本間光貴 (Teruki Honma) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人理化学研究所制御分子設計研究チームチームリーダー

J-GLOBAL ID: 201801016950036755
researchmap会員ID: B000314147

研究分野

ライフサイエンス / 薬系化学、創薬科学 /

論文

104

Discovery of a novel class NSD2 inhibitor for t(4;14)-positive multiple myeloma

Sae Matsuoka, Naoki Osada, Hirokazu Kubota, Ko Kikuzato, Hiroo Koyama, Takeshi Sonoda, Akiko Idei, Minoru Yoshida, Masaki Kikuchi, Takashi Umehara …

Blood Neoplasia 100091-100091 2025年3月
Inhibition of PSF activity overcomes resistance to treatment in cancers harboring mutant p53.

Ken-Ichi Takayama, Tomohiro Sato, Teruki Honma, Minoru Yoshida, Satoshi Inoue

Molecular cancer therapeutics 2024年12月3日
Structure-based development of novel substrate-type G9a inhibitors as epigenetic modulators for sickle cell disease treatment.

Yosuke Nishigaya, Shohei Takase, Tatsunobu Sumiya, Tomohiro Sato, Hideaki Niwa, Shin Sato, Akiko Nakata, Seiji Matsuoka, Yuki Maemoto, Noriaki Hashimoto …

Bioorganic & medicinal chemistry letters 110 129856-129856 2024年9月15日
OA-35 Discovery of a Novel Class MMSET Inhibitor With Specificity for t(4; 14)-Positive Multiple Myeloma

Sae Matsuoka, Naoki Osada, Hirokazu Kubota, Ko Kikuzato, Hiroo Koyama, Takeshi Sonoda, Akiko Ide, Minoru Yoshida, Masaki Kikuchi, Takashi Umehara …

Clinical Lymphoma Myeloma and Leukemia 24 S22-S23 2024年9月
Docosahexaenoic acid enhances the treatment efficacy for castration-resistant prostate cancer by inhibiting autophagy through Atg4B inhibition.

Yudai Kudo, Kana Nakamura, Honoka Tsuzuki, Kotaro Hirota, Mina Kawai, Daisuke Takaya, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma, Yuta Yoshino, Mitsuhiro Nakamura …

Archives of biochemistry and biophysics 760 110135-110135 2024年8月23日査読有り
Geometry Optimization using the Frozen Domain and Partial Dimer Approach with the Fragment Molecular Orbital Method: Implementation, Benchmark, and Application for Ligand-Binding Site of Proteins

Koji Okuwaki, Naoki Watanabe, Koichiro Kato, Chiduru Watanabe, Naofumi Nakayama, Akifumi Kato, Yuji Mochizuki, Tatsuya Nakano, Teruki Honma, Kaori Fukuzawa

2024年7月24日
Statistical analysis of interactions among amino acid residues in apo structures using fragment molecular orbital method

Kikuko Kamisaka, Shunpei Nagase, Chiduru Watanabe, Daisuke Takaya, Hitomi Yuki, Teruki Honma

Chem-Bio Informatics Journal 24 25-47 2024年6月28日
Structural Stability and Binding Ability of SARS-CoV-2 Main Protease with GC376: A Stereoisomeric Covalent Ligand Analysis by FMO calculation

Yuya Seki, Chiduru Watanabe, Norihiko Tani, Kikuko Kamisaka, Tatsuya Ohyama, Daisuke Takaya, Teruki Honma

Chem-Bio Informatics Journal 24 13-24 2024年5月17日
A machine learning model for predicting quantum chemistry based protein-drug molecule interactions

Ryosuke KITA, Chiduru WATANABE, Masateru OHTA, Naoki TANIMURA, Koji OKUWAKI, Mitsunori IKEGUCHI, Kaori FUKUZAWA, Teruki HONMA, Tsuyohiko FUJIGAYA, Koichiro KATO

The 38th Annual Conference of the Japanese Society for Artificial Intelligence 38 2024年5月査読有り
FMOe: Preprocessing and visualizing package of the fragment molecular orbital method for Molecular Operating Environment and its applications in covalent ligand and metalloprotein analyses

Hirotomo Moriwaki, Yusuke Kawashima, Chiduru Watanabe, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma

2024年2月8日
Identification of small-molecule inhibitors against the interaction of RNA-binding protein PSF and its target RNA for cancer treatment.

Ken-Ichi Takayama, Seiji Matsuoka, Shungo Adachi, Teruki Honma, Masahito Yoshida, Takayuki Doi, Kazuo Shin-Ya, Minoru Yoshida, Hiroyuki Osada, Satoshi Inoue

PNAS nexus 2(6) pgad203 2023年6月
Discovery of Novel Substrate-Competitive Lysine Methyltransferase G9a Inhibitors as Anticancer Agents.

