嶋田睦 (Atsushi Shimada) - マイポータル

基本情報

所属: 九州大学生体防御医学研究所構造生物学分野准教授

学位: 博士 (理学)(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901085786073743
researchmap会員ID: 5000072150

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

経歴

2011年10月 - 現在

九州大学生体防御医学研究所, 准教授
2011年4月 - 2011年9月

理化学研究所播磨研究所, 専任研究員
2003年10月 - 2011年3月

理化学研究所播磨研究所, 研究員
2001年6月 - 2003年9月

Max-Planck Institut of Molecular Physiology, Postdoctoral Researcher

学歴

1996年4月 - 2001年3月

東京大学, 大学院理学系研究科, 生物化学
1992年4月 - 1996年3月

東京大学

受賞

2023年11月

令和5年度九州大学共同研究等活動表彰, 九州大学

嶋田睦

論文

CHLOROPLAST UNUSUAL POSITIONING 1 is a plant-specific actin polymerization factor regulating chloroplast movement.

Sam-Geun Kong, Yosuke Yamazaki, Atsushi Shimada, Saku T Kijima, Keiko Hirose, Kaoru Katoh, Jeongsu Ahn, Hyun-Geun Song, Jae-Woo Han, Takeshi Higa …

The Plant cell 2023年12月22日
Crystal contact-free conformation of an intrinsically flexible loop in protein crystal: Tim21 as the case study

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects 1864(2) 129418-129418 2020年2月査読有り
CHLOROPLAST UNUSUAL POSITIONING 1 is a new type of actin nucleation factor in plants

bioRxiv 2020年1月15日
Phagocytosis is mediated by two-dimensional assemblies of the F-BAR protein GAS7.

Kyoko Hanawa-Suetsugu, Yuzuru Itoh, Maisarah Ab Fatah, Tamako Nishimura, Kazuhiro Takemura, Kohei Takeshita, Satoru Kubota, Naoyuki Miyazaki, Wan Nurul Izzati Wan Mohamad Noor, Takehiko Inaba …

Nature communications 10(1) 4763-4763 2019年10月18日査読有り
Tethering an N-Glycosylation Sequon-Containing Peptide Creates a Catalytically Competent Oligosaccharyltransferase Complex

Shunsuke Matsumoto, Yuya Taguchi, Atsushi Shimada, Mayumi Igura, Daisuke Kohda

BIOCHEMISTRY 56(4) 602-611 2017年1月査読有り
Rational design of crystal contact-free space in protein crystals for analyzing spatial distribution of motions within protein molecules

Rei Matsuoka, Atsushi Shimada, Yasuaki Komuro, Yuji Sugita, Daisuke Kohda

PROTEIN SCIENCE 25(3) 754-768 2016年3月査読有り
Structural basis for the recognition of two consecutive mutually interacting DPF motifs by the SGIP1 μ homology domain

Atsushi Shimada, Atsuko Yamaguchi, Daisuke Kohda

Scientific Reports 6(1) 2016年1月査読有り
TRPV4ｲｵﾝﾁｬﾈﾙのｱﾝｷﾘﾝﾘﾋﾟ−ﾄﾄﾞﾒｲﾝとPI(4,5)P2の相互作用による新たな制御機構

末次志郎, 高椅重成, 伊藤弓弦, 竹村和浩, 嶋田睦, 北尾彰朗, 森泰生

生物物理 55(5) 262-265 2015年7月17日査読有り
TRPV4 channel activity is modulated by direct interaction of the ankyrin domain to PI(4,5)P-2

Nobuaki Takahashi, Sayaka Hamada-Nakahara, Yuzuru Itoh, Kazuhiro Takemura, Atsushi Shimada, Yoshifumi Ueda, Manabu Kitamata, Rei Matsuoka, Kyoko Hanawa-Suetsugu, Yosuke Senju …

NATURE COMMUNICATIONS 5(1) 2014年9月査読有り
Crystal structures of an archaeal oligosaccharyltransferase provide insights into the catalytic cycle of N-linked protein glycosylation

Shunsuke Matsumoto, Atsushi Shimada, James Nyirenda, Mayumi Igura, Yoshiaki Kawano, Daisuke Kohda

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 110(44) 17868-17873 2013年10月査読有り
Crystal structure of the C-terminal globular domain of the third paralog of the Archaeoglobus fulgidus oligosaccharyltransferases

Shunsuke Matsumoto, Atsushi Shimada, Daisuke Kohda

BMC STRUCTURAL BIOLOGY 13(1) 11 2013年7月査読有り
Actin Filament Bundling and Different Nucleating Effects of Mouse Diaphanous-Related Formin FH2 Domains on Actin/ADF and Actin/Cofilin Complexes

