島田敦広 (Atsuhiro Shimada) - マイポータル

基本情報

所属: 岐阜大学応用生物科学部応用生命科学課程分子生命科学コース助教

学位: 博士（理学）(大阪大学)

研究者番号: 80723874
J-GLOBAL ID: 201701006536115586
researchmap会員ID: B000276919

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2021年4月 - 現在

岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授
2017年4月 - 2021年3月

岐阜大学, 応用生物科学部, 助教
2013年6月 - 2017年3月

兵庫県立大学, 生命理学研究科, 特任助教
2011年4月 - 2013年3月

日本学術振興会, 日本学術振興会特別研究員（DC2）

学歴

2009年4月 - 2013年5月

大阪大学, 大学院理学研究科博士後期課程, 生物科学専攻
2007年4月 - 2009年3月

大阪大学, 大学院理学研究科博士前期課程, 生物科学専攻
2006年3月 - 2006年11月

東北大学, 大学院農学研究科, 生物産業創成科学専攻
2002年4月 - 2006年3月

東北大学, 農学部

受賞

2020年8月

若手奨励賞, 日本蛋白質科学会

島田敦広
2018年9月

若手招待講演賞, 日本生物物理学会

島田敦広

主要な論文

Crystallographic cyanide-probing for cytochrome c oxidase reveals structural bases suggesting that a putative proton transfer H-pathway pumps protons.

Atsuhiro Shimada, Jumpei Baba, Shuhei Nagao, Kyoko Shinzawa-Itoh, Eiki Yamashita, Kazumasa Muramoto, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa

The Journal of biological chemistry 105277-105277 2023年9月22日査読有り筆頭著者
Recent progress in experimental studies on the catalytic mechanism of cytochrome c oxidase.

Atsuhiro Shimada, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa

Frontiers in chemistry 11 1108190-1108190 2023年査読有り
Brown adipose tissue dysfunction promotes heart failure via a trimethylamine N-oxide-dependent mechanism.

Yohko Yoshida, Ippei Shimizu, Atsuhiro Shimada, Keita Nakahara, Sachiko Yanagisawa, Minoru Kubo, Shinji Fukuda, Chiharu Ishii, Hiromitsu Yamamoto, Takamasa Ishikawa …

Scientific reports 12(1) 14883-14883 2022年9月1日査読有り
Metformin, phenformin, and galegine inhibit complex IV activity and reduce glycerol-derived gluconeogenesis.

Traci E LaMoia, Gina M Butrico, Hasini A Kalpage, Leigh Goedeke, Brandon T Hubbard, Daniel F Vatner, Rafael C Gaspar, Xian-Man Zhang, Gary W Cline, Keita Nakahara …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(10) e2122287119 2022年3月8日査読有り
Critical roles of the CuB site in efficient proton pumping as revealed by crystal structures of mammalian cytochrome c oxidase catalytic intermediates

Atsuhiro Shimada, Fumiyoshi Hara, Kyoko Shinzawa-Itoh, Nobuko Kanehisa, Eiki Yamashita, Kazumasa Muramoto, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa

Journal of Biological Chemistry 297(3) 100967-100967 2021年9月査読有り筆頭著者
X-ray structures of catalytic intermediates of cytochrome c oxidase provide insights into its O2-activation and unidirectional proton-pump mechanisms.

Atsuhiro Shimada, Yuki Etoh, Rika Kitoh-Fujisawa, Ai Sasaki, Kyoko Shinzawa-Itoh, Takeshi Hiromoto, Eiki Yamashita, Kazumasa Muramoto, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa

The Journal of biological chemistry 295(17) 5818-5833 2020年3月12日査読有り
X-ray structural analyses of azide-bound cytochrome c oxidases reveal that the H-pathway is critically important for the proton-pumping activity

Atsuhiro Shimada, Keita Hatano, Hitomi Tadehara, Naomine Yano, Kyoko Shinzawa-Itoh, Eiki Yamashita, Kazumasa Muramoto, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa

Journal of Biological Chemistry 293(38) 14868-14879 2018年9月21日査読有り
A nanosecond time-resolved XFEL analysis of structural changes associated with CO release from cytochrome c oxidase

Atsuhiro Shimada, Minoru Kubo, Seiki Baba, Keitaro Yamashita, Kunio Hirata, Go Ueno, Takashi Nomura, Tetsunari Kimura, Kyoko Shinzawa-Itoh, Junpei Baba …

SCIENCE ADVANCES 3(7) e1603042 2017年7月査読有り
Complex structure of cytochrome c-cytochrome c oxidase reveals a novel protein-protein interaction mode.

