小宮健 (Ken Komiya) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人海洋研究開発機構生命地球科学研究部門副主任研究員

学位: 博士（理学）(東京大学)

研究者番号: 20396790
J-GLOBAL ID: 200901094907398709
researchmap会員ID: 1000368198

外部リンク: https://bio-inspired.chemistry.jpn.com/recent-news/

研究分野

情報通信 / 生命、健康、医療情報学 /

経歴

2024年10月 - 2026年3月

国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門, 副主任研究員
2021年4月 - 2024年9月

国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門, 研究員
2016年4月 - 2021年3月

東京工業大学, 情報理工学院, 助教
2005年4月 - 2016年3月

東京工業大学, 大学院総合理工学研究科, 助教
2004年 - 2005年

:東京大学大学院情報理工学系研究科コンピュータ科学専攻生物情報科学学部教育特別プログラム（UPBSB）科学技術振興特任研究員
2001年 - 2004年

:日本学術振興会特別研究員（DC1）

学歴

- 2004年

東京大学, 理学系研究科, 生物化学専攻

論文

ナノスケールの孔で読み取るDNAコンピューティング

竹内七海, 小宮健, 川野竜司

バイオサイエンスとインダストリー(B&I） 84(2) 150-152 2026年3月16日招待有り
Reversible Photocontrol of mRNA Synthesis and Cleavage for mRNA Concentration Switching Inside Artificial Cells

Daichi Iwata, Keiji Murayama, Ken Komiya, Hideaki T Matsubayashi, Keita Abe, Hiroyuki Asanuma, Satoshi Murata, Shin-Ichiro M Nomura

ChemRxiv 2026年3月3日
Expansion of Molecular Systems Function with the Use of Artificial Nucleic Acids

Ken Komiya

Molecular Robotics II (Murata, S., Nakakuki, T., Toyota, T., Nomura, Si., Kuzuya, A. (eds)) 39-45 2026年1月30日筆頭著者責任著者
分子ロボティクスを支えるDNA計算機構の温故知新

小宮健

電子情報通信学会誌 108(11) 1046-1052 2025年11月招待有り筆頭著者責任著者
Transmembrane DNA Sequence Signaling via Hybridization

Kai Yoshida, Ryusei Kawabe, Keita Abe, Yusuke Sato, Ibuki Kawamata, ken Komiya, Richard James Archer, Hideaki T. Matsubayashi, Shogo Hamada, Satoshi Murata …

ChemRxiv 2025年9月30日
A Novel MiRNA Detection System Combining TWJ-SDA, Multistep L-TEAM, and CRISPR-Cas3

Riko Miyazaki, Kazuki Aibara, Haruhi Isse, Fumiya Kashiwai, Masashi Takahashi, Azusa Onodera, Yuji Tsunekawa, Yuko Yamauchi, Kazuto Yoshimi, Tomoji Mashimo …

bioRxiv 2025年9月25日
Nanopore‐Based Single‐Molecule Logic Unit (sMOLU)

Sotaro Takiguchi, Nanami Takeuchi, Harune Suzuki, Masayuki Ohara, Ken Komiya, Ryuji Kawano

Small 21(34) 2501560 2025年6月4日査読有り
Characterization of Cascaded DNA Generation Reaction for Amplifying DNA Signal

Ken Komiya, Chizuru Noda, Masayuki Yamamura

New Generation Computing 42 237-252 2024年3月査読有り筆頭著者責任著者
Practice of responsible research and innovation in the formulation and revision of ethical principles of molecular robotics in Japan

Ken Komiya, Ryuma Shineha, Naoto Kawahara

SN Applied Sciences 4 305 2022年10月査読有り筆頭著者責任著者
Monotone Control of R Systems

Ryutaro Yako, Daihei Ise, Ken Komiya, Kenzo Fujimoto, Satoshi Kobayashi

New Generation Computing 40(2) 623-657 2022年7月査読有り
Reducing Control Alphabet Size for the Control of Right Linear Grammars with Unknown Behaviors

Nobuya Kimoto, Shigetaka Nakamura, Ken Komiya, Kenzo Fujimoto, Satoshi Kobayashi

Theoretical Computer Scinece 862 193-213 2021年3月16日査読有り
Monotonically controlling right linear grammars with unknown behaviors to output a target string

Nobuya Kimoto, Ken Komiya, Kenzo Fujimoto, Satoshi Kobayashi

Theoretical Computer Science 777 387-408 2019年7月19日査読有り
Measurement of microRNA with isothermal DNA amplification on fully automated immunoassay analyzers

Ken Komiya

Analytical and Bioanalytical Chemistry 2019年6月3日
Isothermal amplification of specific DNA molecules inside giant unilamellar vesicles

Yusuke Sato, Ken Komiya, Ibuki Kawamata, Satoshi Murata, Shin-ichiro M. Nomura

Chemical Communications 2019年
Leak-free million-fold DNA amplification with locked nucleic acid and targeted hybridization in one pot