Gia Machaidze, Andrea Sokoll, Atsushi Shimada, Ariel Lustig, Antonina Mazur, Alfred Wittinghofer, Ueli Aebi, Hans Georg Mannherz

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 403(4) 529-545 2010年11月査読有り
Mapping of the basic amino-acid residues responsible for tubulation and cellular protrusion by the EFC/F-BAR domain of pacsin2/Syndapin II

Atsushi Shimada, Kazunori Takano, Mikako Shirouzu, Kyoko Hanawa-Suetsugu, Takaho Terada, Kiminori Toyooka, Takashi Umehara, Masaki Yamamoto, Shigeyuki Yokoyama, Shiro Suetsugu

FEBS LETTERS 584(6) 1111-1118 2010年3月査読有り
1SP6-02 EFC/F-BARドメインタンパク質の構造,機能と制御(1SP6 メンブラントランスフォーマー!! : 生体膜の形を変えるための合体と解離,第47回日本生物物理学会年会)

嶋田睦, 寺田貴帆, 白水美香子, 山本雅貴, 永山國昭, 末次志郎, 竹縄忠臣, 横山茂之

生物物理 49 S8 2009年
EFC/F-BARドメインの構造機能解析 : エンドサイトーシスにおける細胞膜陥入機構

嶋田睦, 末次志郎, 白水美香子, 永山國昭, 横山茂之

日本結晶学会誌 50(2) 161-168 2008年4月30日
Curved EFC/F-BAR-domain dimers are joined end to end into a filament for membrane invagination in endocytosis

Atsushi Shimada, Hideaki Niwa, Kazuya Tsujita, Shiro Suetsugu, Koji Nitta, Kyoko Hanawa-Suetsugu, Ryogo Akasaka, Yuri Nishino, Mitsutoshi Toyama, Lirong Chen …

CELL 129(4) 761-772 2007年5月査読有り
3P023 EFC/F-BARドメインによる脂質膜チューブ化機構(ヘム蛋白質、電子状態、蛋白質(構造・構造機能相関,口頭発表,第45回日本生物物理学会年会)

嶋田睦, 丹羽英明, 辻田和也, 末次志郎, 新田浩二, 塙-末次京子, 赤坂領吾, 西野有理, 外山光俊, 山本雅貴 …

生物物理 47 S208 2007年
Loss of RanGEF/Pim1 activity abolishes the orchestration of Ran-mediated mitotic cellular events in S-pombe

E Hirose, M Mukai, A Shimada, H Nishitani, Y Shibata, T Nishimoto

GENES TO CELLS 11(1) 29-46 2006年1月査読有り
The core FH2 domain of diaphanous-related formins is an elongated actin binding protein that inhibits polymerization

A Shimada, M Nyitrai, IR Vetter, D Kuhlmann, B Bugyi, S Narumiya, MA Geeves, A Wittinghofer

MOLECULAR CELL 13(4) 511-522 2004年2月査読有り
Mechanism of molecular interactions for tRNA(Val) recognition by valyl-tRNA synthetase

S Fukai, O Nureki, S Sekine, A Shimada, DG Vassylyev, S Yokoyama

RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 9(1) 100-111 2003年1月査読有り

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MISC

古細菌由来オリゴ糖転移酵素の基質ペプチド複合体の結晶構造

松本俊介, 嶋田睦, 遠藤斗志也, 神田大輔

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 87回 [2T10a-01] 2014年10月
古細菌型オリゴ糖転移酵素によるN型糖鎖修飾の構造基盤の解明

松本俊介, 嶋田睦, NYIRENDA James, 井倉真由美, 河野能顕, 神田大輔

日本生化学会大会(Web) 86th 1T13A-05(1P-090) (WEB ONLY) 2013年
嶋田睦

実験医学 22 2181-2183 2004年
Shimada A, Nyitrai M, Vetter IR, Kuhlmann D, Bugyi B, Narumiya S, Geeves MA, Wittinghofer A

Mol. Cell 13 511-522 2004年
Fukai S, Nureki O, Sekine S, Shimada A, Vassylyev DG, Yokoyama S

RNA 9 100-111 2003年
Structural basis for anticodon recognition by discriminating glutamyl-tRNA synthetase

S Sekine, O Nureki, A Shimada, DG Vassylyev, S Yokoyama

NATURE STRUCTURAL BIOLOGY 8(3) 203-206 2001年3月
Nureki O, Fukai S, Sekine S, Shimada A, Terada T, Nakama T, Shirouzu M, Vassylyev DG, Yokoyama S

