清水厚志 (Atsushi Shimizu) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: 岩手医科大学医歯薬総合研究所　生体情報解析部門教授
: (兼任)いわて東北メディカル・メガバンク機構 (副機構長)
: (兼任)医歯薬総合研究所　ゲノム・オミックス解析支援センター (センター長)
: 国立遺伝学研究所日本DNAデータバンク (特命教授)
: 慶應義塾大学医学部衛生学公衆衛生学教室特任教授
: 東北大学東北メディカル・メガバンク機構 (客員教授)

学位: 博士（理学）(青山学院大学)

研究者番号: 30327655
J-GLOBAL ID: 201201004912271535
researchmap会員ID: B000222729

外部リンク: http://iwate-megabank.org

研究キーワード

6

研究分野

4

主要な経歴

13

2022年4月 - 現在

国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJセンター, 特命教授
2020年5月 - 現在

東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構 (客員教授)
2020年1月 - 現在

岩手医科大学, 医歯薬総合研究所生体情報解析部門, 教授
2019年8月 - 現在

慶應義塾大学, 医学部衛生学公衆衛生学教室, 特任教授
2013年4月 - 2024年3月

慶應義塾大学, 医学部生理学教室 (訪問教授)
2013年3月 - 2019年12月

岩手医科大学, いわて東北メディカル・メガバンク機構, 特命教授

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主要な学歴

2

1994年4月 - 1999年3月

青山学院大学, 大学院理工学研究科, 化学専攻

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委員歴

4

2022年1月 - 現在

日本疫学会疫学, リソース利用促進委員会リンケージ基盤推進ワーキンググループ委員
2019年11月 - 現在

日本人類遺伝学会, 利益相反委員会委員
2019年11月 - 現在

日本人類遺伝学会, 評議員
2018年4月 - 2020年3月

日本バイオインフォマティクス学会, 理事

主要な論文

172

Epigenetic profile of Japanese supercentenarians: a cross-sectional study

Shohei Komaki, Masatoshi Nagata, Eri Arai, Ryo Otomo, Kanako Ono, Yukiko Abe, Hideki Ohmomo, So Umekage, Natsuko O Shinozaki, Tsuyoshi Hachiya …

The Lancet Healthy Longevity 4(2) e83-e90 2023年2月査読有り最終著者責任著者
Evaluation of short-term epigenetic age fluctuation

Shohei Komaki, Hideki Ohmomo, Tsuyoshi Hachiya, Yoichi Sutoh, Kanako Ono, Ryohei Furukawa, So Umekage, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Shiori Minabe, Akira Takashima …

Clinical Epigenetics 14(1) 76-76 2022年12月査読有り最終著者責任著者
Potential DNA methylation biomarkers for the detection of clear cell renal cell carcinoma identified by a whole blood-based epigenome-wide association study

Hideki Ohmomo, Shohei Komaki, Yoichi Sutoh, Tsuyoshi Hachiya, Kanako Ono, Eri Arai, Hiroyuki Fujimoto, Teruhiko Yoshida, Yae Kanai, Koichi Asahi …

Epigenetics Communications 2(1) 2022年12月査読有り最終著者責任著者
ヒトゲノム計画とヒトゲノム完全解読

清水厚志

JSBi Bioinformatics Review 3(1) 11-19 2022年6月2日査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
DNA Methylation Abnormalities and Altered Whole Transcriptome Profiles after Switching from Combustible Tobacco Smoking to Heated Tobacco Products.

Hideki Ohmomo, Sei Harada, Shohei Komaki, Kanako Ono, Yoichi Sutoh, Ryo Otomo, So Umekage, Tsuyoshi Hachiya, Kota Katanoda, Toru Takebayashi …

Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology 31(1) 269-279 2022年1月査読有り最終著者責任著者
Longitudinal DNA methylation dynamics as a practical indicator in clinical epigenetics.

