SHIMIZU Atsushi

J-GLOBAL         Last updated: Jan 8, 2020 at 00:45
 
Avatar
Name
SHIMIZU Atsushi
Nickname
atsushi_ngs
E-mail
ashimizuiwate-med.ac.jp
URL
http://researchmap.jp/atsushi_ngs/
Affiliation
Iwate Medical University
Section
Iwate Tohoku Medical Megabank Organization
Job title
Professor
Research funding number
30327655
Twitter ID
atsushi_ngs

Research Interests

 
 

Research Areas

 
 

Academic & Professional Experience

 
Jan 2020
 - 
Today
岩手医科大学
 
Sep 2018
 - 
Today
Project Professor, DDBJ Center, National Institute of Genetics
 
2013
 - 
2013
Associate Professor
 
2012
 - 
2013
Assistant Professor
 
2007
 - 
2012
Instructor
 
2004
 - 
2007
Instructor
 
2000
 - 
2004
Instructor (Non-tenured)
 
1999
 - 
2000
Researcher (Non-tenured)
 

Education

 
 
 - 
1999
Graduate School, Division of Science and Engineering, Aoyama Gakuin University
 
 
 - 
1994
Faculty of Science and Engineering, Aoyama Gakuin University
 

Published Papers

 
Nishida Y, Hachiya T, Hara M, Shimanoe C, Tanaka K, Sutoh Y, Shimizu A, Hishida A, Tsukamoto M, Kadomatsu Y, Oze I, Koyanagi YN, Kuriyama N, Koyama T, Ibusuki R, Takezaki T, Ikezaki H, Furusyo N, Takashima N, Kadota A, Uemura H, Katsuura-Kamano S, Suzuki S, Nakagawa-Senda H, Kuriki K, Mikami H, Nakamura Y, Momozawa Y, Kubo M, Nakatochi M, Naito M, Wakai K, Japan Multi-Institutional Collaborative Cohort Study Group.
Journal of lipid research   61(1) 86-94   Jan 2020   [Refereed]
Low SK, Chin YM, Ito H, Matsuo K, Tanikawa C, Matsuda K, Saito H, Sakurai-Yageta M, Nakaya N, Shimizu A, Nishizuka SS, Yamaji T, Sawada N, Iwasaki M, Tsugane S, Takezaki T, Suzuki S, Naito M, Wakai K, Kamatani Y, Momozawa Y, Murakami Y, Inazawa J, Nakamura Y, Kubo M, Katagiri T, Miki Y
Scientific reports   9(1) 17332   Nov 2019   [Refereed]
Takata R, Takahashi A, Fujita M, Momozawa Y, Saunders EJ, Yamada H, Maejima K, Nakano K, Nishida Y, Hishida A, Matsuo K, Wakai K, Yamaji T, Sawada N, Iwasaki M, Tsugane S, Sasaki M, Shimizu A, Tanno K, Minegishi N, Suzuki K, Matsuda K, Kubo M, Inazawa J, Egawa S, Haiman CA, Ogawa O, Obara W, Kamatani Y, Akamatsu S, Nakagawa H
Nature communications   10(1) 4422   Sep 2019   [Refereed]
Akiyama M, Ishigaki K, Sakaue S, Momozawa Y, Horikoshi M, Hirata M, Matsuda K, Ikegawa S, Takahashi A, Kanai M, Suzuki S, Matsui D, Naito M, Yamaji T, Iwasaki M, Sawada N, Tanno K, Sasaki M, Hozawa A, Minegishi N, Wakai K, Tsugane S, Shimizu A, Yamamoto M, Okada Y, Murakami Y, Kubo M, Kamatani Y
Nature communications   10(1) 4393   Sep 2019   [Refereed]
Kuriyama S, Metoki H, Kikuya M, Obara T, Ishikuro M, Yamanaka C, Nagai M, Matsubara H, Kobayashi T, Sugawara J, Tamiya G, Hozawa A, Nakaya N, Tsuchiya N, Nakamura T, Narita A, Kogure M, Hirata T, Tsuji I, Nagami F, Fuse N, Arai T, Kawaguchi Y, Higuchi S, Sakaida M, Suzuki Y, Osumi N, Nakayama K, Ito K, Egawa S, Chida K, Kodama E, Kiyomoto H, Ishii T, Tsuboi A, Tomita H, Taki Y, Kawame H, Suzuki K, Ishii N, Ogishima S, Mizuno S, Takai-Igarashi T, Minegishi N, Yasuda J, Igarashi K, Shimizu R, Nagasaki M, Tanabe O, Koshiba S, Hashizume H, Motohashi H, Tominaga T, Ito S, Tanno K, Sakata K, Shimizu A, Hitomi J, Sasaki M, Kinoshita K, Tanaka H, Kobayashi T, Kure S, Yaegashi N, Yamamoto M, Tohoku Medical Megabank Project Study Group .
International journal of epidemiology      Aug 2019   [Refereed]

