竹下大二郎 (Daijiro Takeshita) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人産業技術総合研究所バイオメディカル研究部門主任研究員

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-3524-0034
J-GLOBAL ID: 202001003691098147
researchmap会員ID: R000012996

論文

Bidirectional electro-enzymatic reaction of coenzyme F420 using benzyl viologen and F420-dependent sulfite reductase

satoshi furota, Masanori Kaneko, Seiya Tsujimura, Daijiro Takeshita, Yusuke Nakamichi, Kensuke Igarashi, Masaru K. Nobu, Miho Yoshikawa, Kenta Asahina, Chie Fukaya …

Bioelectrochemistry 2025年8月
Molecular arrangements that accompany binding of rice xylanase inhibitor protein OsXIP and the Rhizopus oryzae GH11 xylanase RXyn2

Takayuki Ohnuma, Jun Tanaka, Harutada Ozaki, Keigo Mitsui, Daichi Tsujitsugu, Miki Okugawa, Toru Takeda, Makoto Ihara, Tamo Fukamizo, Daijiro Takeshita

Journal of Biological Chemistry 2025年6月
Mechanism of counterattack against eIF2α kinase immune signalling by viral pseudo-kinase PK2

Daijiro Takeshita, Yuko Takagi

2025年2月5日
Nestin Forms a Flexible Cytoskeleton by Means of a Huge Tail Domain That Is Reversibly Stretched and Contracted by Weak Forces

Ayana Yamagishi, Rina Tokuoka, Kazuki Imai, Mei Mizusawa, Moe Susaki, Koki Uchida, Saku Kijima, Akira Nagasaki, Daijiro Takeshita, Chiaki Yoshikawa …

Cells 2025年1月17日
Periplasmic chitooligosaccharide-binding protein requires a three-domain organization for substrate translocation.

Takayuki Ohnuma, Jun Tsujii, Chikara Kataoka, Teruki Yoshimoto, Daijiro Takeshita, Outi Lampela, André H Juffer, Wipa Suginta, Tamo Fukamizo

Scientific reports 13(1) 20558-20558 2023年11月23日
Protein expression and purification, molecular interaction, and X-ray crystallographic analysis of baculovirus protein PK2.

Daijiro Takeshita

Protein expression and purification 202 106188-106188 2023年2月
Crystal Structures of Csm2 and Csm3 in the Type III-A CRISPR-Cas Effector Complex.

Daijiro Takeshita, Momoe Sato, Hideko Inanaga, Tomoyuki Numata

Journal of molecular biology 431(4) 748-763 2019年2月15日
[Mechanism of RNA polymerization by Qbeta replicase].

Kozo Tomita, Daijiro Takeshita

Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society 86(3) 391-4 2014年6月
Structural basis for high substrate-binding affinity and enantioselectivity of 3-quinuclidinone reductase AtQR.

Feng Hou, Takuya Miyakawa, Michihiko Kataoka, Daijiro Takeshita, Shoko Kumashiro, Atsuko Uzura, Nobuyuki Urano, Koji Nagata, Sakayu Shimizu, Masaru Tanokura

Biochemical and biophysical research communications 446(4) 911-5 2014年4月18日
Structural basis of stereospecific reduction by quinuclidinone reductase.

Daijiro Takeshita, Michihiko Kataoka, Takuya Miyakawa, Ken-Ichi Miyazono, Shoko Kumashiro, Takahiro Nagai, Nobuyuki Urano, Atsuko Uzura, Koji Nagata, Sakayu Shimizu …

AMB Express 4(1) 6-6 2014年2月7日
Translocation and rotation of tRNA during template-independent RNA polymerization by tRNA nucleotidyltransferase.

Seisuke Yamashita, Daijiro Takeshita, Kozo Tomita

Structure (London, England : 1993) 22(2) 315-25 2014年2月4日
Molecular insights into replication initiation by Qβ replicase using ribosomal protein S1.

