新里宙也 (Chuya Shinzato) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大気海洋研究所准教授

研究者番号: 70524726
J-GLOBAL ID: 201401051194547074
researchmap会員ID: B000241874

外部リンク: http://kaken.nii.ac.jp/d/r/70524726.ja.html

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経歴

2009年 - 2017年1月

沖縄科学技術大学院大学, 研究員

論文

106

Time-Series RNA-Seq of Acropora tenuis Reveals Molecular Waves Leading to Synchronous Mass Spawning of Scleractinian Corals.

Yuki Yoshioka, Go Suzuki, Yuji Fujikura, Satokuni Tashiro, Taiga Uchida, Eiichi Shoguchi, Noriyuki Satoh, Chuya Shinzato

Molecular ecology e70054 2025年8月5日査読有り最終著者責任著者
Microbiome of the Boring Giant Clam Provides Insights Into Holobiont Resilience Under Coral Reef Environmental Stress.

Taiga Uchida, Yanxiu Li, Hiroshi Yamashita, Go Shimada, Chuya Shinzato

Environmental microbiology 27(8) e70161 2025年8月査読有り最終著者責任著者
Genetic isolation of an amphidromous goby species, Luciogobius ryukyuensis, highlights limited gene flow in small island populations.

Ken Maeda, Hirozumi Kobayashi, Taiga Uchida, Chuya Shinzato, Ryo Koyanagi, Atsushi J Nagano, Noriyuki Satoh, Vincent Laudet

Scientific reports 15(1) 24193-24193 2025年7月7日査読有り
Nearly T2T, phased genome assemblies of corals reveal haplotype diversity and the evolutionary process of gene expansion.

Takeshi Takeuchi, Yoshihiko Suzuki, Eiichi Shoguchi, Manabu Fujie, Mayumi Kawamitsu, Chuya Shinzato, Noriyuki Satoh, Eugene W Myers

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 32(4) 2025年7月4日査読有り
An eDNA metabarcoding system for detecting scleractinian corals to the generic level along the Japanese coast

Hisata Kanako, Nagata Tomofumi, Kanai Megumi, Sinniger Frederic, Nagata Fumihiko, Suwa Mayuki, Yoshioka Yuki, Harii Saki, Nonaka Masanori, Fukami Hironobu …

Galaxea 27(1) 2025年査読有り
Extensive mitochondrial genomic analyses reveal dynamic gene order rearrangements in the class Octocorallia (Cnidaria: Anthozoa)

Yuki Yoshioka, Megumi Kanai, Shogo Gishitomi, Nana Arakaki, Tatsuki Koido, Chuya Shinzato, Jun Inoue, Tomofumi Nagata, Noriyuki Satoh

Gene Reports 102111-102111 2024年12月査読有り
An Improved RNA Extraction Method for Octocorals and Its Application in Transcriptome Analysis of Dark-Induced Bleaching Octocoral.

Jing-Wen Michelle Wong, An-Chi Liu, Hsuan-Tung Lin, Chuya Shinzato, Sung-Yin Yang, Shan-Hua Yang

Marine biotechnology (New York, N.Y.) 27(1) 8-8 2024年11月26日査読有り
Azooxanthellate Palythoa (Cnidaria: Anthozoa) genomes reveal toxin-related gene clusters and loss of neuronal genes in hexacorals

Yuki Yoshioka, Hiroshi Yamashita, Taiga Uchida, Chuya Shinzato, Mayumi Kawamitsu, Chloé Julie Loïs Fourreau, Guillermo Mironenko Castelló, Britta Katharina Fiedler, Timotheus Maximilian van den Eeckhout, Stefano Borghi …

Genome Biology and Evolution 16(9) 2024年9月6日査読有り
Genome and tissue-specific transcriptomes of the large-polyp coral, Fimbriaphyllia (Euphyllia) ancora: a recipe for a coral polyp

Shinya Shikina, Yuki Yoshioka, Yi-Ling Chiu, Taiga Uchida, Emma Chen, Yin-Chu Cheng, Tzu-Chieh Lin, Yu-Ling Chu, Miyuki Kanda, Mayumi Kawamitsu …

Communications Biology 7(1) 2024年7月24日査読有り最終著者責任著者
phyloBARCODER: A web tool for phylogenetic classification of eukaryote metabarcodes using custom reference databases.

Jun Inoue, Chuya Shinzato, Junya Hirai, Sachihiko Itoh, Yuki Minegishi, Shin-Ichi Ito, Susumu Hyodo

Molecular biology and evolution 2024年6月8日査読有り
Functional analyses of bacterial genomes found in Symbiodiniaceae genome assemblies.

