倉田竜明 (Tatsuaki Kurata) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所開拓研究所研究員

学位: 博士（理学）

J-GLOBAL ID: 201801020833061061
researchmap会員ID: B000327779

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年7月 - 現在

特定国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究所（旧開拓研究本部）, 研究員
2021年4月 - 2024年6月

Lund University, Department of Experimental Science, Assistant researcher
2019年4月 - 2021年4月

Umeå University, Department of Molecular Biology, Postdoc
2016年4月 - 2019年3月

立教大学, 理学部生命理学科, ポストドクトラルフェロー

学歴

2013年4月 - 2016年3月

首都大学東京大学院, 理工学研究科, 生命科学専攻
2011年4月 - 2013年3月

法政大学大学院, 工学研究科, 生命機能学専攻
2007年4月 - 2011年3月

法政大学, 工学部, 生命機能学科

受賞

2025年3月

第19回日本ゲノム微生物学会研究奨励賞, 細菌のRNA機能を制御する因子に関する研究, 日本ゲノム微生物学会

倉田竜明
2018年5月

優秀ポスター賞博士・PD部門, 50種類以上に及ぶDNA断片の試験管内同時集積, 第15回 21世紀大腸菌研究会

倉田竜明, 加納巧希, 末次正幸
2015年3月

第9回日本ゲノム微生物学会年会ポスター賞, 16S rRNAプロセッシングに関わる大腸菌必須遺伝子yqgFの解析

倉田竜明

論文

Nanobody-mediated control of long RSH Rel and RelA catalysis by restriction of their conformational landscape.

Katleen Van Nerom, Andres Ainelo, Kyo Coppieters 't Wallant, Ariel Talavera-Perez, Dannele Echemendia-Blanco, Sarah Peeters, Brahim El Khalfaoui Oulali, Hedvig Tamman, Tatsuaki Kurata, Mohammad Roghanian …

Nature communications 2026年5月13日査読有り
Structural and functional diversity of toxin-antitoxin-chaperone systems.

Jose A Nakamoto, Roni Odai, Toomas Mets, Tanel Tenson, Tatsuaki Kurata, Vasili Hauryliuk, Gemma C Atkinson

Cell reports 45(3) 117024-117024 2026年3月2日査読有り
Mechanistic and evolutionary perspective of RelA/SpoT homologus from and beyond stringent-response singnaling.

Tatsuaki Kurata, Hiraku Takada

Bioscience, biotechnology, and biochemistry 90(3) 306-312 2026年2月23日査読有り招待有り
Characterization of five environmental phages infecting Escherichia coli K-12 isolated during a phage biology training course

Lena Shyrokova, Artyom A. Egorov, Astrid Cole, Julian J. Duque-Pedraza, Anu Tyagi, Karin Ernits, Toomas Mets, Tatsuaki Kurata, Jonas Juozapaitis, Alessio Ling Jie Yang …

Microbiol Spectr. e0227425 2025年11月6日査読有り
Involvement of Escherichia coli unconventional G protein, YchF, in cell growth at the stationary phase

Yuto Kotaka, Takahiro Nagai, Kento Tominaga, Tatsuaki Kurata, Wataru Iwasaki, Yuko Nobe, Masato Taoka, Tsunaki Asano, Jun-ichi Kato

Genes Genetic Systems 100 24-00218 2025年6月7日査読有り
Toxic Small Alarmone Synthetase FaRel2 inhibits translation by pyrophosphorylating tRNAGly and tRNAThr

*Tatsuaki Kurata, *Masaki Takegawa, Takayuki Ohira, Egor Syroegin, Gemma C Atkinson, Marcus Johansson, Yury S. Polikanov, Abel Garcia-Pino, Tsutomu Suzuki, Vasili Hauryliuk

Science Advances 2024年11月13日査読有り筆頭著者
A virally-encoded tRNA neutralizes the PARIS antiviral defence system.

Nathaniel Burman, Svetlana Belukhina, Florence Depardieu, Royce A Wilkinson, Mikhail Skutel, Andrew Santiago-Frangos, Ava B Graham, Alexei Livenskyi, Anna Chechenina, Natalia Morozova …

Nature 2024年8月7日査読有り
Mechanisms of neutralization of toxSAS from toxin-antitoxin modules.

*Lucia Dominguez-Molina, *Tatsuaki Kurata, *Albinas Cepauskas, Dannele Echemendia-Blanco, Safia Zedek, Ariel Talavera-Perez, Gemma C Atkinson, Vasili Hauryliuk, Abel Garcia-Pino

Nature chemical biology 2024年6月4日査読有り筆頭著者
Mechanism of phage sensing and restriction by toxin-antitoxin-chaperone systems.

