山田千早 (YAMADA CHIHAYA) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院農学生命科学研究科（農学部）助教

学位: 農学博士(東京大学大学院)

J-GLOBAL ID: 201401023747902788
researchmap会員ID: B000242102

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 応用微生物学 /

学歴

2007年4月 - 2013年3月

東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻
2003年4月 - 2007年3月

明治大学農学部農芸化学科

受賞

2021年3月

若手女性研究者賞日本農芸化学会
2018年8月

日本生物工学会東日本支部長賞日本生物工学会

論文

A bacterial sulfoglycosidase highlights mucin O-glycan breakdown in the gut ecosystem.

Toshihiko Katoh, Chihaya Yamada, Michael D Wallace, Ayako Yoshida, Aina Gotoh, Moe Arai, Takako Maeshibu, Toma Kashima, Arno Hagenbeek, Miriam N Ojima, Hiromi Takada, Mikiyasu Sakanaka, Hidenori Shimizu, Keita Nishiyama, Hisashi Ashida, Junko Hirose, Maria Suarez-Diez, Makoto Nishiyama, Ikuo Kimura, Keith A Stubbs, Shinya Fushinobu, Takane Katayama

Nature chemical biology 2023年3月2日
Substrate complex structure, active site labeling and catalytic role of the zinc ion in cysteine glycosidase.

Shun Maruyama, Kota Sawano, Satoko Amaki, Takehiro Suzuki, Satoru Narita, Kenta Kimura, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Yukishige Ito, Naoshi Dohmae, Kiyotaka Fujita, Akihiro Ishiwata, Shinya Fushinobu

Glycobiology 32(2) 171-180 2022年3月19日
Crystal structures of glycoside hydrolase family 136 lacto-N-biosidases from monkey gut- and human adult gut bacteria

Chihaya Yamada, Takane Katayama, Shinya Fushinobu

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2022年1月29日査読有り筆頭著者責任著者
Identification of difructose dianhydride I synthase/hydrolase from an oral bacterium establishes a novel glycoside hydrolase family

Toma Kashima, Kouki Okumura, Akihiro Ishiwata, Machika Kaieda, Tohru Terada, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Kentaro Shimizu, Katsunori Tanaka, Motomitsu Kitaoka, Yukishige Ito, Kiyotaka Fujita, Shinya Fushinobu

Journal of Biological Chemistry 297(5) 101324-101324 2021年11月
Cysteine Nucleophiles in Glycosidase Catalysis: Application of a Covalent β-l-Arabinofuranosidase Inhibitor.

Nicholas G S McGregor, Joan Coines, Valentina Borlandelli, Satoko Amaki, Marta Artola, Alba Nin-Hill, Daniël Linzel, Chihaya Yamada, Takatoshi Arakawa, Akihiro Ishiwata, Yukishige Ito, Gijsbert A van der Marel, Jeroen D C Codée, Shinya Fushinobu, Herman S Overkleeft, Carme Rovira, Gideon J Davies

Angewandte Chemie (International ed. in English) 60(11) 5754-5758 2021年3月8日
Butyrate producing colonic Clostridiales metabolise human milk oligosaccharides and cross feed on mucin via conserved pathways

Michael Jakob Pichler, Chihaya Yamada, Bashar Shuoker, Camila Alvarez-Silva, Aina Gotoh, Maria Louise Leth, Erwin Schoof, Toshihiko Katoh, Mikiyasu Sakanaka, Takane Katayama, Chunsheng Jin, Niclas G. Karlsson, Manimozhiyan Arumugam, Shinya Fushinobu, Maher Abou Hachem

NATURE COMMUNICATIONS 11(1) 2020年7月査読有り
Crystal structure of β-L-arabinobiosidase belonging to glycoside hydrolase family 121

Keita Saito, Alexander Holm Viborg, Shiho Sakamoto, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Kiyotaka Fujita, Shinya Fushinobu

PLoS ONE 15(6) 2020年6月査読有り
Crystallographic and cryogenic electron microscopic structures and enzymatic characterization of sulfur oxygenase reductase from Sulfurisphaera tokodaii

Yuta Sato, Takashi Yabuki, Naruhiko Adachi, Toshio Moriya, Takatoshi Arakawa, Masato Kawasaki, Chihaya Yamada, Toshiya Senda, Shinya Fushinobu, Takayoshi Wakagi

Journal of Structural Biology: X 4 2020年査読有り
Structural basis for the specific cleavage of core-fucosylated N-glycans by endo-β-N-acetylglucosaminidase from the fungus Cordyceps militaris

Haruka Seki, Yibo Huang, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Takashi Kinoshita, Shogo Iwamoto, Yujiro Higuchi, Kaoru Takegawa, Shinya Fushinobu

Journal of Biological Chemistry jbc.RA119.010842 2019年11月査読有り
Understanding the Molecular Mechanism Underlying the High Catalytic Activity of p-Hydroxybenzoate Hydroxylase Mutants for Producing Gallic Acid

Yoshitaka Moriwaki, Mirai Yato, Tohru Terada, Seiji Saito, Noriyuki Nukui, Takumi Iwasaki, Tatsunari Nishi, Yuko Kawaguchi, Ken Okamoto, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Shinya Fushinobu, Kentaro Shimizu

Biochemistry 58(45) 4543-4558 2019年10月査読有り
Identification and characterization of a novel β-D-galactosidase that releases pyruvylated galactose

Yujiro Higuchi, Hitomi Matsufuji, Masanari Tanuma, Takatoshi Arakawa, Kazuki Mori, Chihaya Yamada, Risa Shofia, Emiko Matsunaga, Kosuke Tashiro, Shinya Fushinobu, Kaoru Takegawa

