山本大輔 (Daisuke Yamamoto) - マイポータル

基本情報

所属: 福岡大学理学部物理科学科教授

学位: 博士（理学）(名古屋大学)

研究者番号: 80377902
J-GLOBAL ID: 200901021146235757
researchmap会員ID: 1000368765

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 / 生物物理学

経歴

2018年4月

福岡大学教授
2011年4月 - 2018年3月

福岡大学准教授
2005年4月 - 2011年3月

金沢大学研究員
2004年4月 - 2005年3月

名古屋大学研究員(COE)
2003年4月 - 2004年3月

名古屋大学産学官連携研究員

学歴

- 2003年

名古屋大学, 理学研究科, 物質理学専攻

論文

X-ray crystallographic and high-speed AFM studies of peroxiredoxin 1 from Chlamydomonas reinhardtii

Charoenwattanasatien R, Tanaka H, Zinzius K, Hochmal A. K, Mutoh R, Yamamoto D, Hippler M, Kurisu G

Acta Crystallogr F Struct Biol Commun 74(Pt2) 86-91 2018年1月査読有り
A substrate for observing histidine-tagged proteins by high-speed atomic force microscopy

Daisuke Yamamoto, Kentaro Noi, Teru Ogura

Fukuoka University Science Reports 47(1) 1-6 2017年3月査読有り
Chaperonin GroEL-GroES functions as both alternating and non-alternating engines

D. Yamamoto, T. Ando

Journal of Molecular Biology 428(15) 3090-3101 2016年8月査読有り
Gating-Associated Clustering-Dispersion Dynamics of the KcsA Potassium Channel in a Lipid Membrane

Ayumi Sumino, Daisuke Yamamoto, Masayuki Iwamoto, Takehisa Dewa, Shigetoshi Oiki

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS 5(3) 578-584 2014年2月査読有り
High-Speed Atomic Force Microscopic Observation of ATP-Dependent Rotation of the AAA plus Chaperone p97

Kentaro Noi, Daisuke Yamamoto, Shingo Nishikori, Ken-ichi Arita-Morioka, Takayuki Kato, Toshio Ando, Teru Ogura

STRUCTURE 21(11) 1992-2002 2013年11月査読有り
High-Speed AFM for Observing Dynamic Processes in Liquid

Toshio Ando, Takayuki Uchihashi, Noriyuki Kodera, Mikihiro Shibata, Daisuke Yamamoto, Hayato Yamashita

Atomic Force Microscopy in Liquid: Biological Applications 189-209 2012年4月10日査読有り
Direct observation of surfactant aggregate behavior on a mica surface using high-speed atomic force microscopy

Shigeto Inoue, Takayuki Uchihashi, Daisuke Yamamoto, Toshio Ando

CHEMICAL COMMUNICATIONS 47(17) 4974-4976 2011年査読有り
Deciphering the Structure, Growth and Assembly of Amyloid-Like Fibrils Using High-Speed Atomic Force Microscopy

Pierre-Emmanuel Milhiet, Daisuke Yamamoto, Olivia Berthoumieu, Patrice Dosset, Christian Le Grimellec, Jean-Michel Verdier, Stephane Marchal, Toshio Ando

PLOS ONE 5(10) e13240 2010年10月査読有り
Visualization and structural analysis of the bacterial magnetic organelle magnetosome using atomic force microscopy

Daisuke Yamamoto, Azuma Taoka, Takayuki Uchihashi, Hideaki Sasaki, Hiroki Watanabe, Toshio Ando, Yoshihiro Fukumori

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 107(20) 9382-9387 2010年5月査読有り
Surface topography of membrane domains

Marie-Cecile Giocondi, Daisuke Yamamoto, Eric Lesniewska, Pierre-Emmanuel Milhiet, Toshio Ando, Christian Le Grimellec

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES 1798(4) 703-718 2010年4月査読有り
Video imaging of walking myosin V by high-speed atomic force microscopy

Noriyuki Kodera, Daisuke Yamamoto, Ryoki Ishikawa, Toshio Ando

Nature 468(7320) 72-76 2010年査読有り
HIGH-SPEED ATOMIC FORCE MICROSCOPY TECHNIQUES FOR OBSERVING DYNAMIC BIOMOLECULAR PROCESSES

Daisuke Yamamoto, Takayuki Uchihashi, Noriyuki Kodera, Hayato Yamashita, Shingo Nishikori, Teru Ogura, Mikihiro Shibata, Toshio Ando

METHODS IN ENZYMOLOGY, VOL 475: SINGLE MOLECULE TOOLS, PT B 475 541-564 2010年査読有り
Streptavidin 2D Crystal Substrates for Visualizing Biomolecular Processes by Atomic Force Microscopy

