山田千早 (YAMADA CHIHAYA) - マイポータル

基本情報

所属: 明治大学農学部農芸化学科准教授

学位: 農学博士(東京大学大学院)

J-GLOBAL ID: 201401023747902788
researchmap会員ID: B000242102

外部リンク: https://yamada-lab.labby.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2026年4月 - 現在

明治大学, 農学部農芸化学科, 准教授
2023年4月 - 2026年3月

明治大学, 農学部農芸化学科, 専任講師
2018年4月 - 2023年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助教
2016年4月 - 2018年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員 PD
2013年4月 - 2016年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任研究員

学歴

2009年4月 - 2013年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 応用生命工学専攻博士課程
2007年4月 - 2009年3月

東京大学大学院, 農学生命科学研究科, 応用生命工学専攻修士課程
2003年4月 - 2007年3月

明治大学, 農学部, 農芸化学科

受賞

論文

Structural insights into glycoside hydrolase family 1 β-glucosidase: Selective oligosaccharide hydrolysis, synthesis, and product profiling.

Chih-Chieh Lin, Hiroya Uno, Chihaya Yamada, Tohru Terada, Ting-Jang Lu, Shinya Fushinobu

The Journal of biological chemistry 302(4) 111293-111293 2026年4月
One-pot synthesis of lacto-N-tetraose using a glycosynthase engineered from GH136 lacto-N-biosidase LnbX

Noriki Fujio, Ryota Umekage, Ami Ishikawa, Yuji Honda, Yuta Sugiyama, Motomitsu Kitaoka, Takane Katayama, Shinya Fushinobu, Chihaya Yamada

Glycobiology 2026年最終著者責任著者
Crystal structure of plant γ-glutamyl peptidase 1: implications for sulfur metabolism and secondary metabolite biosynthesis.

Kosei Sone, Takehiro Ito, Hibiki Sawada, Chihaya Yamada, Toma Kashima, Akimasa Miyanaga, Naoko Ohkama-Ohtsu, Shinya Fushinobu

The FEBS journal 2025年11月2日
Identification and structural characterization of a novel acetyl xylan esterase from Aspergillus oryzae

Chihaya Yamada, Tomoe Kato, Yoshihito Shiono, Takuya Koseki, Shinya Fushinobu

The FEBS Journal 2025年1月28日筆頭著者
Crystal structure of glycoside hydrolase family 20 lacto-N-biosidase from soil bacterium Streptomyces sp. strain 142

Noriki Fujio, Shinya Fushinobu, Chihaya Yamada

Journal of Applied Glycoscience 2025年査読有り最終著者責任著者
Crystal structure of β‐<scp>d</scp>‐galactofuranosidase from Streptomyces sp. <scp>JHA19</scp> in complex with an inhibitor provides insights into substrate specificity

Noriki Fujio, Chihaya Yamada, Toma Kashima, Emiko Matsunaga, Robert J. Nash, Kaoru Takegawa, Shinya Fushinobu

FEBS Letters 598(23) 2866-2875 2024年11月14日
Crystal structure of plant γ-glutamyl peptidase 1 with dual roles in sulfur metabolism and implications for oxidative stress regulation

Kosei Sone, Takehiro Ito, Chihaya Yamada, Toma Kashima, Akimasa Miyanaga, Naoko Ohkama-Ohtsu, Shinya Fushinobu

2024年11月9日
Protocatechuate hydroxylase is a novel group A flavoprotein monooxygenase with a unique substrate recognition mechanism.

Nozomi Katsuki, Riku Fukushima, Yuki Doi, Shunsuke Masuo, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Shinya Fushinobu, Naoki Takaya

The Journal of biological chemistry 300(1) 105508-105508 2024年1月
【総説：応用糖質科学シンポジウム】<i>Bifidobacterium bifidum</i>由来の硫酸化ムチン糖鎖および血液型抗原分解酵素の構造基盤

Toma Kashima, Toshihiko Katoh, Chihaya Yamada, Takane Katayama, Hisashi Ashida, Shinya Fushinobu

Bulletin of Applied Glycoscience 13(4) 194-202 2023年12月20日
Identification and characterization of endo-α-, exo-α-, and exo-β-D-arabinofuranosidases degrading lipoarabinomannan and arabinogalactan of mycobacteria.