Daijiro Takeshita, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Nucleic acids research 42(16) 10809-22 2014年
Structure of the Ca(2+)-saturated C-terminal domain of scallop troponin C in complex with a troponin I fragment.

Yusuke S Kato, Fumiaki Yumoto, Hiroyuki Tanaka, Takuya Miyakawa, Yumiko Miyauchi, Daijiro Takeshita, Yoriko Sawano, Takao Ojima, Iwao Ohtsuki, Masaru Tanokura

Biological chemistry 394(1) 55-68 2013年1月
Mechanism for template-independent terminal adenylation activity of Qβ replicase.

Daijiro Takeshita, Seisuke Yamashita, Kozo Tomita

Structure (London, England : 1993) 20(10) 1661-9 2012年10月10日
Expression, purification, crystallization and X-ray analysis of 3-quinuclidinone reductase from Agrobacterium tumefaciens.

Feng Hou, Takuya Miyakawa, Daijiro Takeshita, Michihiko Kataoka, Atsuko Uzura, Koji Nagata, Sakayu Shimizu, Masaru Tanokura

Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications 68(Pt 10) 1237-9 2012年10月1日
Molecular basis for RNA polymerization by Qβ replicase.

Daijiro Takeshita, Kozo Tomita

Nature structural & molecular biology 19(2) 229-37 2012年1月15日
Mechanism for the alteration of the substrate specificities of template-independent RNA polymerases.

Yukimatsu Toh, Daijiro Takeshita, Takashi Nagaike, Tomoyuki Numata, Kozo Tomita

Structure (London, England : 1993) 19(2) 232-43 2011年2月9日
Assembly of Q{beta} viral RNA polymerase with host translational elongation factors EF-Tu and -Ts.

Daijiro Takeshita, Kozo Tomita

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 107(36) 15733-8 2010年9月7日
Mechanism for the definition of elongation and termination by the class II CCA-adding enzyme.

Yukimatsu Toh, Daijiro Takeshita, Tomoyuki Numata, Shuya Fukai, Osamu Nureki, Kozo Tomita

The EMBO journal 28(21) 3353-65 2009年11月4日
Crystallization and preliminary X-ray analysis of the NADPH-dependent 3-quinuclidinone reductase from Rhodotorula rubra.

Daijiro Takeshita, Michihiko Kataoka, Takuya Miyakawa, Ken-ichi Miyazono, Atsuko Uzura, Koji Nagata, Sakayu Shimizu, Masaru Tanokura

Acta crystallographica. Section F, Structural biology and crystallization communications 65(Pt 6) 645-7 2009年6月1日

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MISC

Agrobacterium tumefaciens由来キヌクリジノン還元酵素の高活性に関する構造基盤

HOU Feng, 宮川拓也, 片岡道彦, 片岡道彦, 熊代祥子, 竹下大二郎, 永田宏次, 清水昌, 清水昌, 田之倉優

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2012 2012年
Agrobacterium tumefaciens由来キヌクリジノン還元酵素の構造解析

侯峰, 宮川拓也, 片岡道彦, 片岡道彦, 熊代祥子, 竹下大二郎, 永田宏次, 清水昌, 清水昌, 田之倉優

日本結晶学会年会講演要旨集 2011 2011年

共同研究・競争的資金等の研究課題

中間径フィラメントが媒介するメカニカルな転写モジュレ－ション

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

中村史, 山岸彩奈, 黒田裕, 長崎晃, 竹下大二郎
立体構造情報にもとづく制限酵素FokIのDNA切断反応機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2022年3月

加藤義雄, 竹下大二郎
ウイルスRNA応答性の自然免疫機構の構造基盤解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

竹下大二郎
ヒト翻訳制御因子のRNAによる活性化機構の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2016年4月 - 2018年3月

竹下大二郎
前駆体マイクロRNAへのポリウリジル化反応の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

竹下大二郎