長尾知生子 (Chioko Nagao) - マイポータル

基本情報

所属: 金沢大学医薬保健研究域薬学系准教授

学位: 博士（理学）(2006年3月東北大学)

研究者番号: 10402463
J-GLOBAL ID: 201801001400132229
researchmap会員ID: B000334247

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

経歴

2020年4月 - 2026年3月

大阪大学, 蛋白質研究所, 助教
2018年4月 - 2020年3月

国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, インシリコ創薬支援プロジェクト, サブプロジェクトリーダー
2017年4月 - 2018年3月

国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, インシリコ創薬支援プロジェクト, プロジェクト研究員
2008年1月 - 2017年3月

独立行政法人医薬基盤研究所, バイオインフォマティクスプロジェクト, プロジェクト研究員
2007年4月 - 2007年12月

独立行政法人医薬基盤研究所, バイオインフォマティクスプロジェクト, 特任研究員

論文

Subset binding enables detection of multimodal patient subgroup patterns and drug target discovery in idiopathic pulmonary fibrosis

Yayoi Natsume-Kitatani, Mari N Itoh, Yoshito Takeda, Masataka Kuroda, Haruhiko Hirata, Kotaro Miyake, Takayuki Shiroyama, Yuya Shirai, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi …

Briefings in Bioinformatics 27(2) 2026年3月1日査読有り
Lysine-Targeting Inhibitors of Amyloidogenic Protein Aggregation: A Promise for Neurodegenerative Proteinopathies

Kazuma Murakami, Thi Hong Van Nguyen, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi, Gal Bitan

JACS Au 2025年8月11日査読有り
An adjuvant database for preclinical evaluation of vaccines and immunotherapeutics

Yayoi Natsume-Kitatani, Kouji Kobiyama, Yoshinobu Igarashi, Taiki Aoshi, Noriyuki Nakatsu, Lokesh P. Tripathi, Junichi Ito, Johan Nyström-Persson, Yuji Kosugi, Rodolfo S. Allendes Osorio …

Cell Chemical Biology 2025年8月査読有り
Protein Data Bank Japan: Improved tools for sequence-oriented analysis of protein structures.

Gert-Jan Bekker, Chioko Nagao, Matsuyuki Shirota, Tsukasa Nakamura, Toshiaki Katayama, Daisuke Kihara, Kengo Kinoshita, Genji Kurisu

Protein science : a publication of the Protein Society 34(3) e70052 2025年3月査読有り
Protein Data Bank Japan: Computational Resources for Analysis of Protein Structures.

Gert-Jan Bekker, Chioko Nagao, Matsuyuki Shirota, Tsukasa Nakamura, Toshiaki Katayama, Daisuke Kihara, Kengo Kinoshita, Genji Kurisu

Journal of molecular biology 169013-169013 2025年2月15日査読有り
Phosphoproteomic subtyping of gastric cancer reveals dynamic transformation with chemotherapy and guides targeted cancer treatment

Hirokazu Shoji, Hidekazu Hirano, Yosui Nojima, Daigo Gunji, Akina Shinkura, Satoshi Muraoka, Yuichi Abe, Ryohei Narumi, Chioko Nagao, Masahiko Aoki …

Cell Reports 114774-114774 2024年10月査読有り
Familial Episodic Pain Syndrome: A Japanese Family Harboring the Novel Variant c.2431C>T (p.Leu811Phe) in SCN11A.

Chioko Nagao, Hiroko Okuda, Gert-Jan Bekker, Atsuko Noguchi, Tsutomu Takahashi, Akio Koizumi, Shohab Youssefian, Tohru Tezuka, Shinji Akioka

Biochemical genetics 2024年7月25日査読有り筆頭著者
Construction of a Tm-Value Prediction Model and Molecular Dynamics Study of AmNA-Containing Gapmer Antisense Oligonucleotide

Masataka Kuroda, Yuuya Kasahara, Masako Hirose, Harumi Yamaguma, Masayuki Oda, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

Molecular Therapy - Nucleic Acids 102272-102272 2024年7月査読有り
Impact of Hydrogen Bonding on P-Glycoprotein Efflux Transport as Revealed by Evaluation of a De Novo Prediction Model

Yulong Gou, Suyong Re, Kenji Mizuguchi, Chioko Nagao

ACS Medicinal Chemistry Letters 2023年12月21日査読有り最終著者責任著者
Attention network for predicting T-cell receptor–peptide binding can associate attention with interpretable protein structural properties

Kyohei Koyama, Kosuke Hashimoto, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

Frontiers in Bioinformatics 3 2023年12月18日査読有り
DruMAP: A Novel Drug Metabolism and Pharmacokinetics Analysis Platform

Hitoshi Kawashima, Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Masataka Kuroda, Chioko Nagao, Yayoi Natsume-Kitatani, Rikiya Ohashi, Hiroshi Komura, Kenji Mizuguchi

Journal of Medicinal Chemistry 2023年7月14日査読有り
医薬品関連文書の利活用に向けたインタビューフォームの構造化の提案

長尾知生子, 鎌田真由美, 中津井雅彦, 深川明子, 片山俊明, 川島秀一, 水口賢司, 安倍理加

医薬品情報学 24(4) 187-195 2023年2月査読有り筆頭著者
Data-driven patient stratification and drug target discovery by using medical information and serum proteome data of idiopathic pulmonary fibrosis patients

Yayoi Natsume-Kitatani, Mari N Itoh, Yoshito Takeda, Masataka Kuroda, Haruhiko Hirata, Kohtaro Miyake, Takayuki Shiroyama, Yuya Shirai, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi …

2022年3月29日
Novel anti-flavivirus drugs targeting the nucleolar distribution of core protein.