Misc

 
DNAメチル化多様性に基づく効率的なエピゲノムマーカー探索手法の確立
清水 厚志, 八谷 剛史, 大友 亮, 大桃 秀樹, 須藤 洋一, 小巻 翔平, 志波 優, 古川 亮平, 篠崎 夏子, 小野 加奈子, 佐々木 真理
日本遺伝カウンセリング学会誌   40(2) 87-87   Jul 2019
メガゲノム時代の糖尿病学 バイオバンク・ゲノムコホート連携による疾患発症リスク予測モデルの構築
清水 厚志
糖尿病   62(Suppl.1) S-62   Apr 2019
糖尿病群と非糖尿病群におけるPW=Vに関連する因子の違いの検討
武部 典子, 丹野 高三, 大桃 秀樹, 佐藤 衛, 清水 厚志, 坂田 清美, 石垣 泰, 佐々木 真理
日本内分泌学会雑誌   95(1) 396-396   Apr 2019
問診票入力から国際基準の医療用家系図を自動作成する家系情報収集ツールの開発
徳富 智明, 福島 明宗, 山本 佳世乃, 中山 文予, 勝部 暢介, 清水 厚志, 佐々木 真理
日本遺伝カウンセリング学会誌   38(4) 117-125   Jan 2018
問診票に入力するだけで自動的に医療用家系図が作成できるソフトウェア「f-tree(エフツリー)」最新版の使用方法を解説し、現在利用が可能な海外の家族歴ツールについても紹介した。f-treeは描画を目的とした従来のソフトとは異なり、問診票をベースとした新しい自動家系図作成ソフトである。f-treeの特徴は、問診票ベースのため専門的な知識や作図スキルを必要としないこと、医療用家系図の国際的ルールを100%準拠していること、データとして一度に大量の家系図を含む家系情報として取扱いができることであ...
メガゲノム時代の糖尿病学 バイオバンク・ゲノムコホート連携による疾患発症リスク予測モデルの構築
清水 厚志
糖尿病   62(Suppl.1) S-62   Apr 2019
東日本大震災後の社会的孤立と抑うつ症状との関連 TMM CommCohort Study
事崎 由佳, 丹野 高三, 佐々木 亮平, 高梨 信之, 三上 貴浩, 寳澤 篤, 栗山 進一, 辻 一郎, 高橋 宗康, 清水 厚志, 人見 次郎, 坂田 清美
日本公衆衛生学会総会抄録集   77回 463-463   Oct 2018
東日本大震災後の心理的苦痛有病割合の推移 地域住民コホート調査
丹野 高三, 佐々木 亮平, 高梨 信之, 事崎 由佳, 三上 貴浩, 高橋 宗康, 寳澤 篤, 栗山 進一, 辻 一郎, 清水 厚志, 人見 次郎, 坂田 清美
日本公衆衛生学会総会抄録集   77回 506-506   Oct 2018
糖尿病と非糖尿病における上腕 足首脈波伝播速度(baPWV)に関連する因子の解析
武部 典子, 半谷 真理, 丹野 高三, 大桃 秀樹, 佐藤 衛, 清水 厚志, 坂田 清美, 石垣 泰, 佐々木 真理
糖尿病   61(Suppl.1) S-258   Apr 2018
グリコアルブミン/HbA1c比に影響を及ぼす因子の検討
半谷 真理, 武部 典子, 丹野 高三, 大桃 秀樹, 佐藤 衛, 清水 厚志, 坂田 清美, 石垣 泰, 佐々木 真理
糖尿病   61(Suppl.1) S-433   Apr 2018
原めぐみ, 八谷剛史, 西田裕一郎, 島ノ江千里, 清水厚志, 田中恵太郎
日本疫学会学術総会講演集(Web)   28th 133 (WEB ONLY)   Feb 2018

Conference Activities & Talks

 
Retrotransposition of a unique piece of LCR7 played a key role in the generation of Williams-Beuren syndrome-associated LCR during the primate evolution.
The International Congress of Human Genetics 12th Meeting and the American Society of Human Genetics 61th Annual Meeting,   2011   
The Genomic DNA Sequence of Medaka Chromosome LG22
2004   
The Human KAO-NASHI (face-less) Genes: A Strategy for Systematic Characterization
Cold Spring Harbor Meeting on Identification of Functional Elements in Mammalian Genomes   2004   
A systematic approach for functional annotation of human KAO-NASHI (Face-less) genes
The American Soc. Hum. Genet. Ann. Meeting   2004   
Identification of 93 Hair Keratin-associated Protein (KAP) Genes in Human Genome
The American Soc. Hum. Genet. Ann. Meeting   2004