Shohei Komaki, Hideki Ohmomo, Tsuyoshi Hachiya, Yoichi Sutoh, Kanako Ono, Ryohei Furukawa, So Umekage, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Kozo Tanno, Makoto Sasaki …

Clinical epigenetics 13(1) 219-219 2021年12月13日査読有り最終著者責任著者
Genome-Wide Polygenic Score and the Risk of Ischemic Stroke in a Prospective Cohort: The Hisayama Study.

Tsuyoshi Hachiya, Jun Hata, Yoichiro Hirakawa, Daigo Yoshida, Yoshihiko Furuta, Takanari Kitazono, Atsushi Shimizu, Toshiharu Ninomiya

Stroke 51(3) 759-765 2020年3月査読有り責任著者
Population-based biobank participants' preferences for receiving genetic test results

Kayono Yamamoto, Tsuyoshi Hachiya, Akimune Fukushima, Naoki Nakaya, Akira Okayama, Kozo Tanno, Fumie Aizawa, Tomoharu Tokutomi, Atsushi Hozawa, Atsushi Shimizu

JOURNAL OF HUMAN GENETICS 62(12) 1037-1048 2017年12月査読有り最終著者責任著者
Genome-wide identification of inter-individually variable DNA methylation sites improves the efficacy of epigenetic association studies

Tsuyoshi Hachiya, Ryohei Furukawa, Yuh Shiwa, Hideki Ohmomo, Kanako Ono, Fumiki Katsuoka, Masao Nagasaki, Jun Yasuda, Nobuo Fuse, Kengo Kinoshita …

NPJ GENOMIC MEDICINE 2 11 2017年4月査読有り最終著者責任著者
Genetic Predisposition to Ischemic Stroke: A Polygenic Risk Score

Tsuyoshi Hachiya, Yoichiro Kamatani, Atsushi Takahashi, Jun Hata, Ryohei Furukawa, Yuh Shiwa, Taiki Yamaji, Megumi Hara, Kozo Tanno, Hideki Ohmomo …

STROKE 48(2) 253-258 2017年2月査読有り最終著者責任著者
Intraindividual dynamics of transcriptome and genome-wide stability of DNA methylation

Ryohei Furukawa, Tsuyoshi Hachiya, Hideki Ohmomo, Yuh Shiwa, Kanako Ono, Sadafumi Suzuki, Mamoru Satoh, Jiro Hitomi, Kenji Sobue, Atsushi Shimizu

SCIENTIFIC REPORTS 6 26424 2016年5月査読有り最終著者責任著者

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主要なMISC

197

ヒトゲノム完全配列決定 ――なぜヒトゲノム計画完了宣言から完全配列決定まで20年かかったか…

清水厚志

科学 92(8) 692-696 2022年7月筆頭著者最終著者責任著者
出生コホート連携ゲノムコホート研究におけるIPDメタ解析の取り組み

清水厚志

日本衛生学雑誌 77(Suppl.) S117-S117 2022年3月
【最新臨床脳卒中学(第2版)上-最新の診断と治療-】危険因子遺伝要因

八谷剛史, 清水厚志

日本臨床 80(増刊1 最新臨床脳卒中学(上)) 333-338 2022年1月
ゲノム医療におけるデータベース-使い方とコツ 1.一般集団・多因子疾患関連バリアントのデータベース 2)iMETHYL

小巻翔平, 清水厚志, 清水厚志

遺伝子医学 12(1) 20-23 2022年1月
【Common disease解析の最前線】ゲノムコホート研究におけるポリジェニックリスクスコア開発の最前線

須藤洋一, 八谷剛史, 清水厚志

遺伝子医学 11(2) 63-68 2021年4月
エピゲノムワイド関連解析

小巻翔平, 清水厚志

遺伝子医学 10(2) 137-141 2020年4月

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主要な書籍等出版物

7

がんゲノムデータ解析

清水厚志, 坊農秀雅 (担当:編者(編著者))