Makoto Tokunaga, Yoichi Miyamoto, Tatsuya Suzuki, Mayumi Otani, Shinsuke Inuki, Tsuyoshi Esaki, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi, Hiroaki Ohno, Yoshihiro Yoneda …

Virology 541 41-51 2020年2月査読有り
Developing a Kinase-Specific Target Selection Method Using a Structure-Based Machine Learning Approach.

Arina Afanasyeva, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

Advances and applications in bioinformatics and chemistry : AABC 13 27-40 2020年12月査読有り
A prospective compound screening contest identified broader inhibitors for Sirtuin 1.

Shuntaro Chiba, Masahito Ohue, Anastasiia Gryniukova, Petro Borysko, Sergey Zozulya, Nobuaki Yasuo, Ryunosuke Yoshino, Kazuyoshi Ikeda, Woong-Hee Shin, Daisuke Kihara …

Scientific reports 9(1) 19585-19585 2019年12月20日査読有り
Development of an in silico prediction system of human renal excretion and clearance from chemical structure information incorporating fraction unbound in plasma as a descriptor.

Reiko Watanabe, Rikiya Ohashi, Tsuyoshi Esaki, Hitoshi Kawashima, Yayoi Natsume-Kitatani, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

Scientific reports 9(1) 18782-18782 2019年12月11日査読有り
Constructing an In Silico Three-Class Predictor of Human Intestinal Absorption With Caco-2 Permeability and Dried-DMSO Solubility.

Tsuyoshi Esaki, Rikiya Ohashi, Reiko Watanabe, Yayoi Natsume-Kitatani, Hitoshi Kawashima, Chioko Nagao, Hiroshi Komura, Kenji Mizuguchi

Journal of pharmaceutical sciences 108(11) 3630-3639 2019年11月査読有り
Computational Model To Predict the Fraction of Unbound Drug in the Brain.

Tsuyoshi Esaki, Rikiya Ohashi, Reiko Watanabe, Yayoi Natsume-Kitatani, Hitoshi Kawashima, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

Journal of chemical information and modeling 59(7) 3251-3261 2019年7月22日査読有り
High-Contrast Facile Imaging with Target-Directing Fluorescent Molecular Rotors, the N3-Modified Thioflavin T Derivatives.

Yuka Kataoka, Hiroto Fujita, Arina Afanaseva, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi, Yuuya Kasahara, Satoshi Obika, Masayasu Kuwahara

Biochemistry 58(6) 493-498 2019年2月12日査読有り

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MISC

AI創薬とデータベース—AI-driven drug discovery and databases—特集 AI×ビッグデータが実現する創薬DX

長尾知生子, 水口賢司

医学のあゆみ 296(1) 8-13 2026年1月3日
PRISM成果利用システム「峰」の構築新薬創出を加速する人工知能の開発

樋口千洋, 黒田正孝, 黒田正孝, 伊藤眞里, 長尾知生子, 長尾知生子, 浜本隆二, 黒橋禎夫, 高村大也, 奥野恭史 …

医療情報学連合大会論文集(CD-ROM) 42nd 2022年
「新薬創出を加速する人工知能の開発」特発性肺線維症への取り組み

伊藤眞里, 武田吉人, 木田博, 木庭太郎, 野島陽水, 藤原大, 長尾知生子, 夏目やよい, 武田理宏, 松村泰志 …

日本呼吸器学会誌(Web) 8 167 2019年3月10日
間質性肺炎診断と予後新薬創出を加速する人工知能の開発特発性肺線維症への取り組み

伊藤眞里, 武田吉人, 木田博, 木庭太郎, 野島陽水, 藤原大, 長尾知生子, 夏目やよい, 武田理宏, 松村泰志 …

日本呼吸器学会誌 8(増刊) 167-167 2019年3月
プレシジョンメディシンと創薬 5 創薬における計算機の果たす役割―プレシジョンメディシンに向けて―

長尾知生子, 夏目やよい, 水口賢司

月刊Precision Medicine 1(1) 28‐31 2018年10月25日
Development of a pharmacokinetics prediction system using multiscale integrated modeling: 1. In silico prediction of fraction of unbound drug in the brain homogenate

Tsuyoshi Esaki, Reiko Watanabe, Rikiya Ohashi, Yayoi Natsume-Kitatani, Hitoshi Kawashima, Chioko Nagao, Kenji Mizuguchi