Yosuke Nishigaya, Shohei Takase, Tatsunobu Sumiya, Ko Kikuzato, Tomohiro Sato, Hideaki Niwa, Shin Sato, Akiko Nakata, Takeshi Sonoda, Noriaki Hashimoto …

Journal of medicinal chemistry 66(6) 4059-4085 2023年3月23日
Quantum Chemical Interaction Analysis between SARS-CoV-2 Main Protease and Ensitrelvir (Xocova) Compared with Its Initial Screening Hit

Chiduru Watanabe, Shigenori Tanaka, Yoshio Okiyama, Hitomi Yuki, Tatsuya Ohyama, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma

2022年12月2日
Structural basis of transcription regulation by CNC family transcription factor, Nrf2

Toru Sengoku, Masaaki Shiina, Kae Suzuki, Keisuke Hamada, Ko Sato, Akiko Uchiyama, Shunsuke Kobayashi, Asako Oguni, Hayato Itaya, Kota Kasahara …

Nucleic Acids Research 50(21) 12543-12557 2022年12月1日査読有り
Molecular action of larvicidal flavonoids on ecdysteroidogenic glutathione S-transferase Noppera-bo in Aedes aegypti

Kazue Inaba, Kana Ebihara, Miki Senda, Ryunosuke Yoshino, Chisako Sakuma, Kotaro Koiwai, Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Akira Watanabe, Yusuke Kawashima …

BMC Biology 20(1) 2022年12月
Selective Inhibitor Design for Kinase Homologs Using Multiobjective Monte Carlo Tree Search

Tatsuya Yoshizawa, Shoichi Ishida, Tomohiro Sato, Masateru Ohta, Teruki Honma, Kei Terayama

Journal of Chemical Information and Modeling 2022年11月5日
Structure–Activity Relationship and In Silico Evaluation of cis- and trans-PCPA-Derived Inhibitors of LSD1 and LSD2

Hideaki Niwa, Chiduru Watanabe, Shin Sato, Toshiyuki Harada, Hisami Watanabe, Ryo Tabusa, Shunsuke Fukasawa, Ayane Shiobara, Tomoko Hashimoto, Osamu Ohno …

ACS Medicinal Chemistry Letters 13(9) 1485-1492 2022年9月8日
Utilizing public and private sector data to build better machine learning models for the prediction of pharmacokinetic parameters.

Masataka Kuroda, Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Hitoshi Kawashima, Rikiya Ohashi, Tomohiro Sato, Teruki Honma, Hiroshi Komura, Kenji Mizuguchi

Drug discovery today 103339-103339 2022年8月13日
Protein–ligand binding affinity prediction of cyclin‐dependent kinase‐2 inhibitors by dynamically averaged fragment molecular orbital‐based interaction energy

Kenichiro Takaba, Chiduru Watanabe, Atsushi Tokuhisa, Yoshinobu Akinaga, Biao Ma, Ryo Kanada, Mitsugu Araki, Yasushi Okuno, Yusuke Kawashima, Hirotomo Moriwaki …

Journal of Computational Chemistry 43(20) 1362-1371 2022年7月30日
Design and Synthesis of Tranylcypromine-Derived LSD1 Inhibitors with Improved hERG and Microsomal Stability Profiles

Yasuko Koda, Shin Sato, Hirofumi Yamamoto, Hideaki Niwa, Hisami Watanabe, Chiduru Watanabe, Tomohiro Sato, Kana Nakamura, Akiko Tanaka, Mikako Shirouzu …

ACS Medicinal Chemistry Letters 13(5) 848-854 2022年4月29日

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MISC

フラグメント分子軌道法を活用したm-Glu5新規阻害剤の検討

小田島大貴, 宮川柊兵, 半田佑磨, 古石誉之, 米持悦生, 佐藤朋広, 幸瞳, 本間光貴, 高谷大輔, 上村みどり …

日本薬学会年会要旨集(Web) 144th 2024年
フラグメント分子軌道法を活用した代謝型グルタミン酸受容体5阻害剤の分子設計

小田島大貴, 宮川柊兵, 半田佑磨, 古石誉之, 米持悦生, 佐藤朋広, 幸瞳, 本間光貴, 高谷大輔, 上村みどり …

構造活性相関シンポジウム講演要旨集(CD-ROM) 51st 2023年
FMODBデータ収集:高分解能X線結晶構造データに対する量子化学計算

渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 神坂紀久子, 今井恭平, 滝本大地, 斎藤涼祐, 栗田典之, 岡山友樹, 宮嶋起徳, 吉本耀 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 22nd (Web) 2022年
FMO法を用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼ-阻害薬S-217622結合メカニズムの解明

