陳怡安 (Yi-An Chen) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所インシリコデザインプロジェクトプロジェクト研究員

学位: 博士（生命機能学）(2012年3月大阪大学)

J-GLOBAL ID: 201801020429189615
researchmap会員ID: B000322755

研究キーワード

研究分野

学歴

2009年4月 - 2012年3月

大阪大学大学院, 生命機能研究科, 生命機能専攻
2000年9月 - 2002年6月

台湾大学, 農業化学研究科, 生化学専攻

論文

BiLSTM-Powered Bilinear Attention for Protein–Ligand Prediction

Chih-Yang Cheng, Yi-An Chen, Feng-Yin Li, Suyong Re

2026年5月13日
Subset binding enables detection of multimodal patient subgroup patterns and drug target discovery in idiopathic pulmonary fibrosis.

Yayoi Natsume-Kitatani, Mari N Itoh, Yoshito Takeda, Masataka Kuroda, Haruhiko Hirata, Kotaro Miyake, Takayuki Shiroyama, Yuya Shirai, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi …

Briefings in bioinformatics 27(2) 2026年3月1日
Effect of short-term dietary intervention on fecal serotonin, gut microbiome-derived tryptophanase, and energy absorption in a randomized crossover trial: an exploratory analysis

Eiichi Yoshimura, Yuka Hamada, Yoichi Hatamoto, Takashi Nakagata, Hinako Nanri, Yui Nakayama, Chiharu Iwasaka, Takanori Hayashi, Ippei Suzuki, Takafumi Ando …

Gut Microbes 17(1) 2025年6月9日
NIBN Japan Microbiome Database, a database for exploring the correlations between human microbiome and health.

Yi-An Chen, Hitoshi Kawashima, Jonguk Park, Attayeb Mohsen, Koji Hosomi, Takashi Nakagata, Haruka Murakami, Hinako Nanri, Motohiko Miyachi, Jun Kunisawa …

Scientific reports 15(1) 19640-19640 2025年6月4日
SEND: a suite of tools for the easy sharing of linked biological data

Rodolfo S Allendes Osorio, Yi-An Chen, Kenji Mizuguchi

Database 2025年1月18日
Network-Based Analysis for Biological Knowledge Discovery

Lokesh P. Tripathi, Rodolfo S. Allendes Osorio, Yoichi Murakami, Yi-An Chen, Kenji Mizuguchi

Reference Module in Life Sciences 2024年
Ramen Consumption and Gut Microbiota Diversity in Japanese Women: Cross-Sectional Data from the NEXIS Cohort Study

Jonguk Park, Hiroto Bushita, Ayatake Nakano, Ai Hara, Hiroshi M. Ueno, Naoki Ozato, Koji Hosomi, Hitoshi Kawashima, Yi-An Chen, Attayeb Mohsen …

Microorganisms 11(8) 1892-1892 2023年7月26日
Identification of Human Gut Microbiome Associated with Enterolignan Production

Kento Sawane, Koji Hosomi, Jonguk Park, Kouta Ookoshi, Hinako Nanri, Takashi Nakagata, Yi-An Chen, Attayeb Mohsen, Hitoshi Kawashima, Kenji Mizuguchi …

Microorganisms 10(11) 2169-2169 2022年10月31日
Oral administration of Blautia wexlerae ameliorates obesity and type 2 diabetes via metabolic remodeling of the gut microbiota

Koji Hosomi, Mayu Saito, Jonguk Park, Haruka Murakami, Naoko Shibata, Masahiro Ando, Takahiro Nagatake, Kana Konishi, Harumi Ohno, Kumpei Tanisawa …

Nature Communications 13(1) 2022年8月18日査読有り
TargetMine 2022: A new vision into drug target analysis.

Yi-An Chen, Rodolfo S Allendes Osorio, Kenji Mizuguchi

Bioinformatics (Oxford, England) 2022年7月27日
Snaq: A Dynamic Snakemake Pipeline for Microbiome Data Analysis With QIIME2

Attayeb Mohsen, Yi-An Chen, Rodolfo S. Allendes Osorio, Chihiro Higuchi, Kenji Mizuguchi

Frontiers in Bioinformatics 2 2022年7月1日
Dietary Vitamin B1 Intake Influences Gut Microbial Community and the Consequent Production of Short-Chain Fatty Acids.

Jonguk Park, Koji Hosomi, Hitoshi Kawashima, Yi-An Chen, Attayeb Mohsen, Harumi Ohno, Kana Konishi, Kumpei Tanisawa, Masako Kifushi, Masato Kogawa …

Nutrients 14(10) 2022年5月16日
Data-driven patient stratification and drug target discovery by using medical information and serum proteome data of idiopathic pulmonary fibrosis patients

Yayoi Natsume-Kitatani, Mari N Itoh, Yoshito Takeda, Masataka Kuroda, Haruhiko Hirata, Kohtaro Miyake, Takayuki Shiroyama, Yuya Shirai, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi …

2022年3月29日
Comprehensive analysis of gut microbiota of a healthy population and covariates affecting microbial variation in two large Japanese cohorts.

