樋口千洋 (CHIHIRO HIGUCHI) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 AI健康・医薬研究センター技術補助員
: 東京科学大学非常勤講師

研究者番号: 50843075
J-GLOBAL ID: 202101013250168142
researchmap会員ID: R000027927

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / システムゲノム科学 / バイオインフォマティクス

論文

Brugada syndrome in Japan and Europe: a genome-wide association study reveals shared genetic architecture and new risk loci

Taisuke Ishikawa, Tatsuo Masuda, Tsuyoshi Hachiya, Christian Dina, Floriane Simonet, Yuki Nagata, Michael W T Tanck, Kyuto Sonehara, Charlotte Glinge, Rafik Tadros …

European Heart Journal 45(26) 2320-2332 2024年5月15日査読有り
Correction: Targeted deep sequencing analyses of long QT syndrome in a Japanese population.

Yuki Nagata, Ryo Watanabe, Christian Eichhorn, Seiko Ohno, Takeshi Aiba, Taisuke Ishikawa, Yukiko Nakano, Yoshiyasu Aizawa, Kenshi Hayashi, Nobuyuki Murakoshi …

PloS one 19(12) e0315106 2024年
Toward the Construction of a Knowledge Graph from Japanese Food Ontology for the Prevention of Frailty

Chihiro Higuchi, Agustin Martin-Morales, Ai Oya, Mai Inoue, Misako Ikkai, Kenji Mizuguchi, Michihiro Araki

IJCKG-WPD 2023 Workshop, Poster and Demonstration Proceedings of IJCKG 2023 2023年12月査読有り筆頭著者
PRISM成果利用システム「峰」の構築新薬創出を加速する人工知能の開発

樋口千洋, 黒田正孝, 伊藤眞里, 長尾知生子, 浜本隆二, 黒橋禎夫, 高村大也, 奥野恭史, 山西芳裕, 水口賢司 …

医療情報学連合大会論文集 42回 1064-1066 2022年11月
Data-driven patient stratification and drug target discovery by using medical information and serum proteome data of idiopathic pulmonary fibrosis patients

Yayoi Natsume-Kitatani, Mari N Itoh, Yoshito Takeda, Masataka Kuroda, Haruhiko Hirata, Kohtaro Miyake, Takayuki Shiroyama, Yuya Shirai, Yoshimi Noda, Yuichi Adachi …

2022年3月29日査読有り
Snaq: A Dynamic Snakemake Pipeline for Microbiome Data Analysis With QIIME2.

Attayeb Mohsen, Yi-An Chen, Rodolfo S Allendes Osorio, Chihiro Higuchi, Kenji Mizuguchi

Frontiers in bioinformatics 2 893933-893933 2022年
Targeted deep sequencing analyses of long QT syndrome in a Japanese population.

Yuki Nagata, Ryo Watanabe, Christian Eichhorn, Seiko Ohno, Takeshi Aiba, Taisuke Ishikawa, Yukiko Nakano, Yoshiyasu Aizawa, Kenshi Hayashi, Nobuyuki Murakoshi …

PloS one 17(12) e0277242 2022年
国民健康・栄養調査食品群のオントロジー構築

樋口千洋, 櫛田達矢, 八塚茂, 畠中秀樹, 長尾知生子, 荒木通啓, 水口賢司

トーゴーの日2021 1 2021年10月5日
食品オントロジーの製作

樋口千洋, 櫛田達矢, 八塚茂, 畠中秀樹, 長尾知生子, 荒木通啓, 水口賢司

人工知能学会第二種研究会資料 2021(SWO-054) 02 2021年8月4日
Assessing drug target suitability using TargetMine

Yi-An Chen, Erika Yogo, Naoko Kurihara, Tomoshige Ohno, Chihiro Higuchi, Masatomo Rokushima, Kenji Mizuguchi

F1000Research 8 233-233 2019年5月28日
Systematic Comparison of Machine Learning Methods for Identification of miRNA Species as Disease Biomarkers

Chihiro Higuchi, Toshihiro Tanaka, Yukinori Okada

Bioinformatics and Biomedical Engineering 386-394 2015年
Gene expression profiles in the common marmoset brain determined using a newly developed common marmoset-specific DNA microarray

Toshifumi Fukuoka, Kayo Sumida, Toru Yamada, Chihiro Higuchi, Keiko Nakagaki, Katsuki Nakamura, Shinichi Kohsaka, Koichi Saito, Kenji Oeda

Neuroscience Research 66(1) 62-85 2010年1月

MISC

ナレッジグラフにおける機械学習によるがん治療薬レジメン予測

舘功陽, 矢野雄一, 赤木健一朗, 夏目やよい, 夏目やよい, 黒田正孝, 黒田正孝, 伊藤眞里, 樋口千洋, 上野賢也 …

人工知能学会全国大会論文集(Web) 38th 2024年
「新薬創出を加速する人工知能の開発」特発性肺線維症臨床情報収集と創薬標的探索手法の構築

伊藤眞里, 黒田正孝, 夏目やよい, 武田吉人, 武田理宏, 松村泰志, 黒橋禎夫, 荒牧英治, 北村英也, 小倉高志 …

医療情報学連合大会論文集 42回 1067-1069 2022年11月
食品オントロジーの構築

樋口千洋, 櫛田達矢, 畠中秀樹, 長尾知生子, 長尾知生子, 古崎晃司, 荒木通啓, 水口賢司, 水口賢司

人工知能学会第二種研究会資料(Web) 2022(SWO-058) 2022年
マイクロRNAのパスウェイ解析システムの開発

樋口千洋, 田口善弘

情報処理学会研究報告(Web) 2018(BIO-53) 2018年
インターネットとセキュリティ

樋口千洋

薬学図書館 50(1) 2005年
LinuxのためのImage Scan!