渡邉千鶴, 田中成典, 沖山佳生, 大山達也, 神坂紀久子, 幸瞳, 高谷大輔, 福澤薫, 本間光貴

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 50th (CD-ROM) 2022年
FMO計算によるSARS-CoV-2変異株RBD-中和抗体間の相互作用解析

渡邉一樹, 渡邉一樹, 渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 本間光貴, 田雨時, 川嶋裕介, 川下理日人, 星野忠次, 西田紀貴 …

日本薬学会関東支部大会講演要旨集 65th 2021年
フラグメント分子軌道法を用いた中和抗体とSARS-CoV-2変異体スパイク蛋白質間の計算ab initio相互作用解析

Watanabe Kazuki, Watanabe Chiduru, Watanabe Chiduru, Honma Teruki, Tian Yu-Shi, Kawashima Yusuke, Kawashita Norihito, Fukuzawa Kaori, Fukuzawa Kaori, Takagi Tatsuya

Bulletin of the Chemical Society of Japan (Web) 94(6) 2021年
FMODBの開発と最近の最新情報,2021【JST・京大機械翻訳】

TAKAYA Daisuke, WATANABE Chiduru, WATANABE Chiduru, KAMISAKA Kikuko, HANDA Yuma, WATANABE Kazuki, FUKUZAWA Kaori, HONMA Teruki

CBI学会大会 2021 (CD-ROM) 2021年
VISCANAによるSARS-CoV-2main proteaseとリガンドの網羅的相互作用解析

大山達也, 渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 神坂紀久子, 高谷大輔, 福澤薫, 本間光貴

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 49th (CD-ROM) 2021年
翻訳開始因子複合体の阻害剤認識におけるRNA配列特異性のための動的FMO解析【JST・京大機械翻訳】

HANDA Yuma, KAWASHIMA Yusuke, FURUISHI Takayuki, YONEMOCHI Etsuo, ITO Takuhiro, SAITO Hironori, SAITO Hironori, IWASAKI Shintaro, IWASAKI Shintaro, WATANABE Chiduru …

CBI学会大会 2021 (CD-ROM) 2021年
脱皮ホルモン生合成経路を標的とした昆虫成長阻害剤に関する横断的創薬研究

海老原佳奈, 稲葉和恵, 千田美紀, 小祝孝太郎, 高谷大輔, 渡邉千鶴, 今村理世, 小島宏建, 岡部隆義, 佐久間知佐子 …

日本農芸化学会関東支部講演要旨集(CD-ROM) 2021 2021年
フラボノイド化合物による昆虫ステロイドホルモン生合成酵素Noppera-boの阻害:構造生物学的解析と生物活性検定

海老原佳奈, 稲葉和恵, 小祝孝太郎, 高谷大輔, 渡邉千鶴, 今村理世, 岡部隆義, 小島宏建, 佐久間知佐子, 嘉糠洋陸 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2021 2021年
分子動力学計算とFMO計算を用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼと既存薬との結合性予測

半田佑磨, 川嶋裕介, 畑田崚, 奥脇弘次, 望月祐志, 古明地勇人, 田中成典, 本間光貴, 古石誉之, 福澤薫 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 141st 2021年
FMO動的相互作用解析によるSARS-CoV-2メインプロテアーゼと既存薬のポーズ推定と結合性予測

半田佑磨, 奥脇弘次, 畑田崚, 望月祐志, 望月祐志, 古明地勇人, 田中成典, 古石誉之, 米持悦生, 川嶋裕介 …

日本コンピュータ化学会年会講演予稿集 2021 2021年
Protein ligand interaction analysis against new CaMKK2 inhibitors by use of X-ray crystallography and the fragment molecular orbital (FMO) method.

