水口千穂 (Chiho Suzuki-Minakuchi) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院農学生命科学研究科助教

学位: 博士（農学）(2014年3月東京大学)

通称等の別名: 鈴木千穂
研究者番号: 10733032
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-6622-1955
J-GLOBAL ID: 202001015116616002
researchmap会員ID: R000014544

研究分野

ライフサイエンス / 応用微生物学 /

経歴

2025年4月 - 現在

東京大学, 大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻微生物エコテクノロジー社会連携講座, 特任助教（兼任）
2021年4月 - 現在

東京大学, 大学院農学生命科学研究科附属アグロバイオテクノロジー研究センター, 助教
2014年4月 - 2021年3月

東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教
2011年4月 - 2014年3月

日本学術振興会特別研究員 (DC1)

学歴

2011年4月 - 2014年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 応用生命工学専攻博士課程
2009年4月 - 2011年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 応用生命工学専攻修士課程
2007年4月 - 2009年3月

東京大学, 農学部, 生命工学専修
2005年4月 - 2007年3月

東京大学, 教養学部, 理科二類

委員歴

受賞

論文

Integrating real-time imaging and transcriptomics reveals morphotype-associated differences in biofilm architecture and pyrene removal by Mycolicibacterium parafortuitum

Kallayanee Naloka, Satoko Suzuki, Felipe Vejarano, Prinpida Sonthiphand, Nuttapon Pombubpa, Kenshi Suzuki, Chiho Suzuki-Minakuchi, Masaki Shintani, Hideaki Nojiri, Onruthai Pinyakong

Bioresource Technology 464 135936-135936 2027年1月
Structural characterization of the native oligomerization mode of MvaT proteins in Pseudomonas.

Delyana Vasileva, Chiho Suzuki-Minakuchi, Takatoshi Arakawa, Yoshitaka Moriwaki, Kento Yonezawa, Nobutaka Shimizu, Zui Fujimoto, Tohru Terada, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Microbiology Spectrum 14(5) e0023526 2026年4月6日責任著者
A replication-centered phylogeny illuminates the evolutionary landscape of bacterial plasmids

Yosuke Nishimura, Kensei Kaneko, Tatsuya Kamijo, Nanako Isogai, Maho Tokuda, Hui Xie, Yusuke Tsuda, Aki Hirabayashi, Ryota Moriuchi, Hideo Dohra …

bioRxiv 2026年3月30日
DNA-binding Affinity of MvaT Homologs Encoded on the Catabolic Plasmid pCAR1 and the Host Chromosome of Pseudomonas putida KT2440

Chiho Suzuki-Minakuchi, Yuki Kadono, Kazuki Tsushima, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Journal of Environmental Biotechnology 25(1) 65-69 2025年8月20日責任著者
Transcriptional heterogeneity of catabolic genes on the plasmid pCAR1 causes host-specific carbazole degradation

Chiho Suzuki-Minakuchi, Natsumi Yamamoto, Saki Takahira, Masataka Yamaguchi, Yutaro Takeda, Kazunori Okada, Shinsuke Shigeto, Hideaki Nojiri

Applied and Environmental Microbiology 90(2) e0124723 2024年2月21日責任著者
Draft Genome Sequence of the Marine-Derived, Anticancer Compound-Producing Bacterium Streptomyces sp. Strain GMY01.

Jaka Widada, Ema Damayanti, Camelia Herdini, Nastiti Wijayanti, Akira Hosoyama, Atsushi Yamazoe, Chiho Suzuki-Minakuchi, Bambang Hariwiyanto, Sofia Mubarika, Achmad Dinoto …

Microbiology resource announcements 12(6) e0136620 2023年6月20日
The α- and β-Subunit Boundary at the Stem of the Mushroom-Like α3β3-Type Oxygenase Component of Rieske Non-Heme Iron Oxygenases Is the Rieske-Type Ferredoxin-Binding Site.

Pi-Cheng Tsai, Joydeep Chakraborty, Chiho Suzuki-Minakuchi, Tohru Terada, Tatsurou Kotake, Jun Matsuzawa, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Applied and environmental microbiology 88(15) e0083522 2022年8月9日
A toxin-antitoxin system confers stability to the IncP-7 plasmid pCAR1.