樋口千洋

Software Design (135) 2002年
Ext3 Linuxの次世代ファイルシステム

樋口千洋

Software Design (135) 2002年
Linuxの特徴とデータベース系アプリケーションの活用

樋口千洋

CICSJ Bulletin (Division of Chemical Information and Computer Sciences, the Chemical Society of Japan) 20(1-6) 2002年
Linuxカーネル2.4の挑戦前編 2Gバイトの壁を突き破れ!

樋口千洋

Software Design (130) 2001年
Linuxカーネル2.4の挑戦後編 NFS,ReiserFSを活用せよ

樋口千洋

Software Design (131) 2001年
体験! PS2 Linux Kit

樋口千洋

Software Design (133) 2001年
Linux真はまり道第10回 LDAPを使ってみよう前編

樋口千洋

Software Design (123) 2001年
Linuxハードウェア探検2001 1 CPU/マザーボードメモリ編

樋口千洋

Software Design (127) 2001年
Linuxハードウェア探検2001 3 ストレージ編

樋口千洋

Software Design (127) 2001年
Linux真はまり道第11回 LDAPを使ってみよう後編

樋口千洋

Software Design (124) 2001年
Linux 真はまり道第8回考える道具としてのLinux

樋口千洋

Software Design (120) 2000年
Linux 真はまり道第6回 USBホゲり道(前編)

樋口千洋, たなかとしひさ

Software Design (118) 2000年
Linux真はまり道第5回 Linuxで無線LANを使ってみよう

樋口千洋

Software Design (117) 2000年
Linux真はまり道第4回コミュニティへの招待

樋口千洋

Software Design (116) 2000年
Linux真はまり道第7回 USBホゲり道 (後編)

樋口千洋, たなかとしひさ

Software Design (119) 2000年

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書籍等出版物

Pythonではじめるバイオインフォマティクス : 可読性・拡張性・再現性のあるコードを書くために

Youens-Clark, Ken, 異業種データサイエンス研究会

オライリー・ジャパン,オーム社 (発売) 2023年6月 (ISBN: 9784814400379)
Pythonによるバイオインフォマティクス

Bassi, Sebastian, 石井, 学, 大川, 和史, 玉木, 聡志, 樋口, 千洋, 堀田, 倫英, 山根, 健治

共立出版 2021年2月 (ISBN: 9784320058156)
Rパッケージガイドブック

岡田, 昌史

東京図書 2011年4月 (ISBN: 9784489020971)
Rによるバイオインフォマティクスデータ解析 : Bioconductorを用いたゲノムスケールのデータマイニング

樋口, 千洋

共立出版 2011年1月 (ISBN: 9784320057081)
オープンソースで始めるゲノム・プロテオーム・メタボローム解析

樋口, 千洋

オーム社 2009年2月 (ISBN: 9784274067563)
統計解析環境Rによるバイオインフォマティクスデータ解析 : Bioconductorを用いたゲノムスケールのデータマイニング

樋口, 千洋, 石井, 一夫

共立出版 2007年9月 (ISBN: 9784320056596)
PostgreSQLオフィシャルマニュアル

PostgreSQL Global Development Group, 日本ポストグレスユーザー会

インプレス,インプレスコミュニケーションズ (発売) 2005年5月 (ISBN: 4844321080)
Plamo Linux expert

技術評論社 2004年8月 (ISBN: 477412074X)
The R book : データ解析環境Rの活用事例集

岡田, 昌史

九天社 2004年6月 (ISBN: 4901676970)
はじめてのPostgreSQL : データベース問い合わせのコンセプト

Momjian, Bruce, 日本ポストグレスユーザー会

ピアソン・エデュケーション 2001年9月 (ISBN: 4894714612)

講演・口頭発表等

Metabolome data mining of mass spectrometry measurements with random forests

Chihiro Higuchi, Shigeo Takenaka

The R User Conference 2008 2008年8月12日

担当経験のある科目(授業)

2006年4月 - 2009年3月

データベース特論 (神戸情報大学院大学)

所属学協会

2014年10月 - 現在

日本人類遺伝学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

日本食の食品オントロジーの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2025年4月 - 2028年3月

樋口千洋
マイクロRNAのパスウェイ解析システムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業奨励研究奨励研究 2017年 - 2017年

樋口千洋

主要な社会貢献活動

Linux conference '98

運営参加・支援

1998年12月18日

樋口千洋

基本情報

研究キーワード

研究分野

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

主要な社会貢献活動

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