Daisuke Takaya, Hideaki Niwa, Junko Mikuni, Kana Nakamura, Noriko Handa, Akiko Tanaka, Shigeyuki Yokoyama, Teruki Honma

Journal of molecular graphics & modelling 99 107599-107599 2020年4月10日
COVID-19関連タンパク質の量子化学計算のFMODBへの登録

山本亜美, 半田佑磨, 川嶋裕介, 渡邉一樹, 加藤幸一郎, 加藤幸一郎, 渡邉千鶴, 大山達也, 神坂紀久子, 高谷大輔 …

日本薬学会関東支部大会講演要旨集 64th 2020年
FMO計算を用いたSARS-CoV-2のRBD-中和抗体間の相互作用解析

渡邉一樹, 川嶋裕介, 福澤薫, 渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 本間光貴, 田雨時, 川下理日人, 高木達也

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 48th (CD-ROM) 2020年
フラグメント分子軌道法によるSARS-CoV-2Mproと阻害剤の相互作用解析

川嶋裕介, 半田佑磨, 奥脇弘次, 望月祐志, 古明地勇人, 田中成典, 渡邉千鶴, 本間光貴, 福澤薫

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 48th (CD-ROM) 2020年
新型コロナウイルスによるパンデミックに対するFMODBの取り組み

渡邉千鶴, 渡邉千鶴, 神坂紀久子, 大山達也, 高谷大輔, 加藤幸一郎, 川嶋裕介, 半田佑磨, 山本亜美, 渡邉一樹 …

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 48th (CD-ROM) 2020年
FMO法に基づく相互作用記述子を用いたp38MAPキナーゼの阻害剤活性予測

神坂紀久子, 渡邉千鶴, 高谷大輔, 原田俊幸, 佐藤朋広, 幸瞳, 本間光貴

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 48th (CD-ROM) 2020年
Nrf2-小Mafヘテロ二量体による標的DNA認識機構のFMO法(フラグメント分子軌道法)による解析

仙石徹, 森脇寛智, 渡邉千鶴, 本間光貴, 緒方一博

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

量子化学計算に基づく生体高分子の超分解能構造解析技術の開発と創薬への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

福澤薫, 本間光貴, 田中成典, 鶴田宏樹, 渡邉千鶴
癌微小環境におけるピリミジンとエネルギー代謝の関係

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2014年4月 - 2016年3月

稲岡健ダニエル, 北潔, 原田繁春, 斎本博之, 本間光貴
ＨＬＡクラスＩ／ＩＩ分子の高次構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年4月 - 2015年3月

横山茂之, 白水美香子, 本間光貴

産業財産権

WO2016-136985 ピリジノン化合物およびその用途

福井宣規, 宇留野武人, 金井求, 松永茂樹, 白井孝宏, 横山茂之, 本間光貴, 新野睦子, 高▼谷大輔
特開2016-149940 新規なヌクレオチド類縁体及びオリゴヌクレオチド類縁体

新井浩一郎, 跡部公和, 田中英一, 本間光貴, 幸瞳, 渡辺博文
特許第5874989号抗がん剤

長野哲雄, 岡部隆義, 小島宏建, 齊藤奈英, 中野浩史, 阿部昌尚, 田仲昭子, 本間光貴, 横山茂之, 津金沢恵子, 幸瞳
特開2015-063540 抗がん剤

長野哲雄, 岡部隆義, 小島宏建, 齊藤奈英, 中野浩史, 阿部昌尚, 田仲昭子, 本間光貴, 横山茂之, 津金沢恵子, 幸瞳
WO2015-046595 アディポネクチン受容体活性化化合物

門脇孝, 山内敏正, 岩部美紀, 岩部真人, 横山茂之, 本間光貴
特許第5656233号抗がん剤

長野哲雄, 岡部隆義, 小島宏建, 齊藤奈英, 中野浩史, 阿部昌尚, 田仲昭子, 本間光貴, 横山茂之, 津金沢恵子, 幸瞳
WO2011-136319 抗がん剤

長野哲雄, 岡部隆義, 小島宏建, 齊藤奈英, 中野浩史, 阿部昌尚, 田仲昭子, 本間光貴, 横山茂之, 津金沢恵子, 幸瞳
特開2011-148811 ビアリールウレア誘導体

端山俊, 林恭子, 本間光貴, 高橋郁子
特開2010-105992 細胞増殖阻害剤

田仲昭子, 加藤美紀, 本間光貴, 長野哲雄, 岡部隆義, 小島宏建, 安野和浩
特開2009-275020 細胞増殖阻害剤

田仲昭子, 加藤美紀, 本間光貴, 長野哲雄, 岡部隆義, 小島宏建, 安野和浩
特開2002-220338 ビアリールウレア化合物又はその塩を有効成分として含有するCdk4及び/又はCdk6阻害剤

端山俊, 林恭子, 本間光貴, 高橋郁子
特開2001-106673 ビアリールウレア誘導体

端山俊, 林恭子, 本間光貴, 高橋郁子
特開平10-001467 ビフェニルアミジン誘導体

野本貴史, 川元博, 佐藤禎之, 本間光貴, 宮地満, 高榎陽子

本間光貴

基本情報

研究分野

論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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