2018 International Meeting on 22nd MDO and 33rd JSSX 2018年10月
人工知能(AI)がもたらす創薬イノベーション 7.データベース・計算環境~知識データベース・AI基盤

長尾知生子, 種石慶

医薬ジャーナル 54(9) 2063‐2067 2018年9月1日
データベース・計算環境 : 知識データベース・AI基盤 (特集人工知能(AI)がもたらす創薬イノベーション)

長尾知生子, 種石慶

医薬ジャーナル 54(9) 2063-2067 2018年9月
公共データベースの統合からAIによるデータマイニングに向けて:―創薬への応用を目指して―

伊藤眞里, 長尾知生子, 夏目やよい, 水口賢司

日本化学会情報化学部会誌 35(3) 2017年
レセプター指向性を有するリンフォトキシンαの創製と特性評価

吉岡靖雄, 渡辺光, 堤康央, AHMAD Shandar, 長尾知生子, 池水信二, 水口賢司, 向洋平, 岡田直貴, 中川晋作

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 9th 117 2009年4月24日
19aTC-7 遺伝子発現過程を考慮した粗視化DNAモデルの構築(生物物理,領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理)

徳田直子, 長尾知生子, 笹井理生, 千見寺浄慈

日本物理学会講演概要集 62(1) 336-336 2007年2月28日

書籍等出版物

創薬研究のための相互作用解析パーフェクト〜低中分子・抗体創薬におけるスクリーニング戦略と実例、in silico解析、一歩進んだ分析技術まで (実験医学別冊)

長尾知生子, 李秀栄, 水口賢司 (担当:共著, 範囲:第3章 8. 創薬分野におけるAIの活用)

羊土社 2021年12月9日 (ISBN: 4758122563)
実験医学増刊 Vol.38 No.5 イメージング時代の構造生命科学〜細胞の動態、膜のないオルガネラ、分子の構造変化をトランススケールに観る

長尾知生子, 水口賢司 (担当:共著, 範囲:(第4章)活用可能なデータベースとプラットフォーム対象タンパク質を理解するための有用なデータベース)

羊土社 2020年3月21日 (ISBN: 4758103852)
Protein interactions computational methods, analysis and applications Ed. Gromiha;M. Michael

A. Afanasyeva, C. Nagao, K. Mizuguchi (担当:分担執筆, 範囲:Docking algorithms and scoring functions.)

World Scientific 2020年 (ISBN: 9789811211867)
タンパク質結晶の新展開 : 新しい育成技術から構造解析・応用研究へ高野和文編

長尾知生子, 水口賢司 (担当:分担執筆, 範囲:タンパク質立体構造のモデリング)

シーエムシー出版 2013年10月 (ISBN: 9784781307398)
Pharmaceutical Data Mining: Approaches and Applications for Drug Discovery Ed. Konstantin V. Balakin

M. Andrabi, C. Nagao, K. Mizuguchi, S. Ahmad (担当:分担執筆)

Wiley 2009年12月21日 (ISBN: 0470196084, 9780470196083)

講演・口頭発表等

インタビューフォームの構造化に向けた技術的な取り組み

長尾知生子

IMICユーザ会 2023年11月2日招待有り
タンパク質立体構造予測の進歩 Alphafoldの出現からその先へ

長尾知生子

日本乳酸菌学会2023年度大会 2023年7月7日招待有り
医薬品関連文書の利活用に向けたインタビューフォームの構造化の試み

長尾知生子

第25回日本医薬品情報学学会総会・学術大会 2023年6月10日招待有り

担当経験のある科目(授業)

2026年4月 - 現在

服薬指導演習・プライマリケア演習（金沢大学）
2021年4月 - 2026年3月

バイオ/ケモインフォマティクス (大阪大学)
2020年11月

蛋白質計算科学特論B (大阪大学)
2019年10月

構造インフォマティクスの基礎遠隔インタラクティブ講義（計算生命科学の基礎VI） (神戸大学計算科学教育センター)

所属学協会

CBI学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

タンパク質の深層学習を用いた改変ポリメラーゼデザイン法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2025年4月 - 2028年3月

長尾知生子, 笠原勇矢, 李秀栄
人工核酸アプタマーの新規デザイン法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

長尾知生子, 笠原勇矢, 李秀栄
アプタマー情報をベースにした低分子医薬品創製プラットフォームの構築

国立研究開発法人日本医療研究開発機構創薬基盤推進研究事業 2018年5月 - 2023年3月

笠原勇矢
HCP分子の高振動励起状態の観測によるCPHへの異性化反応の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 1998年 - 2000年

長尾知生子

産業財産権

WO2019/176866 ウテログロビンを構造基盤とする二重特異性ポリペプチド

新山真由美, 秋葉宏樹, 阿部康弘, 永田諭志, 伊勢知子, 長尾知生子, 鎌田春彦, 津本浩平, 水口賢司, アリーナ・アファナシェヴァ, 井上豪, 福田庸太

長尾知生子

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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