*Toomas Mets, *Tatsuaki Kurata, *Karin Ernits, *Marcus J O Johansson, Sophie Z Craig, Gabriel Medina Evora, Jessica A Buttress, Roni Odai, Kyo Coppieters't Wallan, Jose A Nakamoto …

Cell host & microbe 2024年5月23日査読有り筆頭著者
Biochemical and X-ray analyses of the players involved in the faRel2/aTfaRel2 toxin-antitoxin operon.

Lucia Dominguez-Molina, Ariel Talavera, Albinas Cepauskas, Tatsuaki Kurata, Dannele Echemendia-Blanco, Vasili Hauryliuk, Abel Garcia-Pino

Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 79(Pt 10) 247-256 2023年10月1日査読有り
The structural basis of hyperpromiscuity in a core combinatorial network of type II toxin-antitoxin and related phage defense systems.

Karin Ernits, Chayan Kumar Saha, Tetiana Brodiazhenko, Bhanu Chouhan, Aditi Shenoy, Jessica A Buttress, Julián J Duque-Pedraza, Veda Bojar, Jose A Nakamoto, Tatsuaki Kurata …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(33) e2305393120 2023年8月15日査読有り
Direct activation of a bacterial innate immune system by a viral capsid protein.

Tong Zhang, Hedvig Tamman, Kyo Coppieters 't Wallant, Tatsuaki Kurata, Michele LeRoux, Sriram Srikant, Tetiana Brodiazhenko, Albinas Cepauskas, Ariel Talavera, Chloe Martens …

Nature 612(7938) 132-140 2022年12月査読有り
Structural basis for HflXr-mediated antibiotic resistance in Listeria monocytogenes.

Timm O Koller, Kathryn J Turnbull, Karolis Vaitkevicius, Caillan Crowe-McAuliffe, Mohammad Roghanian, Ondřej Bulvas, Jose A Nakamoto, Tatsuaki Kurata, Christina Julius, Gemma C Atkinson …

Nucleic acids research 50(19) 11285-11300 2022年10月28日査読有り
Expression of Bacillus subtilis ABCF antibiotic resistance factor VmlR is regulated by RNA polymerase pausing, transcription attenuation, translation attenuation and (p)ppGpp.

Hiraku Takada, Zachary F Mandell, Helen Yakhnin, Anastasiya Glazyrina, Shinobu Chiba, Tatsuaki Kurata, Kelvin J Y Wu, Ben I C Tresco, Andrew G Myers, Gemma C Aktinson …

Nucleic acids research 50(11) 6174-6189 2022年6月24日査読有り
Clinically observed deletions in SARS-CoV-2 Nsp1 affect its stability and ability to inhibit translation.

Pravin Kumar, Erin Schexnaydre, Karim Rafie, Tatsuaki Kurata, Ilya Terenin, Vasili Hauryliuk, Lars-Anders Carlson

FEBS letters 596(9) 1203-1213 2022年5月査読有り
A hyperpromiscuous antitoxin protein domain for the neutralization of diverse toxin domains.

*Tatsuaki Kurata, *Chayan Kumar Saha, Jessica A Buttress, Toomas Mets, Tetiana Brodiazhenko, Kathryn J Turnbull, Ololade F Awoyomi, Sofia Raquel Alves Oliveira, Steffi Jimmy, Karin Ernits …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(6) 2022年2月8日査読有り筆頭著者
RelA-SpoT Homolog toxins pyrophosphorylate the CCA end of tRNA to inhibit protein synthesis.

†Tatsuaki Kurata, Tetiana Brodiazhenko, Sofia Raquel Alves Oliveira, Mohammad Roghanian, Yuriko Sakaguchi, Kathryn Jane Turnbull, Ondřej Bulvas, Hiraku Takada, Hedvig Tamman, Andres Ainelo …

Molecular cell 81(15) 3160-3170 2021年8月5日査読有り筆頭著者責任著者
A widespread toxin-antitoxin system exploiting growth control via alarmone signaling.

*Steffi Jimmy, *Chayan Kumar Saha, *Tatsuaki Kurata, Constantine Stavropoulos, Sofia Raquel Alves Oliveira, Alan Koh, Albinas Cepauskas, Hiraku Takada, Dominik Rejman, Tanel Tenson …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(19) 10500-10510 2020年5月12日査読有り筆頭著者
Subunit Composition of Ribosome in the yqgF Mutant Is Deficient in pre-16S rRNA Processing of Escherichia coli.

