共同研究・競争的資金等の研究課題

2011年 - 2012年

ポストゲノム機能解析を促進する新規データ統合手法の開発~新規共発現関係の探索~

日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

課題番号
23700355
配分額
(総額)
2,860,000円
(直接経費)
2,200,000円
(間接経費)
660,000円

遺伝子共発現解析による遺伝子機能予測を向上させるために、新規データ統合手法の開発を目指した。また二つの条件間で各々測定された遺伝子群間の共発現パターンが二条件間で有意に異なる遺伝子群を探す手法 (共発現差異)を実装したDiffCorr パッケージを開発し、さらなる遺伝子機能予測の向上を推進した。この手法はバイオマーカ候補の探索に役立ち、因果ネットワーク推定の第一歩となる。

リンク情報
URL
https://kaken.nii.ac.jp/file/KAKENHI-PROJECT-23700355/23700355seika.pdf
ID情報
  • 課題番号 : 23700355