Daisuke Yamamoto, Naoki Nagura, Saeko Omote, Masaaki Taniguchi, Toshio Ando

BIOPHYSICAL JOURNAL 97(8) 2358-2367 2009年10月査読有り
2P-025 高速AFMによるGroEL-基質タンパク質複合体の直接観察(蛋白質-構造機能相関,第47回日本生物物理学会年会)

Taniguchi Masaaki, Yamamoto Daisuke, Kodera Noriyuki, Ando Toshio

生物物理 49 S110 2009年
High-speed Atomic Force Microscopy for Nano-visualization of Biomolecular Processes

Toshio Ando, Takayuki Uchihashi, Noriyuki Kodera, Daisuke Yamamoto, Masaaki Taniguchi, Atsushi Miyagi, Hayato Yamashita

Single Molecule Dynamics in Life Science 277-296 2008年10月査読有り招待有り
Anisotropic diffusion of point defects in a two-dimensional crystal of streptavidin observed by high-speed atomic force microscopy

Daisuke Yamamoto, Takayuki Uchihashi, Noriyuki Kodera, Toshio Ando

NANOTECHNOLOGY 19(38) 384009 (9pages) 2008年9月査読有り
Fabrication of 3D micro-cantilevers based on MBE-grown strained semiconductor layers

Hiuma Iwase, Hyonkwan Choi, Masashi Akabori, Toshi-kazu Suzuki, Syoji Yamada, Daisuke Yamamoto, Toshio Ando

PHYSICA E-LOW-DIMENSIONAL SYSTEMS & NANOSTRUCTURES 40(6) 2210-2213 2008年4月査読有り
High-speed AFM and nano-visualization of biomolecular processes

Toshio Ando, Takayuki Uchihashi, Noriyuki Kodera, Daisuke Yamamoto, Atsushi Miyagi, Masaaki Taniguchi, Hayato Yamashita

PFLUGERS ARCHIV-EUROPEAN JOURNAL OF PHYSIOLOGY 456(1) 211-225 2008年4月査読有り
2P-324 ストレプトアピジン二次元結晶における異方的な格子欠陥移動(バイオイメージング(1),第46回日本生物物理学会年会)

Yamamoto Daisuke, Uchihashi Takayuki, Kodera Noriyuki, Ando Toshio

生物物理 48 S125 2008年
1P-136 高速AFMで可視化されたアクトミオシンVの運動の詳細解析(分子モーター(1),第46回日本生物物理学会年会)

Kodera Noriyuki, Yamamoto Daisuke, Ando Toshio

生物物理 48 S42 2008年

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MISC

平面脂質二重膜の生体分子AFM観察への応用

山本大輔

膜 47(1) 10-14 2022年1月査読有り招待有り
高速原子間力顕微鏡を用いたAAAシャペロニンp97のATP依存的構造変化の解析

野井健太郎, 山本大輔, 錦織伸吾, 森岡健一, 安藤敏夫, 小椋光

生化学 2010年
レーザー照射によるカンチレバーの直接駆動を用いた高速AFMの距離制御

山下隼人, 内橋貴之, 古寺哲幸, 宮城篤, 山本大輔, 安藤敏夫

応用物理学会学術講演会講演予稿集 68th(2) 676 2007年9月4日
レーザー照射によるAFMカンチレバーの直接駆動

山下隼人, 内橋貴之, 古寺哲幸, 宮城篤, 山本大輔, 安藤敏夫

応用物理学関係連合講演会講演予稿集 54th(2) 736 2007年3月27日

書籍等出版物

"High-speed AFM for observing dynamic processes in liquid" "in "Atomic force microscopy in liquid"

T. Ando, T. Uchihashi, N. Kodera, M. Shibata, D. Yamamoto, H. Yamashita (担当:共著, 範囲:189-209)

Wiley-VCH 2012年
"High-speed atomic force microscopy for nano-visualization of biomolecular processes" in "Single Molecule Dynamics in Life Science"

T. Ando, T. Uchihashi, N. Kodera, D. Yamamoto, M. Taniguchi, A. Miyagi, H. Yamashita (担当:共著, 範囲:277-296)

Wiley-VCH 2008年

講演・口頭発表等

Observation of photosynthetic proteins in thylakoid membrane by high-speed atomic force microscopy

Daisuke Yamamoto

International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation 2022年11月15日招待有り
チラコイド膜中に存在する光化学系II超複合体の高速AFMによる可視化

