Tomoya Baba
(馬場 知哉)
Modified on: 2024/12/03
Profile Information
- Affiliation
- (Associate Professor), Joint Support-Center for Data Science Research, Research Organization of Information and Systems
- (Concurrent)Advanced Genomics Center
- Degree
-
博士(学術)(神戸大学大学院自然科学研究科)
- J-GLOBAL ID
- 200901097432154647
- researchmap Member ID
- 5000099624
- External link
ゲノム生物学、代謝生物学、環境生物学の経験を通して、新たな研究分野の開拓をめざしています。
情報・システム研究機構の融合プロジェクト【地球環境変動の解析と地球生命システム学の構築】の一環として、南極の極限環境(極低温、貧栄養、白夜/極夜の特殊な日照条件など)において、独自の進化を遂げてきた生物のゲノムレベルでの生物多様性、遺伝子の水平伝播、環境適応、共生関係の解明に取り組んできました。大陸移動や氷期/間氷期といった地球規模での環境変動と生物の適応・進化との関係性が最大の関心事です。
ゲノム情報を中心に、データから導き出される新たなデータ駆動型研究、「データサイエンス」の推進と「異分野融合」に取り組んでいます。
また、化学との接点、特にシリカなどの無機材料と酵素の融合による新たな機能創出にも取り組んでいます。
2020年からの新型コロナ感染症(COVID-19)のパンデミックの中、環境中の極微量のSARS-CoV-2ウイルスの検出法やゲノム解析法の開発にも取り組んでいます。
Research Interests
20Research Areas
4Research History
11-
Aug, 2016 - Present
-
Aug, 2016 - Present
-
Apr, 2016 - Jul, 2016
-
May, 2007 - Mar, 2016
-
May, 2005 - Apr, 2007
-
Jun, 2006 - Oct, 2006
-
Apr, 2001 - Apr, 2005
-
Apr, 1998 - Mar, 2001
-
Apr, 1997 - Mar, 1998
Education
2-
Apr, 1991 - Mar, 1994
-
Apr, 1989 - Mar, 1991
Committee Memberships
1-
Apr, 2019 - Present
Awards
1Papers
63-
BMC Research Notes, 16(1), Jul 7, 2023 Peer-reviewed
-
ACS Applied Materials & Interfaces, 14(26) 29483-29490, Jun 14, 2022 Peer-reviewed
-
Journal of Geography (Chigaku Zasshi), 129(6) 805-824, Dec 25, 2020 Lead author
-
Frontiers in Microbiology, 11(July) Article-1486, Jul 3, 2020 Peer-reviewedLast authorCorresponding author
-
Geoscience Frontiers, 9(4) 1155-1161, Jul 1, 2018 Peer-reviewed
-
Standards in genomic sciences, 11 Article-90, 2016 Peer-reviewed
-
Genome Announcements, 4(3) e00616-16, 2016 Peer-reviewed
-
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 65 4072-4079, Nov, 2015 Peer-reviewed
-
Methods Mol Biol., 1279 45-65, Jan, 2015
-
RSC ADVANCES, 4(49) 25920-25923, 2014 Peer-reviewed
-
POLAR BIOLOGY, 35(11) 1641-1650, Nov, 2012 Peer-reviewed
-
POLAR BIOLOGY, 35(10) 1495-1504, Oct, 2012 Peer-reviewed
-
POLAR BIOLOGY, 35(3) 425-433, Mar, 2012 Peer-reviewed
-
International Journal on Advances in Life Sciences, 4 154-165, 2012 Peer-reviewed
-
日本ゲノム微生物学会ニュースレター, 6 1-1, 2012 Invited
-
POLAR SCIENCE, 5(3) 375-382, Sep, 2011 Peer-reviewed
-
JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8 83-99, Dec, 2010 Peer-reviewed
-
MOLECULAR BIOSYSTEMS, 6(7) 1216-1226, 2010
-
FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 297(2) 217-224, Aug, 2009
-
METABOLIC ENGINEERING, 11(1) 1-7, Jan, 2009
Misc.