Aya Takashima, Hibiki Kawano, Tomomi Ueda, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Gene 812 146068-146068 2022年2月20日
Low-cost gel-filled microwell array device for screening marine microbial consortium.

Clelia Duran, Shiyi Zhang, Chongyang Yang, Maria Lorena Falco, Cristiana Cravo-Laureau, Chiho Suzuki-Minakuchi, Hideaki Nojiri, Robert Duran, Fumihiro Sassa

Frontiers in microbiology 13 1031439-1031439 2022年
Azoxystrobin amine: A novel azoxystrobin degradation product from Bacillus licheniformis strain TAB7.

Enock Mpofu, Amirah Alias, Keisuke Tomita, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kenji Tomita, Joydeep Chakraborty, Michal Malon, Yusuke Ogura, Hirosato Takikawa, Kazunori Okada …

Chemosphere 273 129663-129663 2021年6月
Effects of environmental factors and coexisting substrates on PAH degradation and transcriptomic responses of the defined bacterial consortium OPK.

Natthariga Laothamteep, Hibiki Kawano, Felipe Vejarano, Chiho Suzuki-Minakuchi, Masaki Shintani, Hideaki Nojiri, Onruthai Pinyakong

Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) 277 116769-116769 2021年5月15日
A Novel Gene Cluster Is Involved in the Degradation of Lignin-Derived Monoaromatics in Thermus oshimai JL-2.

Joydeep Chakraborty, Chiho Suzuki-Minakuchi, Takeo Tomita, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Applied and environmental microbiology 87(11) 2021年5月11日
Oxygen concentration affects frequency and range of transconjugants for the incompatibility (Inc) P-1 and P-7 plasmids pBP136 and pCAR1.

Kentaro Ochi, Maho Tokuda, Kosuke Yanagiya, Chiho Suzuki-Minakuchi, Hideaki Nojiri, Masahiro Yuki, Moriya Ohkuma, Kazuhide Kimbara, Masaki Shintani

Bioscience, biotechnology, and biochemistry 85(4) 1005-1015 2021年3月24日
H-NS Family Proteins Drastically Change Their Targets in Response to the Horizontal Transfer of the Catabolic Plasmid pCAR1.

Taisuke Nakamura, Chiho Suzuki-Minakuchi, Hibiki Kawano, Yu Kanesaki, Shinji Kawasaki, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Frontiers in microbiology 11 1099-1099 2020年責任著者
A Novel Small RNA on the Pseudomonas putida KT2440 Chromosome Is Involved in the Fitness Cost Imposed by IncP-1 Plasmid RP4.

Hibiki Kawano, Chiho Suzuki-Minakuchi, Daisuke Sugiyama, Natsuki Watanabe, Yurika Takahashi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Frontiers in microbiology 11 1328-1328 2020年
Biotransformation of Monocyclic Phenolic Compounds by Bacillus licheniformis TAB7.

Enock Mpofu, Joydeep Chakraborty, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Toshiaki Kimura, And Hideaki Nojiri

Microorganisms 8(1) 2019年12月21日
Complete Genome Sequence of Thalassococcus sp. Strain S3, a Marine Roseobacter Clade Member Capable of Degrading Carbazole.

Felipe Vejarano, Chiho Suzuki-Minakuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Microbiology resource announcements 8(28) 2019年7月11日
Complete Genome Sequence of an Anaerobic Benzene-Degrading Bacterium, Azoarcus sp. Strain DN11.

Allan Devanadera, Felipe Vejarano, Yu Zhai, Chiho Suzuki-Minakuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuki Kasai, Yoh Takahata, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Microbiology resource announcements 8(11) 2019年3月14日
Complete Genome Sequence of Bacillus licheniformis TAB7, a Compost-Deodorizing Strain with Potential for Plant Growth Promotion.

Enock Mpofu, Felipe Vejarano, Chiho Suzuki-Minakuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Joydeep Chakraborty, Masatoshi Nakajima, Kazunori Okada, Nobuki Tada, Toshiaki Kimura …

Microbiology resource announcements 8(4) 2019年1月
Conjugative Selectivity of Plasmids Is Affected by Coexisting Recipient Candidates.