K. Komiya, M. Komori, C. Noda, S. Kobayashi, T. Yoshimura, M. Yamamura

Organic & Biomolecular Chemistry 2019年
Engineering multistate DNA molecules: a tunable thermal band-pass filter

John A. Rose, Ken Komiya, Satoshi Kobayashi

MICRO & NANO LETTERS 11(10) 595-601 2016年10月査読有り
Analysis and Design of a Single-Molecule DNA Nanodevice for Thermal Band-Pass Filters

John A. Rose, Ken Komiya

2016 IEEE 11TH ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON NANO/MICRO ENGINEERED AND MOLECULAR SYSTEMS (NEMS) 2016年査読有り
Cascading DNA Generation Reaction for Controlling DNA Nanomachines at a Physiological Temperature

Ken Komiya, Masayuki Yamamura

NEW GENERATION COMPUTING 33(3) 213-+ 2015年7月査読有り
Molecular computing machineries-computing models and wet implementations

Masami Hagiya, Satoshi Kobayashi, Ken Komiya, Fumiaki Tanaka, Takashi Yokomori

Handbook of Natural Computing 3-4 1130-1184 2012年1月1日
自律DNA分子計算 : in vitro インテリジェンスの構築

小宮健, ローズジョン A., 山村雅幸

計測自動制御学会論文集 = Transactions of the Society of Instrument and Control Engineers 46(11) 700-705 2010年11月30日査読有り

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書籍等出版物

新・生命論 : 「シン・生命とは何か?」生命科学のおどろくべき世界

小宮健 (担当:分担執筆, 範囲:生物と非生物の境界線)

ニュートンプレス 2025年10月 (ISBN: 9784315529647)
新・生命論 : 「シン・生命とは何か?」生命科学のおどろくべき世界

小宮健 (担当:分担執筆, 範囲:生命とは何か)

ニュートンプレス 2025年10月 (ISBN: 9784315529647)

講演・口頭発表等

等温インキュベーション時に起こる新規情報生成プロセスとしての非特異的DNA増幅の評価に向けて

第50回生命の起源・アストロバイオロジー学会学術講演会 2026年3月26日
人工細胞内でのmRNA量スイッチングのためのmRNA合成と切断の可逆的な光制御

岩田大地, 村山恵司, 小宮健, 松林英明, 安部桂太, 浅沼浩之, 村田智, 野村慎一郎

第９回分子ロボティクス年次大会 2026年3月12日招待有り
モデル予測および実験によるカスケード型DNA生成反応のシグナル増幅性能検証

小宮健, 野田千鶴, 中茎隆

第９回分子ロボティクス年次大会 2026年3月12日
Experimental Characterization of Cascaded DNA Generation Reaction with Respect to Signal Amplification Performance

Ken Komiya, Chizuru Noda, Takashi Nakakuki

Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2025 2025年10月30日
Characterization of Responsive Nucleic Acid Amplification systems

Ken Komiya, Chizuru Noda, Takashi Nakakuki

The 63rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2025年9月25日
Control of Gene expression in synthetic cells using photoresponsive molecular switches

Daichi Iwata, Keiji Murayama, Ken Komiya, Keita Abe, Satoshi Murata, Hideaki T. Matsubayashi, Shin-ichiro M. Nomura

The 31st International Conference on DNA Computing and Molecular Programming (DNA31) 2025年8月
DNAコンピューティングのkiller app.を求めて：状態遷移機械が多数並列演算する鎖置換駆動型WPCR反応をリブートする

小宮健

東京科学大学情報理工学院情報工学系山村雅幸研究室セミナー 2025年6月24日
腫瘍由来核酸検出・自律型薬剤生成リポソーム型分子ロボットの細胞作用評価

竹内七海, 鈴木春音, 小宮健, 川野竜司

化学とマイクロ・ナノシステム学会第51回研究会（Cheminas51） 2025年5月16日
DNA computing–based liposomes for miR-20a detection and antisense oligonucleotide generation in living cell environments

Nanami Takeuchi, Harune Suzuki, Ken Komiya, Ryuji Kawano

Foundations of Nanoscience 22nd Annual Conference (FNANO2025) 2025年4月29日
Experimental Validation of Signal Dependent Operation in Whiplash PCR

Fourteenth International Meeting on DNA Based Computers (DNA14) 2009年
Experimental Validation of Signal Dependent Operation in Whiplash PCR

Fourteenth International Meeting on DNA Based Computers (DNA14) 2009年
自律DNA分子計算 ‐ in vitro インテリジェンスの構築

システム・情報部門学術講演会 2009 (SSI2009) 2009年
A realization of DNA molecular machine that walks autonomously by using a restriction enzyme