メディカルサイエンスインターナショナル 2022年9月2日 (ISBN: 4815730520)
次世代シークエンサーDRY解析教本

清水厚志, 坊農秀雅 (担当:編者(編著者))

学研メディカル秀潤社 2019年12月12日 (ISBN: 478090983X)
次世代シークエンサーDRY解析教本 (細胞工学別冊)

清水厚志, 坊農秀雅 (担当:監修)

学研メディカル秀潤社 2015年10月15日 (ISBN: 4780909201)
細胞工学２０１１年８月号Ｖｏｌ．３０Ｎｏ．８

清水厚志、佐々木貴史 (担当:編者(編著者))

学研メディカル秀潤社 2011年7月19日 (ISBN: 4780901219)

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主要な講演・口頭発表等

122

脳梗塞のゲノム疫学研究

清水厚志

第54回日本動脈硬化学会総会・学術集会 2022年7月24日招待有り
ポリジェニックリスクスコアのがん予防や治療への実装と課題

日本人類遺伝学会第66回大会第28回日本遺伝子診療学会大会合同開催 2021年10月16日招待有り

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主要な担当経験のある科目(授業)

8

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主要な所属学協会

9

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主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

28

コホート・生体試料支援プラットフォーム

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成) 学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成) 2022年4月 - 2028年3月

村上善則, 若井建志, 村山繁雄, 醍醐弥太郎, 中村洋子, 成松宏人, 栗木清典, 鈴木貞夫, 松尾恵太郎, 喜多義邦, 三浦克之, 小山晃英, 有澤孝吉, 村田昌之, 田中恵太郎, 郡山千早, 玉腰暁子, 今田恒夫, 武林亨, 鈴木康司, 齊藤祐子, 高尾昌樹, 金田大太, 美原盤, 井本逸勢, 宮城洋平, 渡邉俊樹, 安井寛, 中杤昌弘, 清水厚志, 室谷健太
臍帯血ゲノム・エピゲノムによる小児肥満複合リスク予測モデルの開発と検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

清水厚志
ヒトの網羅的解析とその統合解析による新型たばこの疾患リスクの早期評価とその展開

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

原田成, 清水厚志, 大桃秀樹
周産期のストレス曝露に起因する児の知能・精神発達遅滞のバイオマーカー確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

祖父江憲治, 福本健太郎, 真柳平, 清水厚志, 八木淳子, 大桃秀樹, 小巻翔平, 赤坂真奈美
がん化耐性齧歯類ハダカデバネズミ特異的ながん化抑制バリアの形成メカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

三浦恭子, 坊農秀雅, 清水厚志, 大岩祐基
対象配列特異的シークエンシング法によるドラフトゲノムの効率的精度向上法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2012年4月 - 2013年3月

清水厚志

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産業財産権

2

特願2021-010660 腎細胞癌の診断マーカー及びそれを用いた診断方法

大桃秀樹, 清水厚志, 金井弥栄, 新井恵吏
特許6716143 脳梗塞発症リスクの予測モデル作成方法および予測方法

八谷剛史, 清水厚志, 人見次郎

主要な社会貢献活動

3

遺伝と病気（いでんとびょうき）

講師

第４回ゲノムコホート研究における遺伝統計学公開市民講座 2019年11月16日
遺伝講習会

講師

岩手医科大学矢巾キャンパス 2014年11月1日

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主要なメディア報道

6

日本人の病気共同研究環境や遺伝 36万人分データ利用

読売新聞岩手版 2021年8月新聞・雑誌
DNAメチル化

バイリンガルニュース 2017年7月13日インターネットメディア
DNAメチル化解析からエピゲノム多様性解読

科学新聞 2017年5月12日新聞・雑誌
脳梗塞なりやすさゲノム予測岩手医科大が新手法

朝日新聞 2017年1月20日新聞・雑誌

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