Michiko Shimokawa, Akihiro Ishiwata, Toma Kashima, Chiho Nakashima, Jiaman Li, Riku Fukushima, Naomi Sawai, Miku Nakamori, Yuuki Tanaka, Azusa Kudo …

Nature communications 14(1) 5803-5803 2023年9月19日査読有り
A bacterial sulfoglycosidase highlights mucin O-glycan breakdown in the gut ecosystem.

Toshihiko Katoh, Chihaya Yamada, Michael D Wallace, Ayako Yoshida, Aina Gotoh, Moe Arai, Takako Maeshibu, Toma Kashima, Arno Hagenbeek, Miriam N Ojima …

Nature chemical biology 2023年3月2日査読有り
Substrate complex structure, active site labeling and catalytic role of the zinc ion in cysteine glycosidase.

Shun Maruyama, Kota Sawano, Satoko Amaki, Takehiro Suzuki, Satoru Narita, Kenta Kimura, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Yukishige Ito, Naoshi Dohmae …

Glycobiology 32(2) 171-180 2022年3月19日査読有り
Crystal structures of glycoside hydrolase family 136 lacto-N-biosidases from monkey gut- and human adult gut bacteria

Chihaya Yamada, Takane Katayama, Shinya Fushinobu

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 86(4) 464-475 2022年1月29日査読有り筆頭著者責任著者
Identification of difructose dianhydride I synthase/hydrolase from an oral bacterium establishes a novel glycoside hydrolase family

Toma Kashima, Kouki Okumura, Akihiro Ishiwata, Machika Kaieda, Tohru Terada, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Kentaro Shimizu, Katsunori Tanaka, Motomitsu Kitaoka …

Journal of Biological Chemistry 297(5) 101324-101324 2021年11月査読有り
Cysteine Nucleophiles in Glycosidase Catalysis: Application of a Covalent β-l-Arabinofuranosidase Inhibitor.

Nicholas G S McGregor, Joan Coines, Valentina Borlandelli, Satoko Amaki, Marta Artola, Alba Nin-Hill, Daniël Linzel, Chihaya Yamada, Takatoshi Arakawa, Akihiro Ishiwata …

Angewandte Chemie (International ed. in English) 60(11) 5754-5758 2021年3月8日査読有り
Author Correction: Identification and characterization of a novel β-D-galactosidase that releases pyruvylated galactose (Scientific Reports, (2018), 8, 1, (12013), 10.1038/s41598-018-30508-4)

Yujiro Higuchi, Hitomi Matsufuji, Masanari Tanuma, Takatoshi Arakawa, Kazuki Mori, Chihaya Yamada, Risa Shofia, Emiko Matsunaga, Kosuke Tashiro, Shinya Fushinobu …

Scientific Reports 10(1) 2020年12月1日
Butyrate producing colonic Clostridiales metabolise human milk oligosaccharides and cross feed on mucin via conserved pathways

Michael Jakob Pichler, Chihaya Yamada, Bashar Shuoker, Camila Alvarez-Silva, Aina Gotoh, Maria Louise Leth, Erwin Schoof, Toshihiko Katoh, Mikiyasu Sakanaka, Takane Katayama …

NATURE COMMUNICATIONS 11(1) 2020年7月査読有り筆頭著者
Crystal structure of β-L-arabinobiosidase belonging to glycoside hydrolase family 121

Keita Saito, Alexander Holm Viborg, Shiho Sakamoto, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Kiyotaka Fujita, Shinya Fushinobu

PLoS ONE 15(6) 2020年6月査読有り
Crystallographic and cryogenic electron microscopic structures and enzymatic characterization of sulfur oxygenase reductase from Sulfurisphaera tokodaii

Yuta Sato, Takashi Yabuki, Naruhiko Adachi, Toshio Moriya, Takatoshi Arakawa, Masato Kawasaki, Chihaya Yamada, Toshiya Senda, Shinya Fushinobu, Takayoshi Wakagi

Journal of Structural Biology: X 4 2020年査読有り
Structural basis for the specific cleavage of core-fucosylated N-glycans by endo-β-N-acetylglucosaminidase from the fungus Cordyceps militaris

Haruka Seki, Yibo Huang, Takatoshi Arakawa, Chihaya Yamada, Takashi Kinoshita, Shogo Iwamoto, Yujiro Higuchi, Kaoru Takegawa, Shinya Fushinobu