Thirteenth International Meeting on DNA Based Computers (DNA13) 2008年
An Interface for a Computing Model Using Methylation to Allow Precise Population Control by Quantitative Monitoring

Thirteenth International Meeting on DNA Based Computers (DNA13) 2008年
A realization of DNA molecular machine that walks autonomously by using a restriction enzyme

Thirteenth International Meeting on DNA Based Computers (DNA13) 2008年
An Interface for a Computing Model Using Methylation to Allow Precise Population Control by Quantitative Monitoring

Thirteenth International Meeting on DNA Based Computers (DNA13) 2008年
An Implementation of Aqueous Memory Molecules with Light Responsive DNAs

2007 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC2007) 2007年
An Implementation of Aqueous Memory Molecules with Light Responsive DNAs

2007 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC2007) 2007年
Experimental Validation of the Statistical Thermodynamic Model for Prediction of the Behavior of Autonomous Molecular Computers Based on DNA Hairpin Formation

Twelfth International Meeting on DNA Based Computer (DNA12) 2006年
Displacement Whiplash PCR: Optimized Architecture and Experimental Validation

Twelfth International Meeting on DNA Based Computer (DNA12) 2006年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

AI・データ統合による分子ロボット設計・評価手法の構築とタンパク質デバイス創製

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2026年4月 - 2031年3月

西羽美, 野村慎一郎, 中茎隆, 小宮健, 標葉隆馬
自律分散型分子システムによるセラノスティクス

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2025年4月 - 2030年3月

川野竜司, 小宮健, 臼井達哉, 板倉潤, 竹内七海
ミニマル人工脳のための記憶・学習分子回路の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2020年11月 - 2025年3月

中茎隆, 嶋田直彦, 小宮健, 川又生吹
RNAプロファイルをその場で自動計測・判別する診断用分子システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2022年6月 - 2024年3月

小宮健
研究者の自治に基づく分子ロボット技術のRRI実践モデルの構築

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進/社会技術研究開発事業(RISTEX) 2021年 - 2024年

小宮健
実世界で動作するDNAナノマシン構築手法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2023年3月

小宮健
制御信号系列によって多機能性を実現する分子計算システムの理論とその設計基盤の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

小林聡, 小宮健, 藤本健造
分子ロボット技術の社会実装に関するRRIコミュニケーション実践の企画調査

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進/社会技術研究開発事業(RISTEX) 2020年 - 2020年

小宮健
ウエットＧＡの生物学実験データの分析に基づく高度並列型進化計算の実現

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2018年3月

山村雅幸, 坂本健作, 染谷博司, 小宮健
ナノ3Dプリンティング事業化検証のための自己会合技術の開発

科学技術振興機構産学が連携した研究開発成果の展開/研究成果展開事業/大学発新産業創出プログラム(START)/プロジェクト推進型/ビジネスモデル検証支援 2018年 - 2018年

小宮健
分子が癌を診断する知的反応システムの創製

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2017年3月

小宮健
知能分子ロボット実現に向けた化学反応回路の設計と構築

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年6月 - 2017年3月

小林聡, 山下雅史, 小宮健, 藤本健造, 鈴木泰博, 原雄介, 横森貴, 井村順一, 速水謙, ヤニックロンドレーズ
ウェットＧＡの分子実現に基づく高度並列型進化計算理論の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

山村雅幸, 坂本健作, 染谷博司, 小宮健
ウイルス感染症を早期診断する遺伝子検査技術の開発

科学技術振興機構産学が連携した研究開発成果の展開/研究成果展開事業/研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP)/ハイリスク挑戦タイプ 2014年 - 2014年

小宮健
がんの早期診断に向けた微量マイクロRNA検査システムの実用化

科学技術振興機構産学が連携した研究開発成果の展開/復興促進プログラム/A-STEP/シーズ顕在化タイプ 2012年 - 2013年

小宮健
分子ロボティクスのための反応系解析アルゴリズムの理論

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2010年 - 2012年

小林聡, 山下雅史, 村田智, 鈴木泰博, 小宮健, 葛谷明紀, 瀧ノ上正浩
感染症診断およびガンのプロファイリングを簡易に行える核酸検出反応システムの開発

科学技術振興機構産学が連携した研究開発成果の展開/研究成果展開事業/研究成果最適展開支援プログラム(A-STEP)/探索タイプ 2011年 - 2011年

小宮健
クロック制御された動作をする知的DNAナノマシンの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2009年 - 2010年

小宮健
不確実な情報のもとで論理推論を行い機能性分子を産生する反応システムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究課題提案型) 2008年 - 2010年

小宮健
DWPCRを用いた高性能試験管内遺伝的プログラミングによるタンパク質の創製

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2006年 - 2008年

ローズジョンアンソニー, 小宮健, 陶山明, 萩谷昌巳, IBRAHIM Zuwairie, 陶山明, 萩谷昌己, 小宮健, GHOTBI Nader

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