坂下陽彦 (Akihiko Sakashita) - マイポータル

基本情報

所属: 慶應義塾大学医学部分子生物学教室助教

研究者番号: 60893873
J-GLOBAL ID: 202001009324854138
researchmap会員ID: R000008906

研究キーワード

研究分野

主要な経歴

2020年7月 - 現在

慶應義塾大学医学部分子生物学教室助教
2017年6月 - 2020年6月

シンシナティ小児病院医療センター生殖科学部門博士研究員

主要な学歴

2013年4月 - 2017年3月

東京農業大学大学院農学研究科バイオサイエンス専攻
2008年4月 - 2012年3月

東京農業大学応用生物科学部バイオサイエンス学科

受賞

2022年1月

研究奨励金 (基礎医学) 上原記念生命科学財団
2021年4月

第32回加藤記念研究助成加藤記念バイオサイエンス振興財団
2021年3月

2020年度優秀論文発表賞日本農芸化学会
2021年3月

UJA論文賞特別賞 UJA-海外日本人研究者ネットワーク
2019年12月

海外若手会員招聘企画採択第42回日本分子生物学会
2018年10月

Presentation Award UJA MidWest Conference 2018
2015年11月

Student Poster Award Epigenetics 2015, Australian Epigenetics Alliance
2015年5月

学術奨励賞第56回日本卵子学会
2014年5月

学術奨励賞第55回日本卵子学会
2012年5月

学術奨励賞第53回日本哺乳動物卵子学会

論文

Transcription of MERVL retrotransposons is required for preimplantation embryo development

Akihiko Sakashita, Tomohiro Kitano, Hirotsugu Ishizu, Youjia Guo, Harumi Masuda, Masaru Ariura, Kensaku Murano, Haruhiko Siomi

Nature Genetics 2023年3月2日査読有り筆頭著者
Suppression of endogenous retroviral enhancers in mouse embryos derived from somatic cell nuclear transfer

Daiki Shikata, Shogo Matoba, Masashi Hada, Akihiko Sakashita, Kimiko Inoue, Atsuo Ogura

Frontiers in Genetics 13 2022年11月8日査読有り
Bioinformatics Pipelines for Identification of Super-Enhancers and 3D Chromatin Contacts

Akihiko Sakashita, Chikara Takeuchi, So Maezawa, Satoshi H. Namekawa

Methods in Molecular Biology 2577 123-146 2022年11月査読有り筆頭著者責任著者
PRC1-mediated epigenetic programming is required to generate the ovarian reserve

Mengwen Hu, Yu-Han Yeh, Yasuhisa Munakata, Hironori Abe, Akihiko Sakashita, So Maezawa, Miguel Vidal, Haruhiko Koseki, Neil Hunter, Richard M. Schultz, Satoshi H. Namekawa

Nature Communications 13(1) 4510-4510 2022年8月10日査読有り
CRISPR-Mediated Activation of Transposable Elements in Embryonic Stem Cells

Akihiko Sakashita, Masaru Ariura, Satoshi H. Namekawa

Methods in Molecular Biology 171-194 2022年7月査読有り筆頭著者責任著者
Retrotransposons in the Mammalian Male Germline

Shumin Zhou, Akihiko Sakashita, Shuiqiao Yuan, Satoshi H. Namekawa

Sexual Development 1-19 2022年3月1日査読有り
Highly rigid H3.1/H3.2–H3K9me3 domains set a barrier for cell fate reprogramming in trophoblast stem cells

Masashi Hada, Hisashi Miura, Akie Tanigawa, Shogo Matoba, Kimiko Inoue, Narumi Ogonuki, Michiko Hirose, Naomi Watanabe, Ryuichiro Nakato, Katsunori Fujiki, Ayumi Hasegawa, Akihiko Sakashita, Hiroaki Okae, Kento Miura, Daiki Shikata, Takahiro Arima, Katsuhiko Shirahige, Ichiro Hiratani, Atsuo Ogura

Genes & Development 36(1-2) 84-102 2022年1月1日査読有り
Meiosis-specific ZFP541 repressor complex promotes developmental progression of meiotic prophase towards completion during mouse spermatogenesis

