Paudel Atmika (Atmika Paudel) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学

連絡先: atmikapdczc.hokudai.ac.jp
研究者番号: 80832774
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-3478-9452
J-GLOBAL ID: 202001008901916605
researchmap会員ID: R000008904

研究キーワード

Microbiology, Infection, Host-pathogen interaction, antimicrobial agents, antimicrobial resistance, drug discovery, anti-infective agents, virulence factors, pathogenicity

研究分野

ライフサイエンス / 感染症内科学 / Host-pathogen interaction, anti-infective drug discovery, virulence factor, pathogenicity

経歴

2020年9月 - 現在

北海道大学
2016年4月 - 2020年8月

帝京大学, 医真菌研究センター
2013年6月 - 2016年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科
2010年8月 - 2012年3月

特定国立研究開発法人理化学研究所

学歴

2010年4月 - 2013年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科
2008年4月 - 2010年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科
2007年4月 - 2008年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科
2001年11月 - 2005年12月

Tribhuvan University, Department of Pharmacy, Institute of Medicine, Bachelors of Pharmacy

受賞

2021年10月

Best Poster Award, Hokkaido University
2014年9月

Nepal Bidhya Bhusan (A), Nepal Government

論文

Development of a PCR-dipstick DNA chromatography-based tool for the detection of CTX-M- and TEM-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from patients in Kafue and Katete districts of Zambia.

Misheck Shawa, Kyoko Hayashida, Naganori Nao, Atmika Paudel, Harvey Kamboyi, Herman Chambaro, Malala Mulavu, Cynthia Sipho Khumalo, Mike Nundwe, Tuvshinzaya Zorigt …

BMC infectious diseases 25(1) 541-541 2025年4月16日
EsxA, a type VII secretion system-dependent effector, reveals a novel function in the sporulation of Bacillus cereus ATCC14579

Harvey K. Kamboyi, Atmika Paudel, Misheck Shawa, Misa Sugawara, Tuvshinzaya Zorigt, Joseph Y. Chizimu, Tomoe Kitao, Yoshikazu Furuta, Bernard M. Hang’ombe, Musso Munyeme …

BMC Microbiology 24(1) 2024年9月17日
Pan-genome analysis reveals novel chromosomal markers for multiplex PCR-based specific detection of Bacillus anthracis

Tuvshinzaya Zorigt, Yoshikazu Furuta, Atmika Paudel, Harvey Kakoma Kamboyi, Misheck Shawa, Mungunsar Chuluun, Misa Sugawara, Nyamdorj Enkhtsetseg, Jargalsaikhan Enkhtuya, Badgar Battsetseg …

BMC Infectious Diseases 24(1) 2024年9月9日
Trends, patterns and relationship of antimicrobial use and resistance in bacterial isolates tested between 2015-2020 in a national referral hospital of Zambia.

Misheck Shawa, Atmika Paudel, Herman Chambaro, Harvey Kamboyi, Ruth Nakazwe, Luke Alutuli, Tuvshinzaya Zorigt, Taona Sinyawa, Mulemba Samutela, Joseph Chizimu …

PloS one 19(4) e0302053 2024年
Transcriptome change of Staphylococcus aureus in infected mouse liver.

Hiroshi Hamamoto, Suresh Panthee, Atmika Paudel, Suguru Ohgi, Yutaka Suzuki, Koichi Makimura, Kazuhisa Sekimizu

Communications biology 5(1) 721-721 2022年7月20日
Complete Genome Sequences of 24 Strains of Bacillus cereus Isolated from Nosocomial Infection and Bacteremia Cases in Japan.

Yoshikazu Furuta, Mai Tsujinouchi, Misheck Shawa, Tuvshinzaya Zorigt, Yuya Miyajima, Atmika Paudel, Satowa Suzuki, Hideaki Higashi

Microbiology resource announcements 11(4) e0120321 2022年4月21日
選抜ワークショップ5:抗菌性物質、薬剤耐性新規抗生物質ライソシンEは宿主と微生物の相互作用を利用して高い治療効果を発揮する

浜本洋, Panthee Suresh, Paudel Atmika, 宮下惇嗣, 関水和久

日本細菌学雑誌 77(1) 57-57 2022年2月
Clonal relationship between multidrug-resistant Escherichia coli ST69 from poultry and humans in Lusaka, Zambia.