Shimada S, Shinzawa-Itoh K, Baba J, Aoe S, Shimada A, Yamashita E, Kang J, Tateno M, Yoshikawa S, Tsukihara T

The EMBO journal 36(3) 291-300 2017年2月査読有り
The Mg2+-containing Water Cluster of Mammalian Cytochrome c Oxidase Collects Four Pumping Proton Equivalents in Each Catalytic Cycle

Naomine Yano, Kazumasa Muramoto, Atsuhiro Shimada, Shuhei Takemura, Junpei Baba, Hidenori Fujisawa, Masao Mochizuki, Kyoko Shinzawa-Itoh, Eiki Yamashita, Tomitake Tsukihara …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 291(46) 23882-23894 2016年11月査読有り

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MISC

チトクロムc酸化酵素の構造多型結晶での反応中間体の構造決定

島田敦広, 原史剛, 江藤勇樹, 伊藤(新澤)恭子, 山下栄樹, 村本和優, 吉川信也, 月原冨武, 月原冨武

日本結晶学会年会講演要旨集 2022 2022年
ウシ心筋シトクロム酸化酵素の第二のシトクロムc結合構造

伊藤(新澤)恭子, 青江新平, 島田悟, 馬場淳平, 藤本光輝, 島田敦広, 山下栄樹, 吉川信也, 月原冨武, 月原冨武 …

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 47th (CD-ROM) 2021年
チトクロム酸化酵素によるプロトンポンプは、酸素結合によって誘起されるタンパク質内部の構造変化によって厳密に制御されている

島田敦広

生物物理 59(2) 106-107 2019年4月査読有り招待有り
チトクロームcオキシダーゼの中間体構造はO₂還元と共役した一方向性プロトンポンプメカニズムへの知見を提供する

SHIMADA Atsuhiro, MURAMOTO Kazumasa, SHINZAWA-ITOH Kyoko, TSUKIHARA Tomitake, TSUKIHARA Tomitake, YOSHIKAWA Shinya

日本細胞生物学会大会(Web) 71st 2019年
XFEL時分割構造解析法を用いたチトクロム酸化酵素のプロトンポンプ経路開閉機構の解明

島田敦広, 久保稔, 馬場清喜

放射光 31(3) 226-237 2018年5月査読有り招待有り
アジ化物結合チトクロム酸化酵素の高分解能構造解析によって明らかとなった,プロトンポンプ反応におけるH-pathwayの重要性

島田敦広, 伊藤(新澤)恭子, 村本和優, 月原冨武, 月原冨武, 吉川信也

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 44th 2018年
構造解析における動的ゆらぎと構造多型の区別-CO結合還元型チトクロム酸化酵素のX線結晶構造解析の場合

島田敦広, 矢野直峰, 山下栄樹, 廣本武史, 伊藤(新澤)恭子, 吉川信也, 月原冨武, 月原冨武

日本結晶学会年会講演要旨集 2018 2018年
Complex structure of cytochrome c-cytochrome c oxidase reveals a novel interprotein interaction mode

K. Shinzawa-Itoh, S. Shimada, J. Baba, S. Aoe, A. Shimada, E. Yamashita, J. Kang, M. Tateno, S. Yoshikawa, T. Tsukihara

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 46 S174-S174 2017年7月
Fixed target serial crystallography at SACLA

Masaki Yamamoto, Hideo Ago, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Go Ueno, Minoru Kubo, Seiki Baba, Kazuya Hasegawa, Takashi Kumasaka, Atsuhiro Shimada …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 73 A341-A341 2017年
チトクロム酸化酵素の高分解能結晶構造から明らかとなった高効率プロトンポンプ機構