75-
第68回 日本生物工学会大会 トピックス集, 9-10, Aug, 2016
-
32 8p, Sep 9, 2015
-
2012(7) 1-6, Jan 5, 2012
-
International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies, 4 11-19, 2012 Peer-reviewed
-
Metab. Eng., 11(1) 1-7, 2009
-
FEMS Microbiol. Lett., 297(2) 217-224, 2009
-
DNA Res., 15(4) 227-239, 2008
-
Methods Mol. Biol., 416 171-181, 2008
-
Methods Mol. Biol., 416 183-194, 2008
-
生化学, 3S2-6, 2008
-
J. Biochem., 141(1) 19-24, 2007
-
Science, 316(5824) 593-597, 2007
-
高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト 第6回連携研究会 理研シンポジウム 平成19年, 12-13, 2007
-
生化学, 1P-1021, 2007
-
Information Processing Society of Japan, Special Interest Groups, Bioinformatics, Technical Report, 13 73-80, 2006
-
Proteomics, 6 6433-6436, 2006
-
J. Mol. Evol., 63(3) 401-414, 2006
-
Genome Res., 16 686-691, 2006
Books and Other Publications
6-
悠書館, Oct, 2013
-
サイエンスフォーラム, Sep, 2009
-
朝倉書店, Jan, 2009
-
農文協, Dec, 2004
-
エヌ・ティー・エス, Apr, 2004
-
秀潤社, Feb, 2001
Presentations
81-
International Symposium on Data Science (DSWS-2023), Dec 14, 2023
-
第47回日本分子生物学会年会, Nov 27, 2024
-
第47回日本分子生物学会年会, Nov 27, 2024
-
第47回日本分子生物学会年会, Nov 27, 2024
-
第46回日本分子生物学会年会, Dec 6, 2023
-
第46回日本分子生物学会年会, Dec 6, 2023
-
第45回日本分子生物学会年会, Dec 2, 2022
-
第45回日本分子生物学会年会, Dec 2, 2022
-
第45回日本分子生物学会年会, Dec 2, 2022
-
第45回日本分子生物学会年会, Dec 2, 2022
-
The 44th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, Dec 2, 2021
-
第73回日本生物工学会大会, Oct 28, 2021
-
日本遺伝学会 第92回大会 ワークショップ6 『遺伝学における遺伝子水平伝播の意義を考える』, Sep 17, 2020 Invited
-
The 42nd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, Dec 4, 2019 Invited
-
第13回日本ゲノム微生物学会年会, Mar 8, 2019
-
第41回日本分子生物学会年会, Nov 30, 2018
-
生命医薬情報学連合大会2018, Sep 20, 2018
-
生命科学系学会合同年次大会(ConBio)2017, Dec 8, 2017
-
Consortium of Biological Sciences 2017, Dec 8, 2017
Teaching Experience
6Professional Memberships
4Research Projects
20-
科学研究費助成事業, 挑戦的研究(萌芽), 日本学術振興会, Jun, 2024 - Mar, 2026
-
プログラムマネージャー(PM)の育成・活躍推進プログラム, FS(調査研究), 科学技術振興機構(JST), Apr, 2024 - Dec, 2025
-
大学発新産業創出基金事業 可能性検証, 科学技術振興機構(JST), Oct, 2023 - Mar, 2025
-
戦略的な研究開発の推進 戦略的創造研究推進事業 CREST, 科学技術振興機構, Feb, 2021 - Mar, 2024
-
ウイルス等感染症対策技術開発事業, ウイルス等感染症対策に向けた機器・システム等の構築に資する基礎研究支援, 日本医療研究開発機構 (AMED), Sep, 2020 - Mar, 2021
-
科学研究費 基盤研究(C), 科学技術振興事業団(JST), Apr, 2016 - Mar, 2019
-
科学研究費 挑戦的萌芽研究, 科学技術振興事業団(JST), Apr, 2015 - Mar, 2019
-
科学研究費 基盤研究(B), 科学技術振興事業団(JST), Apr, 2012 - Mar, 2017
-
Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2011 - Mar, 2014
-
Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2009 - Mar, 2012
-
Grant-in-Aid for Scientific Research, 2009 - 2011
-
2007 - 2010
-
New Energy Technology Research and Development, 2001 - 2007
-
バイオ人材育成事業, 経済産業省, Apr, 2004 - Mar, 2005
-
新エネルギー技術研究開発費「エネルギー使用合理化技術」, 新エネルギー・産業技術開発機構(NEDO), 2001 - 2005
-
戦略的創造研究推進制度(研究チーム型:CREST) 研究領域「ゲノムの構造と機能」, 科学技術振興事業団(JST), 2001 - 2003
-
JST Basic Research Programs (Core Research for Evolutional Science and Technology :CREST), 2001 - 2003
-
Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B), Japan Society for the Promotion of Science, 1994 - 1995