Misheck Shawa, Yoshikazu Furuta, Atmika Paudel, O'Brian Kabunda, Evans Mulenga, Maron Mubanga, Harvey Kamboyi, Tuvshinzaya Zorigt, Herman Chambaro, Manyando Simbotwe …

FEMS microbiology letters 2022年1月14日
Silkworm model for Bacillus anthracis infection and virulence determination

Atmika Paudel, Yoshikazu Furuta, Hideaki Higashi

Virulence 12(1) 2285-2295 2021年12月査読有り筆頭著者責任著者
YjbH regulates virulence genes expression and oxidative stress resistance in Staphylococcus aureus.

Atmika Paudel, Suresh Panthee, Hiroshi Hamamoto, Tom Grunert, Kazuhisa Sekimizu

Virulence 12(1) 470-480 2021年12月査読有り筆頭著者
Novel Pathogenic Mucorales Identified Using the Silkworm Infection Model.

Suresh Panthee, Hiroshi Hamamoto, Yayoi Nishiyama, Atmika Paudel, Kazuhisa Sekimizu

Journal of fungi (Basel, Switzerland) 7(11) 2021年11月22日
Comparative analysis of COVID‐19 case fatality rate between two waves in Nepal

Sulochan GC, Ashok Khanal, Atmika Paudel, Vijay S. GC, Aashis Khanal, Suresh Panthee

Influenza and Other Respiratory Viruses 2021年10月14日査読有り責任著者
Contribution of rsaC, a small non-coding RNA, towards the pathogenicity of Staphylococcus aureus in a mouse systemic infection model

bioRxiv 2021年10月
Direct Regulons of AtxA, the Master Virulence Regulator of Bacillus anthracis

Yoshikazu Furuta, Cheng Cheng, Tuvshinzaya Zorigt, Atmika Paudel, Shun Izumi, Mai Tsujinouchi, Tomoko Shimizu, Wim G. Meijer, Hideaki Higashi

mSystems 6(4) 2021年8月31日査読有り
Transcriptome change in Staphylococcus aureus in infecting mice

bioRxiv 2021年7月2日
Hybrid assembly using ultra-long reads resolves repeats and completes the genome sequence of a laboratory strain of Staphylococcus aureus subsp. aureus RN4220

Suresh Panthee, Hiroshi Hamamoto, Atmika Paudel, Chikara Kaito, Yutaka Suzuki, Kazuhisa Sekimizu

2021年6月25日
Novel chromosomal insertions of ISEcp1-blaCTX-M-15 and diverse antimicrobial resistance genes in Zambian clinical isolates of Enterobacter cloacae and Escherichia coli.

Misheck Shawa, Yoshikazu Furuta, Gillan Mulenga, Maron Mubanga, Evans Mulenga, Tuvshinzaya Zorigt, Christone Kaile, Manyando Simbotwe, Atmika Paudel, Bernard Hang'ombe …

Antimicrobial resistance and infection control 10(1) 79-79 2021年5月10日査読有り
Complete genome sequence and comparative genomic analysis of Enterococcus faecalis EF-2001, a probiotic bacterium.

Suresh Panthee, Atmika Paudel, Hiroshi Hamamoto, Akihiko Ano Ogasawara, Toshihiro Iwasa, Jochen Blom, Kazuhisa Sekimizu

Genomics 113(3) 1534-1542 2021年5月査読有り
Serum proteins potentiate therapeutic efficacy of lysocin E against S. aureus

2021年査読有り
Discovery of gramicidin A analogues with altered activities by multidimensional screening of a one-bead-one-compound library.

Yuri Takada, Hiroaki Itoh, Atmika Paudel, Suresh Panthee, Hiroshi Hamamoto, Kazuhisa Sekimizu, Masayuki Inoue

Nature communications 11(1) 4935-4935 2020年10月1日査読有り

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MISC

新規抗生物質ライソシンEは宿主と微生物の相互作用を利用して高い治療効果を発揮する

浜本洋, PANTHEE Suresh, PAUDEL Atmika, 宮下惇嗣, 関水和久, 関水和久

日本細菌学雑誌(Web) 77(1) 2022年
血清因子による新規抗生物質カイコシンの抗菌活性促進

安川淳一朗, 浜本洋, SU Jie, ATMIKA Paudel, 浦井誠, 石井健一, 安達健朗, 西田智, 関水和久

日本細菌学雑誌 69(1) 135-135 2014年2月25日
カイコ細菌感染モデルを用いた治療有効な新規抗生物質カイコシンの作用機序解析

安川淳一朗, 浜本洋, Su Jie, Paudel Atmika, 浦井誠, 西田智, 関水和久

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 86回 2T19a-05 2013年9月

講演・口頭発表等

An invertebrate animal model to study the host-pathogen interaction during the infection