Yuki Horisawa-Takada, Chisato Kodera, Kazumasa Takemoto, Akihiko Sakashita, Kenichi Horisawa, Ryo Maeda, Ryuki Shimada, Shingo Usuki, Sayoko Fujimura, Naoki Tani, Kumi Matsuura, Tomohiko Akiyama, Atsushi Suzuki, Hitoshi Niwa, Makoto Tachibana, Takashi Ohba, Hidetaka Katabuchi, Satoshi H. Namekawa, Kimi Araki, Kei-Ichiro Ishiguro

Nature Communications 12(1) 2021年6月査読有り
Endogenous retroviruses drive species-specific germline transcriptomes in mammals

Akihiko Sakashita, So Maezawa, Kazuki Takahashi, Kris G. Alavattam, Masashi Yukawa, Yueh-Chiang Hu, Shohei Kojima, Nicholas F. Parrish, Artem Barski, Mihaela Pavlicev, Satoshi H. Namekawa

Nature Structural & Molecular Biology 27(10) 967-977 2020年10月査読有り筆頭著者
Super-enhancer switching drives a burst in gene expression at the mitosis-to-meiosis transition

So Maezawa, Akihiko Sakashita, Masashi Yukawa, Xiaoting Chen, Kazuki Takahashi, Kris G. Alavattam, Ippo Nakata, Matthew T. Weirauch, Artem Barski, Satoshi H. Namekawa

Nature Structural & Molecular Biology 27(10) 978-988 2020年10月査読有り筆頭著者
Isolation of Murine Spermatogenic Cells using a Violet-Excited Cell-Permeable DNA Binding Dye

Yu-Han Yeh, Mengwen Hu, Toshinori Nakagawa, Akihiko Sakashita, Shosei Yoshida, So Maezawa, Satoshi H. Namekawa

Journal of Visualized Experiments 2020年7月査読有り
Comparative analysis of enteroendocrine cells and their hormones between mouse intestinal organoids and native tissues

Junko Ohki, Akihiko Sakashita, Eitaro Aihara, Akihiko Inaba, Hironobu Uchiyama, Masahito Matsumoto, Yuzo Ninomiya, Takumi Yamane, Yuichi Oishi, Ken Iwatsuki

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 84(5) 936-942 2020年5月3日査読有り
UHRF1 suppresses retrotransposons and cooperates with PRMT5 and PIWI proteins in male germ cells

Juan Dong, Xiaoli Wang, Congcong Cao, Yujiao Wen, Akihiko Sakashita, Si Chen, Jin Zhang, Yue Zhang, Liquan Zhou, Mengcheng Luo, Mingxi Liu, Aihua Liao, Satoshi H. Namekawa, Shuiqiao Yuan

Nature Communications 10(1) 2019年12月査読有り
Sex-specific histone modifications in mouse fetal and neonatal germ cells

Yukiko Kawabata, Asuka Kamio, Yuko Jincho, Akihiko Sakashita, Tomoya Takashima, Hisato Kobayashi, Yasuhisa Matsui, Tomohiro Kono

Epigenomics 11(5) 543-561 2019年4月査読有り
XY oocytes of sex-reversed females with a Sry mutation deviate from the normal developmental process beyond the mitotic stage

Akihiko Sakashita, Takuya Wakai, Yukiko Kawabata, Chiaki Nishimura, Yusuke Sotomaru, Kris G Alavattam, Satoshi H Namekawa, Tomohiro Kono

Biology of Reproduction 100(3) 697-710 2019年3月1日査読有り筆頭著者
Attenuated chromatin compartmentalization in meiosis and its maturation in sperm development

Kris G. Alavattam, So Maezawa, Akihiko Sakashita, Haia Khoury, Artem Barski, Noam Kaplan, Satoshi H. Namekawa

Nature Structural & Molecular Biology 26(3) 175-184 2019年3月査読有り
LTR retrotransposons transcribed in oocytes drive species-specific and heritable changes in DNA methylation

Julie Brind’Amour, Hisato Kobayashi, Julien Richard Albert, Kenjiro Shirane, Akihiko Sakashita, Asuka Kamio, Aaron Bogutz, Tasuku Koike, Mohammad M. Karimi, Louis Lefebvre, Tomohiro Kono, Matthew C. Lorincz