Journal of Biological Chemistry 294(45) jbc.RA119.010842-17154 2019年11月査読有り

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MISC

伝統的壺造り純米黒酢醸造の発酵中期における乳酸菌の役割解明に向けて

磯西琴羽, 松谷峰之介, 川崎信治, 藤井暁, 濱田健作, 藤元勇樹, 新井博之, 山田千早

日本農芸化学会関東支部講演要旨集(CD-ROM) 2025 2025年
壺造り黒酢の醸造過程における乳酸菌のD-アミノ酸生成に関与するラセマーゼの特性解析

佐々木舞, 高村和花, 松谷峰之介, 藤井暁, 濱田健作, 藤元勇樹, 新井博之, 山田千早

日本農芸化学会関東支部講演要旨集(CD-ROM) 2025 2025年
伝統的壺造り純米黒酢醸造において酢酸発酵を支える乳酸菌の役割の解明

高村和花, 横井信保, 佐々木舞, 松谷峰之介, 川崎信治, 藤井暁, 濱田健作, 藤元勇樹, 新井博之, 山田千早 …

日本乳酸菌学会誌 36(3) 2025年
ウサギやハチなど動物由来のビフィズス菌が持つヒトミルクオリゴ糖分解酵素の生物学的意義

石川遥菜, 野間愛叶, 熊谷優, 山口啓, 山田千早, 山田千早

日本応用糖質科学会大会・応用糖質科学シンポジウム講演要旨集 74th-14th 2025年
酪酸産生菌Roseburia inulinivorans由来のLewis a/b抗原特異的なGH136ファミリー糖質加水分解酵素のX線結晶構造解析

熊谷優, 鹿島騰真, 伏信進矢, ABOU HACHEM Maher, 山田千早

日本応用糖質科学会大会・応用糖質科学シンポジウム講演要旨集 74th-14th 2025年
伝統的壺造り純米黒酢醸造において酢酸発酵を支える乳酸菌Lactobacillus acetotolerans黒酢株の単離とゲノム解析

高村和花, 松谷峰之介, 川崎信治, 藤井暁, 新井博之, 山田千早

日本農芸化学会関東支部講演要旨集(CD-ROM) 2024 2024年
日本人に特徴的な還元的酢酸生成菌の多様性解析と共培養実験による酢酸生成への寄与

山口啓, 山田千早, 加藤創一郎

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2024 2024年
腸内細菌による硫酸化ムチン糖鎖の新規分解経路の発見と解析

加藤紀彦, 山田千早, 伏信進矢, 片山高嶺

生化学 96(2) 2024年
Bifidobacterium bifidum由来の硫酸化ムチン糖鎖および血液型抗原分解酵素の構造基盤

鹿島騰真, 加藤紀彦, 山田千早, 片山高嶺, 芦田久, 伏信進矢, 伏信進矢

応用糖質科学 13(4) 2023年
結核菌が持つ特徴的な細胞壁多糖を分解する新規酵素の構造と機能の解明

福島陸, 石渡明弘, 藤田清貴, 荒川孝俊, 山田千早, 伏信進矢, 伏信進矢

応用糖質科学 13(3) 2023年
霊長類腸内細菌由来母乳オリゴ糖分解酵素と専用シャペロンのX線結晶構造解析とBioSAXS

星野菜摘, 山田千早, 山田千早, 清水伸隆, 荒川孝俊, 荒川孝俊, 片山高嶺, 伏信進矢, 伏信進矢

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2021 2022年
ヒト・動物の腸内に生息する嫌気性細菌の代謝機能ビフィズス菌やメタン菌の代謝機能から応用研究への展開

山田千早

化学と生物 60(9) 2022年
Fusarium oxysporum12S由来ラムノースグルクロン酸リアーゼの中性子結晶構造解析

矢野直峰, 近藤辰哉, 日下勝弘, 山田太郎, 荒川孝俊, 山田千早, 阪本龍司, 伏信進矢

量子ビームサイエンスフェスタ(Web) 2021 2022年
カラメル化糖に作用するビフィズス菌の新規exo-α-D-fructofuranosidaseの構造解析

鹿島騰真, 奥村公喜, 荒川孝俊, 山田千早, 石渡明弘, 伊藤幸成, 藤田清貴, 伏信進矢

応用糖質科学 11(2) 2021年
Sulfolobus tokodaii由来sulfur oxygenase reductaseのクライオ電子顕微鏡を用いた近原子分解能単粒子解析

佐藤優太, 安達成彦, 守屋俊夫, 荒川孝俊, 荒川孝俊, 川崎政人, 山田千早, 山田千早, 矢吹崇吏, 若木高善 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020 2020年
阻害剤を用いたGH127β-L-アラビノフラノシダーゼの反応機構に関する研究