Atmika Paudel, Yoshikazu Furuta, Hideaki Higashi

The 7th Hokkaido University Cross-Departmental Symposium, 2021, Hokkaido, Japan 2021年10月1日
Utilization of invertebrate animal model for anti-infective drug discovery

Atmika Paudel, Yoshikazu Furuta, Suresh Panthee, Hiroshi Hamamoto, Kazuhisa Sekimizu, Hideaki Higashi

The 19th Awaji International Forum on Infection and Immunity, 2021 2021年9月28日
Use of an invertebrate animal model for assessing virulence of pathogens

Atmika Paudel, Yoshikazu Furuta, Suresh Panthee, Hiroshi Hamamoto, Kazuhisa Sekimizu, Hideaki Higashi

The 9th SaSSOH, Sapporo Summer Symposium for One Health 2021年9月15日
Host-based approach for identifying virulence factors of pathogens

Atmika Paudel, Yoshikazu Furuta, Suresh Panthee, Hiroshi Hamamoto, Kazuhisa Sekimizu, Hideaki Higashi

The 86th Annual Conference of Japanese Society for Bacteriology Hokkaido Branch 2021年8月28日
Therapeutic activity of antimicrobial agents is correlated with the appropriate pharmacokinetics in silkworms

ASM microbe 2018年
Identification of novel genes required for virulence of Staphylococcus aureus USA300 using invertebrate model silkworm.

Asian Insect Immunity Symposium 2018年
Pharmacokinetic analysis of therapeutically effective antimicrobial agents using silkworm infection model

Japan-China Joint Medical Workshop 2017年招待有り
An antibacterial agent inhibited bacterial transcription by targeting primary sigma factor and preventing open complex formation

ASM Microbe 2016年
Novel and therapeutically effective antibacterial agent targetting the sigma factor of bacterial RNA polymerase.

14th Life Science Network The University of Tokyo Symposium 2014年
Novel Therapeutically Effective Antimicrobial Agent Targets Bacterial RNA Polymerase Sigma Factor A

ICAAC 2014年
Discovery of novel antibiotics using silkworm infection model

Science dialogue 2013年招待有り
Identification of Kaikosin E, a novel therapeutically effective antibiotic, using silkworm infection model.

Program for Young Researcher Symposium in Europe 2012年
Use of silkworm bacterial infection model to identify novel therapeutically effective antibiotic, Kaikosin E

Japan-China Joint Medical Workshop 2012年招待有り
Discovery of novel therapeutically effective antibiotic kaikosin E using silkworm infection model.

11th Life Science Network. The University of Tokyo Symposium 2011年
A novel therapeutically effective lipopeptide antibiotic, Kaikosin E, identified using the silkworm infection model.

International Union of Microbiological Societies (IUMS) 2011年
Use of silkworm bacterial infection model to screen therapeutically effective antibiotics.

The 2nd Global COE Retreat in Oiso, 2010 2010年

所属学協会

2016年 - 現在

American Society of Microbiology
2004年1月 - 現在

Graduate Pharmacists' Association, Nepal
2004年1月 - 現在

Nepal Pharmaceutical Association

共同研究・競争的資金等の研究課題

Identification of genetic basis of virulence determinants of emerging Bacillus cereus ST1420 using silkworm model

Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Early-Career Scientists 若手研究 2021年4月 - 2024年3月

Atmika Paudel
Identification and characterization of novel virulence factors of Staphylococcus aureus USA300 using silkworm model.

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2019年4月 - 2021年3月

Atmika Paudel
Discovery of novel antimicrobial agents with novel mechanisms of actions using silkworm infection model

東京生化学研究会 2015年6月 - 2017年5月
治療効果を指標に同定された新規抗菌薬の作用機序解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2013年4月 - 2015年3月

Kazuhisa Sekimizu, Atmika Paudel

メディア報道

RSC Advances HOT articles

https://blogs.rsc.org/ra/2019/12/18/rsc-advances-hot-articles-a-feature-interview-with-atmika-paudel-and-kazuhisa-sekimizu/?doing_wp_cron=1602215456.6478590965270996093750

Paudel Atmika

基本情報

研究キーワード

研究分野

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MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

メディア報道

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