Nature Communications 9(1) 3331-3331 2018年12月査読有り
Polycomb protein SCML2 facilitates H3K27me3 to establish bivalent domains in the male germline

So Maezawa, Kazuteru Hasegawa, Masashi Yukawa, Naoki Kubo, Akihiko Sakashita, Kris G. Alavattam, Ho-Su Sin, Andrey V. Kartashov, Hiroyuki Sasaki, Artem Barski, Satoshi H. Namekawa

Proceedings of the National Academy of Sciences 115(19) 4957-4962 2018年5月8日査読有り
Epigenomic and single-cell profiling of human spermatogonial stem cells

Akihiko Sakashita, Yu-Han V. Yeh, Satoshi H. Namekawa, Shau-Ping Lin

Stem Cell Investigation 5 11-11 2018年4月査読有り筆頭著者
RNF8 and SCML2 cooperate to regulate ubiquitination and H3K27 acetylation for escape gene activation on the sex chromosomes

Shannel R. Adams, So Maezawa, Kris G. Alavattam, Hironori Abe, Akihiko Sakashita, Megan Shroder, Tyler J. Broering, Julie Sroga Rios, Michael A. Thomas, Xinhua Lin, Carolyn M. Price, Artem Barski, Paul R. Andreassen, Satoshi H. Namekawa

PLOS Genetics 14(2) e1007233-e1007233 2018年2月20日査読有り

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MISC

REFEE, A Nuclear RNA Binding Protein, Regulates Early Development in Mice

Mie Kobayashi-Ishihara, Akihiko Sakashita, Masaru Ariura, Hirotsugu Ishizu, Tomohiro Kitano, Youjia Guo, Hidetoshi Hasuwa, Kensaku Murano, Haruhiko Siomi

SSCR/JSRM 2021 Tokyo International Symposium (120) 2021年10月
The Role of Retroelement MERVL in Preimplantation Development.

Akihiko SAKASHITA, Tomohiro KITANO, Hirotsugu ISHIZU, Youjia GUO, Masaru ARIURA, Kensaku MURANO, Haruhiko SIOMI

SSCR/JSRM 2021 Tokyo International Symposium (108) 2021年10月
腸管オルガノイドと生体腸組織における内分泌細胞の比較

大木淳子, 大木淳子, 坂下陽彦, 稲葉明彦, 粟飯原永太郎, 内山博允, 松本征仁, 二ノ宮裕三, 二ノ宮裕三, 山根拓実, 大石祐一, 岩槻健

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019 2019年
マウス胚発生過程における片親性DNAメチル化の継承とリプログラミングの全容解明

小林久人, 小池佐, 坂下陽彦, 隈本宗一郎, 神尾明日香, 河野友宏

エピゲノムはどこまで操れるようになったか第11回日本エピジェネティクス研究会年会プログラム集理研シンポジウム平成29年 2017年
オルガノイド培養系を用いた消化管内分泌細胞の解析

大木淳子, 坂下陽彦, 山根拓実, 松本征仁, 大石祐一, 岩槻健

日本食品科学工学会大会講演集 63rd 2016年
小規模およびシングルセルショットガンバイサルファイトシーケンス解析による生殖細胞系列における反復配列特性の解明

小林久人, 小池佐, 坂下陽彦, 田中啓介, 隈本宗一郎, 河野友宏

Journal of Reproduction and Development 62(Suppl Japanese Issue) 2016年
体細胞クローンマウス精子のDNAメチル化異常の検出

小池佐, 河野友宏, 神長祐子, 若井拓也, 水谷英二, 小林久人, 若山清香, 坂下陽彦, 三浦史仁, 伊藤隆司

日本繁殖生物学会講演要旨集 108 P-82-P-82 2015年
マウス初期胚における5hmCおよびH3K9me2の挙動とDNA脱メチル化制御機構

坂下陽彦, 中島芽生, 若井拓哉, 小林久人, 井関陽介, 河野友宏

Journal of Mammalian Ova Research 31(2) S78-S78 2014年4月1日
体細胞クローンマウス精子のDNAメチル化リプログラミング

