読有り筆頭著者
Aquifex aeolicus tRNA (N2,N2-guanine)-dimethyltransferase (Trm1) catalyzes transfer of methyl groups not only to guanine 26 but also to guanine 27 in tRNA.

Takako Awai, Satoshi Kimura, Chie Tomikawa, Anna Ochi, Ihsanawati, Yoshitaka Bessho, Shigeyuki Yokoyama, Satoshi Ohno, Kazuya Nishikawa, Takashi Yokogawa …

The Journal of biological chemistry 284(31) 20467-78 2009年7月31日査読有り
The C-terminal region of thermophilic tRNA (m7G46) methyltransferase (TrmB) stabilizes the dimer structure and enhances fidelity of methylation.

Chie Tomikawa, Anna Ochi, Hiroyuki Hori

Proteins 71(3) 1400-8 2008年5月15日査読有り
Production of yeast tRNA (m(7)G46) methyltransferase (Trm8-Trm82 complex) in a wheat germ cell-free translation system.

Keisuke Matsumoto, Chie Tomikawa, Takashi Toyooka, Anna Ochi, Yoshitaka Takano, Naoyuki Takayanagi, Masato Abe, Yaeta Endo, Hiroyuki Hori

Journal of biotechnology 133(4) 453-60 2008年2月29日査読有り
RNA recognition mechanism of eukaryote tRNA (m7G46) methyltransferase (Trm8-Trm82 complex).

Keisuke Matsumoto, Takashi Toyooka, Chie Tomikawa, Anna Ochi, Yoshitaka Takano, Naoyuki Takayanagi, Yaeta Endo, Hiroyuki Hori

FEBS letters 581(8) 1599-604 2007年4月17日査読有り
Complex formations between artificial RNA-DNA chimera nucleic acids and RNA modification enzyme

Anna Ochi, Hiroyuki Hori

2007 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science, MHS 113-118 2007年筆頭著者
Hetero subunit interaction and RNA recognition of yeast tRNA (m7G46) methyltransferase synthesized in a wheat germ cell-free translation system.

Yuki Muneyoshi, Keisuke Matsumoto, Chie Tomikawa, Takashi Toyooka, Anna Ochi, Takashi Masaoka, Yaeta Endo, Hiroyuki Hori

Nucleic acids symposium series (2004) (51) 359-60 2007年
Hydroxyl radical probing of tRNA (Gm18) methyltransferase [TrmH]-AdoMet-artificial tRNA ternary complex.

Anna Ochi, Hiroyuki Hori

Nucleic acids symposium series (2004) (51) 373-4 2007年筆頭著者

MISC

琵琶湖集水域の環境メタロミクス（16）生態系においてセレン循環を駆動する微生物

越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 三原久明

金属 93(2) 162-168 2023年2月
NL若手リレー企画第18回研究続けなさいって言われても

新学術領域研究「生命金属科学」ニュースレター 2022年11月
大腸菌における細胞外セレンナノ粒子の形成には細胞膜の完全性が必要である

芝本佳永, 越智杏奈, 豊竹洋佑, 藤岡大毅, 青野陸, 井上真男, 井上真男, 今井友也, 三原久明

Biomedical Research on Trace Elements (Web) 33(1) 2022年

書籍等出版物

琵琶湖集水域の環境メタロミクス

原田, 英美子 (担当:分担執筆)

アグネ技術センター 2024年8月 (ISBN: 9784867070185)
合成生物工学の隆起 : 有用物質の新たな生産法構築をめざして

植田, 充美 (担当:分担執筆)

シーエムシー出版 2012年4月 (ISBN: 9784781305639)
植物由来ポリマー・複合材料の開発

平川, 亮太 (担当:分担執筆)

サイエンス&テクノロジー 2011年12月 (ISBN: 9784864280310)

講演・口頭発表等

118

Intracellular formation of submicrometer-sized spherical elemental selenium by a novel selenite-reducing bacterium isolated from seleniferous soil

Haruka Kamide, Anna Ochi, Hibiki Ueda, Kano Shibamoto, Daiki Fujioka, Masao Inoue, Riku Aono, Tomoya Imai, N. Tejo Prakash, Hisaaki Mihara

18th International Symposium on Trace Elements in Man and Animals
Kinetic analysis of TmsA, a key enzyme in trimethylselenonium demethylation that drives environmental selenium cycling

Kanako SOWA, Anna OCHI, Masao INOUE, Riku AONO, Soichi SATO, Yasumitsu OGRA, Hisaaki MIHARA

18th International Symposium on Trace Elements in Man and Animals
系統進化的に呼吸鎖複合体 I と [NiFe] ヒドロゲナーゼの中間的な特徴を持つ遺伝子群の構造と機能

井上真男, 高野将光, 松垣俊亮, 青野陸, 越智杏奈, 三原久明

第97回日本生化学会大会 2024年11月8日
セレン蓄積土壌由来 Cellulomonas sp. D3a による元素状セレン粒子形成機構

越智杏奈, 上出遥, 芝本佳永, 藤岡大毅, 青野陸, 井上真男, 今井友也, N. Tejo Prakash, 三原久明

第97回日本生化学会大会 2024年11月8日
高度好熱菌に由来する2つのDNA結合タンパク質間の相互作用における荷電性アミノ酸残基の関与

小林一稀, 井上真男, 藤井桃子, 青野陸, 越智杏奈, 武田陽一, 増井良治, 三原久明

第97回日本生化学会大会 2024年11月8日
Geobacter sulfurreducens PCA 由来ポリスルフィド硫黄転移酵素 ExtH の分子間 S-S 架橋二量体の解析