SHIMADA Atsuhiro, YANO Naomine, MURAMOTO Kazumasa, YAMASHITA Eiki, YAMASHITA Eiki, SHINZAWA-ITOH Kyoko, TSUKIHARA Tomitake, TSUKIHARA Tomitake, YOSHIKAWA Shinya

生物物理(Web) 56(Supplement 1-2) 2016年
精密X線結晶構造解析によるチトクロム酸化酵素の酸素還元・プロトンポンプ機構

TSUKIHARA Tomitake, TSUKIHARA Tomitake, SHIMADA Atsuhiro, YANO Naomine, MURAMOTO Kazumasa, SHINZAWA-ITOH Kyoko, YAMASHITA Eiki, YOSHIKAWA Shinya

生物物理(Web) 56(Supplement 1-2) 2016年
耐熱性ミスマッチDNA修復蛋白質を利用したPCR法の改良

福井健二, 島田敦広, 豊竹洋佑, 増井良治, 倉光成紀, 倉光成紀

日本生化学会大会(Web) 86th 2013年
ATP加水分解にともなうMutSによるMutLの活性化

島田敦広, 増井良治, 増井良治, 倉光成紀, 倉光成紀, 福井健二

日本生化学会大会(Web) 85th 2012年
DNAミスマッチ修復タンパク質MutS-MutL間相互作用の動態解析

秦義人, 島田敦広, 増井良治, 増井良治, 福井健二, 倉光成紀, 倉光成紀

日本生化学会大会(Web) 85th 2012年
Biochemical properties of MutL, a DNA mismatch repair endonuclease

福井健二, 島田敦広, 飯野均, 増井良治, 倉光成紀

DNA Repair-On the pathways to Fixing DNA Damage and Errors 2011年9月査読有り招待有り
Thermus thermophilus HB8由来3′5′エキソヌクレアーゼの機能解析

島田敦広, 福井健二, 中川紀子, 中川紀子, 増井良治, 増井良治, 倉光成紀, 倉光成紀

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 2010年
DNAミスマッチ修復における鎖除去ステップの解析

島田敦広, 福井健二, 中川紀子, 中川紀子, 増井良治, 増井良治, 倉光成紀, 倉光成紀

生化学 2010年
ヒトタイプMutLにおけるATP依存的構造機能変化:立体構造予測を利用した構造機能解析

飯野均, 飯野均, KIM Kwang, 山本竜也, 島田敦広, 増井良治, 倉光成紀, 倉光成紀, 福井健二

生化学 2010年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

食品由来脂質代謝改善ペプチドの新規生体受容機構の解明と革新的応用に関する基盤研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

長岡利, 松井利郎, 海老原章郎, 本多裕之, 島田敦広
回折像とX線発光分光の同時時分割測定による、シトクロム酸化酵素の反応機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

島田敦広, 中根崇智, 片山哲夫
迅速二液混合法とポンププローブ法を用いたシトクロム酸化酵素の未知中間体構造の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2022年4月 - 2024年3月

島田敦広
ウシ心筋チトクロムc酸化酵素の反応中間体の精密結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2022年3月

月原冨武, 吉川信也, 島田敦広
XFEL時分割構造解析によるチトクロム酸化酵素の反応機構の解明

文部科学省科学研究費助成事業 2018年4月 - 2021年3月

島田敦広
X線自由電子レーザーを用いた、常温での高分解能無損傷X線結晶構造解析方法の開発

文部科学省科学研究費助成事業 2015年4月 - 2018年3月

島田敦広
エラーフリー PCR を目指した DNA ミスマッチ修復系のシステム生物学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2011年 - 2012年

島田敦広

産業財産権

WO2013-175815 核酸増幅反応におけるエラーを抑制する方法

福井健二, 島田敦広, 倉光成紀, 横山茂之

島田敦広

基本情報

研究分野

経歴

学歴

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主要な論文

MISC

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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