若井拓哉, 水谷英二, 小林久人, 若山清香, 坂下陽彦, 伊藤隆司, 三浦史仁, 河野友宏

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th 2014年
マウス卵子形成過程における5ヒドロキシメチル化シトシンのダイナミクス

坂下陽彦, 小林久人, 井関陽介, 若井拓哉, 外丸祐介, 河野友宏

Journal of Reproduction and Development 59(Suppl Japanese Issue) J77-j77 2013年8月20日
マウス始原生殖細胞におけるDNAメチローム解析

小林久人, 櫻井隆順, 三浦史仁, 今井美咲, 望月研太郎, 柳澤永吉, 坂下陽彦, 若井拓哉, 鈴木穣, 伊藤隆司, 松居靖久, 河野友宏

日本繁殖生物学会講演要旨集 2012年8月
マウスにおける新規父方特異的メチル化DNA領域の探索

坂下陽彦, 小林久人, 尾畑やよい, 小川英彦, 河野友宏

Journal of mammalian ova research = 日本哺乳動物卵子学会誌 29(2) S56 2012年4月1日

書籍等出版物

Mouse embryonic development requires transposable element expression

Akihiko Sakashita, Haruhiko Siomi (担当:分担執筆)

2023年3月2日

講演・口頭発表等

転移因子が駆動する哺乳動物の個体発生

坂下陽彦

東海医学会 (東海大学医学部) 2023年1月30日招待有り
Regulation of host gene expression and cell fate by endogenous retrovirus during early stage of embryonic development

Akihiko Sakashita

The 1st international symposium of Non-Genome Replication 2022年12月5日
マウス初期発生胚における内在性レトロウイルスを介した宿主ゲノム制御機構

坂下陽彦

第94回日本遺伝学会大会シンポジウム 2022年9月14日招待有り
マウス初期胚における内在性レトロウイルスMERVLを介した全能性制御機構

坂下陽彦

第44回日本分子生物学会年会, 1PWS2-14; 「Epigenetic Regulatory Networks in Stem Cells」 2021年12月1日
精子形成過程における内在性レトロウイルスを介した種特異的遺伝子発現機構の解明

坂下陽彦

新学術領域研究「配偶子インテグリティの構築」・「全能性プログラム: デコーディングからデザインへ」合同公開シンポジウム 2020年12月22日招待有り
バイオインフォマテクス入門 ~RNA-seq法を用いた細胞種特異的トランスクリプトームの同定~

坂下陽彦

東京大学薬科学専攻生物薬科学講座セミナー 2020年11月6日招待有り
哺乳動物の精子形成過程における内在性レトロウイルスの役割

坂下陽彦

第47回山梨大学・発生工学研究センターセミナー 2019年6月5日招待有り

担当経験のある科目(授業)

2021年4月 - 現在

分子生物学 II (遺伝子解析実習) (慶應義塾大学医学部)
2021年4月 - 現在

分子生物学 II (生物進化学・分子系統学概論) (慶應義塾大学医学部)

所属学協会

2014年12月 - 現在

日本分子生物学会
2014年9月 - 現在

日本繁殖生物学会
2013年5月 - 現在

日本卵子学会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

内在性レトロウイルスを介した全能性制御機構の解明

科学技術振興機構創発的研究支援事業 2022年4月 - 2025年3月

坂下陽彦
内在性レトロウイルスによる宿主ゲノムのクロマチン再構築機構

日本学術振興会新学術領域研究(研究領域提案型) 2022年4月 - 2024年3月

坂下陽彦
生殖系列における内在性レトロウイルス由来エンハンサーの確立機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2021年4月 - 2023年3月

坂下陽彦
精子形成過程における内在性レトロウイルスの機能解明

日本学術振興会科学研究費助成事業海外特別研究員奨励費 2020年4月 - 2020年6月

坂下陽彦
Kinetics and functionalities of transposable elements during spermatogenesis

Lalor Foundation The Postdoctoral Fellowship Awards by Lalor Foundation 2018年6月 - 2020年3月

坂下陽彦
マウス生殖系列における性特異的エピゲノム修飾機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員 (DC2) 奨励費 2015年4月 - 2017年3月

坂下陽彦

坂下陽彦

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研究分野

主要な経歴

主要な学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

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