Eiichi Shoguchi, Masanobu Kawachi, Chuya Shinzato, Girish Beedessee

Environmental microbiology reports 16(2) e13238 2024年4月査読有り
Ontogenetic shifts in Symbiodiniaceae assemblages within cultured Acropora humilis across hatchery rearing and post-transplantation phases

Suppakarn Jandang, Voranop Viyakarn, Yuki Yoshioka, Chuya Shinzato, Suchana Chavanich

Frontiers in Marine Science 11 2024年1月26日査読有り
Genomic data reveal diverse biological characteristics of scleractinian corals and promote effective coral reef conservation

Chuya Shinzato, Yuki Yoshioka

Genome Biology and Evolution 2024年1月25日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Genes possibly related to symbiosis in early life stages of Acropora tenuis inoculated with Symbiodinium microadriaticum.

Yuki Yoshioka, Yi-Ling Chiu, Taiga Uchida, Hiroshi Yamashita, Go Suzuki, Chuya Shinzato

Communications biology 6(1) 1027-1027 2023年10月18日査読有り最終著者責任著者
Genomic and transcriptomic analyses illuminate the molecular basis of the unique lifestyle of a tubeworm, Lamellibrachia satsuma.

Taiga Uchida, Yuki Yoshioka, Yu Yoshida, Manabu Fujie, Ayuta Yamaki, Akira Sasaki, Koji Inoue, Chuya Shinzato

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 30(4) 2023年8月1日査読有り最終著者責任著者
An environmental DNA metabarcoding survey reveals generic-level occurrence of scleractinian corals at reef slopes of Okinawa Island.

Koki Nishitsuji, Tomofumi Nagata, Haruhi Narisoko, Megumi Kanai, Kanako Hisata, Chuya Shinzato, Noriyuki Satoh

Proceedings. Biological sciences 290(1995) 20230026-20230026 2023年3月29日査読有り
Evolutionary responses of a reef-building coral to climate change at the end of the last glacial maximum.

Jia Zhang, Zoe T Richards, Arne A S Adam, Cheong Xin Chan, Chuya Shinzato, James Gilmour, Luke Thomas, Jan M Strugnell, David J Miller, Ira Cooke

Molecular biology and evolution 2022年10月11日査読有り
Coral larvae suppress heat stress response during the onset of symbiosis decreasing their odds of survival.

Sheila A Kitchen, Duo Jiang, Saki Harii, Noriyuki Satoh, Virginia M Weis, Chuya Shinzato

Molecular ecology 2022年9月28日査読有り
Genomic analysis of a reef-building coral, Acropora digitifera, reveals complex population structure and a migration network in the Nansei Islands, Japan.

Kojin Tsuchiya, Yuna Zayasu, Yuichi Nakajima, Nana Arakaki, Go Suzuki, Noriyuki Satoh, Chuya Shinzato

Molecular ecology 2022年9月9日査読有り最終著者責任著者
Evolutionary History of DMSP Lyase-Like Genes in Animals and Their Possible Involvement in Evolution of the Scleractinian Coral Genus, Acropora

Yi-Ling Chiu, Chuya Shinzato

FRONTIERS IN MARINE SCIENCE 9 2022年6月査読有り最終著者責任著者

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MISC

サンゴ礁の保全・再生へ, ゲノム科学からの新しい取り組み

新里宙也

動向 22(3) 3_92-3_95 2017年
漁協によるサンゴ再生の取り組み〜沖縄県恩納村での事例〜

比嘉義視, 新里宙也, 座安佑奈, 長田智史, 久保弘文

日本サンゴ礁学会誌 19(1) 119-128 2017年
サンゴ礁の保全・再生へ、遺伝子解析からのアプローチ

新里宙也

ていくおふ (146) 12-19 2017年
Comparative proteomics database for gene spectral analysis

Toshinori Endo, Ryo Koyanagi, Chuya Shinzato, Nori Satoh

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 405-405 2015年12月
Consequences of Hyperthermal Stress on Coral Larvae Undergoing Symbiont Colonization

S. Kitchen, C. Shinzato, S. Harii, N. Satoh, Weis, V

INTEGRATIVE AND COMPARATIVE BIOLOGY 55 E97-E97 2015年4月
2S-Ep02 サンゴ礁生態系の保全・再生へのゲノミクス技術の活用(生物工学的手法を活用した海洋環境・生物多様性資源の新規評価軸構築)

新里宙也

日本生物工学会大会講演要旨集 67 265-265 2015年
ゲノムで進化の謎を解く!(第4回)サンゴ礁を生んだ無脊椎動物と藻類の共生は,どのように進化したのか?