Ayako Sakuda, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

mSphere 3(6) 2018年12月19日

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主要なMISC

163

一細胞解析から見えてきた芳香族化合物分解菌の個性と社会

水口千穂, 野尻秀昭

化学と生物 64(1) 2-4 2026年1月査読有り

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書籍等出版物

DNA Traffic in the Environment

Hiromi Nishida, Taku Oshima (担当:分担執筆, 範囲:Xenogeneic Silencing and Horizontal Gene Transfer [Chiho Suzuki-Minakuchi, William Wiley Navarre])

Springer 2019年 (ISBN: 9789811334108)

担当経験のある科目(授業)

2025年 - 現在

微生物生態学 (東京大学)
2022年 - 現在

教養学部全学自由研究ゼミナール環境浄化・保全の微生物学 (東京大学)
2022年 - 現在

教養学部総合科目E 微生物の科学・微生物のバイオテクノロジー (東京大学)
2014年 - 現在

生命化学・工学専修学生実験 (東京大学)
2014年 - 現在

微生物機能開発学 (東京大学)
2024年

微生物科学イノベーション特論 II (東京大学)
2021年6月

大学院生命科学研究科バイオサイエンス専攻細胞分子機能科学特論Ⅰ (東京農業大学)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

階層的アプローチによる木質バイオマスの低分子化と芳香族化合物資源への選択的変換

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2026年4月 - 2030年3月

原啓文, 手塚武揚, 砂川直輝, 水口千穂
競合を避けて得られた「弱い」分解菌から見るピレン分解菌の多様性

公益財団法人野田産業科学研究所 2026年4月 - 2027年3月

水口千穂
プラスミド獲得に伴う宿主細菌の核様体再構築過程の分子基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

水口千穂, 宮澤佳甫
プラスミドの利用に「最適な宿主」となるための宿主細菌の適応過程の解明

公益財団法人長瀬科学技術振興財団 2025年4月 - 2026年3月

水口千穂
亜寒帯・温帯・熱帯植物の「植物体圏」におけるプラスミドの伝播現象の実態解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2020年10月 - 2025年3月

新谷政己, 水口千穂, 原啓文, 野尻秀昭
宿主にとってよそ者であるプラスミド自身が外来遺伝子のサイレンサーを持つ理由の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

水口千穂
多環芳香族化合物ピレン分解菌群の分解力を決定づける微生物間相互作用の解明

公益財団法人野田産業科学研究所 2022年4月 - 2023年3月

水口千穂
嫌気性ベンゼン分解菌の分解力を引き出す：「本当に現場で分解する」菌を目指して

公益財団法人発酵研究所 2021年4月 - 2023年3月

水口千穂
海岸油汚染の環境浄化に利用可能な炭化水素分解菌の探索と解析

日本学術振興会二国間交流事業フランスとの共同研究 (MEAE-MESRI) 2021年4月 - 2023年3月

水口千穂, 野尻秀昭, 佐々文洋, 楊重陽, DURAN Robert, CRAVO-LAUREAU Cristiana
環境細菌の集団としての振る舞いを決める分子機構の解明

国立研究開発法人科学技術振興機構 ERATO野村集団微生物制御プロジェクト 2016年4月 - 2022年3月

水口千穂
翻訳後修飾に伴うヒストン様因子の機能変化がプラスミド保持細菌に与える影響の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

水口千穂
細菌のヒストン様因子による転写制御ネットワークがプラスミドと宿主に与える影響

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

水口千穂
プラスミドと宿主染色体由来の核様体タンパク質が異なる機能を持つ分子機構の解明

公益財団法人加藤記念バイオサイエンス振興財団 2015年4月 - 2017年3月

水口千穂
嫌気性ベンゼン分解菌の分解経路の解明

公益財団法人野田産業科学研究所 2015年4月 - 2016年3月

水口千穂
プラスミドpCAR1と宿主染色体にコードされるNAPsの協調的転写制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2011年4月 - 2014年3月

鈴木千穂

水口千穂

基本情報

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

主要なMISC

書籍等出版物

担当経験のある科目(授業)

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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