工藤碧斗, 藤田大樹, 青野陸, 井上真男, 越智杏奈, 三原久明

第97回日本生化学会大会 2024年11月6日
メタン生成アーキアMethanococcus maripaludis JJの増殖と遺伝子発現に対する亜セレン酸の影響

青野陸, 小野田幹久, 井上真男, 越智杏奈, 三原久明

極限環境生物学会2024年度(第25回)年会 2024年11月4日
幅広い環境微生物が持つNiFe欠失型ヒドロゲナーゼ様複合体Ehrは水素をエネルギー源とした生育に関与する

高野将光, 井上真男, 青野陸, 越智杏奈, 三原久明

極限環境生物学会2024年度(第25回)年会 2024年11月3日
大腸菌におけるThioredoxinおよびGlutathione systemのセレンタンパク質生合成およびセレンナノ粒子形成への関与

越智杏奈, 青野陸, 井上真男, 三原久明

メタルバイオサイエンス研究会2024 2024年10月18日
セレン蓄積土壌から単離された新奇亜セレン酸還元細菌による球形元素状セレンの細胞内形成

上出遥, 越智杏奈, 植田響輝, 横山文秋, 藤岡大毅, 芝本佳永, 井上真男, 青野陸, 今井友也, N. Tejo Prakash, 三原久明

メタルバイオサイエンス研究会2024 2024年10月17日
大腸菌における細胞外元素状セレンナノ粒子形成機構

越智杏奈, 芝本佳永, 豊竹洋佑, 藤岡大毅, 滝沢優, 井上真男, 青野陸, 今井友也, 三原久明

第35回日本微量元素学会学術集会 2024年9月20日
セレン循環に関わる新奇の細菌鍵酵素 TmsA の速度論的解析

曽羽香南子, 越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明

第35回日本微量元素学会学術集会 2024年9月20日
メタン菌に“単独で”存在するセレノリン酸合成酵素ホモログはセレン含有化合物の合成に寄与しうる

青野陸, 水谷亮太, 井上真男, 越智杏奈, 三原久明

第76回日本生物工学会大会 2024年9月10日
Molecular Recognition Mechanism of Basic d-Amino Acids by the Transcription Factor DlcR from Pseudomonas putida

Shione MORIMOTO, Masao INOUE, Riku AONO, Anna OCHI, Hisaaki MIHARA

第18回 D-アミノ酸学会 2024年8月21日
セレン含有グリシン還元酵素の生物情報学的研究

山田恵矢, 井上真男, 高野将光, 岡元俊輔, 青野陸, 越智杏奈, 三原久明

第41回日本微量栄養素学会学術集会 2024年6月22日
セレン蓄積土壌由来Cellulomonas sp. D3aにおける元素状セレンナノ粒子形成

上出遥, 芝本佳永, 越智杏奈, 藤岡大毅, 井上真男, 青野陸, 今井友也, N. Tejo Prakash, 三原久明

第41回日本微量栄養素学会学術集会 2024年6月22日
Bacillus subtilisにおけるround-bodyの形成メカニズムと亜セレン酸還元への影響

越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 水上博貴, 植田響輝, 三原久明

日本ビタミン学会第76回大会 2024年6月9日
有機セレン新奇代謝系の細菌鍵酵素 TmsA の速度論的解析

曽羽香南子, 越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明

日本ビタミン学会第76回大会 2024年6月8日
メタン生成アーキアMethanolacinia petroleariaの有するセレノリン酸合成酵素ホモログの解析

青野陸, 水谷亮太, 井上真男, 越智杏奈, 三原久明

第 36 回日本 Archaea 研究会講演会 2024年6月5日
Se循環に関わる新奇トリメチルセレノニウムメチル基転移酵素TmsAの基質特異性

曽羽香南子, 越智杏奈, 井上真男, 青野陸, 佐藤総一, 小椋康光, 三原久明

日本農芸化学会2024年度大会 2024年3月26日

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共同研究・競争的資金等の研究課題

細菌における元素状硫黄呼吸の分子メカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

三原久明, 青野陸, 井上真男, 越智杏奈
亜ヒ酸還元酵素は存在するのか？～生物作用による元素状ヒ素生成反応の実証～

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2024年6月 - 2026年3月

三原久明, 井上真男, 青野陸, 越智杏奈
土壌微生物によって駆動される地球化学的な有機硫黄循環機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

越智杏奈、青野陸、井上真男、三原久明
微生物によるセレンナノ粒子発酵生産機構の解明

公益財団法人野田産業科学研究所研究助成 2024年4月 - 2025年3月

越智杏奈
微生物による外膜小胞を介した細胞外セレン粒子生成メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2020年4月 - 2023年3月

越智杏奈
代謝・酵素複合改変による高光学純度乳酸ポリマーの配列制御

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2011年 - 2013年

越智杏奈
新規フォールディングRNA修飾酵素のRNA認識機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2009年 - 2010年

越智杏奈

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