將口栄一, 新里宙也

細胞工学 33(4) 454-458 2014年
サンゴの遺伝子研究のこれまでの歩みとゲノム解読による新展開(地球環境変動と造礁サンゴI-「海の研究」特集号-)

新里宙也, Chuya Shinzato, 沖縄科学技術大学院大学マリンゲノミクスユニット, Marine Genomics Unit Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University

海の研究 = Umi no Kenkyu (Oceanography in Japan) 21(4) 119-130 2012年7月15日
サンゴの遺伝子研究のこれまでの歩みとゲノム解読による新展開(地球環境変動と造礁サンゴI-「海の研究」特集号-)

新里宙也

海の研究 21(4) 119-130 2012年7月15日査読有り招待有り
造礁サンゴ(ミドリイシ)(生物材料インデックス)

新里宙也

生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi 90(6) 353-355 2012年6月25日
サンゴ礁のゲノム科学 (特集マリンゲノミクス : 海洋生物のゲノム解読の現状と将来展望)

新里宙也

遺伝 : 生物の科学 65(6) 44-49 2011年11月
アコヤガイ・ドラフトゲノム解読

竹内猛, 川島武士, 小柳亮, 行者蕗, 藤江学, 宇佐美剛志, 田中牧子, 生田哲朗, 將口栄一, 藤原真幸 …

日本水産学会大会講演要旨集 2011 59 2011年9月28日
クラゲのゲノムが語る進化の"取捨選択" (特集驚異のクラゲ)

川島武士, 新里宙也

科学 79(4) 405-408 2009年4月
動物ゲノム解読の10年がもたらした新しい進化観

川島武士, 濱田麻友子, 新里宙也

科学 78(10) 1070-1079 2008年10月

共同研究・競争的資金等の研究課題

なぜ褐虫藻は過酷なサンゴ礁環境で高い光合成能力を発揮できるのか？

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2025年4月 - 2029年3月

山下洋, 酒井隆一, 井上菜穂子, 神保充, 新里宙也, 將口栄一, 小池一彦, 横田秀夫
サンゴ組織内細菌集合体のin situ共生機構解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2029年3月

和田直久, 新里宙也, 鈴木豪, 金野俊洋
個体差に注目したサンゴの高水温耐性と白化現象のメカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

新里宙也, 鈴木豪
共生が必要・不要な近縁種から探る共生における物質の役割

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

山下洋, 新里宙也, 將口栄一
亜熱帯化する海への布石：高精度な環境 DNA 解析による海洋生物分布マップの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2021年4月 - 2026年3月

井上潤, 新里宙也, 兵藤晋, 伊藤幸彦
サンゴ礁で繁栄する褐虫藻共生システムの体系的理解：学際的研究体制によるアプローチ

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2021年4月 - 2025年3月

山下洋, 酒井隆一, 井上菜穂子, 神保充, 新里宙也, 小池一彦, 横田秀夫
スマートフォンの携帯通信網を活用したサンゴ一斉産卵の同時多点観測システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2025年3月

鈴木豪, 善岡祐輝, 竹垣草世香, 酒井一彦, 新里宙也
スマートフォンの携帯通信網を活用したサンゴ一斉産卵の同時多点観測システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2025年3月

鈴木豪, 竹垣草世香, 酒井一彦, 新里宙也
サンゴが雲を作り気候を変化させているのか？遺伝子解析技術を用いた検証

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2020年7月 - 2023年3月

新里宙也, 山下洋, 鈴木豪, 亀山宗彦
海洋環境下のサンゴ－褐虫藻共生系のゲノム基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

新里宙也, 山下洋, 鈴木豪, 將口栄一
海に漂うマイクロプラスチックの生体影響をムール貝のマルチオミクス解析で解明する

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

井上広滋, 小島茂明, 水川薫子, 新里宙也
褐虫藻を起点としたサンゴ礁生態系の新しい食物網ルートの提案

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

山下洋, 酒井隆一, 神保充, 新里宙也, 鈴木豪, 福岡弘紀
サンゴ“ホロビオント”成立・維持機構の構成的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年7月 - 2020年3月

新里宙也, 山下洋, 將口栄一, 安岡有理, 鈴木豪, 座安佑奈
造礁サンゴ「種分類」の新機軸とその体系化－分子細胞遺伝学的アプローチ－

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

田口尚弘, 久保田賢, 目崎拓真, 深見裕伸, 新里宙也
環境DNA技術を用いたサンゴ礁生態系モニタリング手法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

新里宙也, 鈴木豪
サンゴに共生する褐虫藻核ゲノムのエピゲノミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

將口栄一, 新里宙也
同時一斉産卵の同調性および受精効率を考慮した新しいサンゴ加入モデルの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2015年4月 - 2019年3月

鈴木豪, 山下洋, 竹垣草世香, 酒井一彦, 座安佑奈, 新里宙也, 鯉渕幸生
ゲノム科学による南西諸島全域のサンゴ個体群の全容解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2014年4月 - 2018年3月

新里宙也, 酒井一彦, 中島祐一, 座安佑奈
人工的に構築したサンゴ‐褐虫藻共生体を用いた共生生物学的イベントの多面的精査

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

山下洋, 鈴木豪, 新里宙也, 神保充, 藤倉佑治, 小池一彦
サンゴの「個性」がストレス耐性の鍵？-ゲノム科学による解明-

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2016年3月

新里宙也, 酒井一彦, 井口亮

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産業財産権

特表2017-520235 ミドリイシ属サンゴのための種間及び種内マイクロサテライトマーカー

新里宙也, スタダ・ムンパッティ, 中島祐一

新里宙也

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共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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