Cold Spring Harb. Sympp. Quant. Biol. 66 167-173 2001年
Shimada A, Nureki O, Goto M, Takahashi S, Yokoyama S

Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98 13537-13542 2001年
Sekine S, Nureki O, Shimada A, Vassylyev DG, Yokoyama S

Nat. Struct. Biol. 8 203-206 2001年
Sekine S, Shimada A, Nureki O, Cavarelli J, Moras D, Vassylyev DG, Yokoyama S

J. Biol. Chem. 276 3723-3726 2001年
Shimada A, Nureki O, Dohmae N, Takio K, Yokoyama S

Acta Cryst. D 57 272-275 2001年
Crucial role of the HIGH-loop lysine for the catalytic activity of arginyl-tRNA synthetase

SEKINE S, SHIMADA A, NUREKI O, CAVARELLI J, MORAS D, VASSYLYEV D G, YOKOYAMA S

J. Biol. Chem. 276(6) 3723-3726 2001年
Fukai S, Nureki O, Sekine S, Shimada A, Tao J, Vassylyev DG, Yokoyama S

Cell 103 793-803 2000年
Sugiura I, Nureki O, Ugaji-Yoshikawa Y, Kuwabara S, Shimada A, Tateno M, Lorber B, Giege R, Moras D, Yokoyama S, Konno M

Structure Fold. Des. 8 197-208 2000年
イソロイシルtRNA合成酵素の持つアミノ酸二重ふるい機構の構造的基盤

濡木理, Vassylyev D.G., 館野賢, 嶋田睦, 中間崇, 深井周也, 今野美智子, Hendrickson T.L., Schimmel P., 横山茂之

生物物理 38(2) S104-S104 1998年9月7日
高度好熱菌アルギニルtRNA合成酵素の結晶構造解析

嶋田睦, 濡木理, 瀧尾擴士, 横山茂之

生物物理 38(2) S166 1998年9月7日
高度好熱菌バリルtRNA合成酵素・tRNA^<Val>・バリルAMPアナログ三重複合体の結晶学的解析

深井周也, 濡木理, 関根俊一, 嶋田睦, Kumasaka T., 熊坂崇, 山本雅貴, 横山茂之

生物物理 38(2) S166 1998年9月7日
Nureki O, Vassylyev DG, Tateno M, Shimada A, Nakama T, Fukai S, Konno M, Hendrickson TL, Schimmel P, Yokoyama S

Science 280 578-582 1998年
イソロイシルtRNA合成酵素のアミノ酸校正機構の高次構造的基盤

濡木理, Vassylyev Dmitry G., 館野賢, 中迫雅由, 嶋田睦, 中間崇, 深井周也, 今野美智子, 横山茂之

生物物理 37 S35 1997年10月
高度好熱菌Thermus thermophilusバリルtRNA合成酵素の遺伝子クローニング, 大量発現と結晶化

深井周也, 濡木理, 嶋田睦, 斎藤京子, 今野美智子, 瀧尾擴士, 横山茂之

生物物理 37 S34 1997年10月

共同研究・競争的資金等の研究課題

膜タンパク質の新規構造解析技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

嶋田睦
クラスリン依存性エンドサイトーシスにおけるクラスリン重合進行機構の構造的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

嶋田睦
葉緑体の運動推進力発生機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2013年4月 - 2017年3月

和田正三, 孔三根, 神田大輔, 嶋田睦, 上田太郎, 広瀬恵子, 加藤薫, 徳富哲, 岡島公司, 後藤栄治
植物の新規アクチン結合ドメインとアクチンの複合体の結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

嶋田睦
Ｎ型糖鎖修飾のコンセンサス配列占有則を立体構造の視点から解明する

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2012年4月 - 2015年3月

神田大輔, 嶋田睦, 眞柳浩太
細胞のがん化に関与するエンドサイトーシス機構の構造的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2012年4月 - 2015年3月

嶋田睦
準安定な分子認識解明のためのテザー係留法の開発と細胞内仕分けシグナル識別への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年7月 - 2014年3月

神田大輔, 嶋田睦, 真柳浩太, 斉藤貴士, 井倉真由美
エンドサイトーシスにおける小胞形成機構の構造的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 若手研究(A) 2008年 - 2011年

嶋田睦
RNAポリメラーゼの構造解析

2004年
細胞骨格系タンパク質の構造解析

2004年
アルギニルtRNA合成酵素とtRNAの複合体のX線結晶構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 1999年 - 2000年

嶋田睦

産業財産権

特許7046409 膜タンパク質分析用基板、膜タンパク質分析用基板の製造方法、膜タンパク質の分析方法及び膜タンパク質分析用グリッド

嶋田睦

嶋田睦

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