Kurata T, Nakanishi S, Hashimoto M, Taoka M, Isobe T, Kato JI

Journal of molecular microbiology and biotechnology 28(4) 179-182 2018年12月査読有り筆頭著者
Novel Essential Gene Involved in 16S rRNA Processing in Escherichia coli

*Tatsuaki Kurata, *Shinobu Nakanishi, Masayuki Hashimoto, Masato Taoka, Yukiko Yamazaki, Toshiaki Isobe, Jun-ichi Kato

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 427(4) 955-965 2015年2月査読有り筆頭著者

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講演・口頭発表等

tRNA 修飾による翻訳阻害を介した細菌の免疫応答

倉田竜明

第３回 PRI鈴木梅太郎シンポジウム 2026年6月22日招待有り
Early-Career International Pathways Seminar

Tatsuaki Kurata

20th Society of Genome Microbiology, Japan 2026年3月4日招待有り
Bacterial immune response via translation shutoff by toxSAS tRNA-modifying toxins

Tatsuaki Kurata

NIG-JOINT 2025 International Symposium on Molecular Biology and Microbiology: Frontiers in microbial research providing a fundamental insight into conserved and diverse nature of cell duplication system 2026年3月2日招待有り
ファージ感染防御の観点から見たtoxin-antitoxinシステムの再評価

倉田竜明

第一回応用生物情報学講座セミナー、富山県立大学 2025年12月12日招待有り
ゲノム解析から見出したtoxin-antitoxinシステムによるファージ防御機構

倉田竜明

微生物ウィーク学会ジョイントシンポジウム「ゲノム情報をフル活用する微生物研究の新潮流」 2025年8月1日招待有り
細菌のRNA制御研究:翻訳の視点からその生き様を理解するために

倉田竜明

第19回日本ゲノム微生物学会年会 2025年3月18日招待有り
tRNA recognition mechanism for CCA end pyrophosphorylation by toxSAS enzymes

Tatsuaki Kurata, Gemma Atkinson, Vasili Hauryliuk

29th tRNA Conference 2024年11月20日
抗ファージ機構として機能するtoxin-antitoxinシステム

倉田竜明, Gemma Atkinson, Vasili Hauryliuk

日本微生物生態学会第37回広島大会 2024年10月29日招待有り
古くも新しい、栄養飢餓応答を司るタンパク質を起点に見えてきた新展開

倉田竜明

第2回生命機能学セミナー、法政大学 2024年8月5日招待有り
New aspects of well-studied master enzymes on starvation response in bacteria

Tatsuaki Kurata

Department seminar, The University of Tokyo 2022年12月12日招待有り
古くも新しい、栄養飢餓時の司令塔タンパク質の多様性と進化について

倉田竜明

生命科学・タンパク質動態研究所合同セミナー、京都産業大学 2022年11月25日招待有り
RelA-SpoT Homolog toxins pyrophosphorylate the CCA end of tRNA to inhibit protein synthesis

Tatsuaki Kurata

Ribosome structure & function, Bordeaux 2022年7月10日招待有り
RelA-SpoT Homolog toxins pyrophosphorylate the CCA end of tRNA to inhibit protein synthesis

Tatsuaki Kurata

Conference „Ribosomes & Antibiotics“, Tartu 2022年6月22日招待有り
Cell-free technology toward creation of artificial genome.

Masayuki Su’etsugu, Tatsuaki Kurata

Mini symposium on high-throughput gene synthesis and application, Tokyo 2018年9月28日招待有り

担当経験のある科目(授業)

2025年4月 - 現在

現代生物学概論 (東京理科大学)
2026年6月 - 2026年7月

生命理学実験2A (立教大学理学部生命理学科)
2017年4月 - 2018年8月

分子生物学 (法政大学生命科学部)
2017年9月

ゲノム構造機能学 (法政大学生命科学部)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

多様なファージの感染を防ぐ大腸菌CapRelシステムの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2025年4月 - 2028年3月

倉田竜明
腸内細菌叢において見出した新規ファージ防御機構の解明と応用展開

公益財団法人三島海雲記念財団【自然科学部門】共同研究奨励金 2025年7月 - 2026年6月

倉田竜明, 高田啓

産業財産権

特願2017-132084 DNAの生産法およびDNA断片連結キット

末次正幸, 倉田竜明

倉田竜明

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研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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