山本大輔

第60回日本生物物理学会年会 2022年9月30日
チラコイド膜内光合成タンパク質の高速AFMによる構造ダイナミクス解析

山本大輔

第94回日本生化学会大会 2021年11月4日招待有り
熱揺らぎ一定モード原子間力顕微鏡の開発

山本大輔

日本生物物理学会第59回年会 2021年11月
高速AFMによるグラナ膜に内在するPSII側方運動の可視化

井手美里, 山本大輔

日本生物物理学会第59回年会 2021年11月
高速原子間力顕微鏡によるチラコイド膜内構造の1分子観察

山本大輔

第62回日本植物生理学会年会 2021年3月14日
ホウレンソウグラナ膜における光化学系II分子間相互作用の高速AFMによる解析

第57回日本生物物理学会年会 2019年9月
ホウレンソウ由来ストロマラメラに内在するF0 c-リングの原子間力顕微鏡による観察

山本大輔, 武藤梨沙

第56回日本生物物理学会年会 2018年9月
The dynamics of photosystem 2 and light-harvesting complex 2 in spinach grana membrane revealed by high-speed AFM

R. Mutoh, T. Iida, D. Yamamoto

第55回日本生物物理学会年会 2017年9月
Observation of the Molecular Architecture of Bacteriorhodopsin Vesicle by Atomic Force Microscopy

D. Yamamoto, R. Mutoh

IGER International Symposium on Physics of Life 2017年3月
GroEL-GroES interaction cycle revealed by high-speed AFM

Toshio Ando, Daisuke Yamamoto

XIX. Linz Winterworkshop. Advances in Single-Molecule Research for Biology & Nanoscience 2017年2月招待有り
Microtubule stability and the tubulin molecule interactions within the microtubule lattice

平佐田健太, 山本大輔, 香月美穂

第54回日本生物物理学会年会 2016年11月
バクテリオロドプシン球殻構造体の形成機構

山本大輔, 武藤梨沙

第54回日本生物物理学会年会 2016年11月
高速原子間力顕微鏡により観察されたAAAシャペロンp97の主要ATPaseリングの構造変化

山本大輔, 野井健太郎, 有田(森岡) 健一, 小椋光

第53回日本生物物理学会年会 2015年9月
高速原子間力顕微鏡で見る膜中カリウムチャネルKcsAの動的挙動

角野歩, 内橋貴之, 山本大輔, 岩本真幸, 出羽毅久, 老木成稔

第53回日本生物物理学会年会 2015年9月
高速原子間力顕微鏡によるバクテリオロドプシン球殻構造体の分子構造の観察

野田悠斗, 山本大輔

第53回日本生物物理学会年会 2015年9月
高速原子間力顕微鏡で見るカリウムチャネルKcsAの動的挙動

角野歩, 内橋貴之, 山本大輔, 岩本真幸, 出羽毅久, 老木成稔

第92回日本生理学会大会 2015年3月
高速原子間力顕微鏡によるAAAシャペロンp97の主要ATPase（D2）リングの構造変化の直接観察

山本大輔, 野井健太郎, 有田(森岡) 健一, 小椋光

第52回日本生物物理学会年会 2014年9月
高速原子間力顕微鏡ピエゾドライバの広帯域駆動

半田裕之, 山本大輔

第52回日本生物物理学会年会 2014年9月
高速原子間力顕微鏡によるホウレンソウ由来グラナ膜の観察

小俣愛美, 山本大輔

第52回日本生物物理学会年会 2014年9月

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

光合成超分子複合体の動的構造解析による環境適応原理の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

斉藤圭亮, 山本大輔
光合成ユビキティ：あらゆる地球環境で光合成を可能とする超分子構造制御

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2023年4月 - 2028年3月

栗栖源嗣, 斉藤圭亮, 山本大輔, 白井剛, 坂本亘, 日原由香子, 広瀬侑, 丸山真一朗, 田中亮一, 皆川純, 吉田啓亮, 桶川友季
植物における過剰光ストレス応答の総合研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2021年7月 - 2026年3月

皆川純, 村田和義, 山本大輔
熱ゆらぎ高速AFMによる構造物性可視化技術の開発

挑戦的研究（萌芽） 2021年8月 - 2024年3月
プロトン駆動力制御に伴う光合成タンパク質構造動態変化の高速AFMによる解析

科学研究費補助金新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月
かぎりなくタンパク質に優しい高速原子間力顕微鏡の開発

日本学術振興会科学研究費補助金挑戦的研究（萌芽） 2017年4月 - 2020年3月
NPQに伴うチラコイド膜タンパク質構造動態変化の高速AFMによる測定

日本学術振興会科学研究費補助金新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月
生体試料フリーズフラクチャー面のクライオ原子間力顕微鏡による高分解能測定系の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2005年 - 2005年

山本大輔

産業財産権

特願2020-130552 原子間力顕微鏡及び距離制御方法

山本大輔

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