Jonguk Park, Kumiko Kato, Haruka Murakami, Koji Hosomi, Kumpei Tanisawa, Takashi Nakagata, Harumi Ohno, Kana Konishi, Hitoshi Kawashima, Yi-An Chen …

BMC microbiology 21(1) 151-151 2021年5月20日
MANTA, an integrative database and analysis platform that relates microbiome and phenotypic data

Yi-An Chen, Jonguk Park, Yayoi Natsume-Kitatani, Hitoshi Kawashima, Attayeb Mohsen, Koji Hosomi, Kumpei Tanisawa, Harumi Ohno, Kana Konishi, Haruka Murakami …

PLOS ONE 15(12) e0243609-e0243609 2020年12月4日
Impact of quality trimming on the efficiency of reads joining and diversity analysis of Illumina paired-end reads in the context of QIIME1 and QIIME2 microbiome analysis frameworks

Mohsen A, Park J, Chen YA, Kawashima H, Mizuguchi K

BMC Bioinformatics 20(1) 581 2019年12月査読有り
The TargetMine Data Warehouse: Enhancement and Updates

Chen YA, Tripathi LP, Fujiwara T, Kameyama T, Itoh MN, Mizuguchi K

Frontiers in Genetics 10 934 2019年10月査読有り
生命科学データベースを用いたドラッグリポジショニングモデルの構築

藤原大, 陳怡安, 伊藤眞里, 水口賢司

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 92回 [2T14a-04] 2019年9月査読有り
Assessing drug target suitability using TargetMine

Yi-An Chen, Erika Yogo, Naoko Kurihara, Tomoshige Ohno, Chihiro Higuchi, Masatomo Rokushima, Kenji Mizuguchi

F1000Research 8 233-233 2019年2月28日査読有り
Data Warehousing with TargetMine for Omics Data Analysis

Yi-An Chen, Lokesh P. Tripathi, Kenji Mizuguchi

Methods in Molecular Biology 35-64 2019年

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MISC

ナレッジグラフにおける機械学習によるがん治療薬レジメン予測

舘功陽, 矢野雄一, 赤木健一朗, 夏目やよい, 夏目やよい, 黒田正孝, 黒田正孝, 伊藤眞里, 樋口千洋, 上野賢也 …

人工知能学会全国大会論文集(Web) 38th 2024年
精密栄養学を支える基盤技術 1.マイクロバイオーム統合データベース構築支援ツールMANTAの開発と応用

CHEN Yi-An, PARK Jonguk, PARK Jonguk, 水口賢司, 水口賢司

実験医学 41(10) 2023年
統合創薬研究データウェアハウスによる疾患標的探索モデルの構築

藤原大, CHEN Yi-An, 夏目やよい, 水口賢司

日本薬学会年会要旨集(Web) 143rd 2023年
TargetMineによる生物学的知識の発見 (第1土曜特集構造生命科学による創薬への挑戦) -- (計算機から創薬へ)

陳怡安, 李秀栄, 水口賢司

医学のあゆみ 278(6) 641-645 2021年8月7日
統合生命科学データベースによる臨床試験の統合と薬効・安全性評価

藤原大, CHEN Yi-An, 夏目やよい, 伊藤眞里, 水口賢司

日本薬学会年会要旨集(Web) 140th 2020年
Network-Based Analysis of Host-Pathogen Interactions

Lokesh P. Tripathi, Yi-An Chen, Kenji Mizuguchi, Eiji Morita

Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology 932 2019年査読有り
Network-Based Analysis for Biological Discovery

Lokesh P. Tripathi, Yi-An Chen, Kenji Mizuguchi, Yoichi Murakami

Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology 283 2019年査読有り
Integrative Analysis of Multi-Omics Data

Lokesh P. Tripathi, Tsuyoshi Esaki, Mari N. Itoh, Yi-An Chen, Kenji Mizuguchi

Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology 194 2019年査読有り
生活習慣病やアレルギー疾患の新しい予防法確立に資する健康な日本人の腸管免疫と腸内細菌データベースの構築に関する疫学研究健康な日本人の腸管免疫と腸内細菌データベースの構築

水口賢司, 夏目やよい, 朴鐘旭, 陳怡安, MOHSEN Attayeb, 川島和

生活習慣病やアレルギー疾患の新しい予防法確立に資する健康な日本人の腸管免疫と腸内細菌データベースの構築に関する疫学研究平成29年度総括研究報告書(Web) 2018年
Pathway-Based Analysis of Genome-Wide siRNA Screens Reveals the Regulatory Landscape of App Processing (10, e0115369, 2015)

Luiz Miguel Camargo, Xiaohua Douglas Zhang, Patrick Loerch, Ramon Miguel Caceres, Shane D. Marine, Paolo Uva, Marc Ferrer, Emanuele de Rinaldis, David J. Stone, John Majercak …

PLOS ONE 10(6) 2015年6月

産業財産権

特許第5930266号遺伝子絞り込み装置、遺伝子絞り込み方法、及びコンピュータプログラム

水口賢司, 陳怡安, ロケシュ・パティ・テリパチ
特開2012-069104 遺伝子絞り込み装置、遺伝子絞り込み方法、及びコンピュータプログラム

水口賢司, 陳怡安, ロケシュ・パティ・テリパチ

陳怡安

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