Scientific Reports 8(1) 2018年12月
Identification, functional characterization, and crystal structure determination of bacterial levoglucosan dehydrogenase

Masayuki Sugiura, Moe Nakahara, Chihaya Yamada, Takatoshi Arakawa, Motomitsu Kitaoka, Shinya Fushinobu

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 293(45) 17375-17386 2018年11月
Sharing of human milk oligosaccharides degradants within bifidobacterial communities in faecal cultures supplemented with Bifidobacterium bifidum

Aina Gotoh, Toshihiko Katoh, Mikiyasu Sakanaka, Yiwei Ling, Chihaya Yamada, Sadaki Asakuma, Tadasu Urashima, Yusuke Tomabechi, Ayako Katayama-Ikegami, Shin Kurihara, Kenji Yamamoto, Gaku Harata, Fang He, Junko Hirose, Motomitsu Kitaoka, Shujiro Okuda, Takane Katayama

SCIENTIFIC REPORTS 8 2018年9月
Molecular Insight into Evolution of Symbiosis between Breast-Fed Infants and a Member of the Human Gut Microbiome Bifidobacterium longum

Chihaya Yamada, Aina Gotoh, Mikiyasu Sakanaka, Mitchell Hattie, Keith A. Stubbs, Ayako Katayama-Ikegami, Junko Hirose, Shin Kurihara, Takatoshi Arakawa, Motomitsu Kitaoka, Shujiro Okuda, Takane Katayama, Shinya Fushinobu

CELL CHEMICAL BIOLOGY 24(4) 515-+ 2017年4月査読有り
Isolation and characterization of a thermostable lipase from Bacillus thermoamylovorans NB501

Chihaya Yamada, Kota Sawano, Noriyasu Iwase, Masaki Matsuoka, Takatoshi Arakawa, Shigeo Nishida, Shinya Fushinobu

JOURNAL OF GENERAL AND APPLIED MICROBIOLOGY 62(6) 313-319 2016年査読有り

MISC

Fusarium oxysporum12S由来ラムノースグルクロン酸リアーゼの中性子結晶構造解析

矢野直峰, 近藤辰哉, 日下勝弘, 山田太郎, 荒川孝俊, 山田千早, 阪本龍司, 伏信進矢

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2021 2022年
カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析

鹿島騰真, 奥村公喜, 荒川孝俊, 山田千早, 石渡明弘, 伊藤幸成, 藤田清貴, 伏信進矢

応用糖質科学 11(2) 2021年
Sulfolobus tokodaii由来sulfur oxygenase reductaseのクライオ電子顕微鏡を用いた近原子分解能単粒子解析

佐藤優太, 安達成彦, 守屋俊夫, 荒川孝俊, 荒川孝俊, 川崎政人, 山田千早, 山田千早, 矢吹崇吏, 若木高善, 千田俊哉, 伏信進矢, 伏信進矢

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020 2020年
阻害剤を用いたGH127β-L-アラビノフラノシダーゼの反応機構に関する研究

味木智子, 成田覚, 成田覚, 鈴木健裕, 澤野孝太, 荒川孝俊, 山田千早, 藤田清貴, 伊藤幸成, 伊藤幸成, 堂前直, 石渡明弘, 伏信進矢

日本農芸化学会関東支部講演要旨集(CD-ROM) 2020 2020年
GH127β-L-アラビノフラノシダーゼと阻害剤の複合体構造

澤野孝太, 成田覚, 成田覚, 荒川孝俊, 荒川孝俊, 山田千早, 山田千早, 藤田清貴, 石渡明弘, 伊藤幸成, 伏信進矢, 伏信進矢

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019 2019年
新規ファミリーに属するビフィズス菌由来ラクト-N-ビオシダーゼの立体構造 (応用糖質科学シンポジウム)

山田千早, 片山高嶺, Hattie Mitchell, Stubbs Keith A., 荒川孝俊, 伏信進矢

応用糖質科学 = Bulletin of applied glycoscience : 日本応用糖質科学会誌 7(2) 63-68 2017年
2P-052 好気高温固体発酵システムから単離した好熱性リパーゼ産生菌とその酵素学的性質の解析(酵素学,酵素工学,一般講演)

山田千早, 松岡真生, 岩瀬徳康, 西田茂雄, 祥雲弘文, 若木高善, 伏信進矢

日本生物工学会大会講演要旨集 65 116-116 2013年
3P-184 オカラと廃食用油を用いた好気高温固体発酵システムへの好熱性油脂分解菌の添加効果(培養工学,一般講演)

岩瀬徳康, 山田千早, 松岡真生, 西田茂雄, 祥雲弘文, 若木高善, 伏信進矢

日本生物工学会大会講演要旨集 65 234-234 2013年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ヒト腸内細菌由来の新規なルイス血液型糖鎖抗原利用因子の構造機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2021年4月 - 2024年3月

山田千早
ヒトミルクオリゴ糖の酵素合成と反応メカニズムの解明

加藤記念バイオサイエンス振興財団 2021年4月 - 2023年3月
腸内細菌が有する酵素特異的な専用シャペロンによるフォールディングメカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2021年3月

山田千早
ヒト‐ビフィズス菌の共生・共進化機構の解明：酵素機能から迫る腸内生態学

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2016年4月 - 2019年3月

山田千早
ビフィズス菌由来母乳オリゴ糖分解酵素の合成酵素への転換による母乳オリゴ糖の合成

三島海雲財団学術研究奨励金応募要項【自然科学部門】 2015年7月 - 2016年6月

山田千早

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論文

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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