味木智子, 成田覚, 成田覚, 鈴木健裕, 澤野孝太, 荒川孝俊, 山田千早, 藤田清貴, 伊藤幸成, 伊藤幸成 …

日本農芸化学会関東支部講演要旨集(CD-ROM) 2020 2020年
Bifidobacterium bifidumによるヒト母乳オリゴ糖分解物のクロスフィーディングがビフィズスフローラ形成を促す

後藤愛那, 後藤愛那, 阪中幹祥, 阪中幹祥, 片山高嶺, 片山高嶺, 栗原新, 栗原新, 加藤紀彦, LING Yiwei …

Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications (33) 2019年
GH127β-L-アラビノフラノシダーゼと阻害剤の複合体構造

澤野孝太, 成田覚, 成田覚, 荒川孝俊, 荒川孝俊, 山田千早, 山田千早, 藤田清貴, 石渡明弘, 伊藤幸成 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019 2019年
ラクト-N-ビオシダーゼ(LnbX)の機能から考える母乳オリゴ糖を介したビフィズス菌と母乳栄養児の共生・共進化

後藤愛那, 片山高嶺, 山田千早, 伏信進矢, 櫻間晴子

酵素工学ニュース (78) 2017年
新規ファミリーに属するビフィズス菌由来ラクト-N-ビオシダーゼの立体構造 (応用糖質科学シンポジウム)

山田千早, 片山高嶺, Hattie Mitchell, Stubbs Keith A., 荒川孝俊, 伏信進矢

応用糖質科学 = Bulletin of applied glycoscience : 日本応用糖質科学会誌 7(2) 63-68 2017年

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講演・口頭発表等

伝統的壺酢発酵における微生物動態と機能性成分

山田千早、藤井暁、濱田健作、藤元勇樹、亀谷将史、新井博之

2026年9月16日
ヒトミルクオリゴ糖分解酵素の機能構造解析と酵素合成への応用展開

山田千早

日本生物工学会東日本支部60周年記念講演会 2026年3月7日招待有り
伝統的壺造り純米黒酢醸造において酢酸発酵を支える乳酸菌Lactobacillus acetotolerans黒酢株の単離とゲノム解析

高村和花, 松谷峰之介, 川﨑信治, 藤井暁, 新井博之, 山田千早

日本農芸化学会関東支部2024年度大会 2024年8月30日
ヒト・サルの腸内細菌由来ヒトミルクオリゴ糖分解酵素の結晶構造解析とAlphaFold2を使ってみた感想

山田千早

JBAセミナー"未来へのバイオ技術"勉強会「テクニカルシリーズⅡ AlphaFold2が与えた実験構造生物学への衝撃 2022年5月招待有り
ヒト・動物の腸内細菌由来GH136に属するラクト-N-ビオシダーゼの結晶構造解析

日本応用糖質科学会東日本支部シンポジウム 2021年招待有り
嫌気性細菌の代謝解析とその応用利用

山田千早

日本生物工学会東日本支部賀詞交換会 2020年招待有り
子育てと研究の両立に向けた工夫について

山田千早

日本微生物生態学会ランチセミナー 2017年招待有り
新規ファミリーに属するビフィズス菌由来ラクト-N-ビオシダーゼの立体構造

山田千早

日本応用糖質科学会シンポジウム 2016年9月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

離乳期に主要な酪酸生成腸内細菌におけるヒトミルクオリゴ糖分解酵素の分子メカニズムとヒト健康への寄与への助成

武田科学振興財団 2024年度武田科学振興財団研究助成金ライフサイエンス 2024年10月 - 2027年3月

離乳期に主要な酪酸生成腸内細菌におけるヒトミルクオリゴ糖分解酵素の, 分子メカニズムとヒト健康への寄与への助成
ヒト腸内細菌由来の新規なルイス血液型糖鎖抗原利用因子の構造機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2021年4月 - 2024年3月

山田千早
13Cラベル母乳オリゴ糖を用いた腸内細菌種間関係の解析

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 ACT-X 2021年 - 2023年

山田千早
腸内細菌が有する酵素特異的な専用シャペロンによるフォールディングメカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2018年4月 - 2021年3月

山田千早
ヒト‐ビフィズス菌の共生・共進化機構の解明：酵素機能から迫る腸内生態学

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2016年4月 - 2019年3月

山田千早

山田千早

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論文

MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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